{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[429.3657481390903, 1088.569466384598, 1, 0, 0.2828617084780002, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828617084780003, 0.0006361009946008022],
[429.6224254249297, 1088.176956191805, 0, 1, 0.2830561341824391, 0, 0.0009189681828032912, 0.005195415918970319, 0.7169438658175609, 1, 0.0006361010484983775],
[429.3564547861564, 1088.288207873339, 0, 1, 0.2829097385904281, 0, 0.0009188742400821687, 0.005194884810801479, 0.7170902614095719, 1, 0.0006363854575959709],
[429.3657481390903, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2828870227116162, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828870227116163, 0.0006361713624496054],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006361010489203684],
[429.501581046044, 1088.47896355603, 0, 1, 0.2829427442751806, 0, 0.0009187132075874284, 0.005193974408458611, 0.7170572557248194, 1, 0.0006361582789139564],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006361713095274183],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006361010489232101],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006361582801771255],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006361713090782094],
[429.501581046044, 1088.403348989911, 0, 1, 0.2829568390925974, 0, 0.0009187770332827868, 0.005194335249062138, 0.7170431609074026, 1, 0.0006361010484818873],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006361713624496054],
[429.3354636513566, 1088.599750872332, 0, 1, 0.2828417573710993, 0, 0.0009186112703026674, 0.005193398102769367, 0.7171582426289007, 1, 0.0006361582789139564],
[429.3657481390904, 1088.569466384598, 1, 0, 0.2828617084780002, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828617084780003, 0.0006361010484818873],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006361541359864504],
[429.880793729742, 1088.054420793947, 0, 1, 0.2832010151794481, 0, 0.0009190716759096535, 0.005196001020546587, 0.7167989848205518, 1, 0.0006361582240125677],
[429.5997864741921, 1088.335428049497, 1, 0, 0.2830158905095272, 0.00232774789812442, 0, -0.01315999695264096, 1, 0.2830158905095272, 0.0006363974856332641],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006363516476480189],
[429.3354636513566, 1088.599750872332, 0, 1, 0.2828417573710993, 0, 0.0009186112703026674, 0.005193398102769367, 0.7171582426289007, 1, 0.0006361582240295671],
[429.3807366671583, 1088.690310763484, 0, 1, 0.2828462721780324, 0, 0.0009185348579971408, 0.005192966103363983, 0.7171537278219675, 1, 0.0006361550112573177],
[429.5469111244294, 1088.388303399259, 0, 1, 0.2829810567766664, 0, 0.0009187897342123167, 0.005194407054172152, 0.7170189432233336, 1, 0.0006361582235421924],
[429.501581046044, 1088.403348989911, 0, 1, 0.2829568390925974, 0, 0.0009187770332827868, 0.005194335249062138, 0.7170431609074026, 1, 0.0006361009946008022],
[429.880793729742, 1088.054420793947, 0, 1, 0.2832010151794481, 0, 0.0009190716759096535, 0.005196001020546587, 0.7167989848205518, 1, 0.0006362141199838687],
[429.1527099126635, 1088.616387216338, 1, 0, 0.282752304500365, 0.00233017286597936, 0, -0.01317370658571892, 1, 0.282752304500365, 0.0006361156003309348],
[429.3657481390903, 1088.569466384598, 1, 0, 0.2828617084780002, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828617084780003, 0.0006361010484983775],
[429.6224254249297, 1088.146671704072, 0, 1, 0.2830617820837173, 0, 0.0009189937588413231, 0.005195560513916719, 0.7169382179162826, 1, 0.0006362141757255092],
[429.6374139529976, 1088.297800570691, 1, 0, 0.2830406791029043, 0.002327544034862383, 0, -0.0131588444051897, 1, 0.2830406791029043, 0.00063610004108013],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006361009941593693],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006361500067085848],
[429.3657481390903, 1088.569466384598, 2, 0, 0.2828617084780002, 0.004658033410136182, 0, -0.02633434038629531, 0.9999999999999999, 0.08001074612309333, 0.00127407504719054],
[429.3354636513566, 1088.599750872332, 0, 1, 0.2828417573710993, 0, 0.0009186112703026674, 0.005193398102769367, 0.7171582426289007, 1, 0.0006361009946008022],
[429.6843347847372, 1088.720595251218, 0, 1, 0.2829840224337012, 0, 0.0009185093074952387, 0.005192821652786907, 0.7170159775662988, 1, 0.0006363117882511857],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006361155456921041],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006360163334592904],
[429.6374139529976, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2830153533855779, 0.002327544034862383, 0, -0.0131588444051897, 1, 0.2830153533855779, 0.0006361549582316369],
[429.5197640995365, 1088.415450424152, 0, 1, 0.2829631725977944, 0, 0.0009187668179556832, 0.005194277496384684, 0.7170368274022056, 1, 0.0006361582789139564],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.2295698812202, 1088.871416686239, 0, 1, 0.2827411178038561, 0, 0.0009183820832062048, 0.005192102386212835, 0.7172588821961439, 1, 0.0006364605961953349],
[429.3657481390903, 1088.569466384598, 1, 0, 0.2828617084780002, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828617084780003, 0.0006359854202019411],
[430.001581046044, 1087.933633477645, 0, 1, 0.283280588612587, 0, 0.0009191737154071066, 0.005196577904098545, 0.716719411387413, 1, 0.0006360163330366484],
[429.3354636513566, 1088.599750872332, 0, 1, 0.2828417573710993, 0, 0.0009186112703026674, 0.005193398102769367, 0.7171582426289007, 1, 0.0006362141194980559],
[429.6374139529977, 1088.297800570691, 1, 0, 0.2830406791029043, 0.002327544034862382, 0, -0.0131588444051897, 1, 0.2830406791029043, 0.00063610004108013],
[429.6676984407314, 1088.267516082957, 0, 1, 0.2830606302098053, 0, 0.0009188917111110124, 0.005194983583820039, 0.7169393697901947, 1, 0.0006359070843578407],
[429.690337391469, 1088.079105088449, 0, 1, 0.2831064622630617, 0, 0.0009190508257381811, 0.005195883143437447, 0.7168935377369383, 1, 0.0006366444898931201],
[429.3354636513566, 1088.554420793947, 0, 1, 0.2828502041228457, 0, 0.0009186495235310708, 0.005193614368615691, 0.7171497958771543, 1, 0.0006361155998989773],
[429.2146192724709, 1088.720595251218, 0, 1, 0.2827621463457212, 0, 0.0009185093074952387, 0.005192821652786907, 0.7172378536542787, 1, 0.0006363974860650264],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006361010489232101],
[429.501581046044, 1088.267516082957, 0, 1, 0.2829821623450401, 0, 0.0009188917111110124, 0.005194983583820039, 0.7170178376549599, 1, 0.0006366644170540786],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006361713082094107],
[429.6102669281048, 1088.324947595584, 1, 0, 0.2830227949240323, 0.002327691112110572, 0, -0.01315967591110128, 1, 0.2830227949240323, 0.0006360163846694293],
[429.3657481390904, 1088.569466384598, 1, 0, 0.2828617084780002, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828617084780003, 0.0006361713624496054],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006361582240125677],
[429.501581046044, 1088.421532043403, 0, 1, 0.2829534495801136, 0, 0.0009187616842921136, 0.005194248473054028, 0.7170465504198864, 1, 0.0006363516476480189],
[429.501581046044, 1088.388303399259, 0, 1, 0.2829596438103946, 0, 0.000918789734212317, 0.005194407054172153, 0.7170403561896055, 1, 0.0006363854575931402],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006361010484818873],
[429.5197640995365, 1088.415450424152, 0, 1, 0.2829631725977944, 0, 0.0009187668179556832, 0.005194277496384684, 0.7170368274022056, 1, 0.0006362141749351089],
[429.3657481390903, 1088.569466384598, 1, 0, 0.2828617084780002, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828617084780002, 0.0006361156003309348],
[429.6374139529977, 1088.297800570691, 1, 1, 0.2830406791029043, 0.002327544034862382, 0.0009188661407526609, -0.007964005384205804, 0.9198879739729668, 0.4859693321787754, 0.001272812541055024],
[429.312824700619, 1088.667719901455, 0, 1, 0.2828183972628975, 0, 0.0009185539184449401, 0.005193073862213279, 0.7171816027371025, 1, 0.0006361259953454087],
[429.6374139529977, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2830153533855779, 0.002327544034862382, 0, -0.0131588444051897, 1, 0.2830153533855779, 0.0006360163320990265],
[429.501581046044, 1088.463917965378, 1, 0, 0.2829455487135628, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829455487135628, 0.0006362046098497982],
[429.3657481390903, 1088.569466384598, 1, 0, 0.2828617084780002, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828617084780003, 0.0006361156003280845],
[429.3928951639832, 1088.542319359706, 1, 0, 0.2828795926568723, 0.002328869460259943, 0, -0.0131663377399305, 1, 0.2828795926568723, 0.0006361010475884174],
[429.501581046044, 1088.143081613452, 1, 0, 0.2830053645715674, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2830053645715673, 0.0006371359505008529],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006361156003470182],
[429.6676984407314, 1088.267516082957, 0, 1, 0.2830606302098053, 0, 0.0009188917111110124, 0.005194983583820039, 0.7169393697901947, 1, 0.0006360163334592904],
[429.501581046044, 1088.451816531137, 0, 1, 0.2829478044132154, 0, 0.0009187361211697634, 0.005194103951126847, 0.7170521955867846, 1, 0.0006361582789139564],
[429.4712965583103, 1088.463917965378, 0, 1, 0.2829312426835513, 0, 0.0009187259067523888, 0.005194046203592575, 0.7170687573164487, 1, 0.0006363516476480189],
[429.6374139529977, 1088.297800570691, 1, 0, 0.2830406791029043, 0.002327544034862382, 0, -0.0131588444051897, 1, 0.2830406791029043, 0.0006360163846694293],
[429.501581046044, 1088.143081613452, 1, 0, 0.2830053645715674, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2830053645715673, 0.0006364273689607388],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006363316480929802],
[428.888387089828, 1088.486451764824, 0, 1, 0.2826515743555907, 0, 0.0009187068873284039, 0.005193938676672721, 0.7173484256444094, 1, 0.0006389890991681894],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.3354636513566, 1088.554420793947, 0, 1, 0.2828502041228457, 0, 0.0009186495235310708, 0.005193614368615691, 0.7171497958771543, 1, 0.0006362454701995015],
[429.3657481390903, 1088.569466384598, 1, 0, 0.2828617084780002, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828617084780003, 0.0006362165338275678],
[429.3354636513566, 1088.599750872332, 0, 1, 0.2828417573710993, 0, 0.0009186112703026674, 0.005193398102769367, 0.7171582426289007, 1, 0.0006363974860650264],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006363960319598389],
[429.501581046044, 1088.267516082957, 0, 1, 0.2829821623450401, 0, 0.0009188917111110124, 0.005194983583820039, 0.7170178376549599, 1, 0.0006363316480929802],
[429.6102669281048, 1088.324947595584, 1, 0, 0.2830227949240323, 0.002327691112110572, 0, -0.01315967591110128, 1, 0.2830227949240323, 0.0006360163846694293],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006361582789139564],
[429.3657481390903, 1088.569466384598, 1, 0, 0.2828617084780002, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828617084780003, 0.0006361156003470182],
[429.501581046044, 1088.403348989911, 0, 1, 0.2829568390925974, 0, 0.0009187770332827868, 0.005194335249062138, 0.7170431609074026, 1, 0.0006360973321459372],
[429.2146192724709, 1088.720595251218, 0, 1, 0.2827621463457211, 0, 0.0009185093074952386, 0.005192821652786906, 0.7172378536542789, 1, 0.000636135865795417],
[429.9393642546387, 1087.99585026905, 1, 1, 0.2832396008347095, 0.002325909379648553, 0.0009191211526704909, -0.007953322090832762, 0.9197753285189944, 0.4862545301884135, 0.001274040432155965],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.6374139529977, 1088.297800570691, 1, 0, 0.2830406791029043, 0.002327544034862382, 0, -0.0131588444051897, 1, 0.2830406791029043, 0.0006359152788405444],
[429.4546602143045, 1088.010838797118, 0, 1, 0.2830078578353707, 0, 0.0009191084907808263, 0.005196209154594453, 0.7169921421646293, 1, 0.0006369010056532434],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.0937748935852, 1089.007557024791, 0, 1, 0.2826516029409929, 0, 0.0009182672733071177, 0.005191453304788108, 0.7173483970590071, 1, 0.0006363759226883042],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006358517896748792],
[429.4894796118028, 1088.445734911886, 0, 1, 0.2829432214908933, 0, 0.0009187412545476638, 0.005194132972842463, 0.7170567785091067, 1, 0.0006361010484983775],
[429.4712965583103, 1088.463917965378, 0, 1, 0.2829312426835513, 0, 0.0009187259067523888, 0.005194046203592575, 0.7170687573164487, 1, 0.0006362141757114779],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006361000410773284],
[429.2146192724709, 1088.720595251218, 0, 1, 0.2827621463457212, 0, 0.0009185093074952387, 0.005192821652786907, 0.7172378536542787, 1, 0.0006361009946008022],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.3354636513566, 1088.599750872332, 0, 1, 0.2828417573710993, 0, 0.0009186112703026674, 0.005193398102769367, 0.7171582426289007, 1, 0.0006361244186072916],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.000636135865795417],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006384334858384571],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006361000415099267],
[429.1527099126634, 1088.616387216338, 1, 0, 0.282752304500365, 0.00233017286597936, 0, -0.01317370658571892, 1, 0.282752304500365, 0.0006361009946008022],
[430.1843347847372, 1088.220595251218, 0, 1, 0.2833133153582099, 0, 0.0009189313309854681, 0.005195207576043389, 0.7166866846417901, 1, 0.0006362046098497982],
[429.501581046044, 1088.554420793947, 0, 1, 0.2829286801840366, 0, 0.0009186495235310708, 0.005193614368615691, 0.7170713198159634, 1, 0.0006360992966671452],
[429.6374139529977, 1088.297800570691, 1, 0, 0.2830406791029043, 0.002327544034862382, 0, -0.0131588444051897, 1, 0.2830406791029043, 0.0006360712250516853],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.6091279158347, 1088.326086607854, 0, 1, 0.2830220445545439, 0, 0.0009188422590483401, 0.005194704005007146, 0.7169779554454561, 1, 0.0006360267200699788],
[429.3657481390904, 1088.569466384598, 1, 0, 0.2828617084780002, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828617084780003, 0.0006363032865799967],
[429.880793729742, 1088.054420793947, 0, 1, 0.2832010151794481, 0, 0.0009190716759096535, 0.005196001020546587, 0.7167989848205518, 1, 0.000636354524319265],
[429.380793729742, 1088.554420793947, 0, 1, 0.2828716203573134, 0, 0.0009186495235310708, 0.005193614368615691, 0.7171283796426866, 1, 0.0006360973321459372],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.1527099126634, 1088.616387216338, 1, 0, 0.282752304500365, 0.00233017286597936, 0, -0.01317370658571892, 1, 0.282752304500365, 0.0006362928792298626],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006361466238300721],
[429.501581046044, 1088.724185341837, 0, 1, 0.2828970437433042, 0, 0.0009185062786917148, 0.005192804529349624, 0.7171029562566958, 1, 0.0006360072210267701],
[429.2146192724709, 1088.720595251218, 0, 1, 0.2827621463457211, 0, 0.0009185093074952386, 0.005192821652786906, 0.7172378536542789, 1, 0.0006361009946008022],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006362141749380263],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.000636115599008396],
[429.6676984407314, 1088.267516082957, 0, 1, 0.2830606302098053, 0, 0.0009188917111110124, 0.005194983583820039, 0.7169393697901947, 1, 0.0006359070839374625],
[429.3803913162418, 1088.720595251218, 0, 1, 0.2828404665536139, 0, 0.0009185093074952386, 0.005192821652786906, 0.7171595334463861, 1, 0.0006361582789139564],
[429.4894796118028, 1088.445734911886, 0, 1, 0.2829432214908933, 0, 0.0009187412545476638, 0.005194132972842463, 0.7170567785091067, 1, 0.0006362972152051425],
[429.2146763350546, 1088.720538188634, 0, 1, 0.2827621839379604, 0, 0.0009185093556366233, 0.00519282192495576, 0.7172378160620396, 1, 0.0006368531291496682],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.380793729742, 1088.554420793947, 0, 1, 0.2828716203573134, 0, 0.0009186495235310708, 0.005193614368615691, 0.7171283796426866, 1, 0.000636163831700913],
[429.380793729742, 1088.554420793947, 0, 1, 0.2828716203573134, 0, 0.0009186495235310708, 0.005193614368615691, 0.7171283796426866, 1, 0.0006361010484983775],
[429.501581046044, 1088.554420793947, 0, 1, 0.2829286801840366, 0, 0.0009186495235310708, 0.005193614368615691, 0.7170713198159634, 1, 0.0006361067644152195],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006384659668097613],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006361886093593036],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006359269136326625],
[429.3657481390903, 1088.569466384598, 1, 0, 0.2828617084780002, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828617084780003, 0.0006361009946008022],
[429.880793729742, 1088.054420793947, 0, 1, 0.2832010151794481, 0, 0.0009190716759096535, 0.005196001020546587, 0.7167989848205518, 1, 0.0006362141187053544],
[429.6374139529977, 1088.297800570691, 1, 0, 0.2830406791029043, 0.002327544034862382, 0, -0.0131588444051897, 1, 0.2830406791029043, 0.0006361000410773284],
[429.6374139529977, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2830153533855779, 0.002327544034862382, 0, -0.0131588444051897, 1, 0.2830153533855779, 0.0006360163846694293],
[429.3657481390903, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2828870227116162, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828870227116163, 0.0006361713090810634],
[429.6467073059316, 1088.454279261528, 0, 1, 0.2830158936115278, 0, 0.0009187340424427009, 0.005194092198977127, 0.7169841063884721, 1, 0.0006361582789139564],
[429.501581046044, 1088.403348989911, 0, 1, 0.2829568390925974, 0, 0.0009187770332827868, 0.005194335249062138, 0.7170431609074026, 1, 0.0006361010484983775],
[429.622368362346, 1088.312846161343, 0, 1, 0.2830307672235912, 0, 0.0009188534377106395, 0.005194767203930841, 0.7169692327764088, 1, 0.00063610004108013],
[429.667755503315, 1088.267459020374, 1, 0, 0.2830606678020446, 0.002327379672297249, 0, -0.0131579151761877, 1, 0.2830606678020446, 0.0006359967651500801],
[429.5997864741921, 1088.335428049497, 1, 0, 0.2830158905095272, 0.00232774789812442, 0, -0.01315999695264096, 1, 0.2830158905095272, 0.0006363975402712728],
[429.880793729742, 1088.054420793947, 0, 1, 0.2832010151794481, 0, 0.0009190716759096535, 0.005196001020546587, 0.7167989848205518, 1, 0.0006361582235421924],
[429.501581046044, 1088.308853657223, 0, 1, 0.2829744553245294, 0, 0.0009188568085608566, 0.00519478626114001, 0.7170255446754706, 1, 0.0006360992966671452],
[429.5488472287001, 1088.386367294989, 0, 1, 0.2829823322621103, 0, 0.0009187913686252256, 0.005194416294377638, 0.7170176677378897, 1, 0.000635907136952824],
[429.3354636513566, 1088.554420793947, 0, 1, 0.2828502041228457, 0, 0.0009186495235310708, 0.005193614368615691, 0.7171497958771543, 1, 0.0006361582789139564],
[429.7885428196171, 1088.146671704071, 0, 1, 0.2831402412351834, 0, 0.0009189937588413233, 0.00519556051391672, 0.7168597587648166, 1, 0.0006360992435820197],
[429.501581046044, 1088.267516082957, 0, 1, 0.2829821623450401, 0, 0.0009188917111110124, 0.005194983583820039, 0.7170178376549599, 1, 0.0006361009946008022],
[429.880793729742, 1088.054420793947, 0, 1, 0.2832010151794481, 0, 0.0009190716759096535, 0.005196001020546587, 0.7167989848205518, 1, 0.0006361582240125677],
[429.3657481390903, 1088.569466384598, 1, 0, 0.2828617084780002, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828617084780002, 0.0006361156003280845],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006361010475884174],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006361010484983775],
[429.501581046044, 1088.403348989911, 0, 1, 0.2829568390925974, 0, 0.0009187770332827868, 0.005194335249062138, 0.7170431609074026, 1, 0.0006361582240295671],
[429.3657481390903, 1088.569466384598, 1, 0, 0.2828617084780002, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828617084780003, 0.0006361156003309348],
[429.6374139529976, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2830153533855779, 0.002327544034862383, 0, -0.0131588444051897, 1, 0.2830153533855779, 0.0006360163330366484],
[429.9093871985027, 1087.859709930499, 0, 1, 0.2832508502193882, 0, 0.0009192361762013304, 0.005196931028189993, 0.7167491497806118, 1, 0.0006359967656687241],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006361156003309348],
[429.6467073059316, 1088.57905908195, 0, 1, 0.2829926331234218, 0, 0.0009186287313328875, 0.005193496819260388, 0.7170073668765782, 1, 0.0006362141749380263],
[429.5997864741921, 1088.214640733195, 1, 0, 0.2830384128477477, 0.00232774789812442, 0, -0.01315999695264096, 1, 0.2830384128477477, 0.0006362972152051425],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006361010489203684],
[429.0318655337777, 1088.903348989911, 1, 0, 0.2826417500752186, 0.002330829200194385, 0, -0.01317741719212805, 1, 0.2826417500752185, 0.0006383784835966938],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006361156003309348],
[429.5997864741921, 1088.335428049497, 1, 0, 0.2830158905095272, 0.00232774789812442, 0, -0.01315999695264096, 1, 0.2830158905095272, 0.0006363974856361167],
[429.6676984407314, 1088.267516082957, 0, 1, 0.2830606302098053, 0, 0.0009188917111110124, 0.005194983583820039, 0.7169393697901947, 1, 0.0006366510987517174],
[429.001581046044, 1088.933633477645, 0, 1, 0.2826217989683176, 0, 0.0009183296109666261, 0.005191805732733517, 0.7173782010316824, 1, 0.0006361156532090653],
[429.7885428196171, 1088.146671704072, 0, 1, 0.2831402412351834, 0, 0.0009189937588413231, 0.005195560513916719, 0.7168597587648167, 1, 0.0006360163846694293],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006361550112545146],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006361582240125677],
[429.6374139529977, 1088.297800570691, 1, 0, 0.2830406791029043, 0.002327544034862382, 0, -0.0131588444051897, 1, 0.2830406791029043, 0.0006360163334422663],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.2146192724709, 1088.720595251218, 0, 1, 0.2827621463457212, 0, 0.0009185093074952387, 0.005192821652786907, 0.7172378536542787, 1, 0.0006361503436956405],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 1, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0.0009187514693063176, -0.007968815260317902, 0.9199386219325578, 0.4858410095134625, 0.001272889030024392],
[429.6374139529976, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2830153533855779, 0.002327544034862383, 0, -0.0131588444051897, 1, 0.2830153533855779, 0.0006360163330366484],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006366444898931201],
[429.2146192724709, 1088.720595251218, 0, 1, 0.2827621463457211, 0, 0.0009185093074952386, 0.005192821652786906, 0.7172378536542789, 1, 0.0006361156003309348],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006360163330366484],
[429.0545044845154, 1088.835379960788, 1, 0, 0.2826651056056736, 0.002330706214590249, 0, -0.01317672188909419, 1, 0.2826651056056737, 0.0006361713624496054],
[429.6467073059316, 1088.454279261528, 0, 1, 0.2830158936115278, 0, 0.0009187340424427009, 0.005194092198977127, 0.7169841063884721, 1, 0.0006361582801771255],
[429.3657481390904, 1088.569466384598, 1, 0, 0.2828617084780002, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828617084780003, 0.0006360973321459372],
[429.6374139529977, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2830153533855779, 0.002327544034862382, 0, -0.0131588444051897, 1, 0.2830153533855779, 0.0006361260117510797],
[429.6224254249297, 1088.146671704072, 0, 1, 0.2830617820837173, 0, 0.0009189937588413231, 0.005195560513916719, 0.7169382179162826, 1, 0.0006358985884472741],
[428.6036595058723, 1086.342204943989, 1, 0.75, 0.2829168154213323, 0.002333157866997398, 0.0006903901888251402, -0.009287439441385945, 0.9445979422220864, 0.4412124871660673, 0.0006367361194314643],
[429.6467073059316, 1088.57905908195, 0, 1, 0.2829926331234218, 0, 0.0009186287313328875, 0.005193496819260388, 0.7170073668765782, 1, 0.0006363728117613291],
[429.501581046044, 1088.403348989911, 0, 1, 0.2829568390925974, 0, 0.0009187770332827868, 0.005194335249062138, 0.7170431609074026, 1, 0.000636135865795417],
[429.5168770057098, 1088.252220123292, 0, 1, 0.2829922402677588, 0, 0.0009189046266192838, 0.005195056602057808, 0.7170077597322412, 1, 0.0006368368209680013],
[429.5714523483204, 1088.833477687635, 0, 1, 0.2829096796584745, 0, 0.0009184140830457462, 0.005192283298325864, 0.7170903203415255, 1, 0.0006363743262542237],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.3281206602848, 1088.607093863404, 1, 0, 0.2828369198846232, 0.002329220826397421, 0, -0.01316832419959058, 1, 0.2828369198846232, 0.0006363405284293612],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.3657481390903, 1088.569466384598, 1, 0, 0.2828617084780002, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828617084780003, 0.0006363335003589396],
[429.6467073059316, 1088.758222730023, 0, 1, 0.2829592415086257, 0, 0.0009184775638181035, 0.005192642188896208, 0.7170407584913743, 1, 0.000635916954969939],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006359070852980946],
[429.380793729742, 1088.554420793947, 0, 1, 0.2828716203573134, 0, 0.0009186495235310708, 0.005193614368615691, 0.7171283796426866, 1, 0.000636171362016523],
[429.501581046044, 1088.599750872332, 0, 1, 0.2829202320132982, 0, 0.0009186112703026674, 0.005193398102769367, 0.7170797679867018, 1, 0.0006366644170540786],
[429.501581046044, 1088.403348989911, 0, 1, 0.2829568390925974, 0, 0.0009187770332827868, 0.005194335249062138, 0.7170431609074026, 1, 0.0006360973844420104],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.3657481390904, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2828870227116163, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828870227116163, 0.0006361500061671893],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.501581046044, 1088.267516082957, 0, 1, 0.2829821623450401, 0, 0.0009188917111110124, 0.005194983583820039, 0.7170178376549599, 1, 0.0006366134536918601],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006359127522373881],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.501581046044, 1088.403348989911, 0, 1, 0.2829568390925974, 0, 0.0009187770332827868, 0.005194335249062138, 0.7170431609074026, 1, 0.0006362138728588969],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.4712965583103, 1088.445734911886, 0, 1, 0.2829346319029973, 0, 0.0009187412545476638, 0.005194132972842463, 0.7170653680970027, 1, 0.0006360667810532248],
[428.5050312112391, 1086.440982282216, 1, 0.75, 0.2828516840828602, 0.002333694886086489, 0.0006903274197412215, -0.009290830362943817, 0.9446242207339628, 0.4411236652786009, 0.0006367093463876087],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0004443916190585547],
[428.3691990167567, 1086.576816706723, 1, 0.75, 0.2827620222573964, 0.002334434880694778, 0.0006902411209850353, -0.00929550183882282, 0.9446603856770316, 0.4410013804093639, 0.0006368408291101405],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 0, 0.2829511937904523, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001918014772767603],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.4894796118028, 1088.445734911886, 0, 1, 0.2829432214908933, 0, 0.0009187412545476638, 0.005194132972842463, 0.7170567785091067, 1, 0.0006362083238779698],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.5037713903124, 1086.196052628942, 0.5, 1.25, 0.2833699421112134, 0.001164134131771393, 0.001150805139619685, -7.53558820693547e-05, 0.7512923354833254, 0.4418302644238782, 0.0006365564354451944],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.403375617896, 1088.652626222095, 1, 0, 0.282863988612692, 0.002328812619511982, 0, -0.01316601638894977, 1, 0.282863988612692, 0.0006360152980532446],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006359998463627487],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.1693462566693, 1088.765868267019, 0, 1, 0.2827323209517462, 0, 0.0009184711140804704, 0.005192605725098875, 0.7172676790482538, 1, 0.0006363794727322784],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.3354636513566, 1088.599750872332, 0, 1, 0.2828417573710993, 0, 0.0009186112703026674, 0.005193398102769367, 0.7171582426289007, 1, 0.000636028397327172],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006360905696376442],
[428.6478224066278, 1086.142392501918, 0.75, 2, 0.2829750404959587, 0.001749688114100643, 0.001841379190985281, 0.0005183784263572796, 0.7266898438810639, 0.5993923369103336, 0.001276003807460605],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.000636223885522769],
[429.3657481390903, 1088.569466384598, 1, 0, 0.2828617084780002, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828617084780003, 0.0006363470801074881],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006363733629292577],
[429.9712965583103, 1087.963917965378, 1, 1, 0.283260637505686, 0.002325736643363089, 0.000919148129351678, -0.00795219300720878, 0.9197634112398723, 0.4862846862512443, 0.001273415241737466],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006361993297604468],
[429.403375617896, 1088.652626222095, 1, 0, 0.2828639886126921, 0.002328812619511982, 0, -0.01316601638894977, 1, 0.282863988612692, 0.0006361068158463651],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006360430340019078],
[430.3686922955008, 1087.566522228188, 1, 0, 0.2835224377020238, 0.002323589094425525, 0, -0.01313648502334304, 1, 0.2835224377020238, 0.0006359688533219635],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[430.26000641344, 1087.675208110249, 1, 0, 0.2834508365684439, 0.002324176044935705, 0, -0.01313980336676483, 1, 0.2834508365684439, 0.0006360716462086056],
[429.880793729742, 1088.054420793947, 0, 1, 0.2832010151794481, 0, 0.0009190716759096535, 0.005196001020546587, 0.7167989848205518, 1, 0.0006362755543696724],
[429.501581046044, 1088.373064502177, 1, 0, 0.2829624846200116, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829624846200116, 0.0006364060560584225],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.501581046044, 1088.403348989911, 0, 1, 0.2829568390925974, 0, 0.0009187770332827868, 0.005194335249062138, 0.7170431609074026, 1, 0.0006362143895290421],
[429.2299152321367, 1088.705299291552, 1, 0, 0.2827722231655481, 0.00232975373922663, 0, -0.01317133703926024, 1, 0.2827722231655481, 0.0006363749364372868],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.3657481390903, 1088.569466384598, 1, 0, 0.2828617084780002, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828617084780002, 0.0006361616732092791],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006363398332828656],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006361559137158672],
[429.2299152321367, 1088.705299291552, 1, 0, 0.2827722231655482, 0.00232975373922663, 0, -0.01317133703926024, 1, 0.2827722231655482, 0.000636052461897428],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.3657481390903, 1088.569466384598, 1, 0, 0.2828617084780002, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828617084780003, 0.000636443516954369],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[428.8038387792828, 1088.799140955031, 1, 0, 0.2825533716692842, 0.002332068674680703, 0, -0.01318442460065196, 1, 0.2825533716692843, 0.0006362646042257221],
[429.1527099126634, 1088.616387216338, 1, 0, 0.282752304500365, 0.00233017286597936, 0, -0.01317370658571892, 1, 0.282752304500365, 0.0006362568567413404],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006364516865923072],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006363910061921048],
[429.2299152321367, 1088.651005241766, 1, 0, 0.2827823378253712, 0.00232975373922663, 0, -0.01317133703926024, 1, 0.2827823378253712, 0.0006363317900338615],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.3657481390903, 1088.542319359706, 1, 0, 0.2828667673178639, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.282866767317864, 0.000636273426265137],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006359668521381238],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006360373515590671],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006361789240441113],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.000636706904886956],
[429.6374139529976, 1088.297800570691, 1, 0, 0.2830406791029043, 0.002327544034862383, 0, -0.0131588444051897, 1, 0.2830406791029043, 0.0006361109808473636],
[429.5318655337777, 1088.403348989911, 0, 1, 0.2829711448973533, 0, 0.0009187770332827868, 0.005194335249062138, 0.7170288551026467, 1, 0.0006361741033404117],
[429.403375617896, 1088.652626222095, 1, 0, 0.282863988612692, 0.002328812619511982, 0, -0.01316601638894977, 1, 0.282863988612692, 0.0006362890702652627],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.5469111244294, 1088.388303399259, 0, 1, 0.2829810567766665, 0, 0.000918789734212317, 0.005194407054172153, 0.7170189432233335, 1, 0.0006361867116053395],
[429.5197640995365, 1088.415450424152, 0, 1, 0.2829631725977944, 0, 0.0009187668179556832, 0.005194277496384684, 0.7170368274022056, 1, 0.0006366112015707018],
[429.5136824802852, 1088.421532043403, 0, 1, 0.2829591660900112, 0, 0.0009187616842921136, 0.005194248473054028, 0.7170408339099887, 1, 0.0006359874605434353],
[429.6676984407314, 1088.267516082957, 0, 1, 0.2830606302098053, 0, 0.0009188917111110124, 0.005194983583820039, 0.7169393697901947, 1, 0.0006359855992846901],
[429.2146192724709, 1088.720595251218, 0, 1, 0.2827621463457211, 0, 0.0009185093074952386, 0.005192821652786906, 0.7172378536542789, 1, 0.0006363984275200834],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006359874609597381],
[429.9712965583103, 1087.963917965378, 0, 1, 0.283260637505686, 0, 0.000919148129351678, 0.005196433252518474, 0.716739362494314, 1, 0.0006363984275229393],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.00063633308616259],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006360951285154676],
[429.4410120705766, 1088.494202453112, 1, 0, 0.2829112915766503, 0.002328608521059593, 0, -0.01316486251184236, 1, 0.2829112915766503, 0.0006364225670086767],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.4712965583103, 1088.463917965378, 0, 1, 0.2829312426835513, 0, 0.0009187259067523888, 0.005194046203592575, 0.7170687573164487, 1, 0.0006361354864574483],
[430.26000641344, 1087.509090715561, 1, 1, 0.2834818598081329, 0.002324176044935705, 0.0009195325432562757, -0.007941196817981264, 0.9196380351597221, 0.4866017547759879, 0.001272580661902458],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.880793729742, 1088.054420793947, 0, 1, 0.2832010151794481, 0, 0.0009190716759096535, 0.005196001020546587, 0.7167989848205518, 1, 0.0006359547647709708],
[429.501581046044, 1088.267516082957, 0, 1, 0.2829821623450401, 0, 0.0009188917111110124, 0.005194983583820039, 0.7170178376549599, 1, 0.0006360040976913527],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006362942320077206],
[429.1527099126634, 1088.616387216338, 1, 0, 0.282752304500365, 0.00233017286597936, 0, -0.01317370658571892, 1, 0.282752304500365, 0.0006364705807064639],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.000636005874975562],
[428.8038387792828, 1088.799140955031, 1, 0, 0.2825533716692842, 0.002332068674680703, 0, -0.01318442460065196, 1, 0.2825533716692842, 0.0006361637622722364],
[428.8038387792828, 1088.508589090838, 1, 0, 0.2826074781323728, 0.002332068674680703, 0, -0.01318442460065196, 1, 0.2826074781323729, 0.0006362992354930963],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[428.8220218327753, 1088.780957901539, 0, 1, 0.2825653530990358, 0, 0.0009184583848043682, 0.005192533759730612, 0.7174346469009643, 1, 0.0006364071535892564],
[428.8038387792828, 1088.799140955031, 1, 0, 0.2825533716692842, 0.002332068674680703, 0, -0.01318442460065196, 1, 0.2825533716692842, 0.0006359874605269538],
[428.8038387792828, 1088.799140955031, 0, 1, 0.2825533716692842, 0, 0.0009184430464583746, 0.005192447043902537, 0.7174466283307158, 1, 0.0006363984275200834],
[428.8511049619389, 1088.917646816146, 0, 1, 0.2825536528272404, 0, 0.0009183430931842005, 0.005191881954880398, 0.7174463471727597, 1, 0.0006359856520977407],
[429.1527099126634, 1088.616387216338, 1, 0, 0.282752304500365, 0.00233017286597936, 0, -0.01317370658571892, 1, 0.282752304500365, 0.0006362818005446205],
[429.4849447020381, 1088.284152426963, 1, 0, 0.2829712012943524, 0.002328370324351568, 0, -0.01316351585915962, 1, 0.2829712012943524, 0.0006360087461029601],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.8338158354188, 1088.131683176004, 0, 1, 0.2831644171856005, 0, 0.0009190064175700061, 0.005195632080442899, 0.7168355828143995, 1, 0.0006358314719197795],
[429.8338158354188, 1088.10139868827, 1, 0, 0.2831700666291584, 0.002326480521446212, 0, -0.01315283179818566, 1, 0.2831700666291583, 0.0006359018392332868],
[429.6676984407314, 1088.267516082957, 0, 1, 0.2830606302098053, 0, 0.0009188917111110124, 0.005194983583820039, 0.7169393697901947, 1, 0.000635847992932068],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.000636071172432822],
[429.501581046044, 1088.267516082957, 0, 1, 0.2829821623450401, 0, 0.0009188917111110124, 0.005194983583820039, 0.7170178376549599, 1, 0.0006359507364876463],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006364358920840686],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006362200248214506],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006361802563828563],
[429.2299152321367, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2828228401459862, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7171771598540138, 1, 0.0006362338466575926],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.3657481390903, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2828870227116162, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828870227116163, 0.0006362897815266193],
[429.3657481390903, 1088.569466384598, 1, 0, 0.2828617084780002, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828617084780003, 0.0006361009941593693],
[429.501581046044, 1088.267516082957, 0, 1, 0.2829821623450401, 0, 0.0009188917111110124, 0.005194983583820039, 0.7170178376549599, 1, 0.0006366644746377031],
[429.3657481390903, 1088.569466384598, 1, 0, 0.2828617084780002, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828617084780003, 0.0006361713090782094],
[429.403375617896, 1088.652626222095, 1, 0, 0.2828639886126921, 0.002328812619511982, 0, -0.01316601638894977, 1, 0.282863988612692, 0.0006359071369354699],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.6676984407314, 1088.267516082957, 0, 1, 0.2830606302098053, 0, 0.0009188917111110124, 0.005194983583820039, 0.7169393697901947, 1, 0.0006360152910504525],
[429.1087772812018, 1088.826437242487, 0, 2, 0.2826924187379442, 0, 0.001836840043179986, 0.01038463374415018, 0.5145301661360207, 1, 0.001272979751961162],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.4712965583103, 1088.463917965378, 0, 1, 0.2829312426835513, 0, 0.0009187259067523888, 0.005194046203592575, 0.7170687573164487, 1, 0.0006361034285489365],
[429.3657481390903, 1088.569466384598, 1, 0, 0.2828617084780002, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828617084780003, 0.0006361010484818873],
[429.2146192724709, 1088.886712645905, 0, 1, 0.2827312052549787, 0, 0.0009183691823826946, 0.005192029450995831, 0.7172687947450214, 1, 0.0006362046110588124],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006361156003309348]
],
"NAMES": [
["epi_isl_417689_Reykjavik_20200313_null_1"],
["epi_isl_417520_Taoyuan_20200309_null_1"],
["epi_isl_416374_Shanghai_20200207_null_1"],
["epi_isl_424663_Li_ge_20200405_null_2"],
["epi_isl_422913_Zuid_Holland_20200318_null_5"],
["epi_isl_415503_Noord_Brabant_20200311_null_1"],
["epi_isl_425301_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_424339_Washington_20200324_null_2"],
["epi_isl_416746_ARA_20200303_null_1"],
["epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1"],
["epi_isl_421721_New_York_20200317_null_3"],
["epi_isl_416994_Castilla_y_Le_n_20200304_null_1"],
["epi_isl_427577_New_York_20200315_null_2"],
["epi_isl_422573_Friesland_20200330_null_1"],
["epi_isl_416495_Hauts_de_France_20200310_null_1"],
["epi_isl_428698_Madrid_20200312_null_1"],
["epi_isl_422775_Netherlands_20200327_null_1"],
["epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1"],
["epi_isl_422505_New_York_20200319_null_1"],
["epi_isl_416395_Shanghai_20200209_null_1"],
["epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1"],
["epi_isl_418977_New_York_20200317_null_1"],
["epi_isl_423428_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_427493_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_420070_Dakar_20200317_null_1"],
["epi_isl_424324_Washington_20200324_null_1"],
["epi_isl_427284_Minnesota_20200322_null_2"],
["epi_isl_424369_Reykjavik_20200301_null_3"],
["epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1"],
["epi_isl_426754_Victoria_20200327_null_2"],
["Node27"],
["epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_1"],
["epi_isl_427740_New_South_Wales_20200321_null_3"],
["epi_isl_422925_Zuid_Holland_20200323_null_1"],
["epi_isl_426927_Victoria_20200328_null_2"],
["epi_isl_419675_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1"],
["epi_isl_430341_New_York_20200330_null_1"],
["epi_isl_430380_New_York_20200408_null_1"],
["epi_isl_426070_Idaho_20200328_null_2"],
["epi_isl_427664_New_South_Wales_20200317_null_2"],
["Node412"],
["epi_isl_425279_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_419557_Georgia_20200229_null_1"],
["epi_isl_427140_Victoria_20200406_null_1"],
["epi_isl_425218_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1"],
["epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_1"],
["epi_isl_426902_Northern_territory_20200326_null_1"],
["epi_isl_428924_Chelyabinsk_Region_20200328_null_1"],
["epi_isl_428992_California_20200408_null_8"],
["epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_1"],
["epi_isl_430414_New_York_20200410_null_1"],
["epi_isl_421305_Wisconsin_20200319_null_1"],
["epi_isl_429802_Istria_20200301_null_1"],
["epi_isl_429982_Virginia_20200406_null_1"],
["epi_isl_429565_Unknown_20200324_null_1"],
["epi_isl_430070_St_Petersburg_20200407_null_1"],
["epi_isl_429037_California_20200325_null_1"],
["epi_isl_418390_Finland_20200313_null_1"],
["epi_isl_425146_Wisconsin_20200331_null_1"],
["epi_isl_421631_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_424662_Li_ge_20200405_null_7"],
["epi_isl_428926_Malopolskie_20200328_null_2"],
["epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1"],
["epi_isl_420191_South_Yorkshire_20200327_null_1"],
["epi_isl_426833_Victoria_20200326_null_2"],
["epi_isl_423011_Washington_20200319_null_3"],
["epi_isl_427184_Washington_20200325_null_9"],
["epi_isl_421465_Portugal_20200319_null_1"],
["epi_isl_430109_St_Petersburg_20200415_null_3"],
["epi_isl_430326_New_York_20200330_null_1"],
["epi_isl_428710_Madrid_20200322_null_1"],
["epi_isl_424955_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_425699_Scotland_20200312_null_1"],
["epi_isl_420372_Vorst_20200323_null_1"],
["epi_isl_426022_Scotland_20200331_null_2"],
["Node468"],
["epi_isl_420050_Hauts_de_France_20200319_null_1"],
["epi_isl_428767_New_York_20200405_null_1"],
["epi_isl_417939_California_20200318_null_1"],
["epi_isl_427765_New_South_Wales_20200322_null_1"],
["epi_isl_429452_Unknown_20200310_null_1"],
["epi_isl_427452_Wisconsin_20200410_null_2"],
["epi_isl_429013_California_20200328_null_5"],
["epi_isl_423845_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_423399_England_20200329_null_2"],
["epi_isl_411956_Texas_20200211_null_1"],
["epi_isl_417709_Reykjavik_20200316_null_2"],
["Node488"],
["epi_isl_408483_Shanghai_20200120_null_1"],
["epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1"],
["epi_isl_421574_KZN_20200401_null_1"],
["Node55"],
["epi_isl_429336_Unknown_20200303_null_11"],
["epi_isl_419987_Victoria_20200323_null_1"],
["epi_isl_426817_Victoria_20200325_null_1"],
["epi_isl_427791_New_South_Wales_20200324_null_15"],
["epi_isl_414578_Talca_20200304_null_1"],
["epi_isl_417760_Reykjavik_20200306_null_2"],
["Node51"],
["epi_isl_423177_England_20200324_null_3"],
["epi_isl_424277_Washington_20200323_null_1"],
["epi_isl_427710_New_South_Wales_20200321_null_1"],
["epi_isl_427376_Liege_20200407_null_1"],
["epi_isl_421688_Minnesota_20200316_null_1"],
["epi_isl_426668_Victoria_20200322_null_3"],
["epi_isl_422741_Netherlands_20200325_null_1"],
["epi_isl_416526_Auckland_20200305_null_1"],
["epi_isl_423469_England_20200331_null_1"],
["Node512"],
["epi_isl_430235_Washington_20200320_null_2"],
["epi_isl_427516_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_420287_South_Yorkshire_20200320_null_2"],
["epi_isl_423363_England_20200329_null_1"],
["Node522"],
["epi_isl_428752_Connecticut_20200409_null_1"],
["epi_isl_429416_Unknown_20200310_null_6"],
["epi_isl_420107_Singapore_20200309_null_1"],
["epi_isl_427165_Connecticut_20200330_null_1"],
["epi_isl_418309_Derbyshire_20200325_null_1"],
["epi_isl_426627_Louisiana_20200406_null_1"],
["epi_isl_428794_New_York_20200405_null_1"],
["epi_isl_426028_New_York_20200304_null_1"],
["epi_isl_429394_Unknown_20200309_null_7"],
["Node539"],
["epi_isl_423055_England_20200319_null_1"],
["epi_isl_421728_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_423124_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_430357_New_York_20200403_null_1"],
["Node545"],
["epi_isl_417972_Madrid_20200309_null_1"],
["epi_isl_420102_Singapore_20200305_null_1"],
["epi_isl_424491_Reykjavik_20200320_null_2"],
["epi_isl_427721_New_South_Wales_20200319_null_2"],
["epi_isl_421514_Centre__Val_de_Loire_20200320_null_1"],
["epi_isl_429530_Unknown_20200325_null_2"],
["epi_isl_429581_Unknown_20200324_null_4"],
["epi_isl_418241_Boufarik_20200302_null_1"],
["epi_isl_429463_Unknown_20200323_null_1"],
["epi_isl_429789_Luxembourg_20200331_null_1"],
["epi_isl_423136_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_427695_New_South_Wales_20200322_null_2"],
["epi_isl_429294_Unknown_20200313_null_1"],
["epi_isl_421616_New_York_20200320_null_2"],
["epi_isl_427457_Wisconsin_20200413_null_3"],
["epi_isl_428866_Lipetsk_Region_20200311_null_2"],
["epi_isl_422956_Zuid_Holland_20200327_null_2"],
["epi_isl_426072_Idaho_20200330_null_1"],
["epi_isl_426530_Arizona_20200317_null_1"],
["epi_isl_427773_New_South_Wales_20200325_null_13"],
["epi_isl_421196_Li_ge_20200330_null_1"],
["epi_isl_425908_Scotland_20200323_null_1"],
["epi_isl_428257_Wisconsin_20200329_null_1"],
["epi_isl_427470_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_425863_Scotland_20200319_null_1"],
["epi_isl_426983_Victoria_20200327_null_1"],
["epi_isl_420727_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_422860_Noord_Brabant_20200320_null_1"],
["epi_isl_429438_Unknown_20200310_null_6"],
["epi_isl_425810_Scotland_20200305_null_1"],
["epi_isl_428350_Hauts_De_France_20200324_null_4"],
["epi_isl_419772_Victoria_20200313_null_1"],
["epi_isl_425425_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_428252_Wisconsin_20200325_null_1"],
["epi_isl_429215_Switzerland_20200323_null_6"],
["epi_isl_406844_Victoria_20200125_null_1"],
["epi_isl_421489_Portugal_20200320_null_1"],
["epi_isl_425061_Ghent_20200325_null_9"],
["epi_isl_412967_Guangzhou_20200129_null_1"],
["epi_isl_421893_England_20200327_null_1"],
["Node386"],
["epi_isl_430148_Washington_20200323_null_1"],
["epi_isl_427756_New_South_Wales_20200325_null_1"],
["epi_isl_421312_Wisconsin_20200320_null_1"],
["epi_isl_426676_Victoria_20200322_null_1"],
["epi_isl_418263_Athens_20200318_null_1"],
["epi_isl_414648_California_20200311_null_1"],
["epi_isl_421214_Li_ge_20200330_null_1"],
["epi_isl_423808_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_422954_Zuid_Holland_20200327_null_3"],
["epi_isl_422042_Wales_20200328_null_2"],
["epi_isl_422017_Wales_20200329_null_1"],
["epi_isl_425724_Scotland_20200312_null_3"],
["epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1"],
["epi_isl_430439_Malaysia_20200305_null_1"],
["epi_isl_422046_Wales_20200327_null_1"],
["epi_isl_426867_Victoria_20200326_null_15"],
["Node85"],
["epi_isl_429870_Sakarya_20200322_null_2"],
["Node83"],
["epi_isl_428260_Wisconsin_20200316_null_2"],
["epi_isl_421669_India_20200312_null_1"],
["epi_isl_429644_Washington_20200408_null_2"],
["epi_isl_429782_Luxembourg_20200329_null_1"],
["epi_isl_425331_England_20200329_null_5"],
["epi_isl_420730_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_425576_England_20200324_null_2"],
["Node150"],
["epi_isl_424257_Washington_20200322_null_2"],
["epi_isl_425847_Scotland_20200311_null_1"],
["Node147"],
["epi_isl_425395_England_20200316_null_3"],
["epi_isl_425562_England_20200325_null_1"],
["Node144"],
["epi_isl_420257_Derbyshire_20200325_null_2"],
["epi_isl_425254_England_20200330_null_1"],
["Node141"],
["epi_isl_425436_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_423803_England_20200324_null_6"],
["epi_isl_423804_England_20200324_null_1"],
["Node136"],
["epi_isl_425484_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_425873_Scotland_20200320_null_13"],
["Node131"],
["epi_isl_425247_England_20200330_null_1"],
["Node130"],
["epi_isl_427417_Doha_20200323_null_3"],
["epi_isl_428861_Moscow_20200311_null_1"],
["epi_isl_429229_Abruzzo_20200321_null_3"],
["Node233"],
["epi_isl_429233_Abruzzo_20200324_null_3"],
["epi_isl_430008_Amman_20200404_null_1"],
["epi_isl_422333_Wales_20200324_null_1"],
["epi_isl_422255_Wales_20200323_null_1"],
["epi_isl_422252_Wales_20200325_null_3"],
["epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1"],
["epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1"],
["epi_isl_417242_England_20200303_null_1"],
["epi_isl_422332_Wales_20200326_null_1"],
["epi_isl_423178_England_20200324_null_2"],
["epi_isl_423457_England_20200328_null_2"],
["epi_isl_423461_England_20200330_null_1"],
["Node179"],
["epi_isl_419405_Wales_20200316_null_1"],
["epi_isl_420111_Singapore_20200312_null_1"],
["epi_isl_420718_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_407084_Aichi_20200125_null_1"],
["epi_isl_413871_Guangdong_20200228_null_1"],
["Node189"],
["epi_isl_414010_England_20200226_null_1"],
["epi_isl_426469_Virginia_20200330_null_1"],
["epi_isl_429182_Bangkok_20200328_null_1"],
["epi_isl_422424_Dasman_20200315_null_1"],
["epi_isl_422426_Dasman_20200316_null_1"],
["epi_isl_423153_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_423387_England_20200328_null_2"],
["epi_isl_423454_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_423492_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_423567_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_423569_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_423778_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_423783_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_423825_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_425788_Scotland_20200312_null_1"],
["epi_isl_413596_NSW_20200228_null_1"],
["epi_isl_423467_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_423530_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_423158_England_20200324_null_2"],
["epi_isl_425953_Scotland_20200326_null_1"],
["Node225"],
["epi_isl_420224_South_Yorkshire_20200326_null_14"],
["epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1"],
["epi_isl_430330_New_York_20200330_null_7787"],
["epi_isl_422412_Taipei_20200314_null_1"],
["epi_isl_426882_Victoria_20200324_null_1"],
["epi_isl_428850_Singapore_20200415_null_1"],
["epi_isl_429043_California_20200408_null_31"],
["Node240"],
["epi_isl_417834_Reykjavik_20200316_null_2"],
["epi_isl_427364_Liege_20200407_null_3"],
["epi_isl_428904_Moscow_20200322_null_1"],
["epi_isl_419994_Victoria_20200323_null_1"],
["epi_isl_423579_England_20200331_null_1"],
["Node361"],
["epi_isl_428670_Sri_Lanka_20200316_null_1"],
["epi_isl_416315_Hong_Kong_20200219_null_1"],
["epi_isl_424286_Oregon_20200320_null_1"],
["Node327"],
["epi_isl_417365_Washington_20200314_null_1"],
["epi_isl_426816_Victoria_20200325_null_4"],
["Node319"],
["epi_isl_421707_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_426472_Virginia_20200403_null_1"],
["Node316"],
["epi_isl_422098_Wales_20200327_null_1"],
["epi_isl_424181_USA_20200316_null_1"],
["Node313"],
["epi_isl_417374_Washington_20200315_null_1"],
["epi_isl_419266_Ghent_20200324_null_2"],
["Node310"],
["epi_isl_420694_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_430191_Washington_20200316_null_1"],
["Node307"],
["epi_isl_417500_Minnesota_20200314_null_2"],
["epi_isl_428700_Madrid_20200327_null_1"],
["epi_isl_430124_Washington_20200306_null_5"],
["Node303"],
["epi_isl_417165_Washington_20200308_null_1"],
["epi_isl_422947_Zuid_Holland_20200326_null_1"],
["Node300"],
["epi_isl_417351_Washington_20200312_null_1"],
["epi_isl_421743_Luxembourg_20200317_null_1"],
["Node297"],
["epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_10"],
["epi_isl_424893_Virginia_20200308_null_1"],
["Node291"],
["epi_isl_415594_Washington_20200310_null_1"],
["epi_isl_418928_Washington_20200315_null_1"],
["epi_isl_426096_Washington_20200325_null_1"],
["epi_isl_416702_Washington_20200313_null_1"],
["epi_isl_430295_Washington_20200225_null_889"],
["epi_isl_424849_Arizona_20200309_null_1"],
["epi_isl_418850_British_Columbia_20200313_null_1"],
["epi_isl_429612_Washington_20200326_null_1"],
["epi_isl_418330_Ontario_20200305_null_1"],
["epi_isl_423008_Washington_20200318_null_2"],
["epi_isl_418065_Washington_20200313_null_2"],
["epi_isl_423027_Washington_20200318_null_1"],
["epi_isl_424220_Washington_20200321_null_2"],
["epi_isl_418874_Washington_20200316_null_1"],
["Node263"],
["epi_isl_418341_Ontario_20200312_null_1"],
["epi_isl_428860_Moscow_20200311_null_8"],
["Node294"],
["epi_isl_426878_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_429618_Washington_20200325_null_2"],
["Node323"],
["epi_isl_427800_New_South_Wales_20200324_null_3"],
["epi_isl_419952_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_426325_New_York_20200306_null_1"],
["Node355"],
["epi_isl_418835_British_Columbia_20200311_null_2"],
["epi_isl_427359_Liege_20200406_null_4"],
["Node354"],
["epi_isl_416700_Washington_20200313_null_1"],
["epi_isl_424947_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_430405_New_Jersey_20200410_null_213"],
["epi_isl_428231_New_Taipei_City_20200324_null_1"],
["epi_isl_419819_Victoria_20200317_null_1"],
["epi_isl_421189_Li_ge_20200330_null_3"],
["epi_isl_427349_Liege_20200406_null_1"],
["Node334"],
["epi_isl_427288_Ohio_20200331_null_1"],
["epi_isl_430132_Washington_20200317_null_81"],
["epi_isl_425658_Scotland_20200315_null_1"],
["epi_isl_427732_New_South_Wales_20200317_null_1"],
["Node347"],
["epi_isl_422414_Taipei_20200316_null_1"],
["epi_isl_420355_Ronse_20200306_null_1"],
["epi_isl_418737_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_428761_New_York_20200403_null_1"],
["epi_isl_417420_NanChang_20200323_null_1"],
["epi_isl_427610_New_York_20200316_null_1"],
["epi_isl_430420_New_York_20200413_null_121"],
["Node369"],
["epi_isl_427629_New_York_20200330_null_6"],
["epi_isl_430111_St_Petersburg_20200415_null_3"],
["Node376"],
["epi_isl_420415_Montignies_Sur_Sambre_20200325_null_1"],
["epi_isl_408484_Sichuan_20200115_null_1"],
["epi_isl_430365_New_York_20200408_null_2"],
["epi_isl_425491_England_20200318_null_2"],
["epi_isl_423494_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_426944_Victoria_20200328_null_3"],
["Node102"],
["epi_isl_422713_Netherlands_20200322_null_1"],
["epi_isl_427129_Victoria_20200405_null_1"],
["Node105"],
["epi_isl_429382_Unknown_20200309_null_7"],
["epi_isl_418080_Washington_20200315_null_1"],
["epi_isl_420623_ARA_20200324_null_2"]
],
"RESOLVED": [
[429.3657481390903, 1088.569466384598, 1, 0, 0.2828617084780002, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828617084780003, 0.0006361009946008022],
[429.6224254249297, 1088.176956191805, 0, 1, 0.2830561341824391, 0, 0.0009189681828032912, 0.005195415918970319, 0.7169438658175609, 1, 0.0006361010484983775],
[429.3564547861564, 1088.288207873339, 0, 1, 0.2829097385904281, 0, 0.0009188742400821687, 0.005194884810801479, 0.7170902614095719, 1, 0.0006363854575959709],
[429.3657481390903, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2828870227116162, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828870227116163, 0.0006361713624496054],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006361010489203684],
[429.501581046044, 1088.47896355603, 0, 1, 0.2829427442751806, 0, 0.0009187132075874284, 0.005193974408458611, 0.7170572557248194, 1, 0.0006361582789139564],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006361713095274183],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006361010489232101],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006361582801771255],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006361713090782094],
[429.501581046044, 1088.403348989911, 0, 1, 0.2829568390925974, 0, 0.0009187770332827868, 0.005194335249062138, 0.7170431609074026, 1, 0.0006361010484818873],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006361713624496054],
[429.3354636513566, 1088.599750872332, 0, 1, 0.2828417573710993, 0, 0.0009186112703026674, 0.005193398102769367, 0.7171582426289007, 1, 0.0006361582789139564],
[429.3657481390904, 1088.569466384598, 1, 0, 0.2828617084780002, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828617084780003, 0.0006361010484818873],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006361541359864504],
[429.880793729742, 1088.054420793947, 0, 1, 0.2832010151794481, 0, 0.0009190716759096535, 0.005196001020546587, 0.7167989848205518, 1, 0.0006361582240125677],
[429.5997864741921, 1088.335428049497, 1, 0, 0.2830158905095272, 0.00232774789812442, 0, -0.01315999695264096, 1, 0.2830158905095272, 0.0006363974856332641],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006363516476480189],
[429.3354636513566, 1088.599750872332, 0, 1, 0.2828417573710993, 0, 0.0009186112703026674, 0.005193398102769367, 0.7171582426289007, 1, 0.0006361582240295671],
[429.3807366671583, 1088.690310763484, 0, 1, 0.2828462721780324, 0, 0.0009185348579971408, 0.005192966103363983, 0.7171537278219675, 1, 0.0006361550112573177],
[429.5469111244294, 1088.388303399259, 0, 1, 0.2829810567766664, 0, 0.0009187897342123167, 0.005194407054172152, 0.7170189432233336, 1, 0.0006361582235421924],
[429.501581046044, 1088.403348989911, 0, 1, 0.2829568390925974, 0, 0.0009187770332827868, 0.005194335249062138, 0.7170431609074026, 1, 0.0006361009946008022],
[429.880793729742, 1088.054420793947, 0, 1, 0.2832010151794481, 0, 0.0009190716759096535, 0.005196001020546587, 0.7167989848205518, 1, 0.0006362141199838687],
[429.1527099126635, 1088.616387216338, 1, 0, 0.282752304500365, 0.00233017286597936, 0, -0.01317370658571892, 1, 0.282752304500365, 0.0006361156003309348],
[429.3657481390903, 1088.569466384598, 1, 0, 0.2828617084780002, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828617084780003, 0.0006361010484983775],
[429.6224254249297, 1088.146671704072, 0, 1, 0.2830617820837173, 0, 0.0009189937588413231, 0.005195560513916719, 0.7169382179162826, 1, 0.0006362141757255092],
[429.6374139529976, 1088.297800570691, 1, 0, 0.2830406791029043, 0.002327544034862383, 0, -0.0131588444051897, 1, 0.2830406791029043, 0.00063610004108013],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006361009941593693],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006361500067085848],
[429.3657481390903, 1088.569466384598, 2, 0, 0.2828617084780002, 0.004658033410136182, 0, -0.02633434038629531, 0.9999999999999999, 0.08001074612309333, 0.00127407504719054],
[429.3354636513566, 1088.599750872332, 0, 1, 0.2828417573710993, 0, 0.0009186112703026674, 0.005193398102769367, 0.7171582426289007, 1, 0.0006361009946008022],
[429.6843347847372, 1088.720595251218, 0, 1, 0.2829840224337012, 0, 0.0009185093074952387, 0.005192821652786907, 0.7170159775662988, 1, 0.0006363117882511857],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006361155456921041],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006360163334592904],
[429.6374139529976, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2830153533855779, 0.002327544034862383, 0, -0.0131588444051897, 1, 0.2830153533855779, 0.0006361549582316369],
[429.5197640995365, 1088.415450424152, 0, 1, 0.2829631725977944, 0, 0.0009187668179556832, 0.005194277496384684, 0.7170368274022056, 1, 0.0006361582789139564],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.2295698812202, 1088.871416686239, 0, 1, 0.2827411178038561, 0, 0.0009183820832062048, 0.005192102386212835, 0.7172588821961439, 1, 0.0006364605961953349],
[429.3657481390903, 1088.569466384598, 1, 0, 0.2828617084780002, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828617084780003, 0.0006359854202019411],
[430.001581046044, 1087.933633477645, 0, 1, 0.283280588612587, 0, 0.0009191737154071066, 0.005196577904098545, 0.716719411387413, 1, 0.0006360163330366484],
[429.3354636513566, 1088.599750872332, 0, 1, 0.2828417573710993, 0, 0.0009186112703026674, 0.005193398102769367, 0.7171582426289007, 1, 0.0006362141194980559],
[429.6374139529977, 1088.297800570691, 1, 0, 0.2830406791029043, 0.002327544034862382, 0, -0.0131588444051897, 1, 0.2830406791029043, 0.00063610004108013],
[429.6676984407314, 1088.267516082957, 0, 1, 0.2830606302098053, 0, 0.0009188917111110124, 0.005194983583820039, 0.7169393697901947, 1, 0.0006359070843578407],
[429.690337391469, 1088.079105088449, 0, 1, 0.2831064622630617, 0, 0.0009190508257381811, 0.005195883143437447, 0.7168935377369383, 1, 0.0006366444898931201],
[429.3354636513566, 1088.554420793947, 0, 1, 0.2828502041228457, 0, 0.0009186495235310708, 0.005193614368615691, 0.7171497958771543, 1, 0.0006361155998989773],
[429.2146192724709, 1088.720595251218, 0, 1, 0.2827621463457212, 0, 0.0009185093074952387, 0.005192821652786907, 0.7172378536542787, 1, 0.0006363974860650264],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006361010489232101],
[429.501581046044, 1088.267516082957, 0, 1, 0.2829821623450401, 0, 0.0009188917111110124, 0.005194983583820039, 0.7170178376549599, 1, 0.0006366644170540786],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006361713082094107],
[429.6102669281048, 1088.324947595584, 1, 0, 0.2830227949240323, 0.002327691112110572, 0, -0.01315967591110128, 1, 0.2830227949240323, 0.0006360163846694293],
[429.3657481390904, 1088.569466384598, 1, 0, 0.2828617084780002, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828617084780003, 0.0006361713624496054],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006361582240125677],
[429.501581046044, 1088.421532043403, 0, 1, 0.2829534495801136, 0, 0.0009187616842921136, 0.005194248473054028, 0.7170465504198864, 1, 0.0006363516476480189],
[429.501581046044, 1088.388303399259, 0, 1, 0.2829596438103946, 0, 0.000918789734212317, 0.005194407054172153, 0.7170403561896055, 1, 0.0006363854575931402],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006361010484818873],
[429.5197640995365, 1088.415450424152, 0, 1, 0.2829631725977944, 0, 0.0009187668179556832, 0.005194277496384684, 0.7170368274022056, 1, 0.0006362141749351089],
[429.3657481390903, 1088.569466384598, 1, 0, 0.2828617084780002, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828617084780002, 0.0006361156003309348],
[429.6374139529977, 1088.297800570691, 1, 1, 0.2830406791029043, 0.002327544034862382, 0.0009188661407526609, -0.007964005384205804, 0.9198879739729668, 0.4859693321787754, 0.001272812541055024],
[429.312824700619, 1088.667719901455, 0, 1, 0.2828183972628975, 0, 0.0009185539184449401, 0.005193073862213279, 0.7171816027371025, 1, 0.0006361259953454087],
[429.6374139529977, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2830153533855779, 0.002327544034862382, 0, -0.0131588444051897, 1, 0.2830153533855779, 0.0006360163320990265],
[429.501581046044, 1088.463917965378, 1, 0, 0.2829455487135628, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829455487135628, 0.0006362046098497982],
[429.3657481390903, 1088.569466384598, 1, 0, 0.2828617084780002, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828617084780003, 0.0006361156003280845],
[429.3928951639832, 1088.542319359706, 1, 0, 0.2828795926568723, 0.002328869460259943, 0, -0.0131663377399305, 1, 0.2828795926568723, 0.0006361010475884174],
[429.501581046044, 1088.143081613452, 1, 0, 0.2830053645715674, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2830053645715673, 0.0006371359505008529],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006361156003470182],
[429.6676984407314, 1088.267516082957, 0, 1, 0.2830606302098053, 0, 0.0009188917111110124, 0.005194983583820039, 0.7169393697901947, 1, 0.0006360163334592904],
[429.501581046044, 1088.451816531137, 0, 1, 0.2829478044132154, 0, 0.0009187361211697634, 0.005194103951126847, 0.7170521955867846, 1, 0.0006361582789139564],
[429.4712965583103, 1088.463917965378, 0, 1, 0.2829312426835513, 0, 0.0009187259067523888, 0.005194046203592575, 0.7170687573164487, 1, 0.0006363516476480189],
[429.6374139529977, 1088.297800570691, 1, 0, 0.2830406791029043, 0.002327544034862382, 0, -0.0131588444051897, 1, 0.2830406791029043, 0.0006360163846694293],
[429.501581046044, 1088.143081613452, 1, 0, 0.2830053645715674, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2830053645715673, 0.0006364273689607388],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006363316480929802],
[428.888387089828, 1088.486451764824, 0, 1, 0.2826515743555907, 0, 0.0009187068873284039, 0.005193938676672721, 0.7173484256444094, 1, 0.0006389890991681894],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.3354636513566, 1088.554420793947, 0, 1, 0.2828502041228457, 0, 0.0009186495235310708, 0.005193614368615691, 0.7171497958771543, 1, 0.0006362454701995015],
[429.3657481390903, 1088.569466384598, 1, 0, 0.2828617084780002, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828617084780003, 0.0006362165338275678],
[429.3354636513566, 1088.599750872332, 0, 1, 0.2828417573710993, 0, 0.0009186112703026674, 0.005193398102769367, 0.7171582426289007, 1, 0.0006363974860650264],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006363960319598389],
[429.501581046044, 1088.267516082957, 0, 1, 0.2829821623450401, 0, 0.0009188917111110124, 0.005194983583820039, 0.7170178376549599, 1, 0.0006363316480929802],
[429.6102669281048, 1088.324947595584, 1, 0, 0.2830227949240323, 0.002327691112110572, 0, -0.01315967591110128, 1, 0.2830227949240323, 0.0006360163846694293],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006361582789139564],
[429.3657481390903, 1088.569466384598, 1, 0, 0.2828617084780002, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828617084780003, 0.0006361156003470182],
[429.501581046044, 1088.403348989911, 0, 1, 0.2829568390925974, 0, 0.0009187770332827868, 0.005194335249062138, 0.7170431609074026, 1, 0.0006360973321459372],
[429.2146192724709, 1088.720595251218, 0, 1, 0.2827621463457211, 0, 0.0009185093074952386, 0.005192821652786906, 0.7172378536542789, 1, 0.000636135865795417],
[429.9393642546387, 1087.99585026905, 1, 1, 0.2832396008347095, 0.002325909379648553, 0.0009191211526704909, -0.007953322090832762, 0.9197753285189944, 0.4862545301884135, 0.001274040432155965],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.6374139529977, 1088.297800570691, 1, 0, 0.2830406791029043, 0.002327544034862382, 0, -0.0131588444051897, 1, 0.2830406791029043, 0.0006359152788405444],
[429.4546602143045, 1088.010838797118, 0, 1, 0.2830078578353707, 0, 0.0009191084907808263, 0.005196209154594453, 0.7169921421646293, 1, 0.0006369010056532434],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.0937748935852, 1089.007557024791, 0, 1, 0.2826516029409929, 0, 0.0009182672733071177, 0.005191453304788108, 0.7173483970590071, 1, 0.0006363759226883042],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006358517896748792],
[429.4894796118028, 1088.445734911886, 0, 1, 0.2829432214908933, 0, 0.0009187412545476638, 0.005194132972842463, 0.7170567785091067, 1, 0.0006361010484983775],
[429.4712965583103, 1088.463917965378, 0, 1, 0.2829312426835513, 0, 0.0009187259067523888, 0.005194046203592575, 0.7170687573164487, 1, 0.0006362141757114779],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006361000410773284],
[429.2146192724709, 1088.720595251218, 0, 1, 0.2827621463457212, 0, 0.0009185093074952387, 0.005192821652786907, 0.7172378536542787, 1, 0.0006361009946008022],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.3354636513566, 1088.599750872332, 0, 1, 0.2828417573710993, 0, 0.0009186112703026674, 0.005193398102769367, 0.7171582426289007, 1, 0.0006361244186072916],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.000636135865795417],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006384334858384571],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006361000415099267],
[429.1527099126634, 1088.616387216338, 1, 0, 0.282752304500365, 0.00233017286597936, 0, -0.01317370658571892, 1, 0.282752304500365, 0.0006361009946008022],
[430.1843347847372, 1088.220595251218, 0, 1, 0.2833133153582099, 0, 0.0009189313309854681, 0.005195207576043389, 0.7166866846417901, 1, 0.0006362046098497982],
[429.501581046044, 1088.554420793947, 0, 1, 0.2829286801840366, 0, 0.0009186495235310708, 0.005193614368615691, 0.7170713198159634, 1, 0.0006360992966671452],
[429.6374139529977, 1088.297800570691, 1, 0, 0.2830406791029043, 0.002327544034862382, 0, -0.0131588444051897, 1, 0.2830406791029043, 0.0006360712250516853],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.6091279158347, 1088.326086607854, 0, 1, 0.2830220445545439, 0, 0.0009188422590483401, 0.005194704005007146, 0.7169779554454561, 1, 0.0006360267200699788],
[429.3657481390904, 1088.569466384598, 1, 0, 0.2828617084780002, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828617084780003, 0.0006363032865799967],
[429.880793729742, 1088.054420793947, 0, 1, 0.2832010151794481, 0, 0.0009190716759096535, 0.005196001020546587, 0.7167989848205518, 1, 0.000636354524319265],
[429.380793729742, 1088.554420793947, 0, 1, 0.2828716203573134, 0, 0.0009186495235310708, 0.005193614368615691, 0.7171283796426866, 1, 0.0006360973321459372],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.1527099126634, 1088.616387216338, 1, 0, 0.282752304500365, 0.00233017286597936, 0, -0.01317370658571892, 1, 0.282752304500365, 0.0006362928792298626],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006361466238300721],
[429.501581046044, 1088.724185341837, 0, 1, 0.2828970437433042, 0, 0.0009185062786917148, 0.005192804529349624, 0.7171029562566958, 1, 0.0006360072210267701],
[429.2146192724709, 1088.720595251218, 0, 1, 0.2827621463457211, 0, 0.0009185093074952386, 0.005192821652786906, 0.7172378536542789, 1, 0.0006361009946008022],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006362141749380263],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.000636115599008396],
[429.6676984407314, 1088.267516082957, 0, 1, 0.2830606302098053, 0, 0.0009188917111110124, 0.005194983583820039, 0.7169393697901947, 1, 0.0006359070839374625],
[429.3803913162418, 1088.720595251218, 0, 1, 0.2828404665536139, 0, 0.0009185093074952386, 0.005192821652786906, 0.7171595334463861, 1, 0.0006361582789139564],
[429.4894796118028, 1088.445734911886, 0, 1, 0.2829432214908933, 0, 0.0009187412545476638, 0.005194132972842463, 0.7170567785091067, 1, 0.0006362972152051425],
[429.2146763350546, 1088.720538188634, 0, 1, 0.2827621839379604, 0, 0.0009185093556366233, 0.00519282192495576, 0.7172378160620396, 1, 0.0006368531291496682],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.380793729742, 1088.554420793947, 0, 1, 0.2828716203573134, 0, 0.0009186495235310708, 0.005193614368615691, 0.7171283796426866, 1, 0.000636163831700913],
[429.380793729742, 1088.554420793947, 0, 1, 0.2828716203573134, 0, 0.0009186495235310708, 0.005193614368615691, 0.7171283796426866, 1, 0.0006361010484983775],
[429.501581046044, 1088.554420793947, 0, 1, 0.2829286801840366, 0, 0.0009186495235310708, 0.005193614368615691, 0.7170713198159634, 1, 0.0006361067644152195],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006384659668097613],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006361886093593036],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006359269136326625],
[429.3657481390903, 1088.569466384598, 1, 0, 0.2828617084780002, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828617084780003, 0.0006361009946008022],
[429.880793729742, 1088.054420793947, 0, 1, 0.2832010151794481, 0, 0.0009190716759096535, 0.005196001020546587, 0.7167989848205518, 1, 0.0006362141187053544],
[429.6374139529977, 1088.297800570691, 1, 0, 0.2830406791029043, 0.002327544034862382, 0, -0.0131588444051897, 1, 0.2830406791029043, 0.0006361000410773284],
[429.6374139529977, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2830153533855779, 0.002327544034862382, 0, -0.0131588444051897, 1, 0.2830153533855779, 0.0006360163846694293],
[429.3657481390903, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2828870227116162, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828870227116163, 0.0006361713090810634],
[429.6467073059316, 1088.454279261528, 0, 1, 0.2830158936115278, 0, 0.0009187340424427009, 0.005194092198977127, 0.7169841063884721, 1, 0.0006361582789139564],
[429.501581046044, 1088.403348989911, 0, 1, 0.2829568390925974, 0, 0.0009187770332827868, 0.005194335249062138, 0.7170431609074026, 1, 0.0006361010484983775],
[429.622368362346, 1088.312846161343, 0, 1, 0.2830307672235912, 0, 0.0009188534377106395, 0.005194767203930841, 0.7169692327764088, 1, 0.00063610004108013],
[429.667755503315, 1088.267459020374, 1, 0, 0.2830606678020446, 0.002327379672297249, 0, -0.0131579151761877, 1, 0.2830606678020446, 0.0006359967651500801],
[429.5997864741921, 1088.335428049497, 1, 0, 0.2830158905095272, 0.00232774789812442, 0, -0.01315999695264096, 1, 0.2830158905095272, 0.0006363975402712728],
[429.880793729742, 1088.054420793947, 0, 1, 0.2832010151794481, 0, 0.0009190716759096535, 0.005196001020546587, 0.7167989848205518, 1, 0.0006361582235421924],
[429.501581046044, 1088.308853657223, 0, 1, 0.2829744553245294, 0, 0.0009188568085608566, 0.00519478626114001, 0.7170255446754706, 1, 0.0006360992966671452],
[429.5488472287001, 1088.386367294989, 0, 1, 0.2829823322621103, 0, 0.0009187913686252256, 0.005194416294377638, 0.7170176677378897, 1, 0.000635907136952824],
[429.3354636513566, 1088.554420793947, 0, 1, 0.2828502041228457, 0, 0.0009186495235310708, 0.005193614368615691, 0.7171497958771543, 1, 0.0006361582789139564],
[429.7885428196171, 1088.146671704071, 0, 1, 0.2831402412351834, 0, 0.0009189937588413233, 0.00519556051391672, 0.7168597587648166, 1, 0.0006360992435820197],
[429.501581046044, 1088.267516082957, 0, 1, 0.2829821623450401, 0, 0.0009188917111110124, 0.005194983583820039, 0.7170178376549599, 1, 0.0006361009946008022],
[429.880793729742, 1088.054420793947, 0, 1, 0.2832010151794481, 0, 0.0009190716759096535, 0.005196001020546587, 0.7167989848205518, 1, 0.0006361582240125677],
[429.3657481390903, 1088.569466384598, 1, 0, 0.2828617084780002, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828617084780002, 0.0006361156003280845],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006361010475884174],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006361010484983775],
[429.501581046044, 1088.403348989911, 0, 1, 0.2829568390925974, 0, 0.0009187770332827868, 0.005194335249062138, 0.7170431609074026, 1, 0.0006361582240295671],
[429.3657481390903, 1088.569466384598, 1, 0, 0.2828617084780002, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828617084780003, 0.0006361156003309348],
[429.6374139529976, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2830153533855779, 0.002327544034862383, 0, -0.0131588444051897, 1, 0.2830153533855779, 0.0006360163330366484],
[429.9093871985027, 1087.859709930499, 0, 1, 0.2832508502193882, 0, 0.0009192361762013304, 0.005196931028189993, 0.7167491497806118, 1, 0.0006359967656687241],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006361156003309348],
[429.6467073059316, 1088.57905908195, 0, 1, 0.2829926331234218, 0, 0.0009186287313328875, 0.005193496819260388, 0.7170073668765782, 1, 0.0006362141749380263],
[429.5997864741921, 1088.214640733195, 1, 0, 0.2830384128477477, 0.00232774789812442, 0, -0.01315999695264096, 1, 0.2830384128477477, 0.0006362972152051425],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006361010489203684],
[429.0318655337777, 1088.903348989911, 1, 0, 0.2826417500752186, 0.002330829200194385, 0, -0.01317741719212805, 1, 0.2826417500752185, 0.0006383784835966938],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006361156003309348],
[429.5997864741921, 1088.335428049497, 1, 0, 0.2830158905095272, 0.00232774789812442, 0, -0.01315999695264096, 1, 0.2830158905095272, 0.0006363974856361167],
[429.6676984407314, 1088.267516082957, 0, 1, 0.2830606302098053, 0, 0.0009188917111110124, 0.005194983583820039, 0.7169393697901947, 1, 0.0006366510987517174],
[429.001581046044, 1088.933633477645, 0, 1, 0.2826217989683176, 0, 0.0009183296109666261, 0.005191805732733517, 0.7173782010316824, 1, 0.0006361156532090653],
[429.7885428196171, 1088.146671704072, 0, 1, 0.2831402412351834, 0, 0.0009189937588413231, 0.005195560513916719, 0.7168597587648167, 1, 0.0006360163846694293],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006361550112545146],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006361582240125677],
[429.6374139529977, 1088.297800570691, 1, 0, 0.2830406791029043, 0.002327544034862382, 0, -0.0131588444051897, 1, 0.2830406791029043, 0.0006360163334422663],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.2146192724709, 1088.720595251218, 0, 1, 0.2827621463457212, 0, 0.0009185093074952387, 0.005192821652786907, 0.7172378536542787, 1, 0.0006361503436956405],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 1, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0.0009187514693063176, -0.007968815260317902, 0.9199386219325578, 0.4858410095134625, 0.001272889030024392],
[429.6374139529976, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2830153533855779, 0.002327544034862383, 0, -0.0131588444051897, 1, 0.2830153533855779, 0.0006360163330366484],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006366444898931201],
[429.2146192724709, 1088.720595251218, 0, 1, 0.2827621463457211, 0, 0.0009185093074952386, 0.005192821652786906, 0.7172378536542789, 1, 0.0006361156003309348],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006360163330366484],
[429.0545044845154, 1088.835379960788, 1, 0, 0.2826651056056736, 0.002330706214590249, 0, -0.01317672188909419, 1, 0.2826651056056737, 0.0006361713624496054],
[429.6467073059316, 1088.454279261528, 0, 1, 0.2830158936115278, 0, 0.0009187340424427009, 0.005194092198977127, 0.7169841063884721, 1, 0.0006361582801771255],
[429.3657481390904, 1088.569466384598, 1, 0, 0.2828617084780002, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828617084780003, 0.0006360973321459372],
[429.6374139529977, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2830153533855779, 0.002327544034862382, 0, -0.0131588444051897, 1, 0.2830153533855779, 0.0006361260117510797],
[429.6224254249297, 1088.146671704072, 0, 1, 0.2830617820837173, 0, 0.0009189937588413231, 0.005195560513916719, 0.7169382179162826, 1, 0.0006358985884472741],
[428.6033862821429, 1086.342627665398, 1, 0, 0.2829166071504541, 0.002333159354326042, 0, -0.01319059079279869, 1, 0.2829166071504541, 0.0006367361194314643],
[429.6467073059316, 1088.57905908195, 0, 1, 0.2829926331234218, 0, 0.0009186287313328875, 0.005193496819260388, 0.7170073668765782, 1, 0.0006363728117613291],
[429.501581046044, 1088.403348989911, 0, 1, 0.2829568390925974, 0, 0.0009187770332827868, 0.005194335249062138, 0.7170431609074026, 1, 0.000636135865795417],
[429.5168770057098, 1088.252220123292, 0, 1, 0.2829922402677588, 0, 0.0009189046266192838, 0.005195056602057808, 0.7170077597322412, 1, 0.0006368368209680013],
[429.5714523483204, 1088.833477687635, 0, 1, 0.2829096796584745, 0, 0.0009184140830457462, 0.005192283298325864, 0.7170903203415255, 1, 0.0006363743262542237],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.3281206602848, 1088.607093863404, 1, 0, 0.2828369198846232, 0.002329220826397421, 0, -0.01316832419959058, 1, 0.2828369198846232, 0.0006363405284293612],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.3657481390903, 1088.569466384598, 1, 0, 0.2828617084780002, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828617084780003, 0.0006363335003589396],
[429.6467073059316, 1088.758222730023, 0, 1, 0.2829592415086257, 0, 0.0009184775638181035, 0.005192642188896208, 0.7170407584913743, 1, 0.000635916954969939],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006359070852980946],
[429.380793729742, 1088.554420793947, 0, 1, 0.2828716203573134, 0, 0.0009186495235310708, 0.005193614368615691, 0.7171283796426866, 1, 0.000636171362016523],
[429.501581046044, 1088.599750872332, 0, 1, 0.2829202320132982, 0, 0.0009186112703026674, 0.005193398102769367, 0.7170797679867018, 1, 0.0006366644170540786],
[429.501581046044, 1088.403348989911, 0, 1, 0.2829568390925974, 0, 0.0009187770332827868, 0.005194335249062138, 0.7170431609074026, 1, 0.0006360973844420104],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.3657481390904, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2828870227116163, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828870227116163, 0.0006361500061671893],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.501581046044, 1088.267516082957, 0, 1, 0.2829821623450401, 0, 0.0009188917111110124, 0.005194983583820039, 0.7170178376549599, 1, 0.0006366134536918601],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006359127522373881],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.501581046044, 1088.403348989911, 0, 1, 0.2829568390925974, 0, 0.0009187770332827868, 0.005194335249062138, 0.7170431609074026, 1, 0.0006362138728588969],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.4712965583103, 1088.445734911886, 0, 1, 0.2829346319029973, 0, 0.0009187412545476638, 0.005194132972842463, 0.7170653680970027, 1, 0.0006360667810532248],
[428.5051807026326, 1086.440832790822, 1, 1, 0.2828517827605637, 0.002333694071936938, 0.0009204366863046053, -0.00798989568552699, 0.9199948689891708, 0.4856984345102983, 0.0006367093463876087],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0004443916190585547],
[428.3693485390207, 1086.576667184459, 1, 0, 0.2827621209554771, 0.002334434065860594, 0, -0.01319779741509817, 1, 0.2827621209554771, 0.0006368408291101405],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 0, 0.2829511937904523, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001918014772767603],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.4894796118028, 1088.445734911886, 0, 1, 0.2829432214908933, 0, 0.0009187412545476638, 0.005194132972842463, 0.7170567785091067, 1, 0.0006362083238779698],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.5037713903124, 1086.196052628942, 0.5, 1.25, 0.2833699421112134, 0.001164134131771393, 0.001150805139619685, -7.53558820693547e-05, 0.7512923354833254, 0.4418302644238782, 0.0006365564354451944],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.403375617896, 1088.652626222095, 1, 0, 0.282863988612692, 0.002328812619511982, 0, -0.01316601638894977, 1, 0.282863988612692, 0.0006360152980532446],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006359998463627487],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.1693462566693, 1088.765868267019, 0, 1, 0.2827323209517462, 0, 0.0009184711140804704, 0.005192605725098875, 0.7172676790482538, 1, 0.0006363794727322784],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.3354636513566, 1088.599750872332, 0, 1, 0.2828417573710993, 0, 0.0009186112703026674, 0.005193398102769367, 0.7171582426289007, 1, 0.000636028397327172],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006360905696376442],
[428.6478224066278, 1086.14291650699, 0, 2, 0.282974942607615, 0, 0.001841378302619652, 0.01041029093857592, 0.514124932928553, 1, 0.001276003807460605],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.000636223885522769],
[429.3657481390903, 1088.569466384598, 1, 0, 0.2828617084780002, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828617084780003, 0.0006363470801074881],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006363733629292577],
[429.9712965583103, 1087.963917965378, 1, 1, 0.283260637505686, 0.002325736643363089, 0.000919148129351678, -0.00795219300720878, 0.9197634112398723, 0.4862846862512443, 0.001273415241737466],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006361993297604468],
[429.403375617896, 1088.652626222095, 1, 0, 0.2828639886126921, 0.002328812619511982, 0, -0.01316601638894977, 1, 0.282863988612692, 0.0006361068158463651],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006360430340019078],
[430.3686922955008, 1087.566522228188, 1, 0, 0.2835224377020238, 0.002323589094425525, 0, -0.01313648502334304, 1, 0.2835224377020238, 0.0006359688533219635],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[430.26000641344, 1087.675208110249, 1, 0, 0.2834508365684439, 0.002324176044935705, 0, -0.01313980336676483, 1, 0.2834508365684439, 0.0006360716462086056],
[429.880793729742, 1088.054420793947, 0, 1, 0.2832010151794481, 0, 0.0009190716759096535, 0.005196001020546587, 0.7167989848205518, 1, 0.0006362755543696724],
[429.501581046044, 1088.373064502177, 1, 0, 0.2829624846200116, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829624846200116, 0.0006364060560584225],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.501581046044, 1088.403348989911, 0, 1, 0.2829568390925974, 0, 0.0009187770332827868, 0.005194335249062138, 0.7170431609074026, 1, 0.0006362143895290421],
[429.2299152321367, 1088.705299291552, 1, 0, 0.2827722231655481, 0.00232975373922663, 0, -0.01317133703926024, 1, 0.2827722231655481, 0.0006363749364372868],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.3657481390903, 1088.569466384598, 1, 0, 0.2828617084780002, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828617084780002, 0.0006361616732092791],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006363398332828656],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006361559137158672],
[429.2299152321367, 1088.705299291552, 1, 0, 0.2827722231655482, 0.00232975373922663, 0, -0.01317133703926024, 1, 0.2827722231655482, 0.000636052461897428],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.3657481390903, 1088.569466384598, 1, 0, 0.2828617084780002, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828617084780003, 0.000636443516954369],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[428.8038387792828, 1088.799140955031, 1, 0, 0.2825533716692842, 0.002332068674680703, 0, -0.01318442460065196, 1, 0.2825533716692843, 0.0006362646042257221],
[429.1527099126634, 1088.616387216338, 1, 0, 0.282752304500365, 0.00233017286597936, 0, -0.01317370658571892, 1, 0.282752304500365, 0.0006362568567413404],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006364516865923072],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006363910061921048],
[429.2299152321367, 1088.651005241766, 1, 0, 0.2827823378253712, 0.00232975373922663, 0, -0.01317133703926024, 1, 0.2827823378253712, 0.0006363317900338615],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.3657481390903, 1088.542319359706, 1, 0, 0.2828667673178639, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.282866767317864, 0.000636273426265137],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006359668521381238],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006360373515590671],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006361789240441113],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.000636706904886956],
[429.6374139529976, 1088.297800570691, 1, 0, 0.2830406791029043, 0.002327544034862383, 0, -0.0131588444051897, 1, 0.2830406791029043, 0.0006361109808473636],
[429.5318655337777, 1088.403348989911, 0, 1, 0.2829711448973533, 0, 0.0009187770332827868, 0.005194335249062138, 0.7170288551026467, 1, 0.0006361741033404117],
[429.403375617896, 1088.652626222095, 1, 0, 0.282863988612692, 0.002328812619511982, 0, -0.01316601638894977, 1, 0.282863988612692, 0.0006362890702652627],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.5469111244294, 1088.388303399259, 0, 1, 0.2829810567766665, 0, 0.000918789734212317, 0.005194407054172153, 0.7170189432233335, 1, 0.0006361867116053395],
[429.5197640995365, 1088.415450424152, 0, 1, 0.2829631725977944, 0, 0.0009187668179556832, 0.005194277496384684, 0.7170368274022056, 1, 0.0006366112015707018],
[429.5136824802852, 1088.421532043403, 0, 1, 0.2829591660900112, 0, 0.0009187616842921136, 0.005194248473054028, 0.7170408339099887, 1, 0.0006359874605434353],
[429.6676984407314, 1088.267516082957, 0, 1, 0.2830606302098053, 0, 0.0009188917111110124, 0.005194983583820039, 0.7169393697901947, 1, 0.0006359855992846901],
[429.2146192724709, 1088.720595251218, 0, 1, 0.2827621463457211, 0, 0.0009185093074952386, 0.005192821652786906, 0.7172378536542789, 1, 0.0006363984275200834],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006359874609597381],
[429.9712965583103, 1087.963917965378, 0, 1, 0.283260637505686, 0, 0.000919148129351678, 0.005196433252518474, 0.716739362494314, 1, 0.0006363984275229393],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.00063633308616259],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006360951285154676],
[429.4410120705766, 1088.494202453112, 1, 0, 0.2829112915766503, 0.002328608521059593, 0, -0.01316486251184236, 1, 0.2829112915766503, 0.0006364225670086767],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.4712965583103, 1088.463917965378, 0, 1, 0.2829312426835513, 0, 0.0009187259067523888, 0.005194046203592575, 0.7170687573164487, 1, 0.0006361354864574483],
[430.26000641344, 1087.509090715561, 1, 1, 0.2834818598081329, 0.002324176044935705, 0.0009195325432562757, -0.007941196817981264, 0.9196380351597221, 0.4866017547759879, 0.001272580661902458],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.880793729742, 1088.054420793947, 0, 1, 0.2832010151794481, 0, 0.0009190716759096535, 0.005196001020546587, 0.7167989848205518, 1, 0.0006359547647709708],
[429.501581046044, 1088.267516082957, 0, 1, 0.2829821623450401, 0, 0.0009188917111110124, 0.005194983583820039, 0.7170178376549599, 1, 0.0006360040976913527],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006362942320077206],
[429.1527099126634, 1088.616387216338, 1, 0, 0.282752304500365, 0.00233017286597936, 0, -0.01317370658571892, 1, 0.282752304500365, 0.0006364705807064639],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.000636005874975562],
[428.8038387792828, 1088.799140955031, 1, 0, 0.2825533716692842, 0.002332068674680703, 0, -0.01318442460065196, 1, 0.2825533716692842, 0.0006361637622722364],
[428.8038387792828, 1088.508589090838, 1, 0, 0.2826074781323728, 0.002332068674680703, 0, -0.01318442460065196, 1, 0.2826074781323729, 0.0006362992354930963],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[428.8220218327753, 1088.780957901539, 0, 1, 0.2825653530990358, 0, 0.0009184583848043682, 0.005192533759730612, 0.7174346469009643, 1, 0.0006364071535892564],
[428.8038387792828, 1088.799140955031, 1, 0, 0.2825533716692842, 0.002332068674680703, 0, -0.01318442460065196, 1, 0.2825533716692842, 0.0006359874605269538],
[428.8038387792828, 1088.799140955031, 0, 1, 0.2825533716692842, 0, 0.0009184430464583746, 0.005192447043902537, 0.7174466283307158, 1, 0.0006363984275200834],
[428.8511049619389, 1088.917646816146, 0, 1, 0.2825536528272404, 0, 0.0009183430931842005, 0.005191881954880398, 0.7174463471727597, 1, 0.0006359856520977407],
[429.1527099126634, 1088.616387216338, 1, 0, 0.282752304500365, 0.00233017286597936, 0, -0.01317370658571892, 1, 0.282752304500365, 0.0006362818005446205],
[429.4849447020381, 1088.284152426963, 1, 0, 0.2829712012943524, 0.002328370324351568, 0, -0.01316351585915962, 1, 0.2829712012943524, 0.0006360087461029601],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.8338158354188, 1088.131683176004, 0, 1, 0.2831644171856005, 0, 0.0009190064175700061, 0.005195632080442899, 0.7168355828143995, 1, 0.0006358314719197795],
[429.8338158354188, 1088.10139868827, 1, 0, 0.2831700666291584, 0.002326480521446212, 0, -0.01315283179818566, 1, 0.2831700666291583, 0.0006359018392332868],
[429.6676984407314, 1088.267516082957, 0, 1, 0.2830606302098053, 0, 0.0009188917111110124, 0.005194983583820039, 0.7169393697901947, 1, 0.000635847992932068],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.000636071172432822],
[429.501581046044, 1088.267516082957, 0, 1, 0.2829821623450401, 0, 0.0009188917111110124, 0.005194983583820039, 0.7170178376549599, 1, 0.0006359507364876463],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006364358920840686],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006362200248214506],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2829511937904523, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7170488062095477, 1, 0.0006361802563828563],
[429.2299152321367, 1088.433633477645, 0, 1, 0.2828228401459862, 0, 0.0009187514693063176, 0.005194190722306168, 0.7171771598540138, 1, 0.0006362338466575926],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.3657481390903, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2828870227116162, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828870227116163, 0.0006362897815266193],
[429.3657481390903, 1088.569466384598, 1, 0, 0.2828617084780002, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828617084780003, 0.0006361009941593693],
[429.501581046044, 1088.267516082957, 0, 1, 0.2829821623450401, 0, 0.0009188917111110124, 0.005194983583820039, 0.7170178376549599, 1, 0.0006366644746377031],
[429.3657481390903, 1088.569466384598, 1, 0, 0.2828617084780002, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828617084780003, 0.0006361713090782094],
[429.403375617896, 1088.652626222095, 1, 0, 0.2828639886126921, 0.002328812619511982, 0, -0.01316601638894977, 1, 0.282863988612692, 0.0006359071369354699],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.6676984407314, 1088.267516082957, 0, 1, 0.2830606302098053, 0, 0.0009188917111110124, 0.005194983583820039, 0.7169393697901947, 1, 0.0006360152910504525],
[429.1087772812018, 1088.826437242487, 0, 2, 0.2826924187379442, 0, 0.001836840043179986, 0.01038463374415018, 0.5145301661360207, 1, 0.001272979751961162],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.4712965583103, 1088.463917965378, 0, 1, 0.2829312426835513, 0, 0.0009187259067523888, 0.005194046203592575, 0.7170687573164487, 1, 0.0006361034285489365],
[429.3657481390903, 1088.569466384598, 1, 0, 0.2828617084780002, 0.002329016705068091, 0, -0.01316717019314765, 1, 0.2828617084780003, 0.0006361010484818873],
[429.2146192724709, 1088.886712645905, 0, 1, 0.2827312052549787, 0, 0.0009183691823826946, 0.005192029450995831, 0.7172687947450214, 1, 0.0006362046110588124],
[429.501581046044, 1088.433633477645, 1, 0, 0.2829511937904523, 0.002328280137094063, 0, -0.01316300598262407, 1, 0.2829511937904523, 0.0006361156003309348]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 2.826765940427789, 0.6666666666666666, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 1.844972724468281, 0, 0, 0.2372667046045239, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.4188962716144, 0, 0, 0.4134116918261187, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 13, 0, 0.3333333333333334, 13.00000000000001, 0, -73.4959144511225, 0.9999999999999994, 6.272254748918016e-07, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 2.094532365312225, 0, 0, 0.2150770205595732, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2295246504732971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.3778660235494306, 2.290589888908913, 1, 0, 0.1416047466946221, 2.646440636833772, 0, -14.96173651113146, 1, 0.1416047466946222, 0.1768805803300194],
[1.000434659965273, 1.998967839499972, 0, 1, 0.3335446510242082, 0, 0.5002581733631809, 2.828225531767318, 0.6664553489757918, 1, 0.1768805803300194],
[0.9757971315175266, 2.024202868482472, 0, 0, 0.3252657105058424, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9985325880069097, 2.001467411993088, 0, 2, 0.3328441960023034, 0, 0.9992668319332628, 5.64938689181625, 0.4450968668078129, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.998954576256308, 2, 0, 0.3334495320193653, 2.000000000000001, 0, -11.30706376171115, 0.9999999999999999, 0.1111885904039338, 0.1768805803300194],
[1.24133558648437, 1.426864005546809, 1, 0, 0.4652334068979441, 0.8055839298316864, 0, -4.554394430008358, 1, 0.4652334068979441, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333334, 2.000000000000001, 0, -11.30706376171115, 1, 0.111111111111111, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.3775126908500573, 1.68305628461739, 0, 0, 0.1832079854373315, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9394310245325503, 2.060460065860952, 0, 1, 0.3131550433750324, 0, 0.4853285033612896, 2.743820166440972, 0.6868449566249677, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6683624964924306, 2.331637503507566, 0, 1, 0.2227874988308105, 0, 0.4288831340616474, 2.424704471578778, 0.7772125011691895, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -5.653531880855577, 1, 0.3333333333333334, 0.1768805803300194],
[0.9389424858511363, 2.061057514148863, 1, 0, 0.3129808286170456, 1.065027959719509, 0, -6.021169524276812, 1, 0.3129808286170456, 0.1768805803300194],
[0.9995655745170956, 2.000434425482903, 0, 1, 0.3331885248390321, 0, 0.4998914172148388, 2.826152064190166, 0.6668114751609679, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 2.094532365312225, 0, 0, 0.2150770205595732, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9405212573261321, 2.058280383714895, 0, 1, 0.3136323671610478, 0, 0.4858424575738055, 2.74672582296673, 0.6863676328389523, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 2.094532365312225, 0, 0, 0.2150770205595732, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 1.844972724468281, 0, 0, 0.2372667046045239, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 2.826765940427789, 0.6666666666666666, 1, 0.1768805803300194],
[1.241335697347603, 1.426863758327852, 1, 0, 0.4652334722230722, 0.8055838578852832, 0, -4.554394023257074, 1, 0.4652334722230722, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2295246504732971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.938942542701647, 2.061057457298352, 1, 0, 0.3129808475672158, 1.065027895234857, 0, -6.021169159710774, 1, 0.3129808475672158, 0.1768805803300194],
[0.426076452853881, 2.573923547146118, 0, 0, 0.1420254842846271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 2.826765940427789, 0.6666666666666666, 1, 0.1768805803300194],
[0.9998910474873405, 1.99906236482159, 1, 1, 0.3334133312586247, 1.000108964384603, 0.5002345187411132, -2.826056114870476, 0.8888355505390266, 0.5556622130562761, 0.1768805803300194],
[0.426076452853881, 2.573923547146118, 0, 0, 0.1420254842846271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 2, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 1.000000000000001, 0, 0.7407407407407406, 0.7037037037037037, 0.1768805803300194],
[0.3778660235190967, 2.290141154794094, 1, 1, 0.1416285632926959, 2.646440637046219, 0.4366543074895791, -12.49309746402729, 0.9799413500596468, 0.2631984766450387, 0.1768805803300194],
[0.9394310245325503, 2.060568975467449, 0, 0, 0.3131436748441835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.001363853889071634, 2.998636146110928, 0, 1, 0.000454617963023878, 0, 0.3334849415781728, 1.885367748997458, 0.9995453820369761, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -5.653531880855577, 1, 0.3333333333333334, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2503088382611962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6684559124583433, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2505028879575985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6684559124583433, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2505028879575985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9757971315175266, 2.024202868482472, 0, 0, 0.3252657105058424, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.002043362532696683, 2.997359975821078, 0, 2, 0.000681256337408154, 0, 0.6672538554372777, 3.772340944338445, 0.998637951435381, 1, 0.1768805803300194],
[0.9994025519607358, 2.00043441654878, 0, 2, 0.3331522887583102, 0, 0.999782838894799, 5.652304153624038, 0.4446858699882802, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 2.094532365312225, 0, 0, 0.2150770205595732, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.00136397372394127, 2.998636026276059, 0, 1, 0.0004546579079804232, 0, 0.3334849549052735, 1.885367824342647, 0.9995453420920196, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2503088382611962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5763792778721161, 1.485879171779915, 0, 1, 0.2794893520593258, 0, 0.6730022326123014, 3.804839577960625, 0.7205106479406742, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -5.653531880855577, 1, 0.3333333333333334, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9394310245325503, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3195962132440056, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.937965529331148, 2.062034470668851, 1, 0, 0.3126551764437162, 1.066137260623094, 0, -6.027440992300687, 1, 0.3126551764437162, 0.1768805803300194],
[0.002727846694484912, 2.997272153305516, 0, 2, 0.0009092822314949706, 0, 0.6672734065187632, 3.772451477000929, 0.9981822623311866, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9754062734408064, 2.024593726559192, 1, 0, 0.325135424480269, 1.025213828564417, 0, -5.796079064482933, 1, 0.325135424480269, 0.1768805803300194],
[0.9999127011221987, 2.000087298877799, 1, 1, 0.3333042337073998, 1.000087306499561, 0.4999781762331454, -2.827382911868132, 0.888908287792723, 0.5555167552075226, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 2.826765940427789, 0.6666666666666666, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 1.844972724468281, 0, 0, 0.2372667046045239, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 1.844972724468281, 0, 0, 0.2372667046045239, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.426076452853881, 2.573923547146118, 0, 0, 0.1420254842846271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6680200486128653, 2.001032069815971, 0, 1, 0.2502836284089132, 0, 0.4997421156233478, 2.825307982882809, 0.7497163715910868, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0, 2.244974618299884, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.7588161734507731, 2.241183826549227, 1, 0, 0.2529387244835911, 1.317842232397901, 0, -7.450463074799415, 1, 0.252938724483591, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9394310245325503, 2.060568975467449, 0, 0, 0.3131436748441835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999564732703791, 2.000043526729619, 1, 1, 0.3333188244234599, 1.00004352862428, 0.499989118554412, -2.827073549492423, 0.8888985612849627, 0.5555362101318826, 0.1768805803300194],
[0.3775126908500573, 2.041383580764342, 0, 0, 0.1560681602101528, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.998954786734009, 2, 0, 0.333449508616648, 2.000000000000001, 0, -11.30706376171115, 1, 0.111188574796684, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2295246504732971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9995656250702393, 2.000434374929759, 0, 1, 0.33318854169008, 0, 0.4998914298476365, 2.82615213561009, 0.6668114583099201, 1, 0.1768805803300194],
[0.6684546697993141, 2.000597731960533, 0, 1, 0.2504464391027192, 0, 0.4998506116569603, 2.825921368667784, 0.7495535608972808, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 1.844972724468281, 0, 0, 0.2372667046045239, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333334, 2.000000000000001, 0, -11.30706376171115, 1, 0.111111111111111, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[1.241688757771356, 1.426076452853881, 0, 0, 0.4654415436658105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[1.241688757771356, 1.426076452853881, 0, 0, 0.4654415436658105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.3775126908500573, 1.68305628461739, 0, 0, 0.1832079854373315, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[1.938176379336145, 1.061226212706182, 1, 0, 0.6461874722914136, 0.5159489150014899, 0, -2.916933639853765, 1, 0.6461874722914136, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999475994927928, 0.75, 0, 0.3333915662905739, 0.7500000000000004, 0, -4.240148910641683, 1, 0.2622603880815635, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.331636865995866, 0, 1, 0.2226327759889702, 0, 0.4288832513260549, 2.424705134536845, 0.7773672240110298, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9989680231190911, 2.001031976880907, 0, 1, 0.3329893410396972, 0, 0.4997421388331545, 2.825308114100191, 0.6670106589603028, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -5.653531880855577, 1, 0.3333333333333334, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9394310245325503, 2.060568975467449, 0, 0, 0.3131436748441835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[1.939431024532551, 1.060568975467449, 0, 0, 0.6464770081775171, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 1.000000000000001, 5.653531880855577, 0.4444444444444444, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 2.826765940427789, 0.6666666666666666, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 2.826765940427789, 0.6666666666666666, 1, 0.1768805803300194],
[0.6682536302936872, 2.000434381370819, 1, 1, 0.2504053030451042, 1.496437811434732, 0.4998914282380706, -5.634006748153642, 0.9372971842068897, 0.4381077902970978, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9989679994235208, 2.001032000576477, 0, 1, 0.3329893331411738, 0, 0.4997421329153707, 2.825308080643812, 0.6670106668588262, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.331637178515832, 0, 2, 0.2226327527919535, 0, 0.8577663876817531, 4.849409619085113, 0.6042998370318161, 1, 0.1768805803300194],
[0.6683625253564304, 2.331637474643566, 0, 1, 0.2227875084521437, 0, 0.4288831393709129, 2.42470450159488, 0.7772124915478562, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6684559124583433, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2505028879575985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6679282421015309, 2.332071757898465, 0, 1, 0.2226427473671772, 0, 0.4288032718603586, 2.424252968077717, 0.7773572526328227, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 2.094532365312225, 0, 0, 0.2150770205595732, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999891090393505, 0, 1, 0.333345434840045, 0, 0.5000272288843673, 2.826919879793638, 0.666654565159955, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.4188962716144, 0, 0, 0.4134116918261187, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6682536302936872, 2.331746369706309, 1, 0, 0.222751210097896, 1.496437811434732, 0, -8.460158874664, 1, 0.222751210097896, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 1.486645428321329, 0, 0, 0.278526734110379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.668253694536429, 2.331746305463567, 1, 0, 0.2227512315121433, 1.496437667574296, 0, -8.460158061344437, 1, 0.2227512315121433, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 2.094532365312225, 0, 0, 0.2150770205595732, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9389425398477401, 2.060948544584542, 1, 1, 0.3129922098573226, 1.065027898471999, 0.4852134725185901, -3.277999342107571, 0.9020358765686298, 0.528020296283275, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -5.653531880855577, 1, 0.3333333333333334, 0.1768805803300194],
[0.4271082924680759, 2.572891707531924, 0, 1, 0.142369430822692, 0, 0.3886677379668115, 2.197345447655389, 0.8576305691773081, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9988044810827106, 2.001195518917287, 1, 1, 0.3329348270275704, 1.00119694989353, 0.4997012988221325, -2.835221651442569, 0.8891544009521217, 0.5550240550072625, 0.1768805803300194],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9389425022513872, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3194831139200945, 1.065027941116958, 0, -6.021169419106696, 1, 0.3194831139200944, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 2.094532365312225, 0, 0, 0.2150770205595732, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.419941005204512, 0, 1, 0.4132332143012257, 0, 0.7042546108146031, 3.981525894479893, 0.5867667856987744, 1, 0.1768805803300194],
[0.9982073623921557, 2.001792637607842, 0, 1, 0.3327357874640521, 0, 0.4995522419320154, 2.824234525915525, 0.6672642125359478, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 2.826765940427789, 0.6666666666666666, 1, 0.1768805803300194],
[0, 2.244974618299884, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6687426487766512, 2.331257351223345, 1, 0, 0.222914216258884, 1.49534354034295, 0, -8.453972378160312, 1, 0.222914216258884, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9994025920427321, 2.00043438740435, 0, 1, 0.3331523009050105, 0, 0.499891426730343, 2.826152117986372, 0.6668476990949894, 1, 0.1768805803300194],
[0.426076452853881, 2.573923547146118, 0, 0, 0.1420254842846271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.3775126908500573, 2.290943221608287, 0, 0, 0.1414723357757369, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.7584253673959539, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2528084557986513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 1.486645428321329, 0, 0, 0.278526734110379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.001363853888063201, 2.998636146111937, 0, 1, 0.0004546179626877334, 0, 0.3334849415780606, 1.885367748996824, 0.9995453820373122, 1, 0.1768805803300194],
[1.241688757771356, 1.426076452853881, 0, 0, 0.4654415436658105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9379651032655679, 2.062034896734431, 1, 0, 0.3126550344218561, 1.066137744910183, 0, -6.027443730233189, 1, 0.3126550344218562, 0.1768805803300194],
[0.9989679665458945, 2.001032033454104, 0, 1, 0.332989322181965, 0, 0.49974212470444, 2.825308034223053, 0.6670106778180349, 1, 0.1768805803300194],
[0.9988044810827106, 2.001195518917287, 0, 1, 0.3329348270275704, 0, 0.4997012988221325, 2.825077223795864, 0.6670651729724296, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 2.094532365312225, 0, 0, 0.2150770205595732, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9996731551870933, 2.000326844812905, 1, 1, 0.3332243850623646, 1.000326951675366, 0.4999183021480334, -2.829076253558658, 0.888961509199809, 0.5554102793245381, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9389425286728583, 2.06105747132714, 1, 0, 0.3129808428909529, 1.065027911147494, 0, -6.021169249673372, 1, 0.3129808428909528, 0.1768805803300194],
[0.6684559124583433, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2505028879575985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -5.653531880855577, 1, 0.3333333333333334, 0.1768805803300194],
[1.000707668086203, 1.998545630083286, 0, 1.75, 0.333652268948727, 0, 0.8756367498734927, 4.950440281458548, 0.4914469178636927, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9998910710245041, 2.000108928975494, 0, 1, 0.3332970236748349, 0, 0.4999727692392359, 2.826611990453667, 0.6667029763251651, 1, 0.1768805803300194],
[1.241688757771356, 1.426076452853881, 0, 0, 0.4654415436658105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0, 2.244974618299884, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6700413651142245, 2.328267311386182, 1, 1, 0.2234731101456471, 1.492445171395539, 0.4295039470380356, -6.009372099380805, 0.9500597690418313, 0.3970059893331257, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.3775126908500573, 2.041383580764342, 0, 0, 0.1560681602101528, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[1.045631178473439, 1.863274153330953, 1, 0, 0.3594586482554365, 0.9563601589041582, 0, -5.40681264794476, 1, 0.3594586482554365, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.001797869307783774, 2.998202130692216, 0, 1, 0.0005992897692612579, 0, 0.3335332163776172, 1.885640672115159, 0.9994007102307387, 1, 0.1768805803300194],
[0.3775126908500573, 2.290943221608287, 0, 0, 0.1414723357757369, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6682537144802336, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2504460917092389, 1.496437622913623, 0, -8.4601578088539, 1, 0.2504460917092389, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -5.653531880855577, 1, 0.3333333333333334, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 2.094532365312225, 0, 0, 0.2150770205595732, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.4275427720704941, 2.571859931575404, 0, 1, 0.1425426374227103, 0, 0.3888236632651474, 2.198226976300563, 0.8574573625772897, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.4188962716144, 0, 0, 0.4134116918261187, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 2.826765940427789, 0.6666666666666666, 1, 0.1768805803300194],
[0.3783883401101524, 2.041553265629869, 1, 1, 0.1563625912346925, 2.642787565042017, 0.4898231247919341, -12.17185310130222, 0.9755507400623724, 0.2882759225317575, 0.1768805803300194],
[0.9998910962605799, 2.000043517045847, 0, 2, 0.3333042966421637, 0, 0.9999782419504993, 5.653408871029057, 0.4444831608758001, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999564806097146, 2.000043519390283, 1, 1, 0.3333188268699051, 1.000043521284305, 0.4999891203891662, -2.827073497622802, 0.8888985596540702, 0.5555362133938804, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2295246504732971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.241737664094529, 0, 1, 0.2295117892569724, 0, 0.4460825260764466, 2.521941782665778, 0.7704882107430276, 1, 0.1768805803300194],
[1.938176408143816, 1.061226197615481, 1, 0, 0.6461874789407165, 0.5159489073327933, 0, -2.916933596498545, 1, 0.6461874789407165, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2295246504732971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6683624227547433, 2.331637577245253, 0, 1, 0.2227874742515814, 0, 0.4288831204982828, 2.424704394897864, 0.7772125257484186, 1, 0.1768805803300194],
[0.6684559124583433, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2505028879575985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0.5000000000000003, -2.826765940427789, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.1768805803300194],
[0.9989675405795275, 2.00103245942047, 0, 2, 0.332989180193176, 0, 0.9994840366453778, 5.650614865580864, 0.4449034337393714, 1, 0.1768805803300194],
[0.9394310245325503, 2.024268264581883, 0, 1, 0.3169791982550486, 0, 0.4940056698495702, 2.792876803817958, 0.6830208017449515, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.331636913858107, 0, 1, 0.2226327724363611, 0, 0.4288832425222341, 2.424705084764163, 0.777367227563639, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 2.826765940427789, 0.6666666666666666, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.939539951870233, 1, 0, 0.3401892868861219, 1.000000000000001, 0, -5.653531880855577, 1, 0.3401892868861218, 0.1768805803300194],
[0.9389425286728562, 2.061057471327143, 1, 0, 0.3129808428909522, 1.065027911147496, 0, -6.021169249673386, 1, 0.3129808428909522, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.000434376271281, 0, 1, 0.2502680886034994, 0, 0.4998914295124015, 2.826152133714829, 0.7497319113965006, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 2, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 1.000000000000001, 0, 0.7407407407407406, 0.7037037037037037, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2295246504732971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0, 2.244974618299884, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6682536302543481, 2.331746369745648, 1, 0, 0.222751210084783, 1.496437811522825, 0, -8.460158875162037, 1, 0.222751210084783, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.7588597441755774, 2.241140255824423, 0, 1, 0.2529532480585258, 0, 0.4462014358098, 2.522614042634236, 0.7470467519414742, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.4188962716144, 0, 0, 0.4134116918261187, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6719456791153197, 2.328054320884677, 0, 1, 0.2239818930384402, 0, 0.4295432417659366, 2.428436411529776, 0.7760181069615598, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9379652215823704, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3192567477286842, 1.066137610425443, 0, -6.027442969919424, 1, 0.3192567477286843, 0.1768805803300194],
[0.9994551852686899, 2.000544814731308, 0, 1, 0.3331517284228969, 0, 0.4998638334099551, 2.825996118269861, 0.6668482715771031, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2503088382611962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 4, 1, 0.3333333333333334, 4.000000000000003, 0.5000000000000003, -19.78736158299452, 0.9958847736625515, 0.04526748971193417, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.001363853889071634, 2.998636146110929, 0, 1, 0.0004546179630238779, 0, 0.3334849415781727, 1.885367748997457, 0.9995453820369761, 1, 0.1768805803300194],
[0.7588161734507731, 2.241183826549227, 1, 0, 0.2529387244835911, 1.317842232397901, 0, -7.450463074799415, 1, 0.252938724483591, 0.1768805803300194],
[0.6682536945364269, 2.331746305463569, 1, 0, 0.2227512315121426, 1.496437667574301, 0, -8.460158061344464, 1, 0.2227512315121426, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -5.653531880855577, 1, 0.3333333333333334, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 1.486645428321329, 0, 0, 0.278526734110379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 1.486645428321329, 0, 0, 0.278526734110379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0, 2.244974618299884, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9989680231190911, 2.001031976880907, 1, 1, 0.3329893410396972, 1.001033042957358, 0.4997421388331545, -2.834064108049099, 0.8891180987539482, 0.5550967808333427, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9394964462158981, 2.060503553784101, 0, 1, 0.3131654820719662, 0, 0.4853182602687129, 2.743762256790531, 0.6868345179280337, 1, 0.1768805803300194],
[1.939431024532551, 1.060568975467449, 0, 0, 0.6464770081775171, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5745809870870119, 1.487677747182797, 0, 1, 0.2786173129194945, 0, 0.6721885851244949, 3.800239595948532, 0.7213826870805056, 1, 0.1768805803300194],
[0.9396053427464932, 2.060394657253505, 0, 2, 0.3132017809154979, 0, 0.9706878208789324, 5.487814541697269, 0.4716917937376437, 1, 0.1768805803300194],
[0.9394310245325503, 2.060568975467449, 0, 0, 0.3131436748441835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[1.936127815211215, 1.063709149945318, 2, 0, 0.6454110132315765, 1.032989653000681, 0, -5.840039935833286, 0.9999999999999999, 0.4165553760006102, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2503088382611962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2295246504732971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 1.486645428321329, 0, 0, 0.278526734110379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -5.653531880855577, 1, 0.3333333333333334, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -5.653531880855577, 1, 0.3333333333333334, 0.1768805803300194],
[0.6682536724075729, 2.331746327592423, 1, 0, 0.2227512241358579, 1.496437717128014, 0, -8.46015834149796, 1, 0.2227512241358579, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9989675421068948, 2.001032457893103, 0, 1, 0.3329891807022984, 0, 0.4997420187041368, 2.825307434946959, 0.6670108192977016, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2295246504732971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999891071076356, 0, 1, 0.3333454369865507, 0, 0.5000272337141806, 2.826919907099141, 0.6666545630134493, 1, 0.1768805803300194],
[0.9758406431365956, 2.024159356863402, 0, 1, 0.3252802143788654, 0, 0.4940322492936428, 2.793027071552398, 0.6747197856211347, 1, 0.1768805803300194],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.4720450561622827, 2.527954943837716, 0, 0, 0.1573483520540943, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2295246504732971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[1.920608367335005, 1.070429094708784, 3, 0, 0.6421211341240256, 1.562005066219063, 0, -8.830845439927394, 0.9999999999999998, 0.2647590976381771, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999564671888037, 2.000043532811194, 0, 1, 0.3333188223962681, 0, 0.4999891170340846, 2.826704413233025, 0.6666811776037318, 1, 0.1768805803300194],
[0.9389425398891174, 2.061057460110882, 1, 0, 0.3129808466297059, 1.065027898425066, 0, -6.02116917774672, 1, 0.3129808466297059, 0.1768805803300194],
[0.3775126908500573, 2.041383580764342, 0, 0, 0.1560681602101528, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9379650837137345, 2.025375832195869, 1, 0, 0.3165228403785679, 1.066137767133769, 0, -6.027443855874941, 1, 0.3165228403785679, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9994024995180519, 2.000597500481946, 0, 1, 0.3331341665060175, 0, 0.4998506694920387, 2.825921695640243, 0.6668658334939825, 1, 0.1768805803300194],
[0.3775126908500573, 2.290943221608287, 0, 0, 0.1414723357757369, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9982022568669047, 2.001307175379528, 0, 1, 0.3327885040585846, 0, 0.4996734196040445, 2.82491960774759, 0.6672114959414155, 1, 0.1768805803300194],
[0.9994025837606423, 2.000597416239356, 1, 1, 0.333134194586881, 1.00059777335887, 0.4998506905401091, -2.83098959696129, 0.8890216083969502, 0.5552899975707121, 0.1768805803300194],
[0.9394310245325503, 2.060568975467449, 0, 0, 0.3131436748441835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0, 2.244974618299884, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9995656225324353, 2.000434377467563, 0, 1, 0.3331885408441453, 0, 0.499891429213461, 2.826152132024759, 0.6668114591558547, 1, 0.1768805803300194],
[0.7584253673959539, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2528084557986513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 1.844972724468281, 0, 0, 0.2372667046045239, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6682536302533165, 1.999999999999999, 1, 0, 0.250446068048589, 1.496437811525135, 0, -8.460158875175097, 1, 0.250446068048589, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 2.826765940427789, 0.6666666666666666, 1, 0.1768805803300194],
[0.426076452853881, 2.573923547146118, 0, 0, 0.1420254842846271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.7584253673959539, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2528084557986513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.999402327309343, 2.000597672690655, 0, 1, 0.3331341091031145, 0, 0.4998506264655773, 2.825921452388772, 0.6668658908968854, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 1.844972724468281, 0, 0, 0.2372667046045239, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[1.939431024532551, 1.060568975467449, 0, 0, 0.6464770081775171, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.3775126908500573, 2.290943221608287, 0, 0, 0.1414723357757369, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.7584253673959539, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2528084557986513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2295246504732971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6684559124583433, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2505028879575985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.378204592050681, 2.29144357056441, 0, 2, 0.141668328189062, 0, 0.8728122418949101, 4.934471835553901, 0.7367332588337597, 1, 0.1768805803300194],
[0.9994025520122805, 2.000597447987718, 1, 1, 0.3331341840040937, 1.000597805145201, 0.4998506826077584, -2.830989821512122, 0.8890216154479267, 0.555289983456114, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 1.486645428321329, 0, 0, 0.278526734110379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.937927473460587, 2.060266749029494, 1, 2, 0.3128307920897843, 1.066180518532408, 0.9707480844129125, -0.5395303087622172, 0.7676398715428226, 0.6755176553214816, 0.1768805803300194],
[0.007209114630618483, 2.992790885369382, 1, 1, 0.002403038210206161, 138.7132888347772, 0.3341362755709463, -782.3309506392499, 0.9999942254073603, 0.00480030182777258, 0.1768805803300194],
[0.9994025519607357, 2.000597448039263, 0, 1, 0.3331341839869121, 0, 0.4998506825948798, 2.825921769717573, 0.6668658160130879, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 2.094532365312225, 0, 0, 0.2150770205595732, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -5.653531880855577, 1, 0.3333333333333334, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 1.000000000000001, 5.653531880855577, 0.4444444444444444, 1, 0.1768805803300194],
[1.241254138227103, 1.426999598522885, 0, 1, 0.4651934413625095, 0, 0.7007710450900752, 3.961831444597219, 0.5348065586374905, 1, 0.1768805803300194],
[1.240221564391141, 1.428141298673508, 0, 1, 0.4647874475987611, 0, 0.7002108271281168, 3.958664234489059, 0.535212552401239, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9379651070541719, 2.061925973550061, 1, 1, 0.3126663874960582, 1.066137740603868, 0.4849834634355371, -3.285574233666735, 0.9022397301301648, 0.5275725051222813, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 2.094532365312225, 0, 0, 0.2150770205595732, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9390079713320124, 2.060992028667987, 1, 1, 0.3130026571106709, 1.064953685730131, 0.4852032351849013, -3.27763765509784, 0.9020293366416599, 0.5280346508630016, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999673147331579, 0, 1, 0.3333696542536876, 0, 0.5000817265233712, 2.827227983933178, 0.6666303457463123, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9389425286728562, 2.060948561729874, 1, 1, 0.3129922055093023, 1.065027911147496, 0.4852134684820284, -3.277999436589727, 0.9020358792904226, 0.5280202903090273, 0.1768805803300194],
[0.9389425398894563, 2.061057460110542, 1, 0, 0.3129808466298189, 1.065027898424681, 0, -6.021169177744546, 1, 0.312980846629819, 0.1768805803300194],
[0.7584253673959539, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2528084557986513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9389425398891174, 2.061057460110881, 1, 0, 0.3129808466297059, 1.065027898425066, 0, -6.02116917774672, 1, 0.3129808466297059, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -5.653531880855577, 1, 0.3333333333333334, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 2.094532365312225, 0, 0, 0.2150770205595732, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.7584253673959539, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2528084557986513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.3775126908500573, 2.290943221608287, 0, 0, 0.1414723357757369, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2295246504732971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -5.653531880855577, 1, 0.3333333333333334, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 1.486645428321329, 0, 0, 0.278526734110379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -5.653531880855577, 1, 0.3333333333333334, 0.1768805803300194],
[0.668362524377452, 2.329845028270708, 0, 3, 0.2229206993315464, 0, 1.287639290853051, 7.279709781879983, 0.4692410759990104, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 1.844972724468281, 0, 0, 0.2372667046045239, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0, 2.244974618299884, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.3780346434100448, 2.291017475018794, 0, 1, 0.1416362913259926, 0, 0.4364872860656799, 2.467694787360448, 0.8583637086740074, 1, 0.1768805803300194],
[0.9394310245325503, 2.060568975467449, 0, 0, 0.3131436748441835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2503088382611962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.378556575231187, 1.685391035413718, 0, 2, 0.1834138489168833, 0, 1.186668231867659, 6.708866680862323, 0.6668129421407387, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 2.826765940427789, 0.6666666666666666, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2295246504732971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6679282494023105, 2.332071750597686, 0, 1, 0.2226427498007705, 0, 0.4288032732027693, 2.424252975667079, 0.7773572501992295, 1, 0.1768805803300194],
[0.9394310245325503, 2.060568975467449, 0, 0, 0.3131436748441835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 2.094532365312225, 0, 0, 0.2150770205595732, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 2.826765940427789, 0.6666666666666666, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2503088382611962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 2.094532365312225, 0, 0, 0.2150770205595732, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.4271084268940284, 2.57289157310597, 0, 1, 0.1423694756313429, 0, 0.388667758273548, 2.197345562460171, 0.8576305243686572, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 1.844972724468281, 0, 0, 0.2372667046045239, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 1.844972724468281, 0, 0, 0.2372667046045239, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[1.240303340312533, 1.428493867727719, 1, 1, 0.4647424452393333, 0.8062543794714117, 0.7000380068769093, -0.6004976487318532, 0.7840144595929655, 0.7134993500716318, 0.1768805803300194],
[0.9389419717438078, 2.061058028256191, 1, 0, 0.312980657247936, 1.065028542863831, 0, -6.021172821101826, 1, 0.312980657247936, 0.1768805803300194],
[0.6682536302540366, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2504460680487913, 1.496437811523523, 0, -8.46015887516598, 1, 0.2504460680487912, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6682537367092686, 1.999999999999999, 1, 0, 0.25044609795372, 1.496437573135579, 0, -8.460157527432139, 1, 0.25044609795372, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 2.826765940427789, 0.6666666666666666, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9394310245325503, 2.060568975467449, 0, 0, 0.3131436748441835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5740934748048324, 2.094362437653511, 0, 1, 0.2151407007043046, 0, 0.4774722760595265, 2.699404734927206, 0.7848592992956954, 1, 0.1768805803300194],
[0.9370427062960321, 2.062359208411942, 1, 1, 0.3124098513444017, 1.067187219196046, 0.4848815841203629, -3.292083472302228, 0.9024000847829686, 0.5272197874717723, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.668439586725689, 2.330515058376077, 0, 2, 0.222890862260108, 0, 0.8581793937832853, 4.851744562247113, 0.6038986119588384, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -5.653531880855577, 1, 0.3333333333333334, 0.1768805803300194],
[0.9394310245325503, 2.024202868482472, 0, 0, 0.3169861927772833, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[1.935666222558799, 1.062541141033214, 1, 0, 0.6456078542345273, 0.5166179935082396, 0, -2.92071629652247, 1, 0.6456078542345273, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.331636865941786, 0, 1, 0.2226327759929844, 0, 0.4288832513360024, 2.424705134593083, 0.7773672240070156, 1, 0.1768805803300194],
[0, 2.244974618299884, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9394310245325503, 2.024159331947234, 0, 1, 0.3169908494534401, 0, 0.4940322553748788, 2.793027105932859, 0.6830091505465599, 1, 0.1768805803300194],
[0.6682537029374666, 2.33174629706253, 1, 0, 0.2227512343124891, 1.496437648761637, 0, -8.460157954986471, 1, 0.2227512343124891, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6684559124583433, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2505028879575985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2503088382611962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 2.826765940427789, 0.6666666666666666, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 2.826765940427789, 0.6666666666666666, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.7584253673959539, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2528084557986513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2295246504732971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6684559124583433, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2505028879575985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9394310245325503, 2.060568975467449, 0, 0, 0.3131436748441835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6684559124583433, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2505028879575985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -5.653531880855577, 1, 0.3333333333333334, 0.1768805803300194],
[1.939431024532551, 1.060568975467449, 0, 0, 0.6464770081775171, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9389425398477401, 2.061057460152259, 1, 0, 0.3129808466159135, 1.065027898471999, 0, -6.021169178012061, 1, 0.3129808466159134, 0.1768805803300194],
[0.9994026057592977, 2.0005973942407, 0, 1, 0.3331342019197661, 0, 0.4998506960364889, 2.825921845710138, 0.6668657980802339, 1, 0.1768805803300194],
[0.9379653821071062, 2.062034617892893, 1, 0, 0.3126551273690356, 1.066137427965129, 0, -6.027441938374221, 1, 0.3126551273690356, 0.1768805803300194],
[1.045277901475297, 1.864061941753988, 0, 0, 0.359283534341271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 2.826765940427789, 0.6666666666666666, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2295246504732971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[1.045277901475297, 1.864061941753988, 0, 0, 0.359283534341271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2503088382611962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 2.094532365312225, 0, 0, 0.2150770205595732, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 2.826765940427789, 0.6666666666666666, 1, 0.1768805803300194],
[0.9394310245325503, 2.060568975467449, 0, 0, 0.3131436748441835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9394310245325503, 2.060568975467449, 0, 0, 0.3131436748441835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[1.00168998887742, 1.998310011122579, 0, 1, 0.3338966629591401, 0, 0.5004228545290808, 2.829156561988909, 0.6661033370408599, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 2.826765940427789, 0.6666666666666666, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332071699664049, 0, 1, 0.222600504825725, 0, 0.4288032825680518, 2.424253028614002, 0.777399495174275, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 2.094532365312225, 0, 0, 0.2150770205595732, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 2.826765940427789, 0.6666666666666666, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6683631214962464, 2.33163687850375, 0, 1, 0.2227877071654157, 0, 0.4288832490253442, 2.424705121529704, 0.7772122928345843, 1, 0.1768805803300194],
[1.241688757771356, 1.426076452853881, 0, 0, 0.4654415436658105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 2.094532365312225, 0, 0, 0.2150770205595732, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 1.486645428321329, 0, 0, 0.278526734110379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[1.241688757771356, 1.426076452853881, 0, 0, 0.4654415436658105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999891091020841, 0, 1, 0.3333454347703359, 0, 0.5000272287275163, 2.826919878906875, 0.666654565229664, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.938942485892122, 2.061057514107877, 1, 0, 0.3129808286307074, 1.06502795967302, 0, -6.021169524013982, 1, 0.3129808286307074, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2503088382611962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9394310245325503, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3195962132440056, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9384526168576428, 2.061547383142356, 1, 0, 0.3128175389525477, 1.065583900600592, 0, -6.024312553771884, 1, 0.3128175389525477, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[1.003381619912623, 1.996618380087375, 0, 1, 0.3344605399708744, 0, 0.5008468368182799, 2.831553559377815, 0.6655394600291256, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2295246504732971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.3780346892713875, 2.041906655884772, 0, 1, 0.1562164678197986, 0, 0.4897383517106432, 2.768751384673781, 0.8437835321802014, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6683624227551381, 2.331040183004156, 0, 2, 0.2228318470724083, 0, 0.8579860675857057, 4.850651586425692, 0.6039903379248845, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.4188962716144, 0, 0, 0.4134116918261187, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 2.094532365312225, 0, 0, 0.2150770205595732, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 1.486645428321329, 0, 0, 0.278526734110379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.939539887983678, 0, 1, 0.3401892942796333, 0, 0.5155861996937778, 2.914883017297941, 0.6598107057203667, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.4266739543833184, 2.57332604561668, 1, 0, 0.1422246514611062, 2.34370996806056, 0, -13.25023902390937, 1, 0.1422246514611062, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2503088382611962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[1.938176029679386, 1.061226395871465, 1, 0, 0.6461873915846532, 0.5159490080812837, 0, -2.916934166083347, 1, 0.6461873915846532, 0.1768805803300194],
[0.3778660235190951, 2.290589888939249, 1, 0, 0.141604746683254, 2.646440637046231, 0, -14.9617365123326, 1, 0.141604746683254, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9982018499373351, 2.001798150062663, 0, 1, 0.3327339499791119, 0, 0.4995508662892394, 2.824226748675235, 0.667266050020888, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2295246504732971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.426076452853881, 2.573923547146118, 0, 0, 0.1420254842846271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9394310245325503, 2.024202868482472, 0, 0, 0.3169861927772833, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[1.241335637295737, 1.426863892240235, 1, 0, 0.4652334368380683, 0.8055838968568653, 0, -4.554394243584156, 1, 0.4652334368380683, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9997009863423629, 2.000299013657635, 0, 2.5, 0.3332336621141212, 0, 1.249813144400166, 7.065858456978691, 0.3630230198599048, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -5.653531880855577, 1, 0.3333333333333334, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2295246504732971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6684559124583433, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2505028879575985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.3785726315175799, 2.040323640096819, 1, 0, 0.1565063520747486, 2.641501040345445, 0, -14.93381034490614, 1, 0.1565063520747486, 0.1768805803300194],
[0.9389424858921198, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3194831101320797, 1.065027959673022, 0, -6.021169524013996, 1, 0.3194831101320796, 0.1768805803300194],
[0.6684559124583433, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2505028879575985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[1.04459906597008, 1.864903800476214, 0, 1, 0.3590300865542599, 0, 0.5362206885656216, 3.031540757980069, 0.6409699134457401, 1, 0.1768805803300194],
[0.6682536302540366, 2.00059792337889, 1, 1, 0.2503899586863078, 1.496437811523523, 0.4998505638309671, -5.634237776883974, 0.937304868589069, 0.4380847859616847, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -5.653531880855577, 1, 0.3333333333333334, 0.1768805803300194],
[0.668253694536429, 2.33114905233777, 1, 2, 0.2227955866323199, 1.496437667574296, 0.8579459979164864, -3.609733010071132, 0.8732045779883261, 0.5305322387568634, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2503088382611962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9389425286728584, 2.06105747132714, 1, 0, 0.312980842890953, 1.065027911147494, 0, -6.021169249673372, 1, 0.312980842890953, 0.1768805803300194],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.006819966142427574, 2.993180033857572, 0, 1, 0.002273322047475858, 0, 0.3340928339386297, 1.88880448783743, 0.9977266779525241, 1, 0.1768805803300194],
[0.9757971315175266, 2.024202868482472, 0, 0, 0.3252657105058424, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[1.000434582677029, 1.938507957170698, 0, 1, 0.3404063091103725, 0, 0.5158606629913066, 2.916434704300645, 0.6595936908896275, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -5.653531880855577, 1, 0.3333333333333334, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9390077527567158, 2.060992247243283, 1, 1, 0.3130025842522388, 1.064953933622193, 0.4852031837274342, -3.277639347479945, 0.90202938225142, 0.5280345507558978, 0.1768805803300194],
[1.045277901475297, 1.864061941753988, 0, 0, 0.359283534341271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.002190344268326865, 2.244289190972121, 0.5, 1.25, 0.0009750118948189866, 228.2746174791665, 0.5569692199330865, -1287.408984267032, 0.9991468645666732, 0.001705646902350311, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9389424858511363, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3194831101225898, 1.065027959719509, 0, -6.021169524276812, 1, 0.3194831101225899, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 2.094532365312225, 0, 0, 0.2150770205595732, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 1.486645428321329, 0, 0, 0.278526734110379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2503088382611962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9394310245325503, 2.060568975467449, 0, 0, 0.3131436748441835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0, 2.244974618299884, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9389425398477275, 2.061057460152271, 1, 0, 0.3129808466159093, 1.065027898472014, 0, -6.021169178012142, 1, 0.3129808466159093, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9989679430577088, 2.001032056942289, 0, 1, 0.3329893143525698, 0, 0.4997421188384492, 2.825308001059487, 0.6670106856474303, 1, 0.1768805803300194],
[0.6684559124583433, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2505028879575985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.3775126908500573, 1.68305628461739, 0, 0, 0.1832079854373315, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194]
],
"RESOLVED": [
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 2.826765940427789, 0.6666666666666666, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 1.844972724468281, 0, 0, 0.2372667046045239, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.4188962716144, 0, 0, 0.4134116918261187, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 13, 0, 0.3333333333333334, 13.00000000000001, 0, -73.4959144511225, 0.9999999999999994, 6.272254748918016e-07, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 2.094532365312225, 0, 0, 0.2150770205595732, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2295246504732971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.3778660235494306, 2.290589888908913, 1, 0, 0.1416047466946221, 2.646440636833772, 0, -14.96173651113146, 1, 0.1416047466946222, 0.1768805803300194],
[1.000434659965273, 1.998967839499972, 0, 1, 0.3335446510242082, 0, 0.5002581733631809, 2.828225531767318, 0.6664553489757918, 1, 0.1768805803300194],
[0.9757971315175266, 2.024202868482472, 0, 0, 0.3252657105058424, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9985325880069097, 2.001467411993088, 0, 2, 0.3328441960023034, 0, 0.9992668319332628, 5.64938689181625, 0.4450968668078129, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.998954576256308, 2, 0, 0.3334495320193653, 2.000000000000001, 0, -11.30706376171115, 0.9999999999999999, 0.1111885904039338, 0.1768805803300194],
[1.24133558648437, 1.426864005546809, 1, 0, 0.4652334068979441, 0.8055839298316864, 0, -4.554394430008358, 1, 0.4652334068979441, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333334, 2.000000000000001, 0, -11.30706376171115, 1, 0.111111111111111, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.3775126908500573, 1.68305628461739, 0, 0, 0.1832079854373315, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9394310245325503, 2.060460065860952, 0, 1, 0.3131550433750324, 0, 0.4853285033612896, 2.743820166440972, 0.6868449566249677, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6683624964924306, 2.331637503507566, 0, 1, 0.2227874988308105, 0, 0.4288831340616474, 2.424704471578778, 0.7772125011691895, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -5.653531880855577, 1, 0.3333333333333334, 0.1768805803300194],
[0.9389424858511363, 2.061057514148863, 1, 0, 0.3129808286170456, 1.065027959719509, 0, -6.021169524276812, 1, 0.3129808286170456, 0.1768805803300194],
[0.9995655745170956, 2.000434425482903, 0, 1, 0.3331885248390321, 0, 0.4998914172148388, 2.826152064190166, 0.6668114751609679, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 2.094532365312225, 0, 0, 0.2150770205595732, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9405212573261321, 2.058280383714895, 0, 1, 0.3136323671610478, 0, 0.4858424575738055, 2.74672582296673, 0.6863676328389523, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 2.094532365312225, 0, 0, 0.2150770205595732, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 1.844972724468281, 0, 0, 0.2372667046045239, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 2.826765940427789, 0.6666666666666666, 1, 0.1768805803300194],
[1.241335697347603, 1.426863758327852, 1, 0, 0.4652334722230722, 0.8055838578852832, 0, -4.554394023257074, 1, 0.4652334722230722, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2295246504732971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.938942542701647, 2.061057457298352, 1, 0, 0.3129808475672158, 1.065027895234857, 0, -6.021169159710774, 1, 0.3129808475672158, 0.1768805803300194],
[0.426076452853881, 2.573923547146118, 0, 0, 0.1420254842846271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 2.826765940427789, 0.6666666666666666, 1, 0.1768805803300194],
[0.9998910474873405, 1.99906236482159, 1, 1, 0.3334133312586247, 1.000108964384603, 0.5002345187411132, -2.826056114870476, 0.8888355505390266, 0.5556622130562761, 0.1768805803300194],
[0.426076452853881, 2.573923547146118, 0, 0, 0.1420254842846271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 2, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 1.000000000000001, 0, 0.7407407407407406, 0.7037037037037037, 0.1768805803300194],
[0.3778660235190967, 2.290141154794094, 1, 1, 0.1416285632926959, 2.646440637046219, 0.4366543074895791, -12.49309746402729, 0.9799413500596468, 0.2631984766450387, 0.1768805803300194],
[0.9394310245325503, 2.060568975467449, 0, 0, 0.3131436748441835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.001363853889071634, 2.998636146110928, 0, 1, 0.000454617963023878, 0, 0.3334849415781728, 1.885367748997458, 0.9995453820369761, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -5.653531880855577, 1, 0.3333333333333334, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2503088382611962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6684559124583433, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2505028879575985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6684559124583433, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2505028879575985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9757971315175266, 2.024202868482472, 0, 0, 0.3252657105058424, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.002043362532696683, 2.997359975821078, 0, 2, 0.000681256337408154, 0, 0.6672538554372777, 3.772340944338445, 0.998637951435381, 1, 0.1768805803300194],
[0.9994025519607358, 2.00043441654878, 0, 2, 0.3331522887583102, 0, 0.999782838894799, 5.652304153624038, 0.4446858699882802, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 2.094532365312225, 0, 0, 0.2150770205595732, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.00136397372394127, 2.998636026276059, 0, 1, 0.0004546579079804232, 0, 0.3334849549052735, 1.885367824342647, 0.9995453420920196, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2503088382611962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5763792778721161, 1.485879171779915, 0, 1, 0.2794893520593258, 0, 0.6730022326123014, 3.804839577960625, 0.7205106479406742, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -5.653531880855577, 1, 0.3333333333333334, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9394310245325503, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3195962132440056, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.937965529331148, 2.062034470668851, 1, 0, 0.3126551764437162, 1.066137260623094, 0, -6.027440992300687, 1, 0.3126551764437162, 0.1768805803300194],
[0.002727846694484912, 2.997272153305516, 0, 2, 0.0009092822314949706, 0, 0.6672734065187632, 3.772451477000929, 0.9981822623311866, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9754062734408064, 2.024593726559192, 1, 0, 0.325135424480269, 1.025213828564417, 0, -5.796079064482933, 1, 0.325135424480269, 0.1768805803300194],
[0.9999127011221987, 2.000087298877799, 1, 1, 0.3333042337073998, 1.000087306499561, 0.4999781762331454, -2.827382911868132, 0.888908287792723, 0.5555167552075226, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 2.826765940427789, 0.6666666666666666, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 1.844972724468281, 0, 0, 0.2372667046045239, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 1.844972724468281, 0, 0, 0.2372667046045239, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.426076452853881, 2.573923547146118, 0, 0, 0.1420254842846271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6680200486128653, 2.001032069815971, 0, 1, 0.2502836284089132, 0, 0.4997421156233478, 2.825307982882809, 0.7497163715910868, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0, 2.244974618299884, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.7588161734507731, 2.241183826549227, 1, 0, 0.2529387244835911, 1.317842232397901, 0, -7.450463074799415, 1, 0.252938724483591, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9394310245325503, 2.060568975467449, 0, 0, 0.3131436748441835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999564732703791, 2.000043526729619, 1, 1, 0.3333188244234599, 1.00004352862428, 0.499989118554412, -2.827073549492423, 0.8888985612849627, 0.5555362101318826, 0.1768805803300194],
[0.3775126908500573, 2.041383580764342, 0, 0, 0.1560681602101528, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.998954786734009, 2, 0, 0.333449508616648, 2.000000000000001, 0, -11.30706376171115, 1, 0.111188574796684, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2295246504732971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9995656250702393, 2.000434374929759, 0, 1, 0.33318854169008, 0, 0.4998914298476365, 2.82615213561009, 0.6668114583099201, 1, 0.1768805803300194],
[0.6684546697993141, 2.000597731960533, 0, 1, 0.2504464391027192, 0, 0.4998506116569603, 2.825921368667784, 0.7495535608972808, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 1.844972724468281, 0, 0, 0.2372667046045239, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333334, 2.000000000000001, 0, -11.30706376171115, 1, 0.111111111111111, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[1.241688757771356, 1.426076452853881, 0, 0, 0.4654415436658105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[1.241688757771356, 1.426076452853881, 0, 0, 0.4654415436658105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.3775126908500573, 1.68305628461739, 0, 0, 0.1832079854373315, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[1.938176379336145, 1.061226212706182, 1, 0, 0.6461874722914136, 0.5159489150014899, 0, -2.916933639853765, 1, 0.6461874722914136, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.331636865995866, 0, 1, 0.2226327759889702, 0, 0.4288832513260549, 2.424705134536845, 0.7773672240110298, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9989680231190911, 2.001031976880907, 0, 1, 0.3329893410396972, 0, 0.4997421388331545, 2.825308114100191, 0.6670106589603028, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -5.653531880855577, 1, 0.3333333333333334, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9394310245325503, 2.060568975467449, 0, 0, 0.3131436748441835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[1.939431024532551, 1.060568975467449, 0, 0, 0.6464770081775171, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 1.000000000000001, 5.653531880855577, 0.4444444444444444, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 2.826765940427789, 0.6666666666666666, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 2.826765940427789, 0.6666666666666666, 1, 0.1768805803300194],
[0.6682536302936872, 2.000434381370819, 1, 1, 0.2504053030451042, 1.496437811434732, 0.4998914282380706, -5.634006748153642, 0.9372971842068897, 0.4381077902970978, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9989679994235208, 2.001032000576477, 0, 1, 0.3329893331411738, 0, 0.4997421329153707, 2.825308080643812, 0.6670106668588262, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.331637178515832, 0, 2, 0.2226327527919535, 0, 0.8577663876817531, 4.849409619085113, 0.6042998370318161, 1, 0.1768805803300194],
[0.6683625253564304, 2.331637474643566, 0, 1, 0.2227875084521437, 0, 0.4288831393709129, 2.42470450159488, 0.7772124915478562, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6684559124583433, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2505028879575985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6679282421015309, 2.332071757898465, 0, 1, 0.2226427473671772, 0, 0.4288032718603586, 2.424252968077717, 0.7773572526328227, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 2.094532365312225, 0, 0, 0.2150770205595732, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999891090393505, 0, 1, 0.333345434840045, 0, 0.5000272288843673, 2.826919879793638, 0.666654565159955, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.4188962716144, 0, 0, 0.4134116918261187, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6682536302936872, 2.331746369706309, 1, 0, 0.222751210097896, 1.496437811434732, 0, -8.460158874664, 1, 0.222751210097896, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 1.486645428321329, 0, 0, 0.278526734110379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.668253694536429, 2.331746305463567, 1, 0, 0.2227512315121433, 1.496437667574296, 0, -8.460158061344437, 1, 0.2227512315121433, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 2.094532365312225, 0, 0, 0.2150770205595732, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9389425398477401, 2.060948544584542, 1, 1, 0.3129922098573226, 1.065027898471999, 0.4852134725185901, -3.277999342107571, 0.9020358765686298, 0.528020296283275, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -5.653531880855577, 1, 0.3333333333333334, 0.1768805803300194],
[0.4271082924680759, 2.572891707531924, 0, 1, 0.142369430822692, 0, 0.3886677379668115, 2.197345447655389, 0.8576305691773081, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9988044810827106, 2.001195518917287, 1, 1, 0.3329348270275704, 1.00119694989353, 0.4997012988221325, -2.835221651442569, 0.8891544009521217, 0.5550240550072625, 0.1768805803300194],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9389425022513872, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3194831139200945, 1.065027941116958, 0, -6.021169419106696, 1, 0.3194831139200944, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 2.094532365312225, 0, 0, 0.2150770205595732, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.419941005204512, 0, 1, 0.4132332143012257, 0, 0.7042546108146031, 3.981525894479893, 0.5867667856987744, 1, 0.1768805803300194],
[0.9982073623921557, 2.001792637607842, 0, 1, 0.3327357874640521, 0, 0.4995522419320154, 2.824234525915525, 0.6672642125359478, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 2.826765940427789, 0.6666666666666666, 1, 0.1768805803300194],
[0, 2.244974618299884, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6687426487766512, 2.331257351223345, 1, 0, 0.222914216258884, 1.49534354034295, 0, -8.453972378160312, 1, 0.222914216258884, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9994025920427321, 2.00043438740435, 0, 1, 0.3331523009050105, 0, 0.499891426730343, 2.826152117986372, 0.6668476990949894, 1, 0.1768805803300194],
[0.426076452853881, 2.573923547146118, 0, 0, 0.1420254842846271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.3775126908500573, 2.290943221608287, 0, 0, 0.1414723357757369, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.7584253673959539, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2528084557986513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 1.486645428321329, 0, 0, 0.278526734110379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.001363853888063201, 2.998636146111937, 0, 1, 0.0004546179626877334, 0, 0.3334849415780606, 1.885367748996824, 0.9995453820373122, 1, 0.1768805803300194],
[1.241688757771356, 1.426076452853881, 0, 0, 0.4654415436658105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9379651032655679, 2.062034896734431, 1, 0, 0.3126550344218561, 1.066137744910183, 0, -6.027443730233189, 1, 0.3126550344218562, 0.1768805803300194],
[0.9989679665458945, 2.001032033454104, 0, 1, 0.332989322181965, 0, 0.49974212470444, 2.825308034223053, 0.6670106778180349, 1, 0.1768805803300194],
[0.9988044810827106, 2.001195518917287, 0, 1, 0.3329348270275704, 0, 0.4997012988221325, 2.825077223795864, 0.6670651729724296, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 2.094532365312225, 0, 0, 0.2150770205595732, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9996731551870933, 2.000326844812905, 1, 1, 0.3332243850623646, 1.000326951675366, 0.4999183021480334, -2.829076253558658, 0.888961509199809, 0.5554102793245381, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9389425286728583, 2.06105747132714, 1, 0, 0.3129808428909529, 1.065027911147494, 0, -6.021169249673372, 1, 0.3129808428909528, 0.1768805803300194],
[0.6684559124583433, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2505028879575985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -5.653531880855577, 1, 0.3333333333333334, 0.1768805803300194],
[1.000434444356818, 1.998968351492215, 0, 1, 0.3335445461814434, 0, 0.500258045232936, 2.828224807378894, 0.6664554538185566, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9998910710245041, 2.000108928975494, 0, 1, 0.3332970236748349, 0, 0.4999727692392359, 2.826611990453667, 0.6667029763251651, 1, 0.1768805803300194],
[1.241688757771356, 1.426076452853881, 0, 0, 0.4654415436658105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0, 2.244974618299884, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6700413651142245, 2.328267311386182, 1, 1, 0.2234731101456471, 1.492445171395539, 0.4295039470380356, -6.009372099380805, 0.9500597690418313, 0.3970059893331257, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.3775126908500573, 2.041383580764342, 0, 0, 0.1560681602101528, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[1.045631178473439, 1.863274153330953, 1, 0, 0.3594586482554365, 0.9563601589041582, 0, -5.40681264794476, 1, 0.3594586482554365, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.001797869307783774, 2.998202130692216, 0, 1, 0.0005992897692612579, 0, 0.3335332163776172, 1.885640672115159, 0.9994007102307387, 1, 0.1768805803300194],
[0.3775126908500573, 2.290943221608287, 0, 0, 0.1414723357757369, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6682537144802336, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2504460917092389, 1.496437622913623, 0, -8.4601578088539, 1, 0.2504460917092389, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -5.653531880855577, 1, 0.3333333333333334, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 2.094532365312225, 0, 0, 0.2150770205595732, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.4275427720704941, 2.571859931575404, 0, 1, 0.1425426374227103, 0, 0.3888236632651474, 2.198226976300563, 0.8574573625772897, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.4188962716144, 0, 0, 0.4134116918261187, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 2.826765940427789, 0.6666666666666666, 1, 0.1768805803300194],
[0.3783883401101524, 2.041553265629869, 1, 1, 0.1563625912346925, 2.642787565042017, 0.4898231247919341, -12.17185310130222, 0.9755507400623724, 0.2882759225317575, 0.1768805803300194],
[0.9998910962605799, 2.000043517045847, 0, 2, 0.3333042966421637, 0, 0.9999782419504993, 5.653408871029057, 0.4444831608758001, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999564806097146, 2.000043519390283, 1, 1, 0.3333188268699051, 1.000043521284305, 0.4999891203891662, -2.827073497622802, 0.8888985596540702, 0.5555362133938804, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2295246504732971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.241737664094529, 0, 1, 0.2295117892569724, 0, 0.4460825260764466, 2.521941782665778, 0.7704882107430276, 1, 0.1768805803300194],
[1.938176408143816, 1.061226197615481, 1, 0, 0.6461874789407165, 0.5159489073327933, 0, -2.916933596498545, 1, 0.6461874789407165, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2295246504732971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6683624227547433, 2.331637577245253, 0, 1, 0.2227874742515814, 0, 0.4288831204982828, 2.424704394897864, 0.7772125257484186, 1, 0.1768805803300194],
[0.6684559124583433, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2505028879575985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0.5000000000000003, -2.826765940427789, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.1768805803300194],
[0.9989675405795275, 2.00103245942047, 0, 2, 0.332989180193176, 0, 0.9994840366453778, 5.650614865580864, 0.4449034337393714, 1, 0.1768805803300194],
[0.9394310245325503, 2.024268264581883, 0, 1, 0.3169791982550486, 0, 0.4940056698495702, 2.792876803817958, 0.6830208017449515, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.331636913858107, 0, 1, 0.2226327724363611, 0, 0.4288832425222341, 2.424705084764163, 0.777367227563639, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 2.826765940427789, 0.6666666666666666, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.939539951870233, 1, 0, 0.3401892868861219, 1.000000000000001, 0, -5.653531880855577, 1, 0.3401892868861218, 0.1768805803300194],
[0.9389425286728562, 2.061057471327143, 1, 0, 0.3129808428909522, 1.065027911147496, 0, -6.021169249673386, 1, 0.3129808428909522, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.000434376271281, 0, 1, 0.2502680886034994, 0, 0.4998914295124015, 2.826152133714829, 0.7497319113965006, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 2, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 1.000000000000001, 0, 0.7407407407407406, 0.7037037037037037, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2295246504732971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0, 2.244974618299884, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6682536302543481, 2.331746369745648, 1, 0, 0.222751210084783, 1.496437811522825, 0, -8.460158875162037, 1, 0.222751210084783, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.7588597441755774, 2.241140255824423, 0, 1, 0.2529532480585258, 0, 0.4462014358098, 2.522614042634236, 0.7470467519414742, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.4188962716144, 0, 0, 0.4134116918261187, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6719456791153197, 2.328054320884677, 0, 1, 0.2239818930384402, 0, 0.4295432417659366, 2.428436411529776, 0.7760181069615598, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9379652215823704, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3192567477286842, 1.066137610425443, 0, -6.027442969919424, 1, 0.3192567477286843, 0.1768805803300194],
[0.9994551852686899, 2.000544814731308, 0, 1, 0.3331517284228969, 0, 0.4998638334099551, 2.825996118269861, 0.6668482715771031, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2503088382611962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 4, 1, 0.3333333333333334, 4.000000000000003, 0.5000000000000003, -19.78736158299452, 0.9958847736625515, 0.04526748971193417, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.001363853889071634, 2.998636146110929, 0, 1, 0.0004546179630238779, 0, 0.3334849415781727, 1.885367748997457, 0.9995453820369761, 1, 0.1768805803300194],
[0.7588161734507731, 2.241183826549227, 1, 0, 0.2529387244835911, 1.317842232397901, 0, -7.450463074799415, 1, 0.252938724483591, 0.1768805803300194],
[0.6682536945364269, 2.331746305463569, 1, 0, 0.2227512315121426, 1.496437667574301, 0, -8.460158061344464, 1, 0.2227512315121426, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -5.653531880855577, 1, 0.3333333333333334, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 1.486645428321329, 0, 0, 0.278526734110379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 1.486645428321329, 0, 0, 0.278526734110379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0, 2.244974618299884, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9989680231190911, 2.001031976880907, 1, 1, 0.3329893410396972, 1.001033042957358, 0.4997421388331545, -2.834064108049099, 0.8891180987539482, 0.5550967808333427, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9394964462158981, 2.060503553784101, 0, 1, 0.3131654820719662, 0, 0.4853182602687129, 2.743762256790531, 0.6868345179280337, 1, 0.1768805803300194],
[1.939431024532551, 1.060568975467449, 0, 0, 0.6464770081775171, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5745809870870119, 1.487677747182797, 0, 1, 0.2786173129194945, 0, 0.6721885851244949, 3.800239595948532, 0.7213826870805056, 1, 0.1768805803300194],
[0.9396053427464932, 2.060394657253505, 0, 2, 0.3132017809154979, 0, 0.9706878208789324, 5.487814541697269, 0.4716917937376437, 1, 0.1768805803300194],
[0.9394310245325503, 2.060568975467449, 0, 0, 0.3131436748441835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[1.936127815211215, 1.063709149945318, 2, 0, 0.6454110132315765, 1.032989653000681, 0, -5.840039935833286, 0.9999999999999999, 0.4165553760006102, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2503088382611962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2295246504732971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 1.486645428321329, 0, 0, 0.278526734110379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -5.653531880855577, 1, 0.3333333333333334, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -5.653531880855577, 1, 0.3333333333333334, 0.1768805803300194],
[0.6682536724075729, 2.331746327592423, 1, 0, 0.2227512241358579, 1.496437717128014, 0, -8.46015834149796, 1, 0.2227512241358579, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9989675421068948, 2.001032457893103, 0, 1, 0.3329891807022984, 0, 0.4997420187041368, 2.825307434946959, 0.6670108192977016, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2295246504732971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999891071076356, 0, 1, 0.3333454369865507, 0, 0.5000272337141806, 2.826919907099141, 0.6666545630134493, 1, 0.1768805803300194],
[0.9758406431365956, 2.024159356863402, 0, 1, 0.3252802143788654, 0, 0.4940322492936428, 2.793027071552398, 0.6747197856211347, 1, 0.1768805803300194],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.4720450561622827, 2.527954943837716, 0, 0, 0.1573483520540943, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2295246504732971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[1.920608367335005, 1.070429094708784, 3, 0, 0.6421211341240256, 1.562005066219063, 0, -8.830845439927394, 0.9999999999999998, 0.2647590976381771, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999564671888037, 2.000043532811194, 0, 1, 0.3333188223962681, 0, 0.4999891170340846, 2.826704413233025, 0.6666811776037318, 1, 0.1768805803300194],
[0.9389425398891174, 2.061057460110882, 1, 0, 0.3129808466297059, 1.065027898425066, 0, -6.02116917774672, 1, 0.3129808466297059, 0.1768805803300194],
[0.3775126908500573, 2.041383580764342, 0, 0, 0.1560681602101528, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9379650837137345, 2.025375832195869, 1, 0, 0.3165228403785679, 1.066137767133769, 0, -6.027443855874941, 1, 0.3165228403785679, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9994024995180519, 2.000597500481946, 0, 1, 0.3331341665060175, 0, 0.4998506694920387, 2.825921695640243, 0.6668658334939825, 1, 0.1768805803300194],
[0.3775126908500573, 2.290943221608287, 0, 0, 0.1414723357757369, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9982022568669047, 2.001307175379528, 0, 1, 0.3327885040585846, 0, 0.4996734196040445, 2.82491960774759, 0.6672114959414155, 1, 0.1768805803300194],
[0.9994025837606423, 2.000597416239356, 1, 1, 0.333134194586881, 1.00059777335887, 0.4998506905401091, -2.83098959696129, 0.8890216083969502, 0.5552899975707121, 0.1768805803300194],
[0.9394310245325503, 2.060568975467449, 0, 0, 0.3131436748441835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0, 2.244974618299884, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9995656225324353, 2.000434377467563, 0, 1, 0.3331885408441453, 0, 0.499891429213461, 2.826152132024759, 0.6668114591558547, 1, 0.1768805803300194],
[0.7584253673959539, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2528084557986513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 1.844972724468281, 0, 0, 0.2372667046045239, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6682536302533165, 1.999999999999999, 1, 0, 0.250446068048589, 1.496437811525135, 0, -8.460158875175097, 1, 0.250446068048589, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 2.826765940427789, 0.6666666666666666, 1, 0.1768805803300194],
[0.426076452853881, 2.573923547146118, 0, 0, 0.1420254842846271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.7584253673959539, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2528084557986513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.999402327309343, 2.000597672690655, 0, 1, 0.3331341091031145, 0, 0.4998506264655773, 2.825921452388772, 0.6668658908968854, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 1.844972724468281, 0, 0, 0.2372667046045239, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[1.939431024532551, 1.060568975467449, 0, 0, 0.6464770081775171, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.3775126908500573, 2.290943221608287, 0, 0, 0.1414723357757369, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.7584253673959539, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2528084557986513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2295246504732971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6684559124583433, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2505028879575985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.378204592050681, 2.29144357056441, 0, 2, 0.141668328189062, 0, 0.8728122418949101, 4.934471835553901, 0.7367332588337597, 1, 0.1768805803300194],
[0.9994025520122805, 2.000597447987718, 1, 1, 0.3331341840040937, 1.000597805145201, 0.4998506826077584, -2.830989821512122, 0.8890216154479267, 0.555289983456114, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 1.486645428321329, 0, 0, 0.278526734110379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.937927473460587, 2.060266749029494, 1, 2, 0.3128307920897843, 1.066180518532408, 0.9707480844129125, -0.5395303087622172, 0.7676398715428226, 0.6755176553214816, 0.1768805803300194],
[0.007209114630618483, 2.992790885369382, 1, 1, 0.002403038210206161, 138.7132888347772, 0.3341362755709463, -782.3309506392499, 0.9999942254073603, 0.00480030182777258, 0.1768805803300194],
[0.9994025519607357, 2.000597448039263, 0, 1, 0.3331341839869121, 0, 0.4998506825948798, 2.825921769717573, 0.6668658160130879, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 2.094532365312225, 0, 0, 0.2150770205595732, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -5.653531880855577, 1, 0.3333333333333334, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 1.000000000000001, 5.653531880855577, 0.4444444444444444, 1, 0.1768805803300194],
[1.241254138227103, 1.426999598522885, 0, 1, 0.4651934413625095, 0, 0.7007710450900752, 3.961831444597219, 0.5348065586374905, 1, 0.1768805803300194],
[1.240221564391141, 1.428141298673508, 0, 1, 0.4647874475987611, 0, 0.7002108271281168, 3.958664234489059, 0.535212552401239, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9379651070541719, 2.061925973550061, 1, 1, 0.3126663874960582, 1.066137740603868, 0.4849834634355371, -3.285574233666735, 0.9022397301301648, 0.5275725051222813, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 2.094532365312225, 0, 0, 0.2150770205595732, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9390079713320124, 2.060992028667987, 1, 1, 0.3130026571106709, 1.064953685730131, 0.4852032351849013, -3.27763765509784, 0.9020293366416599, 0.5280346508630016, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999673147331579, 0, 1, 0.3333696542536876, 0, 0.5000817265233712, 2.827227983933178, 0.6666303457463123, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9389425286728562, 2.060948561729874, 1, 1, 0.3129922055093023, 1.065027911147496, 0.4852134684820284, -3.277999436589727, 0.9020358792904226, 0.5280202903090273, 0.1768805803300194],
[0.9389425398894563, 2.061057460110542, 1, 0, 0.3129808466298189, 1.065027898424681, 0, -6.021169177744546, 1, 0.312980846629819, 0.1768805803300194],
[0.7584253673959539, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2528084557986513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9389425398891174, 2.061057460110881, 1, 0, 0.3129808466297059, 1.065027898425066, 0, -6.02116917774672, 1, 0.3129808466297059, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -5.653531880855577, 1, 0.3333333333333334, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 2.094532365312225, 0, 0, 0.2150770205595732, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.7584253673959539, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2528084557986513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.3775126908500573, 2.290943221608287, 0, 0, 0.1414723357757369, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2295246504732971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -5.653531880855577, 1, 0.3333333333333334, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 1.486645428321329, 0, 0, 0.278526734110379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -5.653531880855577, 1, 0.3333333333333334, 0.1768805803300194],
[0.668362524377452, 2.329845028270708, 0, 3, 0.2229206993315464, 0, 1.287639290853051, 7.279709781879983, 0.4692410759990104, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 1.844972724468281, 0, 0, 0.2372667046045239, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0, 2.244974618299884, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.3780346434100448, 2.291017475018794, 0, 1, 0.1416362913259926, 0, 0.4364872860656799, 2.467694787360448, 0.8583637086740074, 1, 0.1768805803300194],
[0.9394310245325503, 2.060568975467449, 0, 0, 0.3131436748441835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2503088382611962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.378556575231187, 1.685391035413718, 0, 2, 0.1834138489168833, 0, 1.186668231867659, 6.708866680862323, 0.6668129421407387, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 2.826765940427789, 0.6666666666666666, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2295246504732971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6679282494023105, 2.332071750597686, 0, 1, 0.2226427498007705, 0, 0.4288032732027693, 2.424252975667079, 0.7773572501992295, 1, 0.1768805803300194],
[0.9394310245325503, 2.060568975467449, 0, 0, 0.3131436748441835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 2.094532365312225, 0, 0, 0.2150770205595732, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 2.826765940427789, 0.6666666666666666, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2503088382611962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 2.094532365312225, 0, 0, 0.2150770205595732, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.4271084268940284, 2.57289157310597, 0, 1, 0.1423694756313429, 0, 0.388667758273548, 2.197345562460171, 0.8576305243686572, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 1.844972724468281, 0, 0, 0.2372667046045239, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 1.844972724468281, 0, 0, 0.2372667046045239, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[1.240303340312533, 1.428493867727719, 1, 1, 0.4647424452393333, 0.8062543794714117, 0.7000380068769093, -0.6004976487318532, 0.7840144595929655, 0.7134993500716318, 0.1768805803300194],
[0.9389419717438078, 2.061058028256191, 1, 0, 0.312980657247936, 1.065028542863831, 0, -6.021172821101826, 1, 0.312980657247936, 0.1768805803300194],
[0.6682536302540366, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2504460680487913, 1.496437811523523, 0, -8.46015887516598, 1, 0.2504460680487912, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6682537367092686, 1.999999999999999, 1, 0, 0.25044609795372, 1.496437573135579, 0, -8.460157527432139, 1, 0.25044609795372, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 2.826765940427789, 0.6666666666666666, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9394310245325503, 2.060568975467449, 0, 0, 0.3131436748441835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5740934748048324, 2.094362437653511, 0, 1, 0.2151407007043046, 0, 0.4774722760595265, 2.699404734927206, 0.7848592992956954, 1, 0.1768805803300194],
[0.9370427062960321, 2.062359208411942, 1, 1, 0.3124098513444017, 1.067187219196046, 0.4848815841203629, -3.292083472302228, 0.9024000847829686, 0.5272197874717723, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.668439586725689, 2.330515058376077, 0, 2, 0.222890862260108, 0, 0.8581793937832853, 4.851744562247113, 0.6038986119588384, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -5.653531880855577, 1, 0.3333333333333334, 0.1768805803300194],
[0.9394310245325503, 2.024202868482472, 0, 0, 0.3169861927772833, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[1.935666222558799, 1.062541141033214, 1, 0, 0.6456078542345273, 0.5166179935082396, 0, -2.92071629652247, 1, 0.6456078542345273, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.331636865941786, 0, 1, 0.2226327759929844, 0, 0.4288832513360024, 2.424705134593083, 0.7773672240070156, 1, 0.1768805803300194],
[0, 2.244974618299884, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9394310245325503, 2.024159331947234, 0, 1, 0.3169908494534401, 0, 0.4940322553748788, 2.793027105932859, 0.6830091505465599, 1, 0.1768805803300194],
[0.6682537029374666, 2.33174629706253, 1, 0, 0.2227512343124891, 1.496437648761637, 0, -8.460157954986471, 1, 0.2227512343124891, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6684559124583433, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2505028879575985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2503088382611962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 2.826765940427789, 0.6666666666666666, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 2.826765940427789, 0.6666666666666666, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.7584253673959539, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2528084557986513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2295246504732971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6684559124583433, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2505028879575985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9394310245325503, 2.060568975467449, 0, 0, 0.3131436748441835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6684559124583433, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2505028879575985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -5.653531880855577, 1, 0.3333333333333334, 0.1768805803300194],
[1.939431024532551, 1.060568975467449, 0, 0, 0.6464770081775171, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9389425398477401, 2.061057460152259, 1, 0, 0.3129808466159135, 1.065027898471999, 0, -6.021169178012061, 1, 0.3129808466159134, 0.1768805803300194],
[0.9994026057592977, 2.0005973942407, 0, 1, 0.3331342019197661, 0, 0.4998506960364889, 2.825921845710138, 0.6668657980802339, 1, 0.1768805803300194],
[0.9379653821071062, 2.062034617892893, 1, 0, 0.3126551273690356, 1.066137427965129, 0, -6.027441938374221, 1, 0.3126551273690356, 0.1768805803300194],
[1.045277901475297, 1.864061941753988, 0, 0, 0.359283534341271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 2.826765940427789, 0.6666666666666666, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2295246504732971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[1.045277901475297, 1.864061941753988, 0, 0, 0.359283534341271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2503088382611962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 2.094532365312225, 0, 0, 0.2150770205595732, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 2.826765940427789, 0.6666666666666666, 1, 0.1768805803300194],
[0.9394310245325503, 2.060568975467449, 0, 0, 0.3131436748441835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9394310245325503, 2.060568975467449, 0, 0, 0.3131436748441835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[1.00168998887742, 1.998310011122579, 0, 1, 0.3338966629591401, 0, 0.5004228545290808, 2.829156561988909, 0.6661033370408599, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 2.826765940427789, 0.6666666666666666, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332071699664049, 0, 1, 0.222600504825725, 0, 0.4288032825680518, 2.424253028614002, 0.777399495174275, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 2.094532365312225, 0, 0, 0.2150770205595732, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 2.826765940427789, 0.6666666666666666, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6683631214962464, 2.33163687850375, 0, 1, 0.2227877071654157, 0, 0.4288832490253442, 2.424705121529704, 0.7772122928345843, 1, 0.1768805803300194],
[1.241688757771356, 1.426076452853881, 0, 0, 0.4654415436658105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 2.094532365312225, 0, 0, 0.2150770205595732, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 1.486645428321329, 0, 0, 0.278526734110379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[1.241688757771356, 1.426076452853881, 0, 0, 0.4654415436658105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999891091020841, 0, 1, 0.3333454347703359, 0, 0.5000272287275163, 2.826919878906875, 0.666654565229664, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.938942485892122, 2.061057514107877, 1, 0, 0.3129808286307074, 1.06502795967302, 0, -6.021169524013982, 1, 0.3129808286307074, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2503088382611962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9394310245325503, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3195962132440056, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9384526168576428, 2.061547383142356, 1, 0, 0.3128175389525477, 1.065583900600592, 0, -6.024312553771884, 1, 0.3128175389525477, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[1.003381619912623, 1.996618380087375, 0, 1, 0.3344605399708744, 0, 0.5008468368182799, 2.831553559377815, 0.6655394600291256, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2295246504732971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.3780346892713875, 2.041906655884772, 0, 1, 0.1562164678197986, 0, 0.4897383517106432, 2.768751384673781, 0.8437835321802014, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6683624227551381, 2.331040183004156, 0, 2, 0.2228318470724083, 0, 0.8579860675857057, 4.850651586425692, 0.6039903379248845, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.4188962716144, 0, 0, 0.4134116918261187, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 2.094532365312225, 0, 0, 0.2150770205595732, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 1.486645428321329, 0, 0, 0.278526734110379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.939539887983678, 0, 1, 0.3401892942796333, 0, 0.5155861996937778, 2.914883017297941, 0.6598107057203667, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.4266739543833184, 2.57332604561668, 1, 0, 0.1422246514611062, 2.34370996806056, 0, -13.25023902390937, 1, 0.1422246514611062, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2503088382611962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[1.938176029679386, 1.061226395871465, 1, 0, 0.6461873915846532, 0.5159490080812837, 0, -2.916934166083347, 1, 0.6461873915846532, 0.1768805803300194],
[0.3778660235190951, 2.290589888939249, 1, 0, 0.141604746683254, 2.646440637046231, 0, -14.9617365123326, 1, 0.141604746683254, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9982018499373351, 2.001798150062663, 0, 1, 0.3327339499791119, 0, 0.4995508662892394, 2.824226748675235, 0.667266050020888, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2295246504732971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.426076452853881, 2.573923547146118, 0, 0, 0.1420254842846271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9394310245325503, 2.024202868482472, 0, 0, 0.3169861927772833, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[1.241335637295737, 1.426863892240235, 1, 0, 0.4652334368380683, 0.8055838968568653, 0, -4.554394243584156, 1, 0.4652334368380683, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 1.000000000000001, 5.653531880855577, 0.4444444444444444, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -5.653531880855577, 1, 0.3333333333333334, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.241574632604046, 0, 0, 0.2295246504732971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6684559124583433, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2505028879575985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.3785726315175799, 2.040323640096819, 1, 0, 0.1565063520747486, 2.641501040345445, 0, -14.93381034490614, 1, 0.1565063520747486, 0.1768805803300194],
[0.9389424858921198, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3194831101320797, 1.065027959673022, 0, -6.021169524013996, 1, 0.3194831101320796, 0.1768805803300194],
[0.6684559124583433, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2505028879575985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[1.04459906597008, 1.864903800476214, 0, 1, 0.3590300865542599, 0, 0.5362206885656216, 3.031540757980069, 0.6409699134457401, 1, 0.1768805803300194],
[0.6682536302540366, 2.00059792337889, 1, 1, 0.2503899586863078, 1.496437811523523, 0.4998505638309671, -5.634237776883974, 0.937304868589069, 0.4380847859616847, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -5.653531880855577, 1, 0.3333333333333334, 0.1768805803300194],
[0.668253694536429, 2.33114905233777, 1, 2, 0.2227955866323199, 1.496437667574296, 0.8579459979164864, -3.609733010071132, 0.8732045779883261, 0.5305322387568634, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2503088382611962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9389425286728584, 2.06105747132714, 1, 0, 0.312980842890953, 1.065027911147494, 0, -6.021169249673372, 1, 0.312980842890953, 0.1768805803300194],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.006819966142427574, 2.993180033857572, 0, 1, 0.002273322047475858, 0, 0.3340928339386297, 1.88880448783743, 0.9977266779525241, 1, 0.1768805803300194],
[0.9757971315175266, 2.024202868482472, 0, 0, 0.3252657105058424, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[1.000434582677029, 1.938507957170698, 0, 1, 0.3404063091103725, 0, 0.5158606629913066, 2.916434704300645, 0.6595936908896275, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -5.653531880855577, 1, 0.3333333333333334, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9390077527567158, 2.060992247243283, 1, 1, 0.3130025842522388, 1.064953933622193, 0.4852031837274342, -3.277639347479945, 0.90202938225142, 0.5280345507558978, 0.1768805803300194],
[1.045277901475297, 1.864061941753988, 0, 0, 0.359283534341271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.002190344268326865, 2.244289190972121, 0.5, 1.25, 0.0009750118948189866, 228.2746174791665, 0.5569692199330865, -1287.408984267032, 0.9991468645666732, 0.001705646902350311, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9389424858511363, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3194831101225898, 1.065027959719509, 0, -6.021169524276812, 1, 0.3194831101225899, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 2.094532365312225, 0, 0, 0.2150770205595732, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.5739235471461178, 1.486645428321329, 0, 0, 0.278526734110379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2503088382611962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9394310245325503, 2.060568975467449, 0, 0, 0.3131436748441835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0, 2.244974618299884, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9389425398477275, 2.061057460152271, 1, 0, 0.3129808466159093, 1.065027898472014, 0, -6.021169178012142, 1, 0.3129808466159093, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.6677652106252385, 2.332234789374758, 0, 0, 0.2225884035417464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9989679430577088, 2.001032056942289, 0, 1, 0.3329893143525698, 0, 0.4997421188384492, 2.825308001059487, 0.6670106856474303, 1, 0.1768805803300194],
[0.6684559124583433, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2505028879575985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194],
[0.3775126908500573, 1.68305628461739, 0, 0, 0.1832079854373315, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1768805803300194]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node102":{
"Global MG94xREV":0.0006360152910504525,
"Nucleotide GTR":0.0006326609030594691,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "G", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GGT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node105":{
"Global MG94xREV":0.0006361034285489365,
"Nucleotide GTR":0.0006327485757147785,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "F", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "TTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node130":{
"Global MG94xREV":0.0001918014772767603,
"Nucleotide GTR":0.0001907899032138669,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node131":{
"Global MG94xREV":0.0004443916190585547,
"Nucleotide GTR":0.0004420478673732737,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "V", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node136":{
"Global MG94xREV":0.0006360667810532248,
"Nucleotide GTR":0.0006327121215004565,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "C", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "TGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node141":{
"Global MG94xREV":0.0006362138728588969,
"Nucleotide GTR":0.0006328584375339219,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "S", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "TCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node144":{
"Global MG94xREV":0.0006359127522373881,
"Nucleotide GTR":0.000632558905043092,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTC", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node147":{
"Global MG94xREV":0.0006366134536918601,
"Nucleotide GTR":0.0006332559109503383,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "Y", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TAT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node150":{
"Global MG94xREV":0.0006361500061671893,
"Nucleotide GTR":0.0006327949076794985,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAT", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node179":{
"Global MG94xREV":0.0006360152980532446,
"Nucleotide GTR":0.0006326609100253267,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTG", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node189":{
"Global MG94xREV":0.0006359998463627487,
"Nucleotide GTR":0.0006326455398281008,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "L", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CTT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node225":{
"Global MG94xREV":0.000636028397327172,
"Nucleotide GTR":0.000632673940212791,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "F", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "TTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node233":{
"Global MG94xREV":0.0006362083238779698,
"Nucleotide GTR":0.0006328529178186979,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "I", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "ATC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node240":{
"Global MG94xREV":0.0006363733629292577,
"Nucleotide GTR":0.0006330170864427808,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTT", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node263":{
"Global MG94xREV":0.0006360951285154676,
"Nucleotide GTR":0.0006327403194562518,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node27":{
"Global MG94xREV":0.0006361500067085848,
"Nucleotide GTR":0.0006327949082180389,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "V", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GTC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node291":{
"Global MG94xREV":0.0006361789240441113,
"Nucleotide GTR":0.0006328236730415659,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCT", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node294":{
"Global MG94xREV":0.0006361354864574483,
"Nucleotide GTR":0.0006327804645476959,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "F", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "TTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node297":{
"Global MG94xREV":0.0006360373515590671,
"Nucleotide GTR":0.000632682847219456,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "V", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GTT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node300":{
"Global MG94xREV":0.000636273426265137,
"Nucleotide GTR":0.0006329176768514385,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGT", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node303":{
"Global MG94xREV":0.0006363910061921048,
"Nucleotide GTR":0.0006330346366538579,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "L", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CTT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node307":{
"Global MG94xREV":0.0006362568567413404,
"Nucleotide GTR":0.0006329011947164392,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "TTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node310":{
"Global MG94xREV":0.000636443516954369,
"Nucleotide GTR":0.0006330868704707825,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAT", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node313":{
"Global MG94xREV":0.0006361559137158672,
"Nucleotide GTR":0.0006328007840713612,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "V", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GTC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node316":{
"Global MG94xREV":0.0006361616732092791,
"Nucleotide GTR":0.0006328065131888137,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node319":{
"Global MG94xREV":0.0006362143895290421,
"Nucleotide GTR":0.0006328589514791127,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "S", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "TCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node323":{
"Global MG94xREV":0.0006359547647709708,
"Nucleotide GTR":0.0006326006959997098,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "I", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATT", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node327":{
"Global MG94xREV":0.0006362755543696724,
"Nucleotide GTR":0.0006329197937322052,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "I", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATT", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node334":{
"Global MG94xREV":0.0006362818005446205,
"Nucleotide GTR":0.0006329260069644008,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node347":{
"Global MG94xREV":0.000635847992932068,
"Nucleotide GTR":0.0006324944872827615,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "L", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "CTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node354":{
"Global MG94xREV":0.000636005874975562,
"Nucleotide GTR":0.0006326515366455989,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACT", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node355":{
"Global MG94xREV":0.0006362942320077206,
"Nucleotide GTR":0.000632938372863118,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACA", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node361":{
"Global MG94xREV":0.0006360430340019078,
"Nucleotide GTR":0.0006326884996927074,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGT", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node369":{
"Global MG94xREV":0.0006361802563828563,
"Nucleotide GTR":0.0006328249983534658,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "V", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GTA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node370":{
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node376":{
"Global MG94xREV":0.0006362897815266193,
"Nucleotide GTR":0.0006329339458541563,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAT", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node386":{
"Global MG94xREV":0.0006361503436956405,
"Nucleotide GTR":0.0006327952434278018,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "I", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ATA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node412":{
"Global MG94xREV":0.0006359854202019411,
"Nucleotide GTR":0.0006326311897518481,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAT", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node468":{
"Global MG94xREV":0.0006362454701995015,
"Nucleotide GTR":0.0006328898682279978,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "C", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "TGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node488":{
"Global MG94xREV":0.0006359152788405444,
"Nucleotide GTR":0.000632561418320772,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAC", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node51":{
"Global MG94xREV":0.0006361244186072916,
"Nucleotide GTR":0.0006327694550701358,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "F", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "TTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node512":{
"Global MG94xREV":0.0006363032865799967,
"Nucleotide GTR":0.0006329473796809624,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAT", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node522":{
"Global MG94xREV":0.0006361466238300721,
"Nucleotide GTR":0.000632791543181058,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "S", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "TCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node539":{
"Global MG94xREV":0.000636163831700913,
"Nucleotide GTR":0.0006328086602964149,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "I", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ATT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node545":{
"Global MG94xREV":0.0006361886093593036,
"Nucleotide GTR":0.0006328333072757463,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "S", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "TCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node55":{
"Global MG94xREV":0.0006358517896748792,
"Nucleotide GTR":0.0006324982640012923,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCC", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node83":{
"Global MG94xREV":0.0006363335003589396,
"Nucleotide GTR":0.0006329774341103752,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTT", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node85":{
"Global MG94xREV":0.0006363405284293612,
"Nucleotide GTR":0.0006329844251142751,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTT", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAA", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406844_Victoria_20200125_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361550112545146,
"Nucleotide GTR":0.0006327998863696511,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCC", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406844_Victoria_20200125_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_407084_Aichi_20200125_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "L", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CTT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_407084_Aichi_20200125_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408483_Shanghai_20200120_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006369010056532434,
"Nucleotide GTR":0.0006335419463430814,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "Q", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAA", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408483_Shanghai_20200120_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408484_Sichuan_20200115_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006366644746377031,
"Nucleotide GTR":0.0006333066628082354,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "Y", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TAT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408484_Sichuan_20200115_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_411956_Texas_20200211_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001274040432155965,
"Nucleotide GTR":0.00126732105608783,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "A", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAC", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTA", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GCT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_411956_Texas_20200211_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412967_Guangzhou_20200129_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "I", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ATA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412967_Guangzhou_20200129_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCC", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413596_NSW_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "KN", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAN", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413596_NSW_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413871_Guangdong_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "L", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "ILVF", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CTT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "NTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413871_Guangdong_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414010_England_20200226_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "TPAS", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "NCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414010_England_20200226_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414578_Talca_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "ILVF", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "NTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414578_Talca_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414648_California_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361713624496054,
"Nucleotide GTR":0.0006328161513274262,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "TTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414648_California_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415503_Noord_Brabant_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361582789139564,
"Nucleotide GTR":0.000632803136795235,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "F", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TTT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415503_Noord_Brabant_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415594_Washington_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000636706904886956,
"Nucleotide GTR":0.0006333488692774627,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCA", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415594_Washington_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416315_Hong_Kong_20200219_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "I", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATT", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416315_Hong_Kong_20200219_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00127407504719054,
"Nucleotide GTR":0.001267355488560353,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACC", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAT", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416374_Shanghai_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006363854575959709,
"Nucleotide GTR":0.0006330291173213985,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "E", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAG", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416374_Shanghai_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416395_Shanghai_20200209_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361550112573177,
"Nucleotide GTR":0.00063279988637244,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "S", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TCA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416395_Shanghai_20200209_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006363516476480189,
"Nucleotide GTR":0.0006329954856894152,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "T", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "ACT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416495_Hauts_de_France_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361541359864504,
"Nucleotide GTR":0.000632799015717811,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "A", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "GCA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416495_Hauts_de_France_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416526_Auckland_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAT", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416526_Auckland_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416700_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361637622722364,
"Nucleotide GTR":0.0006328085912339093,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416700_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416702_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006362890702652627,
"Nucleotide GTR":0.000632933238344041,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTG", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416702_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416746_ARA_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361582801771255,
"Nucleotide GTR":0.0006328031380517425,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "L", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CTC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416746_ARA_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416994_Castilla_y_Le_n_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361713624496054,
"Nucleotide GTR":0.0006328161513274262,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTT", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416994_Castilla_y_Le_n_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417165_Washington_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006363317900338615,
"Nucleotide GTR":0.0006329757328056681,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGT", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417165_Washington_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417242_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "LF", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTN", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417242_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417351_Washington_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006359668521381238,
"Nucleotide GTR":0.0006326127196172646,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "V", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GTT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417351_Washington_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417365_Washington_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006364060560584225,
"Nucleotide GTR":0.0006330496071461546,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "S", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "TCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417365_Washington_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417374_Washington_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000636052461897428,
"Nucleotide GTR":0.0006326978778648627,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAT", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417374_Washington_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417420_NanChang_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006362200248214506,
"Nucleotide GTR":0.0006328645570506046,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "V", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "N", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GTA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "AAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417420_NanChang_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417500_Minnesota_20200314_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTN", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417500_Minnesota_20200314_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417520_Taoyuan_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361010484983775,
"Nucleotide GTR":0.0006327462082167684,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "L", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TTA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417520_Taoyuan_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417689_Reykjavik_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361009946008022,
"Nucleotide GTR":0.0006327461546034531,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAT", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417689_Reykjavik_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417709_Reykjavik_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAC", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417709_Reykjavik_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417760_Reykjavik_20200306_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "F", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "TTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417760_Reykjavik_20200306_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417834_Reykjavik_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001273415241737466,
"Nucleotide GTR":0.001266699162966205,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "L", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCA", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CTA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417834_Reykjavik_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361582235421924,
"Nucleotide GTR":0.0006328030817155056,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "I", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "ATT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417939_California_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006363960319598389,
"Nucleotide GTR":0.0006330396359153498,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "N", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "AAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417939_California_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417972_Madrid_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006359269136326625,
"Nucleotide GTR":0.0006325729917502033,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCC", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417972_Madrid_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418065_Washington_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006363984275200834,
"Nucleotide GTR":0.0006330420188412459,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "I", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ATA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418065_Washington_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418080_Washington_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006362046110588124,
"Nucleotide GTR":0.0006328492245812013,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "F", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTT", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418080_Washington_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418241_Boufarik_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361010484983775,
"Nucleotide GTR":0.0006327462082167684,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "Y", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "TAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418241_Boufarik_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418263_Athens_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006360163330366484,
"Nucleotide GTR":0.0006326619395501575,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTC", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418263_Athens_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418309_Derbyshire_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006359070839374625,
"Nucleotide GTR":0.0006325532666381668,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "G", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GGT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418309_Derbyshire_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418330_Ontario_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006359874605434353,
"Nucleotide GTR":0.000632633219332442,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "T", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ACC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418330_Ontario_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418341_Ontario_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006364225670086767,
"Nucleotide GTR":0.0006330660310165314,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "F", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "TTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418341_Ontario_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006362046098497982,
"Nucleotide GTR":0.0006328492233785639,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCT", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006366444898931201,
"Nucleotide GTR":0.0006332867834645586,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "K", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "AAG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418390_Finland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006362141749351089,
"Nucleotide GTR":0.0006328587380169625,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "I", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "ATC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418390_Finland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418737_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACN", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418737_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418835_British_Columbia_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006364705807064639,
"Nucleotide GTR":0.0006331137914868054,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACT", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418835_British_Columbia_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418850_British_Columbia_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361867116053395,
"Nucleotide GTR":0.0006328314195306669,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "I", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "ATT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418850_British_Columbia_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418874_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00063633308616259,
"Nucleotide GTR":0.0006329770220985261,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "T", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "ACA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418874_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418928_Washington_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361109808473636,
"Nucleotide GTR":0.0006327560881818697,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAC", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418928_Washington_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418977_New_York_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361009946008022,
"Nucleotide GTR":0.0006327461546034531,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "Y", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "TAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418977_New_York_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361713090782094,
"Nucleotide GTR":0.0006328160982375136,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "S", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "TCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419266_Ghent_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAT", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419266_Ghent_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419405_Wales_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "KTRM", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "ANG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419405_Wales_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419557_Georgia_20200229_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006362141194980559,
"Nucleotide GTR":0.000632858682872289,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "F", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "TTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419557_Georgia_20200229_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "EAGV", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GNG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419675_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006360163334592904,
"Nucleotide GTR":0.0006326619399705715,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGC", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419675_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419772_Victoria_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006363974856361167,
"Nucleotide GTR":0.0006330410819248406,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAA", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419772_Victoria_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419819_Victoria_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006359874605269538,
"Nucleotide GTR":0.000632633219316048,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGC", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419819_Victoria_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419952_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACN", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419952_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419987_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006362141757114779,
"Nucleotide GTR":0.0006328587387892367,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "F", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "TTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419987_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419994_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGT", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419994_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420050_Hauts_de_France_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006362165338275678,
"Nucleotide GTR":0.0006328610844684626,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAT", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420050_Hauts_de_France_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420070_Dakar_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361010484983775,
"Nucleotide GTR":0.0006327462082167684,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAT", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420070_Dakar_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420102_Singapore_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361009946008022,
"Nucleotide GTR":0.0006327461546034531,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAT", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420102_Singapore_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "DAGV", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GNC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420107_Singapore_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006362141749380263,
"Nucleotide GTR":0.0006328587380198644,
"amino-acid": [
["S", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420107_Singapore_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420111_Singapore_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "KN", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAN", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420111_Singapore_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420191_South_Yorkshire_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361156003280845,
"Nucleotide GTR":0.0006327606832991331,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAT", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420191_South_Yorkshire_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420224_South_Yorkshire_20200326_null_14":{
"Global MG94xREV":0.0006360905696376442,
"Nucleotide GTR":0.0006327357846222612,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "V", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GTC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420224_South_Yorkshire_20200326_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420257_Derbyshire_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "S", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "TCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420257_Derbyshire_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420287_South_Yorkshire_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "S", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "TCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420287_South_Yorkshire_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420355_Ronse_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006359507364876463,
"Nucleotide GTR":0.0006325966889618262,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "Y", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "TAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420355_Ronse_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420372_Vorst_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006389890991681894,
"Nucleotide GTR":0.0006356190271105201,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "C", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "Q", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "TGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAG", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420372_Vorst_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420415_Montignies_Sur_Sambre_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361009941593693,
"Nucleotide GTR":0.000632746154164348,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAT", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420415_Montignies_Sur_Sambre_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "HPRL", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CNT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420623_ARA_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006361156003309348,
"Nucleotide GTR":0.0006327606833019698,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTT", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420623_ARA_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420694_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "ILVF", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "TTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "NTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420694_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420718_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "KN", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAN", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420718_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420727_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006362141749380263,
"Nucleotide GTR":0.0006328587380198644,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "D", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAT", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420727_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420730_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAN", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420730_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421189_Li_ge_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006363984275200834,
"Nucleotide GTR":0.0006330420188412459,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "S", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "TCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421189_Li_ge_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421196_Li_ge_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361010484983775,
"Nucleotide GTR":0.0006327462082167684,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "V", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GTT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421196_Li_ge_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421214_Li_ge_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361582801771255,
"Nucleotide GTR":0.0006328031380517425,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "N", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAT", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421214_Li_ge_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421305_Wisconsin_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006360163846694293,
"Nucleotide GTR":0.0006326619909106242,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATC", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421305_Wisconsin_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421312_Wisconsin_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006366444898931201,
"Nucleotide GTR":0.0006332867834645586,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCA", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421312_Wisconsin_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000636135865795417,
"Nucleotide GTR":0.0006327808418850099,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "Y", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "TAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421465_Portugal_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006360163334592904,
"Nucleotide GTR":0.0006326619399705715,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "L", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "CTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421465_Portugal_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421489_Portugal_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361582240125677,
"Nucleotide GTR":0.0006328030821834001,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "S", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "TCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421489_Portugal_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421514_Centre__Val_de_Loire_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006360163846694293,
"Nucleotide GTR":0.0006326619909106242,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAC", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421514_Centre__Val_de_Loire_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421574_KZN_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006363759226883042,
"Nucleotide GTR":0.0006330196327014836,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "I", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCC", "GCA", "TTA", "ATA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421574_KZN_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421616_New_York_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000635907136952824,
"Nucleotide GTR":0.0006325533193739211,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "R", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AGA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421616_New_York_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421631_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001272812541055024,
"Nucleotide GTR":0.001266099640968239,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "V", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAC", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GTT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421631_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421669_India_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006359070852980946,
"Nucleotide GTR":0.0006325532679916227,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTG", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421669_India_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421688_Minnesota_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006362046098497982,
"Nucleotide GTR":0.0006328492233785639,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "L", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CTA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421688_Minnesota_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421707_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006363749364372868,
"Nucleotide GTR":0.0006330186516520215,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421707_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421721_New_York_20200317_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006361010484818873,
"Nucleotide GTR":0.0006327462082003649,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "S", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "TCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421721_New_York_20200317_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421728_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361067644152195,
"Nucleotide GTR":0.0006327518939874756,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "C", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TGT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421728_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421743_Luxembourg_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "V", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GTT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421743_Luxembourg_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421893_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "KTRI", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ANA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421893_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422017_Wales_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006367361194314643,
"Nucleotide GTR":0.0006333779297424725,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "ILV", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "NTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAA", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422017_Wales_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422042_Wales_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006358985884472741,
"Nucleotide GTR":0.0006325448159537723,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "L", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "TTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422042_Wales_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422046_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006363743262542237,
"Nucleotide GTR":0.0006330180446871057,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "H", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAT", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTT", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAA", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422046_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422098_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "V", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GTC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422098_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422252_Wales_20200325_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "KN", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAN", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422252_Wales_20200325_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422255_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "QH", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAN", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422255_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422332_Wales_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006365564354451944,
"Nucleotide GTR":0.0006331991934217925,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "G", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "GG-", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422332_Wales_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422333_Wales_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "EAGV", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GNA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422333_Wales_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422412_Taipei_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTN", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422412_Taipei_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422414_Taipei_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000636071172432822,
"Nucleotide GTR":0.0006327164897196184,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTC", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422414_Taipei_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422424_Dasman_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "EAGV", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GNA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422424_Dasman_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422426_Dasman_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTN", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422426_Dasman_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422505_New_York_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361582240295671,
"Nucleotide GTR":0.0006328030822003103,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "F", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "TTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422505_New_York_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422573_Friesland_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361010484818873,
"Nucleotide GTR":0.0006327462082003649,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAT", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422573_Friesland_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422713_Netherlands_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001272979751961162,
"Nucleotide GTR":0.001266265969992662,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "F", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "F", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "F", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "TTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "TTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "TTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422713_Netherlands_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422741_Netherlands_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006360712250516853,
"Nucleotide GTR":0.0006327165420609669,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAC", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422741_Netherlands_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422775_Netherlands_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006363974856332641,
"Nucleotide GTR":0.0006330410819220032,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAA", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422775_Netherlands_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422860_Noord_Brabant_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006362972152051425,
"Nucleotide GTR":0.0006329413403269537,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTA", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422860_Noord_Brabant_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422913_Zuid_Holland_20200318_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006361010489203684,
"Nucleotide GTR":0.0006327462086365338,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTT", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422913_Zuid_Holland_20200318_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422925_Zuid_Holland_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006363117882511857,
"Nucleotide GTR":0.0006329558365137575,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "H", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAC", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422925_Zuid_Holland_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422947_Zuid_Holland_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGT", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422947_Zuid_Holland_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422954_Zuid_Holland_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006361260117510797,
"Nucleotide GTR":0.0006327710398115741,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAC", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422954_Zuid_Holland_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422956_Zuid_Holland_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006361009946008022,
"Nucleotide GTR":0.0006327461546034531,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "Y", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "TAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422956_Zuid_Holland_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423008_Washington_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006359855992846901,
"Nucleotide GTR":0.0006326313678901026,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "G", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "GGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423008_Washington_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423011_Washington_20200319_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006371359505008529,
"Nucleotide GTR":0.0006337756520755516,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGA", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423011_Washington_20200319_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423027_Washington_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006359874609597381,
"Nucleotide GTR":0.0006326332197465489,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCC", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423027_Washington_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423055_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361010484983775,
"Nucleotide GTR":0.0006327462082167684,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "I", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ATT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423055_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423124_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "S", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "TCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423124_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423136_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006363975402712728,
"Nucleotide GTR":0.0006330411362718465,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAA", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423136_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423153_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "YSCF", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TNT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423153_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423158_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006363794727322784,
"Nucleotide GTR":0.0006330231640222845,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "F", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "V", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "TTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GTC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423158_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423177_England_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000636135865795417,
"Nucleotide GTR":0.0006327808418850099,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTT", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423177_England_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423178_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "LF", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTN", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423178_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423363_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006362928792298626,
"Nucleotide GTR":0.0006329370272199019,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "S", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "TCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "TTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423363_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423387_England_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "KQE", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "NAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423387_England_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423399_England_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000636135865795417,
"Nucleotide GTR":0.0006327808418850099,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "I", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ATA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423399_England_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423428_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006362141199838687,
"Nucleotide GTR":0.000632858683355539,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "I", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATT", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423428_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423454_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "DAGV", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GNT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423454_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423457_England_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTG", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423457_England_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423461_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "QH", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAN", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTG", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423461_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423467_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "SRGC", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "NGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423467_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423469_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006360267200699788,
"Nucleotide GTR":0.0006326722718015665,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "I", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAT", "ATT", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423469_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423492_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "DAGV", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GNT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423492_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423494_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "DAGV", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GNT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423494_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423530_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "DAGV", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GNC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423530_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423567_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "SRGC", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "NGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423567_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423569_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "EAGV", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GNG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423569_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423579_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGN", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423579_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423778_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAN", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423778_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423783_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "KTRI", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "ANA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423783_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423803_England_20200324_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "C", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "TGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423803_England_20200324_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423804_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "SRGC", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "C", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "NGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "TGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423804_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423808_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006360973321459372,
"Nucleotide GTR":0.0006327425114646232,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAT", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423808_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423825_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "YSCF", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TNT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423825_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423845_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006360973321459372,
"Nucleotide GTR":0.0006327425114646232,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "Y", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "TAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423845_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424181_USA_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006363398332828656,
"Nucleotide GTR":0.0006329837336340287,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "V", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GTC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424181_USA_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424220_Washington_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006363984275229393,
"Nucleotide GTR":0.0006330420188440876,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "L", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CTA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424220_Washington_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424257_Washington_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "Y", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TAT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424257_Washington_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424277_Washington_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006384334858384571,
"Nucleotide GTR":0.0006350663441233548,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "A", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GCT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424277_Washington_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424286_Oregon_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006360716462086056,
"Nucleotide GTR":0.0006327169609966762,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "I", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATT", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424286_Oregon_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424324_Washington_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006362141757255092,
"Nucleotide GTR":0.0006328587388031947,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "L", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "TTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424324_Washington_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424339_Washington_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006361010489232101,
"Nucleotide GTR":0.0006327462086393606,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "L", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CTT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424339_Washington_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424369_Reykjavik_20200301_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006361009941593693,
"Nucleotide GTR":0.000632746154164348,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "V", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GTT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424369_Reykjavik_20200301_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCT", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424491_Reykjavik_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006362141187053544,
"Nucleotide GTR":0.0006328586820837675,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "I", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATT", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424491_Reykjavik_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424662_Li_ge_20200405_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0006361259953454087,
"Nucleotide GTR":0.0006327710234924278,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "F", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTT", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424662_Li_ge_20200405_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424663_Li_ge_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006361713624496054,
"Nucleotide GTR":0.0006328161513274262,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAT", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424663_Li_ge_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424849_Arizona_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "KTRI", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "ANA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424849_Arizona_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424893_Virginia_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCN", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424893_Virginia_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424947_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006362992354930963,
"Nucleotide GTR":0.0006329433499597704,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGA", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424947_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424955_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006364273689607388,
"Nucleotide GTR":0.0006330708076427716,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGA", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424955_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425061_Ghent_20200325_null_9":{
"Global MG94xREV":0.0006360163334422663,
"Nucleotide GTR":0.0006326619399536367,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAC", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425061_Ghent_20200325_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425146_Wisconsin_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361156003309348,
"Nucleotide GTR":0.0006327606833019698,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAT", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425146_Wisconsin_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425218_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006359070843578407,
"Nucleotide GTR":0.0006325532670563276,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "R", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CGT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425218_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425247_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006368408291101405,
"Nucleotide GTR":0.0006334820871751672,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "DAGV", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTT", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GNT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425247_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425254_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "S", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "DAGV", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "TCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GNT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425254_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425279_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006360163330366484,
"Nucleotide GTR":0.0006326619395501575,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "T", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ACG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425279_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425301_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361713095274183,
"Nucleotide GTR":0.0006328160986843545,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACT", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425301_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425331_England_20200329_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006360973844420104,
"Nucleotide GTR":0.0006327425634848846,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "S", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "TCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425331_England_20200329_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425395_England_20200316_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTC", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425395_England_20200316_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425425_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006366510987517174,
"Nucleotide GTR":0.0006332933574675848,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "T", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "ACT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425425_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425436_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "C", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "DAGV", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "TGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GNT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425436_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425484_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006367093463876087,
"Nucleotide GTR":0.0006333512979014744,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "DAGV", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACT", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GNT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425484_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425491_England_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006359071369354699,
"Nucleotide GTR":0.0006325533193566588,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTG", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425491_England_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425562_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "DAGV", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTC", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GNT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425562_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425576_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAT", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425576_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425658_Scotland_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006358314719197795,
"Nucleotide GTR":0.0006324780534034176,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "L", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "P", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "CTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "CCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425658_Scotland_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425699_Scotland_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006363316480929802,
"Nucleotide GTR":0.0006329755916133942,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGT", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425699_Scotland_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425724_Scotland_20200312_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006363728117613291,
"Nucleotide GTR":0.0006330165381817504,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "D", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAT", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425724_Scotland_20200312_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425788_Scotland_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "KTRI", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "ANA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425788_Scotland_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425810_Scotland_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006383784835966938,
"Nucleotide GTR":0.0006350116319671628,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTC", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425810_Scotland_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425847_Scotland_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "Y", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "DAGV", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TAT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GNT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425847_Scotland_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425863_Scotland_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006359967656687241,
"Nucleotide GTR":0.0006326424753818659,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "L", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "TTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425863_Scotland_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425873_Scotland_20200320_null_13":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "V", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425873_Scotland_20200320_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425908_Scotland_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361582240295671,
"Nucleotide GTR":0.0006328030822003103,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "Y", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "TAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425908_Scotland_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425953_Scotland_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "F", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "TTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425953_Scotland_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426022_Scotland_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "C", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "TGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426022_Scotland_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426028_New_York_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006368531291496682,
"Nucleotide GTR":0.0006334943223434474,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "N", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "AAT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426028_New_York_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426070_Idaho_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAT", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426070_Idaho_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426072_Idaho_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361582240125677,
"Nucleotide GTR":0.0006328030821834001,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "I", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATT", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426072_Idaho_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426096_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361741033404117,
"Nucleotide GTR":0.0006328188777625861,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "G", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "GGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426096_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426325_New_York_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACA", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426325_New_York_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426469_Virginia_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "SL", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TNA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426469_Virginia_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426472_Virginia_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426472_Virginia_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426530_Arizona_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361156003280845,
"Nucleotide GTR":0.0006327606832991331,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAT", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426530_Arizona_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426627_Louisiana_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361582789139564,
"Nucleotide GTR":0.000632803136795235,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "I", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "ATA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426627_Louisiana_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426668_Victoria_20200322_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006360992966671452,
"Nucleotide GTR":0.0006327444656248123,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "C", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TGT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426668_Victoria_20200322_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426676_Victoria_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361156003309348,
"Nucleotide GTR":0.0006327606833019698,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "I", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ATA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426676_Victoria_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001276003807460605,
"Nucleotide GTR":0.001269274076417305,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "L", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "I", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTA", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ATC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGN", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426754_Victoria_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "V", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GTC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426754_Victoria_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426816_Victoria_20200325_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "S", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "TCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426816_Victoria_20200325_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426817_Victoria_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361000410773284,
"Nucleotide GTR":0.0006327452061089262,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTC", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426817_Victoria_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426833_Victoria_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006361010475884174,
"Nucleotide GTR":0.0006327462073116078,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATT", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426833_Victoria_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426867_Victoria_20200326_null_15":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTT", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAA", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426867_Victoria_20200326_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426878_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001272580661902458,
"Nucleotide GTR":0.001265868984762127,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "Y", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "I", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "TAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATT", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426878_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426882_Victoria_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000636223885522769,
"Nucleotide GTR":0.000632868397390322,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCT", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTT", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426882_Victoria_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426902_Northern_territory_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361155998989773,
"Nucleotide GTR":0.0006327606828722908,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "C", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "TGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426902_Northern_territory_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426927_Victoria_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006361155456921041,
"Nucleotide GTR":0.0006327606289513068,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "V", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GTT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426927_Victoria_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426944_Victoria_20200328_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "G", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GGT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426944_Victoria_20200328_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426983_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361156003309348,
"Nucleotide GTR":0.0006327606833019698,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCT", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426983_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427129_Victoria_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "F", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "TTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427129_Victoria_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427140_Victoria_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00063610004108013,
"Nucleotide GTR":0.0006327452061117135,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTC", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427140_Victoria_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427165_Connecticut_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000636115599008396,
"Nucleotide GTR":0.0006327606819864052,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGT", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427165_Connecticut_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427184_Washington_20200325_null_9":{
"Global MG94xREV":0.0006361156003470182,
"Nucleotide GTR":0.0006327606833179673,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTT", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427184_Washington_20200325_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427284_Minnesota_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00063610004108013,
"Nucleotide GTR":0.0006327452061117135,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAC", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427284_Minnesota_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427288_Ohio_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006360087461029601,
"Nucleotide GTR":0.0006326543926304748,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "L", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "CTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427288_Ohio_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427349_Liege_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006359856520977407,
"Nucleotide GTR":0.0006326314204246127,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "R", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AGG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427349_Liege_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427359_Liege_20200406_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACT", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427359_Liege_20200406_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427364_Liege_20200407_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006361993297604468,
"Nucleotide GTR":0.000632843971136764,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCT", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427364_Liege_20200407_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427376_Liege_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361009946008022,
"Nucleotide GTR":0.0006327461546034531,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "TTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427376_Liege_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427417_Doha_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "DAGV", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GNT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427417_Doha_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427452_Wisconsin_20200410_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006361582789139564,
"Nucleotide GTR":0.000632803136795235,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTT", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427452_Wisconsin_20200410_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427457_Wisconsin_20200413_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006361582789139564,
"Nucleotide GTR":0.000632803136795235,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "C", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "TGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427457_Wisconsin_20200413_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427470_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006360163330366484,
"Nucleotide GTR":0.0006326619395501575,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAC", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427470_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427493_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361156003309348,
"Nucleotide GTR":0.0006327606833019698,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "TTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427493_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427516_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006360973321459372,
"Nucleotide GTR":0.0006327425114646232,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "I", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ATT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427516_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427577_New_York_20200315_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006361582789139564,
"Nucleotide GTR":0.000632803136795235,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "F", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "TTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427577_New_York_20200315_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427610_New_York_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "KN", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "V", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAN", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GTA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427610_New_York_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427629_New_York_20200330_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0006362338466575926,
"Nucleotide GTR":0.0006328783059894416,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "V", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAT", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GTA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427629_New_York_20200330_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427664_New_South_Wales_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006364605961953349,
"Nucleotide GTR":0.0006331038596346675,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "S", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAT", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427664_New_South_Wales_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427695_New_South_Wales_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006361582235421924,
"Nucleotide GTR":0.0006328030817155056,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "I", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATT", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427695_New_South_Wales_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427710_New_South_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361000415099267,
"Nucleotide GTR":0.0006327452065392431,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTC", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427710_New_South_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427721_New_South_Wales_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006361000410773284,
"Nucleotide GTR":0.0006327452061089262,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAC", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427721_New_South_Wales_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427732_New_South_Wales_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006359018392332868,
"Nucleotide GTR":0.000632548049594919,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "L", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTT", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "CTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427732_New_South_Wales_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427740_New_South_Wales_20200321_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006361009946008022,
"Nucleotide GTR":0.0006327461546034531,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "F", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "TTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427740_New_South_Wales_20200321_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427756_New_South_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006360163330366484,
"Nucleotide GTR":0.0006326619395501575,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAC", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427756_New_South_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427765_New_South_Wales_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006363316480929802,
"Nucleotide GTR":0.0006329755916133942,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "Y", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "TAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427765_New_South_Wales_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427773_New_South_Wales_20200325_null_13":{
"Global MG94xREV":0.0006361010475884174,
"Nucleotide GTR":0.0006327462073116078,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "S", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "TCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427773_New_South_Wales_20200325_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427791_New_South_Wales_20200324_null_15":{
"Global MG94xREV":0.0006361009946008022,
"Nucleotide GTR":0.0006327461546034531,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "I", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ATA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427791_New_South_Wales_20200324_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427800_New_South_Wales_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006360040976913527,
"Nucleotide GTR":0.0006326497687349073,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "Y", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "TAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427800_New_South_Wales_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428231_New_Taipei_City_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006364071535892564,
"Nucleotide GTR":0.0006330506988885365,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "I", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "ATC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428231_New_Taipei_City_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428252_Wisconsin_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361156532090653,
"Nucleotide GTR":0.0006327607359012169,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "M", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ATG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428252_Wisconsin_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428257_Wisconsin_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361156003309348,
"Nucleotide GTR":0.0006327606833019698,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAT", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428257_Wisconsin_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428260_Wisconsin_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000635916954969939,
"Nucleotide GTR":0.0006325630856101454,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "H", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAT", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428260_Wisconsin_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428350_Hauts_De_France_20200324_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006361156003309348,
"Nucleotide GTR":0.0006327606833019698,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "L", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428350_Hauts_De_France_20200324_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428670_Sri_Lanka_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006359688533219635,
"Nucleotide GTR":0.0006326147102467245,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "I", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATC", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428670_Sri_Lanka_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428698_Madrid_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361582240125677,
"Nucleotide GTR":0.0006328030821834001,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "I", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATT", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428698_Madrid_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428700_Madrid_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "L", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CTT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428700_Madrid_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428710_Madrid_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006360163846694293,
"Nucleotide GTR":0.0006326619909106242,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAC", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428710_Madrid_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428752_Connecticut_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006360072210267701,
"Nucleotide GTR":0.0006326528755976409,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "V", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GTA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428752_Connecticut_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428761_New_York_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006364358920840686,
"Nucleotide GTR":0.0006330792858145674,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "V", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACT", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GTA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428761_New_York_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428767_New_York_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006363974860650264,
"Nucleotide GTR":0.0006330410823514876,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "S", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "AGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428767_New_York_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428794_New_York_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006362972152051425,
"Nucleotide GTR":0.0006329413403269537,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "I", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "ATC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428794_New_York_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428850_Singapore_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006363470801074881,
"Nucleotide GTR":0.0006329909422384046,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTT", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGT", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428850_Singapore_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428860_Moscow_20200311_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "F", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "TTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428860_Moscow_20200311_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428861_Moscow_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "I", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "ATC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428861_Moscow_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428866_Lipetsk_Region_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006360992435820197,
"Nucleotide GTR":0.0006327444128196613,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "V", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "GTA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428866_Lipetsk_Region_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428904_Moscow_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361068158463651,
"Nucleotide GTR":0.0006327519451473698,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTG", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428904_Moscow_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428924_Chelyabinsk_Region_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006363974860650264,
"Nucleotide GTR":0.0006330410823514876,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "I", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "ATA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428924_Chelyabinsk_Region_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428926_Malopolskie_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006360163320990265,
"Nucleotide GTR":0.0006326619386174819,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAC", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428926_Malopolskie_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428992_California_20200408_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0006361010489232101,
"Nucleotide GTR":0.0006327462086393606,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "L", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CTT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428992_California_20200408_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429013_California_20200328_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006361156003470182,
"Nucleotide GTR":0.0006327606833179673,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTT", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429013_California_20200328_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429037_California_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361010484818873,
"Nucleotide GTR":0.0006327462082003649,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCT", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429037_California_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429043_California_20200408_null_31":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTT", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429043_California_20200408_null_31",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429182_Bangkok_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "KQE", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "NAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429182_Bangkok_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429215_Switzerland_20200323_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0006360163846694293,
"Nucleotide GTR":0.0006326619909106242,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "T", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ACA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429215_Switzerland_20200323_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429229_Abruzzo_20200321_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "ILVF", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "NTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429229_Abruzzo_20200321_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429233_Abruzzo_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "NHDY", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "NAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429233_Abruzzo_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429294_Unknown_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006360992966671452,
"Nucleotide GTR":0.0006327444656248123,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "E", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "GAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429294_Unknown_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429336_Unknown_20200303_null_11":{
"Global MG94xREV":0.0006361010484983775,
"Nucleotide GTR":0.0006327462082167684,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "I", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ATC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429336_Unknown_20200303_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429382_Unknown_20200309_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0006361010484818873,
"Nucleotide GTR":0.0006327462082003649,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAT", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429382_Unknown_20200309_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429394_Unknown_20200309_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "I", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ATT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429394_Unknown_20200309_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429416_Unknown_20200310_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0006361009946008022,
"Nucleotide GTR":0.0006327461546034531,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "I", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ATA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429416_Unknown_20200310_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429438_Unknown_20200310_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0006361010489203684,
"Nucleotide GTR":0.0006327462086365338,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTT", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429438_Unknown_20200310_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429452_Unknown_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006360163846694293,
"Nucleotide GTR":0.0006326619909106242,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATC", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429452_Unknown_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429463_Unknown_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00063610004108013,
"Nucleotide GTR":0.0006327452061117135,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "T", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ACT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429463_Unknown_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429530_Unknown_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006361713090810634,
"Nucleotide GTR":0.0006328160982403523,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAT", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429530_Unknown_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429565_Unknown_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006363516476480189,
"Nucleotide GTR":0.0006329954856894152,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "Y", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TAC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429565_Unknown_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429581_Unknown_20200324_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006361582789139564,
"Nucleotide GTR":0.000632803136795235,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "N", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAT", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429581_Unknown_20200324_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429612_Washington_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006366112015707018,
"Nucleotide GTR":0.0006332536707070205,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "I", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "ATC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429612_Washington_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429618_Washington_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "I", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATT", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429618_Washington_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429644_Washington_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000636171362016523,
"Nucleotide GTR":0.0006328161508966275,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "I", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ATT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429644_Washington_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429782_Luxembourg_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006366644170540786,
"Nucleotide GTR":0.0006333066055283117,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "N", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "AAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429782_Luxembourg_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429789_Luxembourg_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006359967651500801,
"Nucleotide GTR":0.0006326424748659566,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATT", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429789_Luxembourg_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429802_Istria_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361713624496054,
"Nucleotide GTR":0.0006328161513274262,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAT", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429802_Istria_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429870_Sakarya_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTT", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429870_Sakarya_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429982_Virginia_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361582240125677,
"Nucleotide GTR":0.0006328030821834001,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "L", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CTC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429982_Virginia_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430008_Amman_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "DAGV", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GNT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430008_Amman_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430070_St_Petersburg_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006363854575931402,
"Nucleotide GTR":0.0006330291173185818,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "C", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TGT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430070_St_Petersburg_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430109_St_Petersburg_20200415_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006361582789139564,
"Nucleotide GTR":0.000632803136795235,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "F", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TTC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430109_St_Petersburg_20200415_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430111_St_Petersburg_20200415_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAT", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430111_St_Petersburg_20200415_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430124_Washington_20200306_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006364516865923072,
"Nucleotide GTR":0.0006330949970214947,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "L", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CTT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430124_Washington_20200306_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430132_Washington_20200317_null_81":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "L", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "CTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430132_Washington_20200317_null_81",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430148_Washington_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001272889030024392,
"Nucleotide GTR":0.001266175726529569,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "V", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCC", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GTT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430148_Washington_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430191_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006362646042257221,
"Nucleotide GTR":0.0006329089013400608,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "TTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430191_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430235_Washington_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000636354524319265,
"Nucleotide GTR":0.0006329983471889015,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "I", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATT", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430235_Washington_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430295_Washington_20200225_null_889":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430295_Washington_20200225_null_889",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430326_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006363516476480189,
"Nucleotide GTR":0.0006329954856894152,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "D", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GAC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430326_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430330_New_York_20200330_null_7787":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430330_New_York_20200330_null_7787",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430341_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361549582316369,
"Nucleotide GTR":0.0006327998336264209,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAC", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430341_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430357_New_York_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006384659668097613,
"Nucleotide GTR":0.0006350986537878027,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "S", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "A", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "TCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "GCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430357_New_York_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430365_New_York_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006361713090782094,
"Nucleotide GTR":0.0006328160982375136,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTT", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430365_New_York_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430380_New_York_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361582789139564,
"Nucleotide GTR":0.000632803136795235,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "I", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "ATC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430380_New_York_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006366644170540786,
"Nucleotide GTR":0.0006333066055283117,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "Y", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TAT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430405_New_Jersey_20200410_null_213":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430405_New_Jersey_20200410_null_213",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430414_New_York_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006361713082094107,
"Nucleotide GTR":0.0006328160973732971,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "S", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "TCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430414_New_York_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430420_New_York_20200413_null_121":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "V", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GTA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430420_New_York_20200413_null_121",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430439_Malaysia_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006368368209680013,
"Nucleotide GTR":0.0006334781001722429,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "L", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTA", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430439_Malaysia_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 321, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345, 346, 347, 348, 349, 350, 351, 352, 353, 354, 355, 356, 357, 358, 359, 360, 361, 362, 363, 364, 365, 366, 367, 368, 369, 370, 371, 372, 373, 374, 375, 376, 377, 378, 379, 380, 381, 382, 383, 384, 385, 386, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 393, 394, 395, 396, 397, 398, 399, 400, 401, 402, 403, 404, 405, 406, 407, 408, 409, 410, 411, 412, 413, 414, 415, 416, 417, 418, 419, 420, 421, 422, 423, 424, 425, 426, 427, 428, 429, 430, 431, 432, 433, 434, 435, 436, 437, 438, 439, 440, 441, 442, 443, 444, 445, 446, 447, 448, 449, 450, 451, 452, 453, 454, 455, 456, 457, 458, 459, 460, 461, 462, 463, 464, 465, 466, 467, 468, 469, 470, 471, 472, 473, 474, 475, 476, 477, 478, 479, 480, 481, 482, 483, 484, 485, 486, 487, 488, 489, 490, 491, 492, 493, 494, 495, 496, 497, 498, 499, 500, 501, 502, 503, 504, 505, 506, 507, 508, 509, 510, 511, 512, 513, 514, 515, 516, 517, 518, 519, 520, 521, 522, 523, 524, 525, 526]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":9724.755717273947,
"Equilibrium frequencies": [
[0.02961260427974778],
[0.01560914336353007],
[0.01206457367850363],
[0.04279031141662274],
[0.01704828978165076],
[0.008986349082670346],
[0.006945702789939084],
[0.02463483528791061],
[0.01621669484130788],
[0.008548005851471471],
[0.006606899814906623],
[0.02343317784050752],
[0.02360861258425114],
[0.01244437047685273],
[0.009618466625873266],
[0.03411452349989357],
[0.01766939245520801],
[0.009313739425763449],
[0.007198748381480376],
[0.02553233071155317],
[0.01017245629585219],
[0.005362018388561441],
[0.004144395653731816],
[0.0146992330920787],
[0.00967625619045542],
[0.00510046562174066],
[0.003942237050108603],
[0.01398222229376097],
[0.01408690154818254],
[0.007425367378575853],
[0.005739193352409958],
[0.02035561946688635],
[0.03055185465115369],
[0.01610423300721771],
[0.01244723692559056],
[0.0441475313190318],
[0.01758902616396895],
[0.009271377431874122],
[0.007166006072402724],
[0.02541620115411771],
[0.01673105475740251],
[0.008819130862798667],
[0.006816456969906213],
[0.02417642962552427],
[0.02435742879537044],
[0.0128390800904307],
[0.009923544432112862],
[0.03519656540897093],
[0.01543433219274319],
[0.04231109072764169],
[0.01685736120682535],
[0.008885708440986476],
[0.006867915917952001],
[0.02435894286393023],
[0.008452274338473766],
[0.006532907292382041],
[0.02317074311502942],
[0.02334421311591456],
[0.01230500248451004],
[0.009510746722680373],
[0.0337324653910683]
],
"Log Likelihood":-4476.502832876677,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.5779491894120077, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":385
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":10463.73605337146,
"Equilibrium frequencies": [
[0.2935116574172349],
[0.182551766138855],
[0.1997549259588534],
[0.3241816504850566]
],
"Log Likelihood":-4580.035785812496,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.1802345057484437,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.3559559958910161,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.1762527191212448,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":4.215440388854533,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":1.393667048450195
},
"display order":0,
"estimated parameters":651
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-04-27/sequences.exonuclease.compressed.fas",
"number of sequences":323,
"number of sites":527,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_417689_Reykjavik_20200313_null_1,epi_isl_417520_Taoyuan_20200309_null_1,epi_isl_416374_Shanghai_20200207_null_1,epi_isl_424663_Li_ge_20200405_null_2,epi_isl_422913_Zuid_Holland_20200318_null_5,epi_isl_415503_Noord_Brabant_20200311_null_1,epi_isl_425301_England_20200327_null_1,epi_isl_424339_Washington_20200324_null_2,epi_isl_416746_ARA_20200303_null_1,epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1,epi_isl_421721_New_York_20200317_null_3,epi_isl_416994_Castilla_y_Le_n_20200304_null_1,epi_isl_427577_New_York_20200315_null_2,epi_isl_422573_Friesland_20200330_null_1,epi_isl_416495_Hauts_de_France_20200310_null_1,epi_isl_428698_Madrid_20200312_null_1,epi_isl_422775_Netherlands_20200327_null_1,epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1,epi_isl_422505_New_York_20200319_null_1,epi_isl_416395_Shanghai_20200209_null_1,epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1,epi_isl_418977_New_York_20200317_null_1,epi_isl_423428_England_20200330_null_1,epi_isl_427493_New_York_20200401_null_1,epi_isl_420070_Dakar_20200317_null_1,epi_isl_424324_Washington_20200324_null_1,epi_isl_427284_Minnesota_20200322_null_2,epi_isl_424369_Reykjavik_20200301_null_3,(epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1,epi_isl_426754_Victoria_20200327_null_2)Node27,epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_1,epi_isl_427740_New_South_Wales_20200321_null_3,epi_isl_422925_Zuid_Holland_20200323_null_1,epi_isl_426927_Victoria_20200328_null_2,epi_isl_419675_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1,epi_isl_430341_New_York_20200330_null_1,epi_isl_430380_New_York_20200408_null_1,(epi_isl_426070_Idaho_20200328_null_2,epi_isl_427664_New_South_Wales_20200317_null_2)Node412,epi_isl_425279_England_20200330_null_1,epi_isl_419557_Georgia_20200229_null_1,epi_isl_427140_Victoria_20200406_null_1,epi_isl_425218_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1,epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_1,epi_isl_426902_Northern_territory_20200326_null_1,epi_isl_428924_Chelyabinsk_Region_20200328_null_1,epi_isl_428992_California_20200408_null_8,epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_1,epi_isl_430414_New_York_20200410_null_1,epi_isl_421305_Wisconsin_20200319_null_1,epi_isl_429802_Istria_20200301_null_1,epi_isl_429982_Virginia_20200406_null_1,epi_isl_429565_Unknown_20200324_null_1,epi_isl_430070_St_Petersburg_20200407_null_1,epi_isl_429037_California_20200325_null_1,epi_isl_418390_Finland_20200313_null_1,epi_isl_425146_Wisconsin_20200331_null_1,epi_isl_421631_New_York_20200318_null_1,epi_isl_424662_Li_ge_20200405_null_7,epi_isl_428926_Malopolskie_20200328_null_2,epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1,epi_isl_420191_South_Yorkshire_20200327_null_1,epi_isl_426833_Victoria_20200326_null_2,epi_isl_423011_Washington_20200319_null_3,epi_isl_427184_Washington_20200325_null_9,epi_isl_421465_Portugal_20200319_null_1,epi_isl_430109_St_Petersburg_20200415_null_3,epi_isl_430326_New_York_20200330_null_1,epi_isl_428710_Madrid_20200322_null_1,epi_isl_424955_New_York_20200401_null_1,epi_isl_425699_Scotland_20200312_null_1,(epi_isl_420372_Vorst_20200323_null_1,epi_isl_426022_Scotland_20200331_null_2)Node468,epi_isl_420050_Hauts_de_France_20200319_null_1,epi_isl_428767_New_York_20200405_null_1,epi_isl_417939_California_20200318_null_1,epi_isl_427765_New_South_Wales_20200322_null_1,epi_isl_429452_Unknown_20200310_null_1,epi_isl_427452_Wisconsin_20200410_null_2,epi_isl_429013_California_20200328_null_5,epi_isl_423845_England_20200324_null_1,epi_isl_423399_England_20200329_null_2,(epi_isl_411956_Texas_20200211_null_1,epi_isl_417709_Reykjavik_20200316_null_2)Node488,epi_isl_408483_Shanghai_20200120_null_1,(epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1,epi_isl_421574_KZN_20200401_null_1)Node55,epi_isl_429336_Unknown_20200303_null_11,epi_isl_419987_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_426817_Victoria_20200325_null_1,epi_isl_427791_New_South_Wales_20200324_null_15,(epi_isl_414578_Talca_20200304_null_1,epi_isl_417760_Reykjavik_20200306_null_2)Node51,epi_isl_423177_England_20200324_null_3,epi_isl_424277_Washington_20200323_null_1,epi_isl_427710_New_South_Wales_20200321_null_1,epi_isl_427376_Liege_20200407_null_1,epi_isl_421688_Minnesota_20200316_null_1,epi_isl_426668_Victoria_20200322_null_3,epi_isl_422741_Netherlands_20200325_null_1,(epi_isl_416526_Auckland_20200305_null_1,epi_isl_423469_England_20200331_null_1)Node512,epi_isl_430235_Washington_20200320_null_2,epi_isl_427516_New_York_20200318_null_1,(epi_isl_420287_South_Yorkshire_20200320_null_2,epi_isl_423363_England_20200329_null_1)Node522,epi_isl_428752_Connecticut_20200409_null_1,epi_isl_429416_Unknown_20200310_null_6,epi_isl_420107_Singapore_20200309_null_1,epi_isl_427165_Connecticut_20200330_null_1,epi_isl_418309_Derbyshire_20200325_null_1,epi_isl_426627_Louisiana_20200406_null_1,epi_isl_428794_New_York_20200405_null_1,(epi_isl_426028_New_York_20200304_null_1,epi_isl_429394_Unknown_20200309_null_7)Node539,epi_isl_423055_England_20200319_null_1,epi_isl_421728_New_York_20200318_null_1,(epi_isl_423124_England_20200324_null_1,epi_isl_430357_New_York_20200403_null_1)Node545,epi_isl_417972_Madrid_20200309_null_1,epi_isl_420102_Singapore_20200305_null_1,epi_isl_424491_Reykjavik_20200320_null_2,epi_isl_427721_New_South_Wales_20200319_null_2,epi_isl_421514_Centre__Val_de_Loire_20200320_null_1,epi_isl_429530_Unknown_20200325_null_2,epi_isl_429581_Unknown_20200324_null_4,epi_isl_418241_Boufarik_20200302_null_1,epi_isl_429463_Unknown_20200323_null_1,epi_isl_429789_Luxembourg_20200331_null_1,epi_isl_423136_England_20200323_null_1,epi_isl_427695_New_South_Wales_20200322_null_2,epi_isl_429294_Unknown_20200313_null_1,epi_isl_421616_New_York_20200320_null_2,epi_isl_427457_Wisconsin_20200413_null_3,epi_isl_428866_Lipetsk_Region_20200311_null_2,epi_isl_422956_Zuid_Holland_20200327_null_2,epi_isl_426072_Idaho_20200330_null_1,epi_isl_426530_Arizona_20200317_null_1,epi_isl_427773_New_South_Wales_20200325_null_13,epi_isl_421196_Li_ge_20200330_null_1,epi_isl_425908_Scotland_20200323_null_1,epi_isl_428257_Wisconsin_20200329_null_1,epi_isl_427470_New_York_20200401_null_1,epi_isl_425863_Scotland_20200319_null_1,epi_isl_426983_Victoria_20200327_null_1,epi_isl_420727_England_20200328_null_1,epi_isl_422860_Noord_Brabant_20200320_null_1,epi_isl_429438_Unknown_20200310_null_6,epi_isl_425810_Scotland_20200305_null_1,epi_isl_428350_Hauts_De_France_20200324_null_4,epi_isl_419772_Victoria_20200313_null_1,epi_isl_425425_England_20200330_null_1,epi_isl_428252_Wisconsin_20200325_null_1,epi_isl_429215_Switzerland_20200323_null_6,epi_isl_406844_Victoria_20200125_null_1,epi_isl_421489_Portugal_20200320_null_1,epi_isl_425061_Ghent_20200325_null_9,(epi_isl_412967_Guangzhou_20200129_null_1,epi_isl_421893_England_20200327_null_1)Node386,epi_isl_430148_Washington_20200323_null_1,epi_isl_427756_New_South_Wales_20200325_null_1,epi_isl_421312_Wisconsin_20200320_null_1,epi_isl_426676_Victoria_20200322_null_1,epi_isl_418263_Athens_20200318_null_1,epi_isl_414648_California_20200311_null_1,epi_isl_421214_Li_ge_20200330_null_1,epi_isl_423808_England_20200323_null_1,epi_isl_422954_Zuid_Holland_20200327_null_3,epi_isl_422042_Wales_20200328_null_2,epi_isl_422017_Wales_20200329_null_1,epi_isl_425724_Scotland_20200312_null_3,epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1,(epi_isl_430439_Malaysia_20200305_null_1,(epi_isl_422046_Wales_20200327_null_1,epi_isl_426867_Victoria_20200326_null_15)Node85,epi_isl_429870_Sakarya_20200322_null_2)Node83,epi_isl_428260_Wisconsin_20200316_null_2,epi_isl_421669_India_20200312_null_1,epi_isl_429644_Washington_20200408_null_2,epi_isl_429782_Luxembourg_20200329_null_1,epi_isl_425331_England_20200329_null_5,(epi_isl_420730_England_20200327_null_1,epi_isl_425576_England_20200324_null_2)Node150,(epi_isl_424257_Washington_20200322_null_2,epi_isl_425847_Scotland_20200311_null_1)Node147,(epi_isl_425395_England_20200316_null_3,epi_isl_425562_England_20200325_null_1)Node144,(epi_isl_420257_Derbyshire_20200325_null_2,epi_isl_425254_England_20200330_null_1)Node141,(epi_isl_425436_England_20200401_null_1,epi_isl_423803_England_20200324_null_6,epi_isl_423804_England_20200324_null_1)Node136,((epi_isl_425484_England_20200317_null_1,epi_isl_425873_Scotland_20200320_null_13)Node131,epi_isl_425247_England_20200330_null_1)Node130,epi_isl_427417_Doha_20200323_null_3,(epi_isl_428861_Moscow_20200311_null_1,epi_isl_429229_Abruzzo_20200321_null_3)Node233,epi_isl_429233_Abruzzo_20200324_null_3,epi_isl_430008_Amman_20200404_null_1,epi_isl_422333_Wales_20200324_null_1,epi_isl_422255_Wales_20200323_null_1,epi_isl_422252_Wales_20200325_null_3,epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1,epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1,epi_isl_417242_England_20200303_null_1,epi_isl_422332_Wales_20200326_null_1,(epi_isl_423178_England_20200324_null_2,epi_isl_423457_England_20200328_null_2,epi_isl_423461_England_20200330_null_1)Node179,epi_isl_419405_Wales_20200316_null_1,epi_isl_420111_Singapore_20200312_null_1,epi_isl_420718_England_20200327_null_1,(epi_isl_407084_Aichi_20200125_null_1,epi_isl_413871_Guangdong_20200228_null_1)Node189,epi_isl_414010_England_20200226_null_1,epi_isl_426469_Virginia_20200330_null_1,epi_isl_429182_Bangkok_20200328_null_1,epi_isl_422424_Dasman_20200315_null_1,epi_isl_422426_Dasman_20200316_null_1,epi_isl_423153_England_20200324_null_1,epi_isl_423387_England_20200328_null_2,epi_isl_423454_England_20200331_null_1,epi_isl_423492_England_20200331_null_1,epi_isl_423567_England_20200401_null_1,epi_isl_423569_England_20200331_null_1,epi_isl_423778_England_20200324_null_1,epi_isl_423783_England_20200324_null_1,epi_isl_423825_England_20200322_null_1,epi_isl_425788_Scotland_20200312_null_1,epi_isl_413596_NSW_20200228_null_1,epi_isl_423467_England_20200330_null_1,epi_isl_423530_England_20200325_null_1,(epi_isl_423158_England_20200324_null_2,epi_isl_425953_Scotland_20200326_null_1)Node225,epi_isl_420224_South_Yorkshire_20200326_null_14,epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1,epi_isl_430330_New_York_20200330_null_7787,(epi_isl_422412_Taipei_20200314_null_1,epi_isl_426882_Victoria_20200324_null_1,epi_isl_428850_Singapore_20200415_null_1,epi_isl_429043_California_20200408_null_31)Node240,epi_isl_417834_Reykjavik_20200316_null_2,epi_isl_427364_Liege_20200407_null_3,epi_isl_428904_Moscow_20200322_null_1,(epi_isl_419994_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_423579_England_20200331_null_1)Node361,(epi_isl_428670_Sri_Lanka_20200316_null_1,epi_isl_416315_Hong_Kong_20200219_null_1,epi_isl_424286_Oregon_20200320_null_1)Node327,(epi_isl_417365_Washington_20200314_null_1,epi_isl_426816_Victoria_20200325_null_4)Node319,(epi_isl_421707_New_York_20200318_null_1,epi_isl_426472_Virginia_20200403_null_1)Node316,(epi_isl_422098_Wales_20200327_null_1,epi_isl_424181_USA_20200316_null_1)Node313,(epi_isl_417374_Washington_20200315_null_1,epi_isl_419266_Ghent_20200324_null_2)Node310,(epi_isl_420694_England_20200328_null_1,epi_isl_430191_Washington_20200316_null_1)Node307,epi_isl_417500_Minnesota_20200314_null_2,(epi_isl_428700_Madrid_20200327_null_1,epi_isl_430124_Washington_20200306_null_5)Node303,(epi_isl_417165_Washington_20200308_null_1,epi_isl_422947_Zuid_Holland_20200326_null_1)Node300,(epi_isl_417351_Washington_20200312_null_1,epi_isl_421743_Luxembourg_20200317_null_1)Node297,((epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_10,epi_isl_424893_Virginia_20200308_null_1)Node291,epi_isl_415594_Washington_20200310_null_1,epi_isl_418928_Washington_20200315_null_1,epi_isl_426096_Washington_20200325_null_1,epi_isl_416702_Washington_20200313_null_1,epi_isl_430295_Washington_20200225_null_889,epi_isl_424849_Arizona_20200309_null_1,epi_isl_418850_British_Columbia_20200313_null_1,epi_isl_429612_Washington_20200326_null_1,epi_isl_418330_Ontario_20200305_null_1,epi_isl_423008_Washington_20200318_null_2,epi_isl_418065_Washington_20200313_null_2,epi_isl_423027_Washington_20200318_null_1,epi_isl_424220_Washington_20200321_null_2,epi_isl_418874_Washington_20200316_null_1)Node263,(epi_isl_418341_Ontario_20200312_null_1,epi_isl_428860_Moscow_20200311_null_8)Node294,(epi_isl_426878_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_429618_Washington_20200325_null_2)Node323,epi_isl_427800_New_South_Wales_20200324_null_3,((epi_isl_419952_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_426325_New_York_20200306_null_1)Node355,epi_isl_418835_British_Columbia_20200311_null_2,epi_isl_427359_Liege_20200406_null_4)Node354,(epi_isl_416700_Washington_20200313_null_1,epi_isl_424947_New_York_20200401_null_1,epi_isl_430405_New_Jersey_20200410_null_213,epi_isl_428231_New_Taipei_City_20200324_null_1,epi_isl_419819_Victoria_20200317_null_1,epi_isl_421189_Li_ge_20200330_null_3,epi_isl_427349_Liege_20200406_null_1)Node334,(epi_isl_427288_Ohio_20200331_null_1,epi_isl_430132_Washington_20200317_null_81,epi_isl_425658_Scotland_20200315_null_1,epi_isl_427732_New_South_Wales_20200317_null_1)Node347,epi_isl_422414_Taipei_20200316_null_1,epi_isl_420355_Ronse_20200306_null_1,epi_isl_418737_England_20200317_null_1,(epi_isl_428761_New_York_20200403_null_1,epi_isl_417420_NanChang_20200323_null_1,epi_isl_427610_New_York_20200316_null_1,epi_isl_430420_New_York_20200413_null_121)Node369,(epi_isl_427629_New_York_20200330_null_6,epi_isl_430111_St_Petersburg_20200415_null_3)Node376,epi_isl_420415_Montignies_Sur_Sambre_20200325_null_1,epi_isl_408484_Sichuan_20200115_null_1,epi_isl_430365_New_York_20200408_null_2,epi_isl_425491_England_20200318_null_2,(epi_isl_423494_England_20200331_null_1,epi_isl_426944_Victoria_20200328_null_3)Node102,(epi_isl_422713_Netherlands_20200322_null_1,epi_isl_427129_Victoria_20200405_null_1)Node105,epi_isl_429382_Unknown_20200309_null_7,epi_isl_418080_Washington_20200315_null_1,epi_isl_420623_ARA_20200324_null_2)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node102":"test",
"Node105":"test",
"Node130":"test",
"Node131":"test",
"Node136":"test",
"Node141":"test",
"Node144":"test",
"Node147":"test",
"Node150":"test",
"Node179":"test",
"Node189":"test",
"Node225":"test",
"Node233":"test",
"Node240":"test",
"Node263":"test",
"Node27":"test",
"Node291":"test",
"Node294":"test",
"Node297":"test",
"Node300":"test",
"Node303":"test",
"Node307":"test",
"Node310":"test",
"Node313":"test",
"Node316":"test",
"Node319":"test",
"Node323":"test",
"Node327":"test",
"Node334":"test",
"Node347":"test",
"Node354":"test",
"Node355":"test",
"Node361":"test",
"Node369":"test",
"Node376":"test",
"Node386":"test",
"Node412":"test",
"Node468":"test",
"Node488":"test",
"Node51":"test",
"Node512":"test",
"Node522":"test",
"Node539":"test",
"Node545":"test",
"Node55":"test",
"Node83":"test",
"Node85":"test",
"epi_isl_406844_Victoria_20200125_null_1":"test",
"epi_isl_407084_Aichi_20200125_null_1":"test",
"epi_isl_408483_Shanghai_20200120_null_1":"test",
"epi_isl_408484_Sichuan_20200115_null_1":"test",
"epi_isl_411956_Texas_20200211_null_1":"test",
"epi_isl_412967_Guangzhou_20200129_null_1":"test",
"epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1":"test",
"epi_isl_413596_NSW_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_413871_Guangdong_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_414010_England_20200226_null_1":"test",
"epi_isl_414578_Talca_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_414648_California_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_415503_Noord_Brabant_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_415594_Washington_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_416315_Hong_Kong_20200219_null_1":"test",
"epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_1":"test",
"epi_isl_416374_Shanghai_20200207_null_1":"test",
"epi_isl_416395_Shanghai_20200209_null_1":"test",
"epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_416495_Hauts_de_France_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_416526_Auckland_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_416700_Washington_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_416702_Washington_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_416746_ARA_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_416994_Castilla_y_Le_n_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_417165_Washington_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_417242_England_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_417351_Washington_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_417365_Washington_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_417374_Washington_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_417420_NanChang_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_417500_Minnesota_20200314_null_2":"test",
"epi_isl_417520_Taoyuan_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_417689_Reykjavik_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_417709_Reykjavik_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_417760_Reykjavik_20200306_null_2":"test",
"epi_isl_417834_Reykjavik_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417939_California_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_417972_Madrid_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_418065_Washington_20200313_null_2":"test",
"epi_isl_418080_Washington_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418241_Boufarik_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_418263_Athens_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418309_Derbyshire_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_418330_Ontario_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_418341_Ontario_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_418390_Finland_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418737_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418835_British_Columbia_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_418850_British_Columbia_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418874_Washington_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418928_Washington_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418977_New_York_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1":"test",
"epi_isl_419266_Ghent_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_419405_Wales_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_419557_Georgia_20200229_null_1":"test",
"epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_419675_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_419772_Victoria_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_419819_Victoria_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419952_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_419987_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_419994_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420050_Hauts_de_France_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_420070_Dakar_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_420102_Singapore_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_420107_Singapore_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_420111_Singapore_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_420191_South_Yorkshire_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_420224_South_Yorkshire_20200326_null_14":"test",
"epi_isl_420257_Derbyshire_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_420287_South_Yorkshire_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_420355_Ronse_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_420372_Vorst_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420415_Montignies_Sur_Sambre_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_420623_ARA_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_420694_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420718_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_420727_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420730_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421189_Li_ge_20200330_null_3":"test",
"epi_isl_421196_Li_ge_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_421214_Li_ge_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_421305_Wisconsin_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_421312_Wisconsin_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_421465_Portugal_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_421489_Portugal_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_421514_Centre__Val_de_Loire_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_421574_KZN_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_421616_New_York_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_421631_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_421669_India_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_421688_Minnesota_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_421707_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_421721_New_York_20200317_null_3":"test",
"epi_isl_421728_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_421743_Luxembourg_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_421893_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422017_Wales_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_422042_Wales_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_422046_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422098_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422252_Wales_20200325_null_3":"test",
"epi_isl_422255_Wales_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_422332_Wales_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_422333_Wales_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_422412_Taipei_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_422414_Taipei_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_422424_Dasman_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_422426_Dasman_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_422505_New_York_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_422573_Friesland_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422713_Netherlands_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_422741_Netherlands_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422775_Netherlands_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422860_Noord_Brabant_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_422913_Zuid_Holland_20200318_null_5":"test",
"epi_isl_422925_Zuid_Holland_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_422947_Zuid_Holland_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_422954_Zuid_Holland_20200327_null_3":"test",
"epi_isl_422956_Zuid_Holland_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_423008_Washington_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_423011_Washington_20200319_null_3":"test",
"epi_isl_423027_Washington_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_423055_England_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_423124_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423136_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423153_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423158_England_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_423177_England_20200324_null_3":"test",
"epi_isl_423178_England_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_423363_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_423387_England_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_423399_England_20200329_null_2":"test",
"epi_isl_423428_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423454_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423457_England_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_423461_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423467_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423469_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423492_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423494_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423530_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_423567_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_423569_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423579_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423778_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423783_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423803_England_20200324_null_6":"test",
"epi_isl_423804_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423808_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423825_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_423845_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_424181_USA_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_424220_Washington_20200321_null_2":"test",
"epi_isl_424257_Washington_20200322_null_2":"test",
"epi_isl_424277_Washington_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_424286_Oregon_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424324_Washington_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_424339_Washington_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_424369_Reykjavik_20200301_null_3":"test",
"epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_10":"test",
"epi_isl_424491_Reykjavik_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_424662_Li_ge_20200405_null_7":"test",
"epi_isl_424663_Li_ge_20200405_null_2":"test",
"epi_isl_424849_Arizona_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_424893_Virginia_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_424947_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_424955_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_425061_Ghent_20200325_null_9":"test",
"epi_isl_425146_Wisconsin_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_425218_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_425247_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_425254_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_425279_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_425301_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_425331_England_20200329_null_5":"test",
"epi_isl_425395_England_20200316_null_3":"test",
"epi_isl_425425_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_425436_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_425484_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_425491_England_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_425562_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_425576_England_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_425658_Scotland_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_425699_Scotland_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_425724_Scotland_20200312_null_3":"test",
"epi_isl_425788_Scotland_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_425810_Scotland_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_425847_Scotland_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_425863_Scotland_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_425873_Scotland_20200320_null_13":"test",
"epi_isl_425908_Scotland_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_425953_Scotland_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_426022_Scotland_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_426028_New_York_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_426070_Idaho_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_426072_Idaho_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_426096_Washington_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_426325_New_York_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_426469_Virginia_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_426472_Virginia_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_426530_Arizona_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_426627_Louisiana_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_426668_Victoria_20200322_null_3":"test",
"epi_isl_426676_Victoria_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_426754_Victoria_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_426816_Victoria_20200325_null_4":"test",
"epi_isl_426817_Victoria_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_426833_Victoria_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_426867_Victoria_20200326_null_15":"test",
"epi_isl_426878_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_426882_Victoria_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_426902_Northern_territory_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_426927_Victoria_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_426944_Victoria_20200328_null_3":"test",
"epi_isl_426983_Victoria_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_427129_Victoria_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_427140_Victoria_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_427165_Connecticut_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_427184_Washington_20200325_null_9":"test",
"epi_isl_427284_Minnesota_20200322_null_2":"test",
"epi_isl_427288_Ohio_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_427349_Liege_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_427359_Liege_20200406_null_4":"test",
"epi_isl_427364_Liege_20200407_null_3":"test",
"epi_isl_427376_Liege_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_427417_Doha_20200323_null_3":"test",
"epi_isl_427452_Wisconsin_20200410_null_2":"test",
"epi_isl_427457_Wisconsin_20200413_null_3":"test",
"epi_isl_427470_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_427493_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_427516_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_427577_New_York_20200315_null_2":"test",
"epi_isl_427610_New_York_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_427629_New_York_20200330_null_6":"test",
"epi_isl_427664_New_South_Wales_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_427695_New_South_Wales_20200322_null_2":"test",
"epi_isl_427710_New_South_Wales_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_427721_New_South_Wales_20200319_null_2":"test",
"epi_isl_427732_New_South_Wales_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_427740_New_South_Wales_20200321_null_3":"test",
"epi_isl_427756_New_South_Wales_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_427765_New_South_Wales_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_427773_New_South_Wales_20200325_null_13":"test",
"epi_isl_427791_New_South_Wales_20200324_null_15":"test",
"epi_isl_427800_New_South_Wales_20200324_null_3":"test",
"epi_isl_428231_New_Taipei_City_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_428252_Wisconsin_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_428257_Wisconsin_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_428260_Wisconsin_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_428350_Hauts_De_France_20200324_null_4":"test",
"epi_isl_428670_Sri_Lanka_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_428698_Madrid_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_428700_Madrid_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_428710_Madrid_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_428752_Connecticut_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_428761_New_York_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_428767_New_York_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_428794_New_York_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_428850_Singapore_20200415_null_1":"test",
"epi_isl_428860_Moscow_20200311_null_8":"test",
"epi_isl_428861_Moscow_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_428866_Lipetsk_Region_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_428904_Moscow_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_428924_Chelyabinsk_Region_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_428926_Malopolskie_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_428992_California_20200408_null_8":"test",
"epi_isl_429013_California_20200328_null_5":"test",
"epi_isl_429037_California_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_429043_California_20200408_null_31":"test",
"epi_isl_429182_Bangkok_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_429215_Switzerland_20200323_null_6":"test",
"epi_isl_429229_Abruzzo_20200321_null_3":"test",
"epi_isl_429233_Abruzzo_20200324_null_3":"test",
"epi_isl_429294_Unknown_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_429336_Unknown_20200303_null_11":"test",
"epi_isl_429382_Unknown_20200309_null_7":"test",
"epi_isl_429394_Unknown_20200309_null_7":"test",
"epi_isl_429416_Unknown_20200310_null_6":"test",
"epi_isl_429438_Unknown_20200310_null_6":"test",
"epi_isl_429452_Unknown_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_429463_Unknown_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_429530_Unknown_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_429565_Unknown_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_429581_Unknown_20200324_null_4":"test",
"epi_isl_429612_Washington_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_429618_Washington_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_429644_Washington_20200408_null_2":"test",
"epi_isl_429782_Luxembourg_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_429789_Luxembourg_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_429802_Istria_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_429870_Sakarya_20200322_null_2":"test",
"epi_isl_429982_Virginia_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_430008_Amman_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_430070_St_Petersburg_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_430109_St_Petersburg_20200415_null_3":"test",
"epi_isl_430111_St_Petersburg_20200415_null_3":"test",
"epi_isl_430124_Washington_20200306_null_5":"test",
"epi_isl_430132_Washington_20200317_null_81":"test",
"epi_isl_430148_Washington_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_430191_Washington_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_430235_Washington_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_430295_Washington_20200225_null_889":"test",
"epi_isl_430326_New_York_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_430330_New_York_20200330_null_7787":"test",
"epi_isl_430341_New_York_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_430357_New_York_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_430365_New_York_20200408_null_2":"test",
"epi_isl_430380_New_York_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_430405_New_Jersey_20200410_null_213":"test",
"epi_isl_430414_New_York_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_430420_New_York_20200413_null_121":"test",
"epi_isl_430439_Malaysia_20200305_null_1":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":9
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":9
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":19
}
}
}