{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001100743211139726],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001101805401551045],
[274.4842743455, 613.6101819688226, 0, 1, 0.3090710367505684, 0, 0.001629699163060514, 0.01112581160484408, 0.6909289632494316, 1, 0.001101805401551045],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001101805411335228],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001100743211050562],
[275.0218672610484, 613.0725890532741, 0, 1, 0.30967636978888, 0, 0.001631128218510358, 0.01113556763961923, 0.69032363021112, 1, 0.001100858724046138],
[274.5114469443276, 613.583009369995, 0, 1, 0.3091016332694796, 0, 0.001629771334487837, 0.01112630431277562, 0.6908983667305204, 1, 0.001101893479511483],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.5489097097218, 613.5455466046008, 0, 1, 0.3091438165813198, 0, 0.001629870847460408, 0.0111269836790109, 0.6908561834186802, 1, 0.001101646304146874],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001102102795942663],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001101805401551045],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001100743220793948],
[274.6508776891839, 613.4435786251387, 0, 1, 0.309258633174011, 0, 0.001630141768280009, 0.01112883323141114, 0.690741366825989, 1, 0.001100594924119074],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 1, 0, 0.30918599989316, 0.003641841330237986, 0, -0.02486252766975132, 1, 0.3091859998931601, 0.00110305054858036],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001101185188449848],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001100594924119074],
[274.4842743455, 613.6101819688225, 0, 1, 0.3090710367505684, 0, 0.001629699163060514, 0.01112581160484409, 0.6909289632494316, 1, 0.001101805401551045],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.00110084364139934],
[274.5217371108943, 613.5727192034283, 1, 0, 0.3091132200624086, 0.00364269879144778, 0, -0.02486838148135954, 1, 0.3091132200624086, 0.001101226693408461],
[274.4859847063606, 613.4783851532602, 0, 1, 0.309118241703498, 0, 0.001630049279976145, 0.01112820182196591, 0.690881758296502, 1, 0.001102277843185],
[274.5217371108943, 613.5727192034283, 1, 0, 0.3091132200624086, 0.00364269879144778, 0, -0.02486838148135954, 1, 0.3091132200624086, 0.001101805401630989],
[274.6508776891839, 613.4435786251387, 1, 0, 0.309258633174011, 0.003640985997982782, 0, -0.02485668839232721, 1, 0.309258633174011, 0.001100594924119074],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001101037888053749],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001101131740783919],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001101805411335228],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001101805401551045],
[274.2242230092661, 613.8702333050564, 0, 1, 0.3087782172938259, 0, 0.001629008780269462, 0.01112109842277799, 0.6912217827061741, 1, 0.001101805401551045],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001101805411335228],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 1, 0, 0.30918599989316, 0.003641841330237986, 0, -0.02486252766975132, 1, 0.3091859998931601, 0.001101556356396341],
[274.8464238113501, 613.1459343733563, 0, 1, 0.3095144020982451, 0, 0.001630933100815573, 0.01113423558842711, 0.6904855979017549, 1, 0.00110090324489448],
[274.5941365545643, 613.5745414569112, 1, 0, 0.3091689037822796, 0.003641738358099613, 0, -0.02486182468809799, 1, 0.3091689037822796, 0.001100743211056301],
[274.5863724751161, 613.470621073812, 0, 1, 0.3091990429328088, 0, 0.001630069909867259, 0.01112834266040233, 0.6908009570671911, 1, 0.001101805401551045],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001100743211081179],
[274.4842743455, 613.5725890532741, 0, 1, 0.3090841202386443, 0, 0.001629799012930113, 0.0111264932710455, 0.6909158797613557, 1, 0.001100951446584168],
[274.8464238113501, 613.1833971387506, 0, 1, 0.3095013448053948, 0, 0.001630833458091366, 0.01113355533638891, 0.6904986551946052, 1, 0.001101185188370619],
[274.5217371108943, 613.5725890532741, 1, 0, 0.3091132653629268, 0.00364269879144778, 0, -0.02486838148135954, 1, 0.3091132653629268, 0.001101805411335228],
[274.651007839338, 613.4434484749845, 1, 0, 0.3092587797239115, 0.003640984272611764, 0, -0.02485667661337234, 1, 0.3092587797239115, 0.001100594924119074],
[274.5941365545643, 613.5003197597582, 1, 0, 0.309194742295945, 0.003641738358099613, 0, -0.02486182468809799, 1, 0.3091947422959449, 0.001100743211050562],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001100271359142901],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 1, 0, 0.30918599989316, 0.003641841330237986, 0, -0.02486252766975132, 1, 0.3091859998931601, 0.001101971858036829],
[274.5217371108943, 613.5727192034283, 1, 0, 0.3091132200624085, 0.003642698791447781, 0, -0.02486838148135955, 1, 0.3091132200624085, 0.00110180540158017],
[274.5863724751161, 613.470621073812, 0, 1, 0.3091990429328088, 0, 0.001630069909867259, 0.01112834266040233, 0.6908009570671911, 1, 0.001101805401630989],
[274.5941365545643, 613.5648249738259, 1, 0, 0.3091722860984574, 0.003641738358099613, 0, -0.02486182468809799, 1, 0.3091722860984574, 0.001100743211139726],
[274.5863724751161, 613.5725890532741, 0, 1, 0.3091635443306158, 0, 0.001629799012930113, 0.0111264932710455, 0.6908364556693842, 1, 0.001100860369539517],
[274.8840167268986, 613.2104395874239, 1, 0, 0.3095211492116432, 0.003637897946585651, 0, -0.02483560653940043, 1, 0.3095211492116432, 0.001102512781036929],
[274.4485219409663, 613.6459343733563, 0, 1, 0.3090307793159233, 0, 0.001629604213089395, 0.01112516338981489, 0.6909692206840767, 1, 0.001100743211050562],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001101805401551045],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 1, 0, 0.30918599989316, 0.003641841330237986, 0, -0.02486252766975132, 1, 0.3091859998931601, 0.001100594924233296],
[275.0218672610484, 613.0725890532741, 0, 1, 0.30967636978888, 0, 0.001631128218510358, 0.01113556763961923, 0.69032363021112, 1, 0.001100951446584168],
[275.0863724751161, 613.0080838392064, 0, 1, 0.309749003069731, 0, 0.001631299857804653, 0.01113673940585412, 0.690250996930269, 1, 0.001100860379230396],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.00110084364136863],
[274.4842743455, 613.6101819688225, 0, 1, 0.3090710367505684, 0, 0.001629699163060514, 0.01112581160484409, 0.6909289632494316, 1, 0.001101805401551045],
[274.5121507779631, 613.638170293908, 0, 1, 0.3090829832124206, 0, 0.00162962483171645, 0.01112530415135258, 0.6909170167875793, 1, 0.001100843631560914],
[274.5217371108943, 613.5727192034283, 1, 0, 0.3091132200624085, 0.003642698791447781, 0, -0.02486838148135955, 1, 0.3091132200624085, 0.001101185188419856],
[274.5506200705824, 613.4137497890384, 0, 1, 0.309191032196468, 0, 0.001630221038155591, 0.01112937439981919, 0.6908089678035321, 1, 0.001102503234646175],
[274.5217371108943, 613.5727192034283, 1, 0, 0.3091132200624086, 0.00364269879144778, 0, -0.02486838148135954, 1, 0.3091132200624086, 0.001101805411335228],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.00110180540158017],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 1, 0, 0.30918599989316, 0.003641841330237986, 0, -0.02486252766975132, 1, 0.3091859998931601, 0.001101805411335228],
[274.5218672610484, 613.5725890532741, 0, 1, 0.309113366612309, 0, 0.001629799012930113, 0.0111264932710455, 0.690886633387691, 1, 0.001101185188419856],
[275.5489097097218, 612.5455466046008, 0, 1, 0.3102698229344616, 0, 0.001632531663225856, 0.01114514883218309, 0.6897301770655384, 1, 0.001101339169394138],
[274.650001312113, 613.5186766993626, 0, 1, 0.3092318025974841, 0, 0.001629942229925009, 0.01112747100076393, 0.6907681974025159, 1, 0.001100743220793948],
[274.578608395668, 613.5158479186546, 1, 0, 0.3091772574903751, 0.00364194430819971, 0, -0.02486323069116016, 1, 0.3091772574903751, 0.00110084364139934],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001100743220793948],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 1, 0, 0.30918599989316, 0.003641841330237986, 0, -0.02486252766975132, 1, 0.3091859998931601, 0.001100951446659083],
[274.5217371108943, 613.5727192034283, 1, 0, 0.3091132200624086, 0.00364269879144778, 0, -0.02486838148135954, 1, 0.3091132200624086, 0.001101185188420029],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001101805401551045],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 1, 0, 0.30918599989316, 0.003641841330237986, 0, -0.02486252766975132, 1, 0.3091859998931601, 0.001101805401550256],
[274.2242230092661, 613.8702333050564, 0, 1, 0.3087782172938259, 0, 0.001629008780269462, 0.01112109842277799, 0.6912217827061741, 1, 0.001101805401630989],
[275.0218672610484, 613.0725890532741, 0, 1, 0.30967636978888, 0, 0.001631128218510358, 0.01113556763961923, 0.69032363021112, 1, 0.001100951446584168],
[274.5217371108943, 613.5727192034283, 1, 0, 0.3091132200624085, 0.003642698791447781, 0, -0.02486838148135955, 1, 0.3091132200624085, 0.001101185188340625],
[274.5217371108943, 613.5727192034283, 1, 0, 0.3091132200624086, 0.00364269879144778, 0, -0.02486838148135954, 1, 0.3091132200624086, 0.001101805401551045],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001101805411335228],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.00110180540158017],
[275.0863724751161, 613.0080838392064, 0, 1, 0.309749003069731, 0, 0.001631299857804653, 0.01113673940585412, 0.690250996930269, 1, 0.001100743211139726],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001100951436207827],
[274.578608395668, 613.5158479186546, 1, 0, 0.3091772574903751, 0.00364194430819971, 0, -0.02486323069116016, 1, 0.3091772574903751, 0.001101653180481932],
[274.5217371108943, 613.5727192034283, 1, 0, 0.3091132200624086, 0.00364269879144778, 0, -0.02486838148135954, 1, 0.3091132200624086, 0.001101805411335228],
[274.3821762158839, 613.6370942673418, 0, 1, 0.3089822319582949, 0, 0.001629627689300563, 0.01112532365982581, 0.6910177680417051, 1, 0.001101795152739478],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4842743455, 613.5725890532741, 0, 1, 0.3090841202386443, 0, 0.001629799012930113, 0.0111264932710455, 0.6909158797613557, 1, 0.001101420946644645],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.5217371108943, 613.5727192034283, 1, 0, 0.3091132200624085, 0.003642698791447781, 0, -0.02486838148135955, 1, 0.3091132200624085, 0.001101983833363036],
[273.5591998762886, 614.535256438034, 0, 1, 0.3080293970211069, 0, 0.001627245938331016, 0.01110906365725756, 0.691970602978893, 1, 0.001101323629818655],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.1238352405105, 613.970621073812, 1, 0, 0.3086651800284294, 0.003647986316558796, 0, -0.02490447894620119, 1, 0.3086651800284294, 0.001101534618081144],
[274.2817884471283, 613.6825814124926, 0, 1, 0.3088882817341981, 0, 0.001629506898661412, 0.01112449903284846, 0.6911117182658019, 1, 0.001103181495677119],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4842743455, 613.6101819688226, 0, 1, 0.3090710367505683, 0, 0.001629699163060514, 0.01112581160484408, 0.6909289632494318, 1, 0.001101450137708649],
[274.4842743455, 613.6101819688226, 0, 1, 0.3090710367505683, 0, 0.001629699163060514, 0.01112581160484408, 0.6909289632494318, 1, 0.001102530378224416],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 1, 0, 0.30918599989316, 0.003641841330237986, 0, -0.02486252766975132, 1, 0.3091859998931601, 0.001101448459784259],
[274.651007839338, 613.5080838392064, 1, 0, 0.3092362735602596, 0.003640984272611764, 0, -0.02485667661337234, 1, 0.3092362735602596, 0.001100594924119074],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001101805401550256],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.00110180540158017],
[274.5217371108943, 613.5727192034283, 1, 0, 0.3091132200624086, 0.00364269879144778, 0, -0.02486838148135954, 1, 0.3091132200624086, 0.001101185188449848],
[274.6143608002017, 613.9426327487265, 0, 1, 0.309056552133344, 0, 0.001628816678722617, 0.01111978696256027, 0.6909434478666561, 1, 0.001100903244962873],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001101805401551045],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 1, 0, 0.30918599989316, 0.003641841330237986, 0, -0.02486252766975132, 1, 0.3091859998931601, 0.001100594924141666],
[274.5217371108943, 613.5725890532741, 1, 0, 0.3091132653629268, 0.003642698791447781, 0, -0.02486838148135955, 1, 0.3091132653629268, 0.001101805401631779],
[274.5863724751161, 613.638170293908, 1, 0, 0.3091407175252082, 0.003641841330237986, 0, -0.02486252766975132, 1, 0.3091407175252082, 0.001100722392920349],
[274.650001312113, 613.5186766993625, 0, 1, 0.3092318025974841, 0, 0.00162994222992501, 0.01112747100076393, 0.6907681974025159, 1, 0.001100860369651769],
[274.5217371108943, 613.5727192034283, 1, 0, 0.3091132200624085, 0.003642698791447781, 0, -0.02486838148135955, 1, 0.3091132200624085, 0.001101805401630989],
[274.5489097097218, 613.5455466046008, 0, 1, 0.3091438165813198, 0, 0.001629870847460408, 0.0111269836790109, 0.6908561834186802, 1, 0.00110084364148207],
[274.651007839338, 613.5080838392064, 1, 0, 0.3092362735602596, 0.003640984272611764, 0, -0.02485667661337234, 1, 0.3092362735602596, 0.001100594924210706],
[274.651007839338, 613.4434484749845, 1, 0, 0.3092587797239115, 0.003640984272611764, 0, -0.02485667661337234, 1, 0.3092587797239115, 0.001100271349515741],
[275.1867602438717, 613.3702333050564, 0, 1, 0.3097007420365531, 0, 0.001630336696666294, 0.01113016399021093, 0.6902992579634469, 1, 0.001101971858088176],
[274.5121507779631, 613.6381702939082, 0, 1, 0.3090829832124206, 0, 0.001629624831716449, 0.01112530415135258, 0.6909170167875794, 1, 0.001100843651320469],
[274.6508776891839, 613.4435786251387, 0, 1, 0.309258633174011, 0, 0.001630141768280009, 0.01112883323141114, 0.690741366825989, 1, 0.001100743211139726],
[274.4842743455, 613.5725890532741, 0, 1, 0.3090841202386442, 0, 0.001629799012930113, 0.0111264932710455, 0.6909158797613557, 1, 0.001101805401550256],
[275.0218672610484, 613.0725890532741, 0, 1, 0.30967636978888, 0, 0.001631128218510358, 0.01113556763961923, 0.69032363021112, 1, 0.001100903244933634],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001101185188449848],
[274.651007839338, 613.5080838392064, 1, 0, 0.3092362735602596, 0.003640984272611764, 0, -0.02485667661337234, 1, 0.3092362735602596, 0.001100594924141666],
[274.0863724751162, 614.0080838392064, 0, 1, 0.3086229967165892, 0, 0.001628643052624492, 0.01111860163259189, 0.6913770032834108, 1, 0.001101805401551045],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 1, 0, 0.30918599989316, 0.003641841330237986, 0, -0.02486252766975132, 1, 0.3091859998931601, 0.001101805411335228],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001101185188340625],
[274.5863724751161, 613.896399376659, 0, 1, 0.3090508687105136, 0, 0.001628939347120108, 0.01112062440882722, 0.6909491312894864, 1, 0.001102149920886277],
[274.5218672610484, 613.5725890532741, 0, 1, 0.309113366612309, 0, 0.001629799012930113, 0.0111264932710455, 0.690886633387691, 1, 0.00110084364136863],
[274.5863724751161, 613.5455466046008, 0, 1, 0.3091729579538621, 0, 0.001629870847460408, 0.0111269836790109, 0.690827042046138, 1, 0.001100594924210706],
[274.651007839338, 613.4434484749846, 1, 0, 0.3092587797239115, 0.003640984272611764, 0, -0.02485667661337234, 1, 0.3092587797239115, 0.001100594924119074],
[274.5863724751161, 613.5456767547548, 0, 1, 0.3091729126465138, 0, 0.001629870501719333, 0.01112698131866726, 0.6908270873534863, 1, 0.001103050548588917],
[274.7888583734879, 613.4076960704508, 1, 0, 0.3093784331842193, 0.003639157737031749, 0, -0.02484420701701161, 1, 0.3093784331842193, 0.001100271359173733],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 1, 0, 0.30918599989316, 0.003641841330237986, 0, -0.02486252766975132, 1, 0.3091859998931601, 0.001100743211081179],
[274.4842743455, 613.6101819688226, 0, 1, 0.3090710367505683, 0, 0.001629699163060514, 0.01112581160484408, 0.6909289632494318, 1, 0.001100843641396438],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 1, 0, 0.30918599989316, 0.003641841330237986, 0, -0.02486252766975132, 1, 0.3091859998931601, 0.001100594924233296],
[274.5863724751161, 613.5455466046008, 0, 1, 0.3091729579538621, 0, 0.001629870847460408, 0.0111269836790109, 0.690827042046138, 1, 0.001102512781089531],
[274.2242230092661, 613.8702333050564, 0, 1, 0.3087782172938259, 0, 0.001629008780269462, 0.01112109842277799, 0.6912217827061741, 1, 0.001101185188419856],
[274.5217371108943, 613.5727192034283, 1, 0, 0.3091132200624086, 0.00364269879144778, 0, -0.02486838148135954, 1, 0.3091132200624086, 0.001101805401551045],
[274.6884706047323, 613.4059857095901, 0, 1, 0.3093009630357518, 0, 0.001630241672394502, 0.01112951526793763, 0.6906990369642483, 1, 0.001100594924119074],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 1, 0, 0.30918599989316, 0.003641841330237986, 0, -0.02486252766975132, 1, 0.3091859998931601, 0.00110180541136514],
[274.152830092821, 613.9416262215016, 0, 1, 0.3086978284163395, 0, 0.001628819349087781, 0.01111980519290634, 0.6913021715836605, 1, 0.001100951446595193],
[274.2242230092661, 613.8702333050564, 0, 1, 0.3087782172938259, 0, 0.001629008780269462, 0.01112109842277799, 0.6912217827061741, 1, 0.001101653180481932],
[274.5217371108943, 613.5727192034283, 1, 0, 0.3091132200624085, 0.003642698791447781, 0, -0.02486838148135955, 1, 0.3091132200624085, 0.001101805411335228],
[274.4842743455, 613.6101819688226, 0, 1, 0.3090710367505683, 0, 0.001629699163060514, 0.01112581160484408, 0.6909289632494318, 1, 0.001100843641396438],
[274.5489097097218, 613.5455466046008, 0, 1, 0.3091438165813198, 0, 0.001629870847460408, 0.0111269836790109, 0.6908561834186802, 1, 0.00110180540158017],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 1, 0, 0.30918599989316, 0.003641841330237986, 0, -0.02486252766975132, 1, 0.3091859998931601, 0.001100858734477117],
[274.5843594206661, 613.6585402879625, 0, 1, 0.3091320623117149, 0, 0.001629570737385558, 0.01112493485415465, 0.6908679376882851, 1, 0.001101504799194593],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.648994784888, 613.5939049237406, 1, 0, 0.3092048299794813, 0.003641010959400106, 0, -0.0248568588017088, 1, 0.3092048299794814, 0.001100961817850605],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.650001312113, 613.5186766993626, 0, 1, 0.3092318025974841, 0, 0.001629942229925009, 0.01112747100076393, 0.6907681974025159, 1, 0.001100993471816411],
[274.5217371108943, 613.5727192034283, 1, 0, 0.3091132200624086, 0.00364269879144778, 0, -0.02486838148135954, 1, 0.3091132200624086, 0.001102056125858369]
],
"NAMES": [
["epi_isl_427164_Connecticut_20200331_null_1"],
["epi_isl_427482_New_York_20200401_null_2"],
["epi_isl_428335_Wisconsin_20200327_null_11"],
["epi_isl_429007_California_20200318_null_4"],
["epi_isl_424129_England_20200320_null_2"],
["epi_isl_427184_Washington_20200325_null_1"],
["epi_isl_426475_Virginia_20200404_null_2"],
["epi_isl_429987_Virginia_20200402_null_21"],
["Node257"],
["epi_isl_428258_Wisconsin_20200329_null_2"],
["epi_isl_427779_New_South_Wales_20200324_null_3"],
["epi_isl_420510_England_20200323_null_2"],
["epi_isl_422919_Zuid_Holland_20200319_null_1"],
["epi_isl_418021_Portugal_20200316_null_1"],
["epi_isl_421316_Wisconsin_20200323_null_2"],
["epi_isl_427132_Victoria_20200405_null_1"],
["epi_isl_421984_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_421763_Luxembourg_20200317_null_1"],
["epi_isl_423958_England_20200319_null_1"],
["epi_isl_425982_Scotland_20200329_null_3"],
["epi_isl_428299_Wisconsin_20200325_null_1"],
["epi_isl_422504_New_York_20200319_null_1"],
["epi_isl_421871_England_20200327_null_2"],
["epi_isl_426028_New_York_20200304_null_2"],
["Node228"],
["epi_isl_422860_Noord_Brabant_20200320_null_1"],
["epi_isl_427096_Victoria_20200403_null_2"],
["epi_isl_421515_Comunitat_Valenciana_20200307_null_1"],
["epi_isl_424275_Washington_20200322_null_4"],
["epi_isl_425196_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1"],
["epi_isl_425342_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_428354_Ile_De_France_20200325_null_17"],
["epi_isl_428789_New_York_20200406_null_1"],
["epi_isl_420610_ARA_20200323_null_2"],
["epi_isl_424164_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_427025_Victoria_20200331_null_3"],
["epi_isl_426534_Arizona_20200327_null_1"],
["epi_isl_421513_Ile_de_France_20200323_null_1"],
["epi_isl_418366_Ontario_20200305_null_1"],
["epi_isl_425498_England_20200319_null_2"],
["epi_isl_429781_Luxembourg_20200323_null_1"],
["epi_isl_427020_Victoria_20200329_null_2"],
["epi_isl_428787_New_York_20200406_null_7"],
["epi_isl_421918_England_20200327_null_2"],
["epi_isl_425132_Duesseldorf_20200323_null_1"],
["epi_isl_429791_Luxembourg_20200328_null_2"],
["epi_isl_428362_Ile_De_France_20200325_null_1"],
["epi_isl_419756_Victoria_20200311_null_1"],
["epi_isl_423089_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1"],
["epi_isl_424297_Washington_20200323_null_1"],
["epi_isl_428777_New_York_20200406_null_2"],
["epi_isl_421506_Ile_de_France_20200321_null_1"],
["epi_isl_424003_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_425564_England_20200325_null_3"],
["epi_isl_429699_Minas_gerais_20200320_null_1"],
["epi_isl_428852_Moscow_20200402_null_2"],
["epi_isl_420241_South_Yorkshire_20200326_null_2"],
["epi_isl_422800_Netherlands_20200314_null_3"],
["epi_isl_425655_Scotland_20200310_null_1"],
["epi_isl_428333_Wisconsin_20200327_null_2"],
["epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_6"],
["epi_isl_429309_Unknown_20200318_null_3"],
["epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1"],
["epi_isl_425191_Comunitat_Valenciana_20200316_null_3"],
["epi_isl_427149_Victoria_20200408_null_15"],
["epi_isl_428902_Orenburg_Region_20200323_null_3"],
["epi_isl_424552_Reykjavik_20200328_null_15"],
["epi_isl_414624_Normandie_20200226_null_1"],
["epi_isl_423772_England_20200322_null_2"],
["epi_isl_427259_Washington_20200331_null_1"],
["epi_isl_429585_Unknown_20200326_null_7"],
["epi_isl_427632_New_York_20200406_null_2"],
["epi_isl_429992_Amman_20200322_null_58"],
["epi_isl_423704_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_417778_Reykjavik_20200310_null_1"],
["epi_isl_421692_Minnesota_20200317_null_1"],
["epi_isl_428360_Hauts_De_France_20200325_null_21"],
["epi_isl_426989_Victoria_20200328_null_3"],
["epi_isl_428365_Ile_De_France_20200326_null_2"],
["Node20"],
["epi_isl_430297_GP_20200306_null_11083"],
["epi_isl_423389_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_425904_Scotland_20200322_null_1"],
["epi_isl_429518_Unknown_20200311_null_12"],
["Node33"],
["epi_isl_425242_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_429273_Unknown_20200310_null_125"],
["Node27"],
["epi_isl_422266_Wales_20200325_null_1"],
["epi_isl_429315_Unknown_20200318_null_4"],
["Node30"],
["epi_isl_429815_NL_20200315_null_20"],
["epi_isl_418082_Washington_20200315_null_1"],
["epi_isl_423288_England_20200326_null_5"],
["epi_isl_425777_Scotland_20200313_null_8"],
["epi_isl_426621_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_428864_Moscow_20200311_null_2"],
["epi_isl_429026_California_20200331_null_2"],
["epi_isl_422661_Netherlands_20200310_null_1"],
["epi_isl_423084_England_20200324_null_2"],
["epi_isl_427212_Washington_20200327_null_3"],
["epi_isl_429705_Istria_20200301_null_4"],
["epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_2"],
["epi_isl_422914_Zuid_Holland_20200319_null_1"],
["epi_isl_425878_Scotland_20200321_null_5"],
["epi_isl_428387_Connecticut_20200331_null_1"],
["epi_isl_428732_Wisconsin_20200406_null_1"],
["epi_isl_420195_South_Yorkshire_20200328_null_2"],
["epi_isl_423509_England_20200331_null_5"],
["epi_isl_425839_Scotland_20200313_null_1"],
["epi_isl_427274_Minnesota_20200320_null_2"],
["epi_isl_426964_Victoria_20200327_null_1"],
["epi_isl_424470_Reykjavik_20200320_null_2"],
["epi_isl_418844_British_Columbia_20200312_null_1"],
["epi_isl_425319_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_430051_Utah_20200402_null_1"],
["epi_isl_429663_Istria_20200301_null_1"],
["epi_isl_416720_Washington_20200313_null_1"],
["epi_isl_423766_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1"],
["epi_isl_421670_India_20200312_null_1"],
["epi_isl_429638_Washington_20200407_null_4"],
["epi_isl_420422_Tielt_Winge_20200325_null_1"],
["epi_isl_422923_Zuid_Holland_20200323_null_10"],
["epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1"],
["epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_2"],
["epi_isl_429868_Eskisehir_20200317_null_2"],
["epi_isl_429159_Ostergotland_20200310_null_1"],
["epi_isl_415454_Switzerland_20200228_null_1"],
["epi_isl_423428_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_427051_Victoria_20200330_null_3"],
["epi_isl_427799_New_South_Wales_20200317_null_8"],
["epi_isl_429484_Unknown_20200324_null_13"],
["epi_isl_421432_New_York_20200317_null_1"],
["epi_isl_430264_Washington_20200321_null_1"],
["epi_isl_420520_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_423505_England_20200330_null_2"],
["Node94"],
["epi_isl_428779_New_York_20200406_null_116"],
["Node93"],
["epi_isl_427453_Wisconsin_20200406_null_20"]
],
"RESOLVED": [
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001100743211139726],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001101805401551045],
[274.4842743455, 613.6101819688226, 0, 1, 0.3090710367505684, 0, 0.001629699163060514, 0.01112581160484408, 0.6909289632494316, 1, 0.001101805401551045],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001101805411335228],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001100743211050562],
[275.0218672610484, 613.0725890532741, 0, 1, 0.30967636978888, 0, 0.001631128218510358, 0.01113556763961923, 0.69032363021112, 1, 0.001100858724046138],
[274.5114469443276, 613.583009369995, 0, 1, 0.3091016332694796, 0, 0.001629771334487837, 0.01112630431277562, 0.6908983667305204, 1, 0.001101893479511483],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.5489097097218, 613.5455466046008, 0, 1, 0.3091438165813198, 0, 0.001629870847460408, 0.0111269836790109, 0.6908561834186802, 1, 0.001101646304146874],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001102102795942663],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001101805401551045],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001100743220793948],
[274.6508776891839, 613.4435786251387, 0, 1, 0.309258633174011, 0, 0.001630141768280009, 0.01112883323141114, 0.690741366825989, 1, 0.001100594924119074],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 1, 0, 0.30918599989316, 0.003641841330237986, 0, -0.02486252766975132, 1, 0.3091859998931601, 0.00110305054858036],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001101185188449848],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001100594924119074],
[274.4842743455, 613.6101819688225, 0, 1, 0.3090710367505684, 0, 0.001629699163060514, 0.01112581160484409, 0.6909289632494316, 1, 0.001101805401551045],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.00110084364139934],
[274.5217371108943, 613.5727192034283, 1, 0, 0.3091132200624086, 0.00364269879144778, 0, -0.02486838148135954, 1, 0.3091132200624086, 0.001101226693408461],
[274.4859847063606, 613.4783851532602, 0, 1, 0.309118241703498, 0, 0.001630049279976145, 0.01112820182196591, 0.690881758296502, 1, 0.001102277843185],
[274.5217371108943, 613.5727192034283, 1, 0, 0.3091132200624086, 0.00364269879144778, 0, -0.02486838148135954, 1, 0.3091132200624086, 0.001101805401630989],
[274.6508776891839, 613.4435786251387, 1, 0, 0.309258633174011, 0.003640985997982782, 0, -0.02485668839232721, 1, 0.309258633174011, 0.001100594924119074],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001101037888053749],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001101131740783919],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001101805411335228],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001101805401551045],
[274.2242230092661, 613.8702333050564, 0, 1, 0.3087782172938259, 0, 0.001629008780269462, 0.01112109842277799, 0.6912217827061741, 1, 0.001101805401551045],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001101805411335228],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 1, 0, 0.30918599989316, 0.003641841330237986, 0, -0.02486252766975132, 1, 0.3091859998931601, 0.001101556356396341],
[274.8464238113501, 613.1459343733563, 0, 1, 0.3095144020982451, 0, 0.001630933100815573, 0.01113423558842711, 0.6904855979017549, 1, 0.00110090324489448],
[274.5941365545643, 613.5745414569112, 1, 0, 0.3091689037822796, 0.003641738358099613, 0, -0.02486182468809799, 1, 0.3091689037822796, 0.001100743211056301],
[274.5863724751161, 613.470621073812, 0, 1, 0.3091990429328088, 0, 0.001630069909867259, 0.01112834266040233, 0.6908009570671911, 1, 0.001101805401551045],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001100743211081179],
[274.4842743455, 613.5725890532741, 0, 1, 0.3090841202386443, 0, 0.001629799012930113, 0.0111264932710455, 0.6909158797613557, 1, 0.001100951446584168],
[274.8464238113501, 613.1833971387506, 0, 1, 0.3095013448053948, 0, 0.001630833458091366, 0.01113355533638891, 0.6904986551946052, 1, 0.001101185188370619],
[274.5217371108943, 613.5725890532741, 1, 0, 0.3091132653629268, 0.00364269879144778, 0, -0.02486838148135954, 1, 0.3091132653629268, 0.001101805411335228],
[274.651007839338, 613.4434484749845, 1, 0, 0.3092587797239115, 0.003640984272611764, 0, -0.02485667661337234, 1, 0.3092587797239115, 0.001100594924119074],
[274.5941365545643, 613.5003197597582, 1, 0, 0.309194742295945, 0.003641738358099613, 0, -0.02486182468809799, 1, 0.3091947422959449, 0.001100743211050562],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001100271359142901],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 1, 0, 0.30918599989316, 0.003641841330237986, 0, -0.02486252766975132, 1, 0.3091859998931601, 0.001101971858036829],
[274.5217371108943, 613.5727192034283, 1, 0, 0.3091132200624085, 0.003642698791447781, 0, -0.02486838148135955, 1, 0.3091132200624085, 0.00110180540158017],
[274.5863724751161, 613.470621073812, 0, 1, 0.3091990429328088, 0, 0.001630069909867259, 0.01112834266040233, 0.6908009570671911, 1, 0.001101805401630989],
[274.5941365545643, 613.5648249738259, 1, 0, 0.3091722860984574, 0.003641738358099613, 0, -0.02486182468809799, 1, 0.3091722860984574, 0.001100743211139726],
[274.5863724751161, 613.5725890532741, 0, 1, 0.3091635443306158, 0, 0.001629799012930113, 0.0111264932710455, 0.6908364556693842, 1, 0.001100860369539517],
[274.8840167268986, 613.2104395874239, 1, 0, 0.3095211492116432, 0.003637897946585651, 0, -0.02483560653940043, 1, 0.3095211492116432, 0.001102512781036929],
[274.4485219409663, 613.6459343733563, 0, 1, 0.3090307793159233, 0, 0.001629604213089395, 0.01112516338981489, 0.6909692206840767, 1, 0.001100743211050562],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001101805401551045],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 1, 0, 0.30918599989316, 0.003641841330237986, 0, -0.02486252766975132, 1, 0.3091859998931601, 0.001100594924233296],
[275.0218672610484, 613.0725890532741, 0, 1, 0.30967636978888, 0, 0.001631128218510358, 0.01113556763961923, 0.69032363021112, 1, 0.001100951446584168],
[275.0863724751161, 613.0080838392064, 0, 1, 0.309749003069731, 0, 0.001631299857804653, 0.01113673940585412, 0.690250996930269, 1, 0.001100860379230396],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.00110084364136863],
[274.4842743455, 613.6101819688225, 0, 1, 0.3090710367505684, 0, 0.001629699163060514, 0.01112581160484409, 0.6909289632494316, 1, 0.001101805401551045],
[274.5121507779631, 613.638170293908, 0, 1, 0.3090829832124206, 0, 0.00162962483171645, 0.01112530415135258, 0.6909170167875793, 1, 0.001100843631560914],
[274.5217371108943, 613.5727192034283, 1, 0, 0.3091132200624085, 0.003642698791447781, 0, -0.02486838148135955, 1, 0.3091132200624085, 0.001101185188419856],
[274.5506200705824, 613.4137497890384, 0, 1, 0.309191032196468, 0, 0.001630221038155591, 0.01112937439981919, 0.6908089678035321, 1, 0.001102503234646175],
[274.5217371108943, 613.5727192034283, 1, 0, 0.3091132200624086, 0.00364269879144778, 0, -0.02486838148135954, 1, 0.3091132200624086, 0.001101805411335228],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.00110180540158017],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 1, 0, 0.30918599989316, 0.003641841330237986, 0, -0.02486252766975132, 1, 0.3091859998931601, 0.001101805411335228],
[274.5218672610484, 613.5725890532741, 0, 1, 0.309113366612309, 0, 0.001629799012930113, 0.0111264932710455, 0.690886633387691, 1, 0.001101185188419856],
[275.5489097097218, 612.5455466046008, 0, 1, 0.3102698229344616, 0, 0.001632531663225856, 0.01114514883218309, 0.6897301770655384, 1, 0.001101339169394138],
[274.650001312113, 613.5186766993626, 0, 1, 0.3092318025974841, 0, 0.001629942229925009, 0.01112747100076393, 0.6907681974025159, 1, 0.001100743220793948],
[274.578608395668, 613.5158479186546, 1, 0, 0.3091772574903751, 0.00364194430819971, 0, -0.02486323069116016, 1, 0.3091772574903751, 0.00110084364139934],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001100743220793948],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 1, 0, 0.30918599989316, 0.003641841330237986, 0, -0.02486252766975132, 1, 0.3091859998931601, 0.001100951446659083],
[274.5217371108943, 613.5727192034283, 1, 0, 0.3091132200624086, 0.00364269879144778, 0, -0.02486838148135954, 1, 0.3091132200624086, 0.001101185188420029],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001101805401551045],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 1, 0, 0.30918599989316, 0.003641841330237986, 0, -0.02486252766975132, 1, 0.3091859998931601, 0.001101805401550256],
[274.2242230092661, 613.8702333050564, 0, 1, 0.3087782172938259, 0, 0.001629008780269462, 0.01112109842277799, 0.6912217827061741, 1, 0.001101805401630989],
[275.0218672610484, 613.0725890532741, 0, 1, 0.30967636978888, 0, 0.001631128218510358, 0.01113556763961923, 0.69032363021112, 1, 0.001100951446584168],
[274.5217371108943, 613.5727192034283, 1, 0, 0.3091132200624085, 0.003642698791447781, 0, -0.02486838148135955, 1, 0.3091132200624085, 0.001101185188340625],
[274.5217371108943, 613.5727192034283, 1, 0, 0.3091132200624086, 0.00364269879144778, 0, -0.02486838148135954, 1, 0.3091132200624086, 0.001101805401551045],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001101805411335228],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.00110180540158017],
[275.0863724751161, 613.0080838392064, 0, 1, 0.309749003069731, 0, 0.001631299857804653, 0.01113673940585412, 0.690250996930269, 1, 0.001100743211139726],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001100951436207827],
[274.578608395668, 613.5158479186546, 1, 0, 0.3091772574903751, 0.00364194430819971, 0, -0.02486323069116016, 1, 0.3091772574903751, 0.001101653180481932],
[274.5217371108943, 613.5727192034283, 1, 0, 0.3091132200624086, 0.00364269879144778, 0, -0.02486838148135954, 1, 0.3091132200624086, 0.001101805411335228],
[274.3821762158839, 613.6370942673418, 0, 1, 0.3089822319582949, 0, 0.001629627689300563, 0.01112532365982581, 0.6910177680417051, 1, 0.001101795152739478],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4842743455, 613.5725890532741, 0, 1, 0.3090841202386443, 0, 0.001629799012930113, 0.0111264932710455, 0.6909158797613557, 1, 0.001101420946644645],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.5217371108943, 613.5727192034283, 1, 0, 0.3091132200624085, 0.003642698791447781, 0, -0.02486838148135955, 1, 0.3091132200624085, 0.001101983833363036],
[273.5591998762886, 614.535256438034, 0, 1, 0.3080293970211069, 0, 0.001627245938331016, 0.01110906365725756, 0.691970602978893, 1, 0.001101323629818655],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.1238352405105, 613.970621073812, 1, 0, 0.3086651800284294, 0.003647986316558796, 0, -0.02490447894620119, 1, 0.3086651800284294, 0.001101534618081144],
[274.2817884471283, 613.6825814124926, 0, 1, 0.3088882817341981, 0, 0.001629506898661412, 0.01112449903284846, 0.6911117182658019, 1, 0.001103181495677119],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4842743455, 613.6101819688226, 0, 1, 0.3090710367505683, 0, 0.001629699163060514, 0.01112581160484408, 0.6909289632494318, 1, 0.001101450137708649],
[274.4842743455, 613.6101819688226, 0, 1, 0.3090710367505683, 0, 0.001629699163060514, 0.01112581160484408, 0.6909289632494318, 1, 0.001102530378224416],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 1, 0, 0.30918599989316, 0.003641841330237986, 0, -0.02486252766975132, 1, 0.3091859998931601, 0.001101448459784259],
[274.651007839338, 613.5080838392064, 1, 0, 0.3092362735602596, 0.003640984272611764, 0, -0.02485667661337234, 1, 0.3092362735602596, 0.001100594924119074],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001101805401550256],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.00110180540158017],
[274.5217371108943, 613.5727192034283, 1, 0, 0.3091132200624086, 0.00364269879144778, 0, -0.02486838148135954, 1, 0.3091132200624086, 0.001101185188449848],
[274.6143608002017, 613.9426327487265, 0, 1, 0.309056552133344, 0, 0.001628816678722617, 0.01111978696256027, 0.6909434478666561, 1, 0.001100903244962873],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001101805401551045],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 1, 0, 0.30918599989316, 0.003641841330237986, 0, -0.02486252766975132, 1, 0.3091859998931601, 0.001100594924141666],
[274.5217371108943, 613.5725890532741, 1, 0, 0.3091132653629268, 0.003642698791447781, 0, -0.02486838148135955, 1, 0.3091132653629268, 0.001101805401631779],
[274.5863724751161, 613.638170293908, 1, 0, 0.3091407175252082, 0.003641841330237986, 0, -0.02486252766975132, 1, 0.3091407175252082, 0.001100722392920349],
[274.650001312113, 613.5186766993625, 0, 1, 0.3092318025974841, 0, 0.00162994222992501, 0.01112747100076393, 0.6907681974025159, 1, 0.001100860369651769],
[274.5217371108943, 613.5727192034283, 1, 0, 0.3091132200624085, 0.003642698791447781, 0, -0.02486838148135955, 1, 0.3091132200624085, 0.001101805401630989],
[274.5489097097218, 613.5455466046008, 0, 1, 0.3091438165813198, 0, 0.001629870847460408, 0.0111269836790109, 0.6908561834186802, 1, 0.00110084364148207],
[274.651007839338, 613.5080838392064, 1, 0, 0.3092362735602596, 0.003640984272611764, 0, -0.02485667661337234, 1, 0.3092362735602596, 0.001100594924210706],
[274.651007839338, 613.4434484749845, 1, 0, 0.3092587797239115, 0.003640984272611764, 0, -0.02485667661337234, 1, 0.3092587797239115, 0.001100271349515741],
[275.1867602438717, 613.3702333050564, 0, 1, 0.3097007420365531, 0, 0.001630336696666294, 0.01113016399021093, 0.6902992579634469, 1, 0.001101971858088176],
[274.5121507779631, 613.6381702939082, 0, 1, 0.3090829832124206, 0, 0.001629624831716449, 0.01112530415135258, 0.6909170167875794, 1, 0.001100843651320469],
[274.6508776891839, 613.4435786251387, 0, 1, 0.309258633174011, 0, 0.001630141768280009, 0.01112883323141114, 0.690741366825989, 1, 0.001100743211139726],
[274.4842743455, 613.5725890532741, 0, 1, 0.3090841202386442, 0, 0.001629799012930113, 0.0111264932710455, 0.6909158797613557, 1, 0.001101805401550256],
[275.0218672610484, 613.0725890532741, 0, 1, 0.30967636978888, 0, 0.001631128218510358, 0.01113556763961923, 0.69032363021112, 1, 0.001100903244933634],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001101185188449848],
[274.651007839338, 613.5080838392064, 1, 0, 0.3092362735602596, 0.003640984272611764, 0, -0.02485667661337234, 1, 0.3092362735602596, 0.001100594924141666],
[274.0863724751162, 614.0080838392064, 0, 1, 0.3086229967165892, 0, 0.001628643052624492, 0.01111860163259189, 0.6913770032834108, 1, 0.001101805401551045],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 1, 0, 0.30918599989316, 0.003641841330237986, 0, -0.02486252766975132, 1, 0.3091859998931601, 0.001101805411335228],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 0, 1, 0.30918599989316, 0, 0.00162997037258614, 0.01112766312821475, 0.6908140001068399, 1, 0.001101185188340625],
[274.5863724751161, 613.896399376659, 0, 1, 0.3090508687105136, 0, 0.001628939347120108, 0.01112062440882722, 0.6909491312894864, 1, 0.001102149920886277],
[274.5218672610484, 613.5725890532741, 0, 1, 0.309113366612309, 0, 0.001629799012930113, 0.0111264932710455, 0.690886633387691, 1, 0.00110084364136863],
[274.5863724751161, 613.5455466046008, 0, 1, 0.3091729579538621, 0, 0.001629870847460408, 0.0111269836790109, 0.690827042046138, 1, 0.001100594924210706],
[274.651007839338, 613.4434484749846, 1, 0, 0.3092587797239115, 0.003640984272611764, 0, -0.02485667661337234, 1, 0.3092587797239115, 0.001100594924119074],
[274.5863724751161, 613.5456767547548, 0, 1, 0.3091729126465138, 0, 0.001629870501719333, 0.01112698131866726, 0.6908270873534863, 1, 0.001103050548588917],
[274.7888583734879, 613.4076960704508, 1, 0, 0.3093784331842193, 0.003639157737031749, 0, -0.02484420701701161, 1, 0.3093784331842193, 0.001100271359173733],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 1, 0, 0.30918599989316, 0.003641841330237986, 0, -0.02486252766975132, 1, 0.3091859998931601, 0.001100743211081179],
[274.4842743455, 613.6101819688226, 0, 1, 0.3090710367505683, 0, 0.001629699163060514, 0.01112581160484408, 0.6909289632494318, 1, 0.001100843641396438],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 1, 0, 0.30918599989316, 0.003641841330237986, 0, -0.02486252766975132, 1, 0.3091859998931601, 0.001100594924233296],
[274.5863724751161, 613.5455466046008, 0, 1, 0.3091729579538621, 0, 0.001629870847460408, 0.0111269836790109, 0.690827042046138, 1, 0.001102512781089531],
[274.2242230092661, 613.8702333050564, 0, 1, 0.3087782172938259, 0, 0.001629008780269462, 0.01112109842277799, 0.6912217827061741, 1, 0.001101185188419856],
[274.5217371108943, 613.5727192034283, 1, 0, 0.3091132200624086, 0.00364269879144778, 0, -0.02486838148135954, 1, 0.3091132200624086, 0.001101805401551045],
[274.6884706047323, 613.4059857095901, 0, 1, 0.3093009630357518, 0, 0.001630241672394502, 0.01112951526793763, 0.6906990369642483, 1, 0.001100594924119074],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 1, 0, 0.30918599989316, 0.003641841330237986, 0, -0.02486252766975132, 1, 0.3091859998931601, 0.00110180541136514],
[274.152830092821, 613.9416262215016, 0, 1, 0.3086978284163395, 0, 0.001628819349087781, 0.01111980519290634, 0.6913021715836605, 1, 0.001100951446595193],
[274.2242230092661, 613.8702333050564, 0, 1, 0.3087782172938259, 0, 0.001629008780269462, 0.01112109842277799, 0.6912217827061741, 1, 0.001101653180481932],
[274.5217371108943, 613.5727192034283, 1, 0, 0.3091132200624085, 0.003642698791447781, 0, -0.02486838148135955, 1, 0.3091132200624085, 0.001101805411335228],
[274.4842743455, 613.6101819688226, 0, 1, 0.3090710367505683, 0, 0.001629699163060514, 0.01112581160484408, 0.6909289632494318, 1, 0.001100843641396438],
[274.5489097097218, 613.5455466046008, 0, 1, 0.3091438165813198, 0, 0.001629870847460408, 0.0111269836790109, 0.6908561834186802, 1, 0.00110180540158017],
[274.5863724751161, 613.5080838392064, 1, 0, 0.30918599989316, 0.003641841330237986, 0, -0.02486252766975132, 1, 0.3091859998931601, 0.001100858734477117],
[274.5843594206661, 613.6585402879625, 0, 1, 0.3091320623117149, 0, 0.001629570737385558, 0.01112493485415465, 0.6908679376882851, 1, 0.001101504799194593],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.648994784888, 613.5939049237406, 1, 0, 0.3092048299794813, 0.003641010959400106, 0, -0.0248568588017088, 1, 0.3092048299794814, 0.001100961817850605],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.650001312113, 613.5186766993626, 0, 1, 0.3092318025974841, 0, 0.001629942229925009, 0.01112747100076393, 0.6907681974025159, 1, 0.001100993471816411],
[274.5217371108943, 613.5727192034283, 1, 0, 0.3091132200624086, 0.00364269879144778, 0, -0.02486838148135954, 1, 0.3091132200624086, 0.001102056125858369]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.8515566056939561, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2986286872207191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7242989317002281, 2.127257673993728, 0, 0, 0.2540012462856098, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.007237071829794946, 2.992762928170206, 0, 1, 0.002412357276598315, 0, 0.3341393969389371, 2.281140019190639, 0.9975876427234017, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 3.413455641699607, 0.6666666666666667, 1, 0.1464791262824329],
[0.9245882866730165, 2.075411713326984, 1, 0, 0.3081960955576721, 1.081562479661451, 0, -7.383731096101994, 1, 0.3081960955576721, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7242989317002281, 2.127257673993728, 0, 0, 0.2540012462856098, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9995152199733595, 2.000484780026642, 0, 1, 0.3331717399911197, 0, 0.49987883436268, 3.412628454643029, 0.6668282600088803, 1, 0.1464791262824329],
[0.7398270905965738, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2700269272961611, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9953909816389128, 2.004609018361088, 0, 4, 0.3317969938796375, 0, 1.995401578742915, 13.62242955283262, 0.1993580148702347, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.129010428135388, 0, 0, 0.2720869411905728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.003273221425608242, 2.996726778574393, 0, 1, 0.00109107380853608, 0, 0.3336974218502901, 2.278122694470974, 0.9989089261914639, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7242989317002281, 1.350626599088373, 0, 0, 0.3490722538967214, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1.001954485715235, 1.997278168349241, 0, 1, 0.3340702777283431, 0, 0.5006813852206197, 3.418107398150599, 0.6659297222716569, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.129010428135388, 0, 0, 0.2720869411905728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9245882866687344, 2.075411713331267, 1, 0, 0.3081960955562447, 1.08156247966646, 0, -7.383731096136191, 1, 0.3081960955562446, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0, 1.520345818806854, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9245885603482344, 2.075411439651767, 1, 0, 0.3081961867827447, 1.081562159522461, 0, -7.383728910541516, 1, 0.3081961867827447, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9250744692113989, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3162567240419007, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.129010428135388, 0, 0, 0.2720869411905728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.8515566056939561, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2986286872207191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9245882866730162, 2.00048520355833, 1, 0, 0.316090617812098, 1.081562479661451, 0, -7.383731096101998, 1, 0.316090617812098, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 3.413455641699607, 0.6666666666666667, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7242989317002281, 2.015528158896346, 0, 0, 0.2643593583646617, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9238321553067635, 2.075188121688961, 1, 1, 0.3080446512459777, 1.082447708986644, 0.4818840227295232, -4.099995006108569, 0.9051084928387438, 0.5211977953306994, 0.1464791262824329],
[0.003273078118039352, 2.996726921881961, 0, 1, 0.001091026039346451, 0, 0.3336974058924242, 2.27812258552804, 0.9989089739606536, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9245885603482693, 2.075411439651732, 1, 0, 0.3081961867827563, 1.081562159522421, 0, -7.383728910541237, 1, 0.3081961867827563, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 3.413455641699607, 0.6666666666666667, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2846422047311406, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7242989317002281, 2.015528158896346, 0, 0, 0.2643593583646617, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1.520102672467913, 1.275701068299772, 0, 0, 0.5437086481794735, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -6.826911283399214, 1, 0.3333333333333333, 0.1464791262824329],
[0.8709895718646118, 2.129010428135388, 0, 0, 0.2903298572882039, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9992320252478685, 2.000485203558294, 0, 1, 0.3331087396012811, 0, 0.4998787285311006, 3.412627732140225, 0.6668912603987189, 1, 0.1464791262824329],
[0.7403052407108519, 2.111809117012698, 0, 1, 0.259563659748109, 0, 0.4735276460092994, 3.232731229542356, 0.740436340251891, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9250744692113989, 2.074925530788602, 0, 0, 0.3083581564037995, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1.535630831364258, 1.389183337538815, 0, 0, 0.5250353501741218, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -6.826911283399214, 1, 0.3333333333333333, 0.1464791262824329],
[0.7400374443765954, 1.338364409321741, 0, 1, 0.3560608084811715, 0, 0.7471806579994021, 5.10093606483377, 0.6439391915188285, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 3.413455641699607, 0.6666666666666667, 1, 0.1464791262824329],
[0.999232695609, 2.000767304391001, 0, 1, 0.3330775652029999, 0, 0.4998082474685294, 3.412146564178892, 0.6669224347970001, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7242989317002281, 1.350626599088373, 0, 0, 0.3490722538967214, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9997182077862076, 2.000281792213794, 1, 1, 0.3332394025954024, 1.000281871643027, 0.4999295618710097, -3.415860829257443, 0.8889515005578592, 0.5554303057486641, 0.1464791262824329],
[0.8670847645903024, 2.132915235409698, 0, 0, 0.2890282548634341, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 3.413455641699607, 0.6666666666666667, 1, 0.1464791262824329],
[0.8709895718646118, 2.129010428135388, 0, 0, 0.2903298572882039, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 1.739827090596575, 0, 0, 0.3649865363519194, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7288156873766193, 1.352511335409742, 0, 2, 0.3501687526263522, 0, 1.478730675032829, 10.09516313049016, 0.4222806500631911, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.129010428135388, 0, 0, 0.2720869411905728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9972763142367856, 2.002723685763216, 0, 1, 0.3324254380789284, 0, 0.4993200046060828, 3.408813373472216, 0.6675745619210716, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7398270905965738, 2.111729515097384, 0, 0, 0.2594467488806973, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9992320252478679, 2.000767974752133, 0, 1, 0.3330773417492892, 0, 0.4998080800068213, 3.412145420932667, 0.6669226582507108, 1, 0.1464791262824329],
[0.7422188014278586, 2.112127684536989, 0, 1, 0.2600310806965568, 0, 0.4734562248869038, 3.232243643876, 0.7399689193034432, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7955346434386297, 2.203486235913041, 0, 1, 0.265264789890562, 0, 0.4538262974833777, 3.098231870992561, 0.734735210109438, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 3.413455641699607, 0.6666666666666667, 1, 0.1464791262824329],
[0.7962893891708839, 2.203710610829116, 1, 0, 0.2654297963902947, 1.255824846594056, 0, -8.573404815186054, 1, 0.2654297963902947, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 3.413455641699607, 0.6666666666666667, 1, 0.1464791262824329],
[0.7398270905965738, 2.111729515097384, 0, 0, 0.2594467488806973, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 3.413455641699607, 0.6666666666666667, 1, 0.1464791262824329],
[0.7398270905965738, 2.111729515097384, 0, 0, 0.2594467488806973, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.000484787393249, 0, 1, 0.2845928568362254, 0, 0.4998788325219206, 3.412628442076327, 0.7154071431637745, 1, 0.1464791262824329],
[0.73976869782052, 2.111787907873437, 1, 0, 0.2594262713716985, 1.351773876004978, 0, -9.228440326702682, 1, 0.2594262713716985, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9997184537611382, 2.000281546238863, 1, 1, 0.3332394845870459, 1.00028162552947, 0.4999296233474251, -3.415858729367995, 0.8889514459121601, 0.5554304150862518, 0.1464791262824329],
[0.8709895718646118, 2.129010428135388, 0, 0, 0.2903298572882039, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7242989317002281, 1.350626599088373, 0, 0, 0.3490722538967214, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 1.999718207786195, 0, 1, 0.3333646465205826, 0, 0.5000704579807064, 3.413936652083099, 0.6666353534794174, 1, 0.1464791262824329],
[1, 1.739827090596575, 0, 0, 0.3649865363519194, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7398270905965738, 1.335098440192028, 0, 0, 0.356555972548756, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 1.925074469211399, 0, 0, 0.3418716379790496, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -6.826911283399214, 1, 0.3333333333333333, 0.1464791262824329],
[1.520102672467913, 1.275701068299772, 0, 0, 0.5437086481794735, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 3.413455641699607, 0.6666666666666667, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.129010428135388, 0, 0, 0.2720869411905728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9250744692113989, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3162567240419007, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 1.925074469211399, 0, 0, 0.3418716379790496, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9250744692113989, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3162567240419007, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7242989317002281, 1.350626599088373, 0, 0, 0.3490722538967214, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.129010428135388, 0, 0, 0.2720869411905728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 3.413455641699607, 0.6666666666666667, 1, 0.1464791262824329],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.8670847645903024, 2.132915235409698, 0, 0, 0.2890282548634341, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0.4999999999999998, -3.413455641699607, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9245882866730389, 2.075411713326962, 1, 0, 0.3081960955576795, 1.081562479661424, 0, -7.383731096101815, 1, 0.3081960955576795, 0.1464791262824329],
[0.9995150695658154, 2.000484930434186, 0, 1, 0.3331716898552716, 0, 0.4998787967790188, 3.412628198062708, 0.6668283101447283, 1, 0.1464791262824329],
[0.8714743076646549, 2.128525692335345, 0, 1, 0.2904914358882183, 0, 0.4698087524153089, 3.207342672903782, 0.7095085641117818, 1, 0.1464791262824329],
[0.7397687407298812, 2.111787864964076, 1, 0, 0.259426286419396, 1.351773797597024, 0, -9.228439791418536, 1, 0.2594262864193959, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 1.925074469211399, 0, 0, 0.3418716379790496, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9250744692113989, 2.074925530788602, 0, 0, 0.3083581564037995, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7962892463903876, 2.203710753609612, 1, 1, 0.2654297487967959, 1.255825071772653, 0.45378006090955, -5.475490134455364, 0.92954704845367, 0.4604065460472615, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 1.925074469211399, 0, 0, 0.3418716379790496, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.129010428135388, 0, 0, 0.2720869411905728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 3.413455641699607, 0.6666666666666667, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9231302659506153, 2.076869734049386, 2, 1, 0.307710088650205, 2.166541466323231, 0.4814938479796927, -11.50367059873448, 0.9708643168143296, 0.2257851296000104, 0.1464791262824329],
[0.2757010682997719, 2.72429893170023, 0, 0, 0.09190035609992392, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7962893891709243, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2847664452236888, 1.255824846593993, 0, -8.573404815185619, 1, 0.2847664452236888, 0.1464791262824329],
[0.9245882866730166, 2.075411713326984, 1, 0, 0.3081960955576721, 1.081562479661451, 0, -7.383731096101994, 1, 0.3081960955576721, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.129010428135388, 0, 0, 0.2720869411905728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999996, 6.826911283399214, 0.4444444444444445, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.12929351888812, 0, 1, 0.2720606086312926, 0, 0.4696393386488973, 3.206186100150303, 0.7279393913687074, 1, 0.1464791262824329],
[0.9250744692113989, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3162567240419007, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9250744692113989, 2.074925530788602, 0, 0, 0.3083581564037995, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.003273221425608242, 2.996726778574393, 0, 1, 0.00109107380853608, 0, 0.3336974218502901, 2.278122694470974, 0.9989089261914639, 1, 0.1464791262824329],
[0.7242989317002281, 2.015528158896346, 0, 0, 0.2643593583646617, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1.520102672467913, 1.275701068299772, 0, 0, 0.5437086481794735, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 1.999718207786215, 0, 1, 0.3333646465205803, 0, 0.5000704579807013, 3.413936652083064, 0.6666353534794197, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -6.826911283399214, 1, 0.3333333333333333, 0.1464791262824329],
[1, 1.739827090596575, 0, 0, 0.3649865363519194, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 3.413455641699607, 0.6666666666666667, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -6.826911283399214, 1, 0.3333333333333333, 0.1464791262824329],
[0.9245882866687344, 2.075411713331267, 1, 0, 0.3081960955562447, 1.08156247966646, 0, -7.383731096136191, 1, 0.3081960955562446, 0.1464791262824329],
[1.520102672467913, 1.275701068299772, 0, 0, 0.5437086481794735, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7242989317002281, 2.015528158896346, 0, 0, 0.2643593583646617, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9250744692113989, 2.074925530788602, 0, 1, 0.3083581564037995, 0, 0.4819450072600616, 3.290195808041632, 0.6916418435962005, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7962893891708938, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2847664452236809, 1.255824846594041, 0, -8.573404815185947, 1, 0.2847664452236809, 0.1464791262824329],
[1, 1.739827090596575, 0, 0, 0.3649865363519194, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999996, 6.826911283399214, 0.4444444444444445, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9245882866730518, 2.075411713326949, 1, 0, 0.3081960955576838, 1.081562479661409, 0, -7.383731096101712, 1, 0.3081960955576838, 0.1464791262824329],
[0.8670847645903024, 2.132915235409698, 0, 0, 0.2890282548634341, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7242989317002281, 1.350626599088373, 0, 0, 0.3490722538967214, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9972774712827047, 2.002722528717297, 0, 1, 0.3324258237609014, 0, 0.4993202930814784, 3.408815342868149, 0.6675741762390985, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999996, 6.826911283399214, 0.4444444444444445, 1, 0.1464791262824329],
[0.7243572762436421, 1.35056825454496, 1, 0, 0.3491003727581206, 1.380534209838797, 0, -9.424784574267109, 1, 0.3491003727581206, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999996, 6.826911283399214, 0.4444444444444445, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9962390361360209, 2.00376096386398, 1, 1, 0.3320796787120068, 1.003775162112264, 0.4990615238215022, -3.445635232132673, 0.8897230869865302, 0.5538824444105439, 0.1464791262824329],
[0.9250744692113989, 2.074925530788602, 0, 0, 0.3083581564037995, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9972759378911569, 2.002724062108844, 0, 1, 0.3324253126303855, 0, 0.4993199107754326, 3.408812732898692, 0.6675746873696145, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.8709895718646118, 2.129010428135388, 0, 0, 0.2903298572882039, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 3.413455641699607, 0.6666666666666667, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 3.413455641699607, 0.6666666666666667, 1, 0.1464791262824329],
[1.521623636172909, 1.274947010096557, 1, 0, 0.5441034140162722, 0.657192735593367, 0, -4.486596501990356, 1, 0.5441034140162722, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0, 1.520345818806854, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1.535630831364258, 1.389183337538815, 0, 0, 0.5250353501741218, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9250744692113989, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3162567240419007, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -6.826911283399214, 1, 0.3333333333333333, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.2757010682997719, 2.72429893170023, 0, 0, 0.09190035609992392, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 1.739827090596575, 0, 0, 0.3649865363519194, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9245882866730517, 2.075411713326949, 1, 0, 0.3081960955576838, 1.08156247966141, 0, -7.383731096101714, 1, 0.3081960955576838, 0.1464791262824329],
[0.8638262176214473, 2.136173782378553, 0, 1, 0.2879420725404824, 0, 0.4681267077842964, 3.195859503433141, 0.7120579274595176, 1, 0.1464791262824329],
[0, 1.520345818806854, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9991546189958436, 2.000845381004158, 0, 1, 0.3330515396652811, 0, 0.4997887440448464, 3.412013416035685, 0.6669484603347189, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1.074925530788602, 1, 0, 0, 0.5180549927399383, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.796570871799043, 2.203429128200956, 0, 1, 0.2655236239330144, 0, 0.4538380595959873, 3.098312169891853, 0.7344763760669857, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9972759378909593, 2.002724062109042, 0, 1, 0.3324253126303196, 0, 0.4993199107753832, 3.408812732898354, 0.6675746873696804, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9245885603482211, 2.07541143965178, 1, 0, 0.3081961867827402, 1.081562159522477, 0, -7.383728910541622, 1, 0.3081961867827403, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9250744692113989, 2.074925530788602, 0, 0, 0.3083581564037995, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9992320252478679, 2.000767974752133, 0, 1, 0.3330773417492892, 0, 0.4998080800068213, 3.412145420932667, 0.6669226582507108, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -6.826911283399214, 1, 0.3333333333333333, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999996, 6.826911283399214, 0.4444444444444445, 1, 0.1464791262824329],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7403052915989599, 2.111809125484496, 0, 1, 0.2595636721881546, 0, 0.4735276441096815, 3.232731216573834, 0.7404363278118453, 1, 0.1464791262824329],
[0.9250744692113989, 2.000563455757805, 0, 2, 0.3161958153865319, 0, 0.9997183514693404, 6.824988493867305, 0.46758816289489, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7962893891708839, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2847664452236784, 1.255824846594056, 0, -8.573404815186054, 1, 0.2847664452236784, 0.1464791262824329],
[0.7242989317002281, 2.015528158896346, 0, 0, 0.2643593583646617, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1.925074469211399, 1.074925530788602, 0, 0, 0.6416914897371327, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7242989317002281, 1.350626599088373, 0, 0, 0.3490722538967214, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9245885603482343, 2.075411439651767, 1, 0, 0.3081961867827446, 1.081562159522461, 0, -7.383728910541516, 1, 0.3081961867827446, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9238331087100076, 2.075187970809271, 1, 1, 0.3080448867195329, 1.082446591891849, 0.4818840577656322, -4.099987140613099, 0.9051083477659503, 0.5211981212050159, 0.1464791262824329],
[0.2779413642390005, 2.722058635761001, 1, 0, 0.09264712141300012, 3.597881167267009, 0, -24.56241553714469, 1, 0.09264712141300013, 0.1464791262824329],
[1.925074469211399, 1.074925530788602, 0, 0, 0.6416914897371327, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9994421970817635, 1.74080473738773, 0, 1, 0.3647270559852862, 0, 0.5744469661201697, 3.921698474720234, 0.6352729440147138, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9992320252478679, 2.000767974752133, 0, 1, 0.3330773417492892, 0, 0.4998080800068213, 3.412145420932667, 0.6669226582507108, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 3.413455641699607, 0.6666666666666667, 1, 0.1464791262824329],
[0.7242989317002281, 1.350626599088373, 0, 0, 0.3490722538967214, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -6.826911283399214, 1, 0.3333333333333333, 0.1464791262824329],
[1, 1.740804629699517, 1, 0, 0.3648563597579859, 0.9999999999999996, 0, -6.826911283399214, 1, 0.3648563597579859, 0.1464791262824329],
[0.87195891286198, 2.12804108713802, 1, 1, 0.2906529709539933, 1.146843028093787, 0.4699157389601389, -4.621322548227349, 0.9155208504756169, 0.4968267923836038, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0.4999999999999998, -3.413455641699607, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 3.413455641699607, 0.6666666666666667, 1, 0.1464791262824329],
[1.520102672467913, 1.275701068299772, 0, 0, 0.5437086481794735, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.007030683825896708, 2.992969316174104, 0, 2, 0.002343561275298902, 0, 0.668232710970986, 4.561965434464272, 0.9953183697288533, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.129010428135388, 0, 0, 0.2720869411905728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 3.413455641699607, 0.6666666666666667, 1, 0.1464791262824329],
[1, 1.925074469211399, 0, 0, 0.3418716379790496, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1.520102672467913, 1.275701068299772, 0, 0, 0.5437086481794735, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7242989317002281, 2.127257673993728, 0, 0, 0.2540012462856098, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7242989317002281, 2.015528158896346, 0, 0, 0.2643593583646617, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1.520102672467913, 1.275701068299772, 0, 0, 0.5437086481794735, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1.914640851895801, 1.085359148104201, 1, 0, 0.6382136172985999, 0.522291164429005, 0, -3.56563544366009, 1, 0.6382136172985999, 0.1464791262824329],
[0.7242989317002281, 1.350626599088373, 0, 0, 0.3490722538967214, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 1, 0.265267913589228, 0, 0.453680109387484, 3.097233857831206, 0.734732086410772, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.003757338124127442, 2.996242661875874, 0, 1, 0.001252446041375813, 0, 0.333751338876513, 2.278490781225663, 0.9987475539586241, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9994421970917757, 1.740804737370181, 0, 1, 0.3647270559899429, 0, 0.5744469661259605, 3.921698474759768, 0.6352729440100571, 1, 0.1464791262824329],
[0.9976963580015388, 2.00145543234538, 0, 1, 0.3326595076690443, 0, 0.4996364065065204, 3.410973421176402, 0.6673404923309557, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.2746651661650704, 2.725334833834931, 0, 1, 0.09155505538835675, 0, 0.3669273909337806, 2.504980745354063, 0.9084449446116433, 1, 0.1464791262824329],
[1.535630831364258, 1.389183337538815, 0, 0, 0.5250353501741218, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1.520161017011332, 1.276127459556397, 1, 0, 0.5436352614367012, 0.6578250519579962, 0, -4.490913269714721, 1, 0.5436352614367012, 0.1464791262824329],
[1.520102672467913, 1.275701068299772, 0, 0, 0.5437086481794735, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7242989317002281, 2.015528158896346, 0, 0, 0.2643593583646617, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7962893891708839, 2.203710610829116, 1, 0, 0.2654297963902947, 1.255824846594056, 0, -8.573404815186054, 1, 0.2654297963902947, 0.1464791262824329],
[0.7242989317002281, 2.015528158896346, 0, 0, 0.2643593583646617, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.8516149502373704, 2.000499407481245, 1, 0, 0.2985907447689337, 1.174239601736994, 0, -8.016429586512489, 1, 0.2985907447689337, 0.1464791262824329],
[0.7242989317002281, 1.350626599088373, 0, 0, 0.3490722538967214, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9245882866687345, 2.000485203562603, 1, 0, 0.3160906178106352, 1.08156247966646, 0, -7.383731096136191, 1, 0.3160906178106352, 0.1464791262824329],
[1.001954986262853, 1.922633574085404, 0, 1, 0.3425969040046923, 0, 0.5201199092113533, 3.550812476915564, 0.6574030959953077, 1, 0.1464791262824329],
[0.9992326204671808, 2.000484827500972, 1, 1, 0.33310891368919, 1.000767968856402, 0.4998788224998492, -3.419525764993749, 0.8890384516208076, 0.5552562789991878, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9245882866687344, 2.075411713331267, 1, 0, 0.3081960955562447, 1.08156247966646, 0, -7.383731096136191, 1, 0.3081960955562446, 0.1464791262824329],
[0.7242989317002281, 1.350626599088373, 0, 0, 0.3490722538967214, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329]
],
"RESOLVED": [
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.8515566056939561, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2986286872207191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7242989317002281, 2.127257673993728, 0, 0, 0.2540012462856098, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.007237071829794946, 2.992762928170206, 0, 1, 0.002412357276598315, 0, 0.3341393969389371, 2.281140019190639, 0.9975876427234017, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 3.413455641699607, 0.6666666666666667, 1, 0.1464791262824329],
[0.9245882866730165, 2.075411713326984, 1, 0, 0.3081960955576721, 1.081562479661451, 0, -7.383731096101994, 1, 0.3081960955576721, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7242989317002281, 2.127257673993728, 0, 0, 0.2540012462856098, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9995152199733595, 2.000484780026642, 0, 1, 0.3331717399911197, 0, 0.49987883436268, 3.412628454643029, 0.6668282600088803, 1, 0.1464791262824329],
[0.7398270905965738, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2700269272961611, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9953909816389128, 2.004609018361088, 0, 4, 0.3317969938796375, 0, 1.995401578742915, 13.62242955283262, 0.1993580148702347, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.129010428135388, 0, 0, 0.2720869411905728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.003273221425608242, 2.996726778574393, 0, 1, 0.00109107380853608, 0, 0.3336974218502901, 2.278122694470974, 0.9989089261914639, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7242989317002281, 1.350626599088373, 0, 0, 0.3490722538967214, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1.001954485715235, 1.997278168349241, 0, 1, 0.3340702777283431, 0, 0.5006813852206197, 3.418107398150599, 0.6659297222716569, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.129010428135388, 0, 0, 0.2720869411905728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9245882866687344, 2.075411713331267, 1, 0, 0.3081960955562447, 1.08156247966646, 0, -7.383731096136191, 1, 0.3081960955562446, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0, 1.520345818806854, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9245885603482344, 2.075411439651767, 1, 0, 0.3081961867827447, 1.081562159522461, 0, -7.383728910541516, 1, 0.3081961867827447, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9250744692113989, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3162567240419007, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.129010428135388, 0, 0, 0.2720869411905728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.8515566056939561, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2986286872207191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9245882866730162, 2.00048520355833, 1, 0, 0.316090617812098, 1.081562479661451, 0, -7.383731096101998, 1, 0.316090617812098, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 3.413455641699607, 0.6666666666666667, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7242989317002281, 2.015528158896346, 0, 0, 0.2643593583646617, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9238321553067635, 2.075188121688961, 1, 1, 0.3080446512459777, 1.082447708986644, 0.4818840227295232, -4.099995006108569, 0.9051084928387438, 0.5211977953306994, 0.1464791262824329],
[0.003273078118039352, 2.996726921881961, 0, 1, 0.001091026039346451, 0, 0.3336974058924242, 2.27812258552804, 0.9989089739606536, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9245885603482693, 2.075411439651732, 1, 0, 0.3081961867827563, 1.081562159522421, 0, -7.383728910541237, 1, 0.3081961867827563, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 3.413455641699607, 0.6666666666666667, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2846422047311406, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7242989317002281, 2.015528158896346, 0, 0, 0.2643593583646617, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1.520102672467913, 1.275701068299772, 0, 0, 0.5437086481794735, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -6.826911283399214, 1, 0.3333333333333333, 0.1464791262824329],
[0.8709895718646118, 2.129010428135388, 0, 0, 0.2903298572882039, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9992320252478685, 2.000485203558294, 0, 1, 0.3331087396012811, 0, 0.4998787285311006, 3.412627732140225, 0.6668912603987189, 1, 0.1464791262824329],
[0.7403052407108519, 2.111809117012698, 0, 1, 0.259563659748109, 0, 0.4735276460092994, 3.232731229542356, 0.740436340251891, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9250744692113989, 2.074925530788602, 0, 0, 0.3083581564037995, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1.535630831364258, 1.389183337538815, 0, 0, 0.5250353501741218, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -6.826911283399214, 1, 0.3333333333333333, 0.1464791262824329],
[0.7400374443765954, 1.338364409321741, 0, 1, 0.3560608084811715, 0, 0.7471806579994021, 5.10093606483377, 0.6439391915188285, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 3.413455641699607, 0.6666666666666667, 1, 0.1464791262824329],
[0.999232695609, 2.000767304391001, 0, 1, 0.3330775652029999, 0, 0.4998082474685294, 3.412146564178892, 0.6669224347970001, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7242989317002281, 1.350626599088373, 0, 0, 0.3490722538967214, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9997182077862076, 2.000281792213794, 1, 1, 0.3332394025954024, 1.000281871643027, 0.4999295618710097, -3.415860829257443, 0.8889515005578592, 0.5554303057486641, 0.1464791262824329],
[0.8670847645903024, 2.132915235409698, 0, 0, 0.2890282548634341, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 3.413455641699607, 0.6666666666666667, 1, 0.1464791262824329],
[0.8709895718646118, 2.129010428135388, 0, 0, 0.2903298572882039, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 1.739827090596575, 0, 0, 0.3649865363519194, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7288156873766193, 1.352511335409742, 0, 2, 0.3501687526263522, 0, 1.478730675032829, 10.09516313049016, 0.4222806500631911, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.129010428135388, 0, 0, 0.2720869411905728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9972763142367856, 2.002723685763216, 0, 1, 0.3324254380789284, 0, 0.4993200046060828, 3.408813373472216, 0.6675745619210716, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7398270905965738, 2.111729515097384, 0, 0, 0.2594467488806973, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9992320252478679, 2.000767974752133, 0, 1, 0.3330773417492892, 0, 0.4998080800068213, 3.412145420932667, 0.6669226582507108, 1, 0.1464791262824329],
[0.7422188014278586, 2.112127684536989, 0, 1, 0.2600310806965568, 0, 0.4734562248869038, 3.232243643876, 0.7399689193034432, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7955346434386297, 2.203486235913041, 0, 1, 0.265264789890562, 0, 0.4538262974833777, 3.098231870992561, 0.734735210109438, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 3.413455641699607, 0.6666666666666667, 1, 0.1464791262824329],
[0.7962893891708839, 2.203710610829116, 1, 0, 0.2654297963902947, 1.255824846594056, 0, -8.573404815186054, 1, 0.2654297963902947, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 3.413455641699607, 0.6666666666666667, 1, 0.1464791262824329],
[0.7398270905965738, 2.111729515097384, 0, 0, 0.2594467488806973, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 3.413455641699607, 0.6666666666666667, 1, 0.1464791262824329],
[0.7398270905965738, 2.111729515097384, 0, 0, 0.2594467488806973, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.000484787393249, 0, 1, 0.2845928568362254, 0, 0.4998788325219206, 3.412628442076327, 0.7154071431637745, 1, 0.1464791262824329],
[0.73976869782052, 2.111787907873437, 1, 0, 0.2594262713716985, 1.351773876004978, 0, -9.228440326702682, 1, 0.2594262713716985, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9997184537611382, 2.000281546238863, 1, 1, 0.3332394845870459, 1.00028162552947, 0.4999296233474251, -3.415858729367995, 0.8889514459121601, 0.5554304150862518, 0.1464791262824329],
[0.8709895718646118, 2.129010428135388, 0, 0, 0.2903298572882039, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7242989317002281, 1.350626599088373, 0, 0, 0.3490722538967214, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 1.999718207786195, 0, 1, 0.3333646465205826, 0, 0.5000704579807064, 3.413936652083099, 0.6666353534794174, 1, 0.1464791262824329],
[1, 1.739827090596575, 0, 0, 0.3649865363519194, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7398270905965738, 1.335098440192028, 0, 0, 0.356555972548756, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 1.925074469211399, 0, 0, 0.3418716379790496, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -6.826911283399214, 1, 0.3333333333333333, 0.1464791262824329],
[1.520102672467913, 1.275701068299772, 0, 0, 0.5437086481794735, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 3.413455641699607, 0.6666666666666667, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.129010428135388, 0, 0, 0.2720869411905728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9250744692113989, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3162567240419007, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 1.925074469211399, 0, 0, 0.3418716379790496, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9250744692113989, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3162567240419007, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7242989317002281, 1.350626599088373, 0, 0, 0.3490722538967214, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.129010428135388, 0, 0, 0.2720869411905728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 3.413455641699607, 0.6666666666666667, 1, 0.1464791262824329],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.8670847645903024, 2.132915235409698, 0, 0, 0.2890282548634341, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0.4999999999999998, -3.413455641699607, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9245882866730389, 2.075411713326962, 1, 0, 0.3081960955576795, 1.081562479661424, 0, -7.383731096101815, 1, 0.3081960955576795, 0.1464791262824329],
[0.9995150695658154, 2.000484930434186, 0, 1, 0.3331716898552716, 0, 0.4998787967790188, 3.412628198062708, 0.6668283101447283, 1, 0.1464791262824329],
[0.8714743076646549, 2.128525692335345, 0, 1, 0.2904914358882183, 0, 0.4698087524153089, 3.207342672903782, 0.7095085641117818, 1, 0.1464791262824329],
[0.7397687407298812, 2.111787864964076, 1, 0, 0.259426286419396, 1.351773797597024, 0, -9.228439791418536, 1, 0.2594262864193959, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 1.925074469211399, 0, 0, 0.3418716379790496, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9250744692113989, 2.074925530788602, 0, 0, 0.3083581564037995, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7962892463903876, 2.203710753609612, 1, 1, 0.2654297487967959, 1.255825071772653, 0.45378006090955, -5.475490134455364, 0.92954704845367, 0.4604065460472615, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 1.925074469211399, 0, 0, 0.3418716379790496, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.129010428135388, 0, 0, 0.2720869411905728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 3.413455641699607, 0.6666666666666667, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9231302659506153, 2.076869734049386, 2, 1, 0.307710088650205, 2.166541466323231, 0.4814938479796927, -11.50367059873448, 0.9708643168143296, 0.2257851296000104, 0.1464791262824329],
[0.2757010682997719, 2.72429893170023, 0, 0, 0.09190035609992392, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7962893891709243, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2847664452236888, 1.255824846593993, 0, -8.573404815185619, 1, 0.2847664452236888, 0.1464791262824329],
[0.9245882866730166, 2.075411713326984, 1, 0, 0.3081960955576721, 1.081562479661451, 0, -7.383731096101994, 1, 0.3081960955576721, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.129010428135388, 0, 0, 0.2720869411905728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999996, 6.826911283399214, 0.4444444444444445, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.12929351888812, 0, 1, 0.2720606086312926, 0, 0.4696393386488973, 3.206186100150303, 0.7279393913687074, 1, 0.1464791262824329],
[0.9250744692113989, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3162567240419007, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9250744692113989, 2.074925530788602, 0, 0, 0.3083581564037995, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.003273221425608242, 2.996726778574393, 0, 1, 0.00109107380853608, 0, 0.3336974218502901, 2.278122694470974, 0.9989089261914639, 1, 0.1464791262824329],
[0.7242989317002281, 2.015528158896346, 0, 0, 0.2643593583646617, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1.520102672467913, 1.275701068299772, 0, 0, 0.5437086481794735, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 1.999718207786215, 0, 1, 0.3333646465205803, 0, 0.5000704579807013, 3.413936652083064, 0.6666353534794197, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -6.826911283399214, 1, 0.3333333333333333, 0.1464791262824329],
[1, 1.739827090596575, 0, 0, 0.3649865363519194, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 3.413455641699607, 0.6666666666666667, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -6.826911283399214, 1, 0.3333333333333333, 0.1464791262824329],
[0.9245882866687344, 2.075411713331267, 1, 0, 0.3081960955562447, 1.08156247966646, 0, -7.383731096136191, 1, 0.3081960955562446, 0.1464791262824329],
[1.520102672467913, 1.275701068299772, 0, 0, 0.5437086481794735, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7242989317002281, 2.015528158896346, 0, 0, 0.2643593583646617, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9250744692113989, 2.074925530788602, 0, 1, 0.3083581564037995, 0, 0.4819450072600616, 3.290195808041632, 0.6916418435962005, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7962893891708938, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2847664452236809, 1.255824846594041, 0, -8.573404815185947, 1, 0.2847664452236809, 0.1464791262824329],
[1, 1.739827090596575, 0, 0, 0.3649865363519194, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999996, 6.826911283399214, 0.4444444444444445, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9245882866730518, 2.075411713326949, 1, 0, 0.3081960955576838, 1.081562479661409, 0, -7.383731096101712, 1, 0.3081960955576838, 0.1464791262824329],
[0.8670847645903024, 2.132915235409698, 0, 0, 0.2890282548634341, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7242989317002281, 1.350626599088373, 0, 0, 0.3490722538967214, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9972774712827047, 2.002722528717297, 0, 1, 0.3324258237609014, 0, 0.4993202930814784, 3.408815342868149, 0.6675741762390985, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999996, 6.826911283399214, 0.4444444444444445, 1, 0.1464791262824329],
[0.7243572762436421, 1.35056825454496, 1, 0, 0.3491003727581206, 1.380534209838797, 0, -9.424784574267109, 1, 0.3491003727581206, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999996, 6.826911283399214, 0.4444444444444445, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9962390361360209, 2.00376096386398, 1, 1, 0.3320796787120068, 1.003775162112264, 0.4990615238215022, -3.445635232132673, 0.8897230869865302, 0.5538824444105439, 0.1464791262824329],
[0.9250744692113989, 2.074925530788602, 0, 0, 0.3083581564037995, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9972759378911569, 2.002724062108844, 0, 1, 0.3324253126303855, 0, 0.4993199107754326, 3.408812732898692, 0.6675746873696145, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.8709895718646118, 2.129010428135388, 0, 0, 0.2903298572882039, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 3.413455641699607, 0.6666666666666667, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 3.413455641699607, 0.6666666666666667, 1, 0.1464791262824329],
[1.521623636172909, 1.274947010096557, 1, 0, 0.5441034140162722, 0.657192735593367, 0, -4.486596501990356, 1, 0.5441034140162722, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0, 1.520345818806854, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1.535630831364258, 1.389183337538815, 0, 0, 0.5250353501741218, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9250744692113989, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3162567240419007, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -6.826911283399214, 1, 0.3333333333333333, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.2757010682997719, 2.72429893170023, 0, 0, 0.09190035609992392, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 1.739827090596575, 0, 0, 0.3649865363519194, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9245882866730517, 2.075411713326949, 1, 0, 0.3081960955576838, 1.08156247966141, 0, -7.383731096101714, 1, 0.3081960955576838, 0.1464791262824329],
[0.8638262176214473, 2.136173782378553, 0, 1, 0.2879420725404824, 0, 0.4681267077842964, 3.195859503433141, 0.7120579274595176, 1, 0.1464791262824329],
[0, 1.520345818806854, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9991546189958436, 2.000845381004158, 0, 1, 0.3330515396652811, 0, 0.4997887440448464, 3.412013416035685, 0.6669484603347189, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1.074925530788602, 1, 0, 0, 0.5180549927399383, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.796570871799043, 2.203429128200956, 0, 1, 0.2655236239330144, 0, 0.4538380595959873, 3.098312169891853, 0.7344763760669857, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9972759378909593, 2.002724062109042, 0, 1, 0.3324253126303196, 0, 0.4993199107753832, 3.408812732898354, 0.6675746873696804, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9245885603482211, 2.07541143965178, 1, 0, 0.3081961867827402, 1.081562159522477, 0, -7.383728910541622, 1, 0.3081961867827403, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9250744692113989, 2.074925530788602, 0, 0, 0.3083581564037995, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9992320252478679, 2.000767974752133, 0, 1, 0.3330773417492892, 0, 0.4998080800068213, 3.412145420932667, 0.6669226582507108, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -6.826911283399214, 1, 0.3333333333333333, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999996, 6.826911283399214, 0.4444444444444445, 1, 0.1464791262824329],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7403052915989599, 2.111809125484496, 0, 1, 0.2595636721881546, 0, 0.4735276441096815, 3.232731216573834, 0.7404363278118453, 1, 0.1464791262824329],
[0.9250744692113989, 2.000563455757805, 0, 2, 0.3161958153865319, 0, 0.9997183514693404, 6.824988493867305, 0.46758816289489, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7962893891708839, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2847664452236784, 1.255824846594056, 0, -8.573404815186054, 1, 0.2847664452236784, 0.1464791262824329],
[0.7242989317002281, 2.015528158896346, 0, 0, 0.2643593583646617, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1.925074469211399, 1.074925530788602, 0, 0, 0.6416914897371327, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7242989317002281, 1.350626599088373, 0, 0, 0.3490722538967214, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9245885603482343, 2.075411439651767, 1, 0, 0.3081961867827446, 1.081562159522461, 0, -7.383728910541516, 1, 0.3081961867827446, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9238331087100076, 2.075187970809271, 1, 1, 0.3080448867195329, 1.082446591891849, 0.4818840577656322, -4.099987140613099, 0.9051083477659503, 0.5211981212050159, 0.1464791262824329],
[0.2779413642390005, 2.722058635761001, 1, 0, 0.09264712141300012, 3.597881167267009, 0, -24.56241553714469, 1, 0.09264712141300013, 0.1464791262824329],
[1.925074469211399, 1.074925530788602, 0, 0, 0.6416914897371327, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9994421970817635, 1.74080473738773, 0, 1, 0.3647270559852862, 0, 0.5744469661201697, 3.921698474720234, 0.6352729440147138, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9992320252478679, 2.000767974752133, 0, 1, 0.3330773417492892, 0, 0.4998080800068213, 3.412145420932667, 0.6669226582507108, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 3.413455641699607, 0.6666666666666667, 1, 0.1464791262824329],
[0.7242989317002281, 1.350626599088373, 0, 0, 0.3490722538967214, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -6.826911283399214, 1, 0.3333333333333333, 0.1464791262824329],
[1, 1.740804629699517, 1, 0, 0.3648563597579859, 0.9999999999999996, 0, -6.826911283399214, 1, 0.3648563597579859, 0.1464791262824329],
[0.87195891286198, 2.12804108713802, 1, 1, 0.2906529709539933, 1.146843028093787, 0.4699157389601389, -4.621322548227349, 0.9155208504756169, 0.4968267923836038, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0.4999999999999998, -3.413455641699607, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 3.413455641699607, 0.6666666666666667, 1, 0.1464791262824329],
[1.520102672467913, 1.275701068299772, 0, 0, 0.5437086481794735, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.007030683825896708, 2.992969316174104, 0, 2, 0.002343561275298902, 0, 0.668232710970986, 4.561965434464272, 0.9953183697288533, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.129010428135388, 0, 0, 0.2720869411905728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 3.413455641699607, 0.6666666666666667, 1, 0.1464791262824329],
[1, 1.925074469211399, 0, 0, 0.3418716379790496, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1.520102672467913, 1.275701068299772, 0, 0, 0.5437086481794735, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7242989317002281, 2.127257673993728, 0, 0, 0.2540012462856098, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7242989317002281, 2.015528158896346, 0, 0, 0.2643593583646617, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1.520102672467913, 1.275701068299772, 0, 0, 0.5437086481794735, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1.914640851895801, 1.085359148104201, 1, 0, 0.6382136172985999, 0.522291164429005, 0, -3.56563544366009, 1, 0.6382136172985999, 0.1464791262824329],
[0.7242989317002281, 1.350626599088373, 0, 0, 0.3490722538967214, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 1, 0.265267913589228, 0, 0.453680109387484, 3.097233857831206, 0.734732086410772, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.003757338124127442, 2.996242661875874, 0, 1, 0.001252446041375813, 0, 0.333751338876513, 2.278490781225663, 0.9987475539586241, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9994421970917757, 1.740804737370181, 0, 1, 0.3647270559899429, 0, 0.5744469661259605, 3.921698474759768, 0.6352729440100571, 1, 0.1464791262824329],
[0.9976963580015388, 2.00145543234538, 0, 1, 0.3326595076690443, 0, 0.4996364065065204, 3.410973421176402, 0.6673404923309557, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.2746651661650704, 2.725334833834931, 0, 1, 0.09155505538835675, 0, 0.3669273909337806, 2.504980745354063, 0.9084449446116433, 1, 0.1464791262824329],
[1.535630831364258, 1.389183337538815, 0, 0, 0.5250353501741218, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1.520161017011332, 1.276127459556397, 1, 0, 0.5436352614367012, 0.6578250519579962, 0, -4.490913269714721, 1, 0.5436352614367012, 0.1464791262824329],
[1.520102672467913, 1.275701068299772, 0, 0, 0.5437086481794735, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7242989317002281, 2.015528158896346, 0, 0, 0.2643593583646617, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.7962893891708839, 2.203710610829116, 1, 0, 0.2654297963902947, 1.255824846594056, 0, -8.573404815186054, 1, 0.2654297963902947, 0.1464791262824329],
[0.7242989317002281, 2.015528158896346, 0, 0, 0.2643593583646617, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.795803740767684, 2.204196259232316, 0, 0, 0.265267913589228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.8516149502373704, 2.000499407481245, 1, 0, 0.2985907447689337, 1.174239601736994, 0, -8.016429586512489, 1, 0.2985907447689337, 0.1464791262824329],
[0.7242989317002281, 1.350626599088373, 0, 0, 0.3490722538967214, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9245882866687345, 2.000485203562603, 1, 0, 0.3160906178106352, 1.08156247966646, 0, -7.383731096136191, 1, 0.3160906178106352, 0.1464791262824329],
[1.001954986262853, 1.922633574085404, 0, 1, 0.3425969040046923, 0, 0.5201199092113533, 3.550812476915564, 0.6574030959953077, 1, 0.1464791262824329],
[0.9992326204671808, 2.000484827500972, 1, 1, 0.33310891368919, 1.000767968856402, 0.4998788224998492, -3.419525764993749, 0.8890384516208076, 0.5552562789991878, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329],
[0.9245882866687344, 2.075411713331267, 1, 0, 0.3081960955562447, 1.08156247966646, 0, -7.383731096136191, 1, 0.3081960955562446, 0.1464791262824329],
[0.7242989317002281, 1.350626599088373, 0, 0, 0.3490722538967214, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1464791262824329]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node142":{
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node20":{
"Global MG94xREV":0.001101420946644645,
"Nucleotide GTR":0.001090317918592786,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "C", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "TGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node228":{
"Global MG94xREV":0.001101131740783919,
"Nucleotide GTR":0.001090031628112229,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "I", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "ATC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node257":{
"Global MG94xREV":0.001101646304146874,
"Nucleotide GTR":0.001090541004347165,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "F", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "TTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node27":{
"Global MG94xREV":0.001101450137708649,
"Nucleotide GTR":0.001090346815392184,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node30":{
"Global MG94xREV":0.001101448459784259,
"Nucleotide GTR":0.001090345154382345,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGT", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node33":{
"Global MG94xREV":0.001101534618081144,
"Nucleotide GTR":0.001090430444148456,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTT", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node93":{
"Global MG94xREV":0.001100993471816411,
"Nucleotide GTR":0.001089894752984406,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "R", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AGG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node94":{
"Global MG94xREV":0.001100961817850605,
"Nucleotide GTR":0.001089863418110834,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "R", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AGG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414624_Normandie_20200226_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001101805401630989,
"Nucleotide GTR":0.001090698498026817,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "I", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ATA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414624_Normandie_20200226_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415454_Switzerland_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110180541136514,
"Nucleotide GTR":0.001090698507662841,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCT", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415454_Switzerland_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100951446584168,
"Nucleotide GTR":0.001089853151393399,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "I", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATT", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416720_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100594924210706,
"Nucleotide GTR":0.001089500222993635,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "H", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "CAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416720_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001102512781089531,
"Nucleotide GTR":0.001091398746647694,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "F", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TTC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103050548588917,
"Nucleotide GTR":0.001091931093106515,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "S", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "AGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417778_Reykjavik_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100951436207827,
"Nucleotide GTR":0.001089853141121658,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "V", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GTT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417778_Reykjavik_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418021_Portugal_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110305054858036,
"Nucleotide GTR":0.001091931093098043,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACA", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418021_Portugal_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418082_Washington_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001101805401550256,
"Nucleotide GTR":0.001090698497946899,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "V", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GTT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418082_Washington_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418366_Ontario_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100743211050562,
"Nucleotide GTR":0.001089647015007243,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAG", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418366_Ontario_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418844_British_Columbia_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001101805411335228,
"Nucleotide GTR":0.001090698507633231,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418844_British_Columbia_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100743220793948,
"Nucleotide GTR":0.001089647024652409,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "D", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "GAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419756_Victoria_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001101805401551045,
"Nucleotide GTR":0.001090698497947679,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "L", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CTT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419756_Victoria_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00110084364148207,
"Nucleotide GTR":0.001089746433035724,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "H", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CAC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420195_South_Yorkshire_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001100743211139726,
"Nucleotide GTR":0.001089647015095506,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "V", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "GTT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420195_South_Yorkshire_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420241_South_Yorkshire_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00110180540158017,
"Nucleotide GTR":0.00109069849797651,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "L", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CTT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420241_South_Yorkshire_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420422_Tielt_Winge_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100843641396438,
"Nucleotide GTR":0.001089746432950956,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "D", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GAT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420422_Tielt_Winge_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420510_England_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001100743220793948,
"Nucleotide GTR":0.001089647024652409,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "D", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "GAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420510_England_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420520_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001101504799194593,
"Nucleotide GTR":0.001090400925855364,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "A", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "R", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GCT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AGG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420520_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420610_ARA_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001100743211081179,
"Nucleotide GTR":0.001089647015037552,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "D", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "GAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420610_ARA_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421316_Wisconsin_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001101185188449848,
"Nucleotide GTR":0.001090084536991478,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "I", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ATC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421316_Wisconsin_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421432_New_York_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110180540158017,
"Nucleotide GTR":0.00109069849797651,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "F", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "TTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421432_New_York_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421506_Ile_de_France_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001101805401551045,
"Nucleotide GTR":0.001090698497947679,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "F", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "TTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421506_Ile_de_France_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421513_Ile_de_France_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100594924119074,
"Nucleotide GTR":0.001089500222902928,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAC", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421513_Ile_de_France_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421515_Comunitat_Valenciana_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001101805401551045,
"Nucleotide GTR":0.001090698497947679,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "I", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ATA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421515_Comunitat_Valenciana_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421670_India_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100271359173733,
"Nucleotide GTR":0.001089179919699316,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "CTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421670_India_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421692_Minnesota_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001101653180481932,
"Nucleotide GTR":0.001090547811364364,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAA", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421692_Minnesota_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421763_Luxembourg_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110084364139934,
"Nucleotide GTR":0.00108974643295383,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "T", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "ACT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421763_Luxembourg_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421871_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "I", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "ATC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421871_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421918_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001100743211139726,
"Nucleotide GTR":0.001089647015095506,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTG", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421918_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421984_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001101805401551045,
"Nucleotide GTR":0.001090698497947679,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "F", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TTT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421984_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422266_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001102530378224416,
"Nucleotide GTR":0.001091416166392196,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGT", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422266_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422504_New_York_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100594924119074,
"Nucleotide GTR":0.001089500222902928,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATC", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422504_New_York_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422661_Netherlands_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001101805401631779,
"Nucleotide GTR":0.001090698498027597,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGT", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422661_Netherlands_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422800_Netherlands_20200314_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001101805411335228,
"Nucleotide GTR":0.001090698507633231,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTT", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422800_Netherlands_20200314_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422860_Noord_Brabant_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001101805411335228,
"Nucleotide GTR":0.001090698507633231,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "V", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GTT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422860_Noord_Brabant_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422914_Zuid_Holland_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100594924210706,
"Nucleotide GTR":0.001089500222993635,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAC", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422914_Zuid_Holland_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422919_Zuid_Holland_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100594924119074,
"Nucleotide GTR":0.001089500222902928,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "T", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ACT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422919_Zuid_Holland_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422923_Zuid_Holland_20200323_null_10":{
"Global MG94xREV":0.001100594924233296,
"Nucleotide GTR":0.001089500223015998,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACC", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422923_Zuid_Holland_20200323_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423084_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001100722392920349,
"Nucleotide GTR":0.001089626406737106,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGC", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423084_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423089_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100594924233296,
"Nucleotide GTR":0.001089500223015998,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCC", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423089_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423288_England_20200326_null_5":{
"Global MG94xREV":0.00110180540158017,
"Nucleotide GTR":0.00109069849797651,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "S", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "TCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423288_England_20200326_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423389_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001101983833363036,
"Nucleotide GTR":0.001090875131052807,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAT", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423389_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423428_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100951446595193,
"Nucleotide GTR":0.001089853151404313,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "M", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "ATG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423428_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423505_England_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "R", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AGG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423505_England_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423509_England_20200331_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001101805401550256,
"Nucleotide GTR":0.001090698497946899,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "C", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "TGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423509_England_20200331_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423704_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100743211139726,
"Nucleotide GTR":0.001089647015095506,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "V", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "GTG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423704_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423766_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100594924119074,
"Nucleotide GTR":0.001089500222902928,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAC", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423766_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423772_England_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001100951446584168,
"Nucleotide GTR":0.001089853151393399,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "I", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATT", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423772_England_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423958_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001101226693408461,
"Nucleotide GTR":0.001090125623553544,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAT", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423958_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424003_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100843631560914,
"Nucleotide GTR":0.001089746423214582,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "R", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "AGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424003_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424129_England_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001100743211050562,
"Nucleotide GTR":0.001089647015007243,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "A", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "GCA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424129_England_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424164_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100951446584168,
"Nucleotide GTR":0.001089853151393399,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "C", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "TGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424164_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424275_Washington_20200322_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001101805411335228,
"Nucleotide GTR":0.001090698507633231,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "V", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GTT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424275_Washington_20200322_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424297_Washington_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100860379230396,
"Nucleotide GTR":0.001089763002056835,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "V", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "GTG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424297_Washington_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424470_Reykjavik_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001101805401551045,
"Nucleotide GTR":0.001090698497947679,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "M", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ATG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424470_Reykjavik_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424552_Reykjavik_20200328_null_15":{
"Global MG94xREV":0.001101805401550256,
"Nucleotide GTR":0.001090698497946899,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCT", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424552_Reykjavik_20200328_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001101185188419856,
"Nucleotide GTR":0.001090084536961788,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "I", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ATA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425132_Duesseldorf_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100860369539517,
"Nucleotide GTR":0.001089762992463649,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "C", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TGT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425132_Duesseldorf_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425191_Comunitat_Valenciana_20200316_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001100951446659083,
"Nucleotide GTR":0.00108985315146756,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTT", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425191_Comunitat_Valenciana_20200316_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425196_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001101556356396341,
"Nucleotide GTR":0.001090451963327523,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACA", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425196_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425242_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001103181495677119,
"Nucleotide GTR":0.001092060720164261,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "E", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425242_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425319_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001101185188340625,
"Nucleotide GTR":0.001090084536883357,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "V", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GTA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425319_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425342_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110090324489448,
"Nucleotide GTR":0.001089805435607593,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "L", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "TTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425342_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425498_England_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001100271359142901,
"Nucleotide GTR":0.001089179919668797,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "A", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GCT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425498_England_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425564_England_20200325_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001101185188419856,
"Nucleotide GTR":0.001090084536961788,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAT", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425564_England_20200325_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425655_Scotland_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001101185188419856,
"Nucleotide GTR":0.001090084536961788,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "I", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ATT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425655_Scotland_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425777_Scotland_20200313_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001101185188449848,
"Nucleotide GTR":0.001090084536991478,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAT", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425777_Scotland_20200313_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425839_Scotland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100903244933634,
"Nucleotide GTR":0.001089805435646352,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "I", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATT", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425839_Scotland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425878_Scotland_20200321_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001100271349515741,
"Nucleotide GTR":0.001089179910138684,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAC", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425878_Scotland_20200321_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425904_Scotland_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001101323629818655,
"Nucleotide GTR":0.001090221582782685,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTT", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425904_Scotland_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425982_Scotland_20200329_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001102277843185,
"Nucleotide GTR":0.0010911661770676,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "E", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAA", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425982_Scotland_20200329_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426028_New_York_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001101037888053749,
"Nucleotide GTR":0.001089938721477645,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "L", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "CTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426028_New_York_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426475_Virginia_20200404_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001101893479511483,
"Nucleotide GTR":0.001090785688025905,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "V", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "F", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GTA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "TTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426475_Virginia_20200404_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001100743220793948,
"Nucleotide GTR":0.001089647024652409,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "R", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AGG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426534_Arizona_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001101805411335228,
"Nucleotide GTR":0.001090698507633231,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGT", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426534_Arizona_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426621_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100903244962873,
"Nucleotide GTR":0.001089805435675296,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "H", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAT", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426621_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426964_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100594924141666,
"Nucleotide GTR":0.001089500222925291,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAC", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426964_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426989_Victoria_20200328_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001101795152739478,
"Nucleotide GTR":0.001090688352450691,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "T", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "C", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "ACA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "TGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426989_Victoria_20200328_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427020_Victoria_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00110180540158017,
"Nucleotide GTR":0.00109069849797651,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTT", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427020_Victoria_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427025_Victoria_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001101185188370619,
"Nucleotide GTR":0.001090084536913048,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "L", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TTA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427025_Victoria_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427051_Victoria_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001101653180481932,
"Nucleotide GTR":0.001090547811364364,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "I", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "ATA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427051_Victoria_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427096_Victoria_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001101805401551045,
"Nucleotide GTR":0.001090698497947679,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "V", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GTT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427096_Victoria_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427132_Victoria_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100594924119074,
"Nucleotide GTR":0.001089500222902928,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "A", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GCT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427132_Victoria_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427149_Victoria_20200408_null_15":{
"Global MG94xREV":0.001101185188420029,
"Nucleotide GTR":0.00109008453696196,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAT", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427149_Victoria_20200408_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427164_Connecticut_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100743211139726,
"Nucleotide GTR":0.001089647015095506,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "S", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AGT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427164_Connecticut_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427184_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100858724046138,
"Nucleotide GTR":0.001089761363557894,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "I", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATT", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427184_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427212_Washington_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001100860369651769,
"Nucleotide GTR":0.001089762992574768,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "R", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AGG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427212_Washington_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427259_Washington_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001101185188340625,
"Nucleotide GTR":0.001090084536883357,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAT", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427259_Washington_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427274_Minnesota_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001101185188449848,
"Nucleotide GTR":0.001090084536991478,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "V", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GTT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427274_Minnesota_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427453_Wisconsin_20200406_null_20":{
"Global MG94xREV":0.001102056125858369,
"Nucleotide GTR":0.001090946694793521,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427453_Wisconsin_20200406_null_20",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427482_New_York_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001101805401551045,
"Nucleotide GTR":0.001090698497947679,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "L", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CTT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427482_New_York_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427632_New_York_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001101805411335228,
"Nucleotide GTR":0.001090698507633231,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "V", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GTC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427632_New_York_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427779_New_South_Wales_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001101805401551045,
"Nucleotide GTR":0.001090698497947679,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "V", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GTC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427779_New_South_Wales_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427799_New_South_Wales_20200317_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001101805411335228,
"Nucleotide GTR":0.001090698507633231,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAT", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427799_New_South_Wales_20200317_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428258_Wisconsin_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001102102795942663,
"Nucleotide GTR":0.001090992894413496,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "V", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GTA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428258_Wisconsin_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428299_Wisconsin_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001101805401630989,
"Nucleotide GTR":0.001090698498026817,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAT", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428299_Wisconsin_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428333_Wisconsin_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001101339169394138,
"Nucleotide GTR":0.001090236965709302,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "L", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "CTG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428333_Wisconsin_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428335_Wisconsin_20200327_null_11":{
"Global MG94xREV":0.001101805401551045,
"Nucleotide GTR":0.001090698497947679,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "F", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "TTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428335_Wisconsin_20200327_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428354_Ile_De_France_20200325_null_17":{
"Global MG94xREV":0.001100743211056301,
"Nucleotide GTR":0.001089647015012923,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGG", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428354_Ile_De_France_20200325_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428360_Hauts_De_France_20200325_null_21":{
"Global MG94xREV":0.001101805411335228,
"Nucleotide GTR":0.001090698507633231,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAT", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428360_Hauts_De_France_20200325_null_21",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428362_Ile_De_France_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100743211050562,
"Nucleotide GTR":0.001089647015007243,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "M", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATG", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428362_Ile_De_France_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428365_Ile_De_France_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "C", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "TGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428365_Ile_De_France_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428387_Connecticut_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001101971858088176,
"Nucleotide GTR":0.001090863276496383,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "L", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CTA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428387_Connecticut_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428732_Wisconsin_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100843651320469,
"Nucleotide GTR":0.001089746442774948,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "R", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "AGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428732_Wisconsin_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428777_New_York_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00110084364136863,
"Nucleotide GTR":0.00108974643292343,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "T", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "ACT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428777_New_York_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428779_New_York_20200406_null_116":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "R", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AGG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428779_New_York_20200406_null_116",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428787_New_York_20200406_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001101805401630989,
"Nucleotide GTR":0.001090698498026817,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "S", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "TCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428787_New_York_20200406_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428789_New_York_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001101805401551045,
"Nucleotide GTR":0.001090698497947679,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "S", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "TCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428789_New_York_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428852_Moscow_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001101805411335228,
"Nucleotide GTR":0.001090698507633231,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTT", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428852_Moscow_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
]
},
"epi_isl_428864_Moscow_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001101805401551045,
"Nucleotide GTR":0.001090698497947679,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "S", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "TCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428864_Moscow_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428902_Orenburg_Region_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001101805401551045,
"Nucleotide GTR":0.001090698497947679,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "L", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CTC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428902_Orenburg_Region_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429007_California_20200318_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001101805411335228,
"Nucleotide GTR":0.001090698507633231,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "V", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GTA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429007_California_20200318_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429026_California_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001100594924141666,
"Nucleotide GTR":0.001089500222925291,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGC", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429026_California_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429159_Ostergotland_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100594924119074,
"Nucleotide GTR":0.001089500222902928,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "S", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TCT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429159_Ostergotland_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429273_Unknown_20200310_null_125":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429273_Unknown_20200310_null_125",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429309_Unknown_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":0.00110084364139934,
"Nucleotide GTR":0.00108974643295383,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAA", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429309_Unknown_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429315_Unknown_20200318_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGT", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429315_Unknown_20200318_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429484_Unknown_20200324_null_13":{
"Global MG94xREV":0.001100843641396438,
"Nucleotide GTR":0.001089746432950956,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "S", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "AGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429484_Unknown_20200324_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429518_Unknown_20200311_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTT", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429518_Unknown_20200311_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429585_Unknown_20200326_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001101805401551045,
"Nucleotide GTR":0.001090698497947679,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAT", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429585_Unknown_20200326_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429638_Washington_20200407_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001100743211081179,
"Nucleotide GTR":0.001089647015037552,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACG", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429638_Washington_20200407_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429663_Istria_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110084364136863,
"Nucleotide GTR":0.00108974643292343,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "I", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "ATT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429663_Istria_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429699_Minas_gerais_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001102503234646175,
"Nucleotide GTR":0.001091389296438597,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "E", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAA", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429699_Minas_gerais_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429705_Istria_20200301_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001101805401630989,
"Nucleotide GTR":0.001090698498026817,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTT", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429705_Istria_20200301_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429781_Luxembourg_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001101971858036829,
"Nucleotide GTR":0.001090863276445553,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTT", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429781_Luxembourg_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429791_Luxembourg_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001102512781036929,
"Nucleotide GTR":0.001091398746595621,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATT", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429791_Luxembourg_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429815_NL_20200315_null_20":{
"Global MG94xREV":0.001100594924119074,
"Nucleotide GTR":0.001089500222902928,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAC", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429815_NL_20200315_null_20",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429868_Eskisehir_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001101805401551045,
"Nucleotide GTR":0.001090698497947679,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAT", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429868_Eskisehir_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429987_Virginia_20200402_null_21":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "F", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "TTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429987_Virginia_20200402_null_21",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429992_Amman_20200322_null_58":{
"Global MG94xREV":0.00110180540158017,
"Nucleotide GTR":0.00109069849797651,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "V", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GTT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429992_Amman_20200322_null_58",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430051_Utah_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001102149920886277,
"Nucleotide GTR":0.001091039544307519,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "K", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "AAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430051_Utah_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430264_Washington_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100858734477117,
"Nucleotide GTR":0.001089761373883722,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTT", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430264_Washington_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430297_GP_20200306_null_11083":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430297_GP_20200306_null_11083",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":4863.828568360967,
"Equilibrium frequencies": [
[0.02588853844387181],
[0.0116307307035211],
[0.01087199866331446],
[0.04086947591128656],
[0.01716381750476707],
[0.007711047098125468],
[0.007208016063702238],
[0.02709601500206922],
[0.01529008059901862],
[0.00686924873213205],
[0.006421132509852087],
[0.02413800153600961],
[0.02418503268374536],
[0.01086541068397331],
[0.01015660438228168],
[0.03818020135918429],
[0.01603654083456743],
[0.007204604781658678],
[0.006734611569347819],
[0.02531641640410414],
[0.01063205097070343],
[0.004776574078697499],
[0.004464973725434127],
[0.01678450685722637],
[0.009471372917463085],
[0.004255125797636999],
[0.003977542182292898],
[0.01495217847605836],
[0.01498131171286878],
[0.006730530674632551],
[0.006291463740609967],
[0.02365055715663628],
[0.02852179622193195],
[0.01281375276388078],
[0.01197784614502153],
[0.04502652268941829],
[0.01890963857703898],
[0.008495377769868489],
[0.007941180834872214],
[0.02985209149566219],
[0.01684531415350547],
[0.00756795571756244],
[0.007074259265624015],
[0.02659320310829345],
[0.02664501803846848],
[0.01197058806806636],
[0.01118968539403164],
[0.04206370804747991],
[0.01129113637981882],
[0.03967616807999456],
[0.01666266799436562],
[0.007485899780121486],
[0.006997556256594239],
[0.02630486497682886],
[0.006668680260812796],
[0.006233648145569989],
[0.02343321965118236],
[0.02347887758246117],
[0.01054816219056142],
[0.009860051630418172],
[0.03706541502375105]
],
"Log Likelihood":-2274.306978691574,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.7534322209012975, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":157
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":5210.127331441373,
"Equilibrium frequencies": [
[0.2810376223457874],
[0.1772022241732514],
[0.2035980229571099],
[0.3381621305238513]
],
"Log Likelihood":-2331.454221212873,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.2018694148288453,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.1233933108305102,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":2.071366187121512,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.2922613156646506
},
"display order":0,
"estimated parameters":273
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-04-26/sequences.3C.compressed.fas",
"number of sequences":134,
"number of sites":306,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_427164_Connecticut_20200331_null_1,epi_isl_427482_New_York_20200401_null_2,epi_isl_428335_Wisconsin_20200327_null_11,epi_isl_429007_California_20200318_null_4,epi_isl_424129_England_20200320_null_2,epi_isl_427184_Washington_20200325_null_1,(epi_isl_426475_Virginia_20200404_null_2,epi_isl_429987_Virginia_20200402_null_21)Node257,epi_isl_428258_Wisconsin_20200329_null_2,epi_isl_427779_New_South_Wales_20200324_null_3,epi_isl_420510_England_20200323_null_2,epi_isl_422919_Zuid_Holland_20200319_null_1,epi_isl_418021_Portugal_20200316_null_1,epi_isl_421316_Wisconsin_20200323_null_2,epi_isl_427132_Victoria_20200405_null_1,epi_isl_421984_England_20200401_null_1,epi_isl_421763_Luxembourg_20200317_null_1,epi_isl_423958_England_20200319_null_1,epi_isl_425982_Scotland_20200329_null_3,epi_isl_428299_Wisconsin_20200325_null_1,epi_isl_422504_New_York_20200319_null_1,(epi_isl_421871_England_20200327_null_2,epi_isl_426028_New_York_20200304_null_2)Node228,epi_isl_422860_Noord_Brabant_20200320_null_1,epi_isl_427096_Victoria_20200403_null_2,epi_isl_421515_Comunitat_Valenciana_20200307_null_1,epi_isl_424275_Washington_20200322_null_4,epi_isl_425196_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1,epi_isl_425342_England_20200318_null_1,epi_isl_428354_Ile_De_France_20200325_null_17,epi_isl_428789_New_York_20200406_null_1,epi_isl_420610_ARA_20200323_null_2,epi_isl_424164_England_20200322_null_1,epi_isl_427025_Victoria_20200331_null_3,epi_isl_426534_Arizona_20200327_null_1,epi_isl_421513_Ile_de_France_20200323_null_1,epi_isl_418366_Ontario_20200305_null_1,epi_isl_425498_England_20200319_null_2,epi_isl_429781_Luxembourg_20200323_null_1,epi_isl_427020_Victoria_20200329_null_2,epi_isl_428787_New_York_20200406_null_7,epi_isl_421918_England_20200327_null_2,epi_isl_425132_Duesseldorf_20200323_null_1,epi_isl_429791_Luxembourg_20200328_null_2,epi_isl_428362_Ile_De_France_20200325_null_1,epi_isl_419756_Victoria_20200311_null_1,epi_isl_423089_England_20200323_null_1,epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1,epi_isl_424297_Washington_20200323_null_1,epi_isl_428777_New_York_20200406_null_2,epi_isl_421506_Ile_de_France_20200321_null_1,epi_isl_424003_England_20200320_null_1,epi_isl_425564_England_20200325_null_3,epi_isl_429699_Minas_gerais_20200320_null_1,epi_isl_428852_Moscow_20200402_null_2,epi_isl_420241_South_Yorkshire_20200326_null_2,epi_isl_422800_Netherlands_20200314_null_3,epi_isl_425655_Scotland_20200310_null_1,epi_isl_428333_Wisconsin_20200327_null_2,epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_6,epi_isl_429309_Unknown_20200318_null_3,epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1,epi_isl_425191_Comunitat_Valenciana_20200316_null_3,epi_isl_427149_Victoria_20200408_null_15,epi_isl_428902_Orenburg_Region_20200323_null_3,epi_isl_424552_Reykjavik_20200328_null_15,epi_isl_414624_Normandie_20200226_null_1,epi_isl_423772_England_20200322_null_2,epi_isl_427259_Washington_20200331_null_1,epi_isl_429585_Unknown_20200326_null_7,epi_isl_427632_New_York_20200406_null_2,epi_isl_429992_Amman_20200322_null_58,epi_isl_423704_England_20200323_null_1,epi_isl_417778_Reykjavik_20200310_null_1,epi_isl_421692_Minnesota_20200317_null_1,epi_isl_428360_Hauts_De_France_20200325_null_21,(epi_isl_426989_Victoria_20200328_null_3,epi_isl_428365_Ile_De_France_20200326_null_2)Node20,epi_isl_430297_GP_20200306_null_11083,epi_isl_423389_England_20200330_null_1,(epi_isl_425904_Scotland_20200322_null_1,epi_isl_429518_Unknown_20200311_null_12)Node33,(epi_isl_425242_England_20200331_null_1,epi_isl_429273_Unknown_20200310_null_125)Node27,(epi_isl_422266_Wales_20200325_null_1,epi_isl_429315_Unknown_20200318_null_4)Node30,epi_isl_429815_NL_20200315_null_20,epi_isl_418082_Washington_20200315_null_1,epi_isl_423288_England_20200326_null_5,epi_isl_425777_Scotland_20200313_null_8,epi_isl_426621_New_York_20200401_null_1,epi_isl_428864_Moscow_20200311_null_2,epi_isl_429026_California_20200331_null_2,epi_isl_422661_Netherlands_20200310_null_1,epi_isl_423084_England_20200324_null_2,epi_isl_427212_Washington_20200327_null_3,epi_isl_429705_Istria_20200301_null_4,epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_2,epi_isl_422914_Zuid_Holland_20200319_null_1,epi_isl_425878_Scotland_20200321_null_5,epi_isl_428387_Connecticut_20200331_null_1,epi_isl_428732_Wisconsin_20200406_null_1,epi_isl_420195_South_Yorkshire_20200328_null_2,epi_isl_423509_England_20200331_null_5,epi_isl_425839_Scotland_20200313_null_1,epi_isl_427274_Minnesota_20200320_null_2,epi_isl_426964_Victoria_20200327_null_1,epi_isl_424470_Reykjavik_20200320_null_2,epi_isl_418844_British_Columbia_20200312_null_1,epi_isl_425319_England_20200328_null_1,epi_isl_430051_Utah_20200402_null_1,epi_isl_429663_Istria_20200301_null_1,epi_isl_416720_Washington_20200313_null_1,epi_isl_423766_England_20200323_null_1,epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1,epi_isl_421670_India_20200312_null_1,epi_isl_429638_Washington_20200407_null_4,epi_isl_420422_Tielt_Winge_20200325_null_1,epi_isl_422923_Zuid_Holland_20200323_null_10,epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1,epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_2,epi_isl_429868_Eskisehir_20200317_null_2,epi_isl_429159_Ostergotland_20200310_null_1,epi_isl_415454_Switzerland_20200228_null_1,epi_isl_423428_England_20200330_null_1,epi_isl_427051_Victoria_20200330_null_3,epi_isl_427799_New_South_Wales_20200317_null_8,epi_isl_429484_Unknown_20200324_null_13,epi_isl_421432_New_York_20200317_null_1,epi_isl_430264_Washington_20200321_null_1,((epi_isl_420520_England_20200324_null_1,epi_isl_423505_England_20200330_null_2)Node94,epi_isl_428779_New_York_20200406_null_116)Node93,epi_isl_427453_Wisconsin_20200406_null_20)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node20":"test",
"Node228":"test",
"Node257":"test",
"Node27":"test",
"Node30":"test",
"Node33":"test",
"Node93":"test",
"Node94":"test",
"epi_isl_414624_Normandie_20200226_null_1":"test",
"epi_isl_415454_Switzerland_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1":"test",
"epi_isl_416720_Washington_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1":"test",
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417778_Reykjavik_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_418021_Portugal_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418082_Washington_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418366_Ontario_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_418844_British_Columbia_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419756_Victoria_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_420195_South_Yorkshire_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_420241_South_Yorkshire_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_420422_Tielt_Winge_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_420510_England_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_420520_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420610_ARA_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_421316_Wisconsin_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_421432_New_York_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_421506_Ile_de_France_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_421513_Ile_de_France_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_421515_Comunitat_Valenciana_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_421670_India_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_421692_Minnesota_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_421763_Luxembourg_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_421871_England_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_421918_England_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_421984_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_422266_Wales_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422504_New_York_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_422661_Netherlands_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_422800_Netherlands_20200314_null_3":"test",
"epi_isl_422860_Noord_Brabant_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_422914_Zuid_Holland_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_422919_Zuid_Holland_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_422923_Zuid_Holland_20200323_null_10":"test",
"epi_isl_423084_England_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_423089_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423288_England_20200326_null_5":"test",
"epi_isl_423389_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423428_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423505_England_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_423509_England_20200331_null_5":"test",
"epi_isl_423704_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423766_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423772_England_20200322_null_2":"test",
"epi_isl_423958_England_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_424003_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424129_England_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_424164_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_424275_Washington_20200322_null_4":"test",
"epi_isl_424297_Washington_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_424470_Reykjavik_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_424552_Reykjavik_20200328_null_15":"test",
"epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_425132_Duesseldorf_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_425191_Comunitat_Valenciana_20200316_null_3":"test",
"epi_isl_425196_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_425242_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_425319_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_425342_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_425498_England_20200319_null_2":"test",
"epi_isl_425564_England_20200325_null_3":"test",
"epi_isl_425655_Scotland_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_425777_Scotland_20200313_null_8":"test",
"epi_isl_425839_Scotland_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_425878_Scotland_20200321_null_5":"test",
"epi_isl_425904_Scotland_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_425982_Scotland_20200329_null_3":"test",
"epi_isl_426028_New_York_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_426475_Virginia_20200404_null_2":"test",
"epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_6":"test",
"epi_isl_426534_Arizona_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_426621_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_426964_Victoria_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_426989_Victoria_20200328_null_3":"test",
"epi_isl_427020_Victoria_20200329_null_2":"test",
"epi_isl_427025_Victoria_20200331_null_3":"test",
"epi_isl_427051_Victoria_20200330_null_3":"test",
"epi_isl_427096_Victoria_20200403_null_2":"test",
"epi_isl_427132_Victoria_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_427149_Victoria_20200408_null_15":"test",
"epi_isl_427164_Connecticut_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_427184_Washington_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_427212_Washington_20200327_null_3":"test",
"epi_isl_427259_Washington_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_427274_Minnesota_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_427453_Wisconsin_20200406_null_20":"test",
"epi_isl_427482_New_York_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_427632_New_York_20200406_null_2":"test",
"epi_isl_427779_New_South_Wales_20200324_null_3":"test",
"epi_isl_427799_New_South_Wales_20200317_null_8":"test",
"epi_isl_428258_Wisconsin_20200329_null_2":"test",
"epi_isl_428299_Wisconsin_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_428333_Wisconsin_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_428335_Wisconsin_20200327_null_11":"test",
"epi_isl_428354_Ile_De_France_20200325_null_17":"test",
"epi_isl_428360_Hauts_De_France_20200325_null_21":"test",
"epi_isl_428362_Ile_De_France_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_428365_Ile_De_France_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_428387_Connecticut_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_428732_Wisconsin_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_428777_New_York_20200406_null_2":"test",
"epi_isl_428779_New_York_20200406_null_116":"test",
"epi_isl_428787_New_York_20200406_null_7":"test",
"epi_isl_428789_New_York_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_428852_Moscow_20200402_null_2":"test",
"epi_isl_428864_Moscow_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_428902_Orenburg_Region_20200323_null_3":"test",
"epi_isl_429007_California_20200318_null_4":"test",
"epi_isl_429026_California_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_429159_Ostergotland_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_429273_Unknown_20200310_null_125":"test",
"epi_isl_429309_Unknown_20200318_null_3":"test",
"epi_isl_429315_Unknown_20200318_null_4":"test",
"epi_isl_429484_Unknown_20200324_null_13":"test",
"epi_isl_429518_Unknown_20200311_null_12":"test",
"epi_isl_429585_Unknown_20200326_null_7":"test",
"epi_isl_429638_Washington_20200407_null_4":"test",
"epi_isl_429663_Istria_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_429699_Minas_gerais_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_429705_Istria_20200301_null_4":"test",
"epi_isl_429781_Luxembourg_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_429791_Luxembourg_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_429815_NL_20200315_null_20":"test",
"epi_isl_429868_Eskisehir_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_429987_Virginia_20200402_null_21":"test",
"epi_isl_429992_Amman_20200322_null_58":"test",
"epi_isl_430051_Utah_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_430264_Washington_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_430297_GP_20200306_null_11083":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":5
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":3
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":8
}
}
}