{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001100433579003676],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001100433579003676],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001100433579003676],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001100433579018043],
[276.2940305359269, 612.1030285328388, 1, 0, 0.3110028648964051, 0.003619332629301843, 0, -0.02510663323062667, 1, 0.3110028648964051, 0.001100433579003676],
[276.2940305359269, 612.1030285328389, 1, 0, 0.3110028648964049, 0.003619332629301843, 0, -0.02510663323062667, 1, 0.3110028648964049, 0.001100433579003676],
[276.2620265086225, 612.1350325601433, 0, 1, 0.3109668404330441, 0, 0.001633626482408109, 0.01133216123812605, 0.6890331595669559, 1, 0.00110043357985114],
[276.3688623632094, 612.1024311583484, 1, 0, 0.311061105044587, 0.003618352630065034, 0, -0.02509983515929008, 1, 0.3110611050445871, 0.001100429385043028],
[276.2940305359269, 612.1030285328389, 1, 0, 0.3110028648964049, 0.003619332629301843, 0, -0.02510663323062667, 1, 0.3110028648964049, 0.001100433579018817],
[276.2336522306181, 612.1634068381476, 0, 1, 0.3109349016983142, 0, 0.001633550762475409, 0.01133163598312098, 0.6890650983016858, 1, 0.00110042938376882],
[276.4277388704437, 612.0361743655805, 1, 0, 0.3111299567177913, 0.003617581955003005, 0, -0.02509448913058697, 1, 0.3111299567177913, 0.001100114722442164],
[276.3529070431612, 612.0441520256045, 1, 0, 0.3110691376363171, 0.003618561536766532, 0, -0.02510128430598952, 1, 0.3110691376363171, 0.001100668853896778],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 1, 0, 0.3110781174724643, 0.003618457080400547, 0, -0.02510055971172367, 1, 0.3110781174724643, 0.001100433579003676],
[276.2940305359269, 612.1030285328389, 1, 0, 0.3110028648964049, 0.003619332629301843, 0, -0.02510663323062667, 1, 0.3110028648964049, 0.0011006793276998],
[276.800450839193, 611.5966082295727, 0, 1, 0.3115729031446147, 0, 0.001635064659522497, 0.01134213760366905, 0.6884270968553854, 1, 0.001099388944543565],
[276.2940305359268, 612.0966082295727, 1, 0, 0.3110051124805444, 0.003619332629301844, 0, -0.02510663323062668, 1, 0.3110051124805444, 0.001100433579003676],
[275.9881171757525, 612.4089418930132, 0, 1, 0.3106585218382514, 0, 0.001632895817799307, 0.01132709275445056, 0.6893414781617486, 1, 0.001100433579003676],
[276.2866502503932, 612.1554291781237, 0, 1, 0.3109787983343972, 0, 0.001633572051043628, 0.01133178365793538, 0.6890212016656028, 1, 0.001100668853911073],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001100119530991111],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 1, 0, 0.3110781174724643, 0.003618457080400547, 0, -0.02510055971172367, 1, 0.3110781174724643, 0.001101727781672833],
[276.6347940360553, 611.695410865452, 0, 1, 0.3114098704622195, 0, 0.001634800559620283, 0.01134030559206353, 0.6885901295377805, 1, 0.00110043357985114],
[276.5549713430109, 611.9409459203176, 1, 0, 0.3112619495144475, 0.003615917642499006, 0, -0.02508294410615877, 1, 0.3112619495144475, 0.001100114724123767],
[276.2620265086225, 612.0966082295727, 0, 1, 0.3109802907358903, 0, 0.00163372903321977, 0.0113328726139181, 0.6890197092641097, 1, 0.001100433579003676],
[276.2940305359269, 612.1030285328388, 1, 0, 0.3110028648964051, 0.003619332629301843, 0, -0.02510663323062667, 1, 0.3110028648964051, 0.0011006793276998],
[276.3325104251808, 611.9452938310418, 0, 1, 0.3110879379188822, 0, 0.001634133001889055, 0.01133567486898974, 0.6889120620811178, 1, 0.001101967277403315],
[276.4138827229605, 612.0574107985973, 0, 1, 0.3111117767546123, 0, 0.001633833660628706, 0.0113335983946769, 0.6888882232453877, 1, 0.001100429385056491],
[276.3608847031853, 612.0966082295727, 0, 1, 0.3110569575939199, 0, 0.00163372903321977, 0.0113328726139181, 0.6889430424060801, 1, 0.00110042938376882],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001100429385056491],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001100679326910874],
[276.6732183666259, 611.7238407021399, 1, 0, 0.3114296873704646, 0.003614372239942927, 0, -0.02507222393778988, 1, 0.3114296873704645, 0.001101727676963357],
[276.2940305359268, 612.1030285328389, 1, 0, 0.3110028648964049, 0.003619332629301844, 0, -0.02510663323062668, 1, 0.3110028648964049, 0.001100433579018043],
[276.4277388704436, 611.969320198322, 1, 0, 0.3111533700485235, 0.003617581955003006, 0, -0.02509448913058698, 1, 0.3111533700485235, 0.001100114722428124],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001100668852907459],
[276.6347940360553, 611.6634068381476, 0, 1, 0.3114210900841745, 0, 0.001634886097190722, 0.0113408989501846, 0.6885789099158255, 1, 0.001099557779273553],
[276.2940305359269, 612.1030285328389, 1, 0, 0.3110028648964049, 0.003619332629301843, 0, -0.02510663323062667, 1, 0.3110028648964049, 0.001100679327699089],
[276.4138827229605, 612.0574107985973, 0, 1, 0.3111117767546123, 0, 0.001633833660628706, 0.0113335983946769, 0.6888882232453877, 1, 0.001100429383770201],
[275.9881171757525, 612.4089418930133, 0, 1, 0.3106585218382514, 0, 0.001632895817799307, 0.01132709275445056, 0.6893414781617486, 1, 0.001100433579003676],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 1, 0, 0.3110781174724643, 0.003618457080400547, 0, -0.02510055971172367, 1, 0.3110781174724643, 0.001100433579018817],
[276.2940305359269, 612.1030285328389, 1, 0, 0.3110028648964049, 0.003619332629301843, 0, -0.02510663323062667, 1, 0.3110028648964049, 0.001100433579003676],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 1, 0, 0.3110781174724643, 0.003618457080400547, 0, -0.02510055971172367, 1, 0.3110781174724643, 0.001099557174235612],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001100679326910874],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001100668852907459],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 1, 0, 0.3110781174724643, 0.003618457080400547, 0, -0.02510055971172367, 1, 0.3110781174724643, 0.00110066885391009],
[276.3288806758809, 612.0681783928848, 0, 1, 0.3110420930091033, 0, 0.001633804917984321, 0.01133339901233088, 0.6889579069908967, 1, 0.001100668853911073],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 1, 0, 0.3110781174724643, 0.003618457080400547, 0, -0.02510055971172367, 1, 0.3110781174724643, 0.001100114722428124],
[276.3608847031853, 612.1554291781237, 1, 0, 0.3110363652142267, 0.003618457080400547, 0, -0.02510055971172367, 1, 0.3110363652142267, 0.001099512289288228],
[275.9881171757525, 612.4089418930132, 0, 1, 0.3106585218382514, 0, 0.001632895817799307, 0.01132709275445056, 0.6893414781617486, 1, 0.001101027038125074],
[276.2940305359268, 612.1030285328388, 1, 0, 0.3110028648964049, 0.003619332629301844, 0, -0.02510663323062668, 1, 0.3110028648964049, 0.00110043357985114],
[276.2620265086225, 612.1350325601433, 0, 1, 0.3109668404330441, 0, 0.001633626482408109, 0.01133216123812605, 0.6890331595669559, 1, 0.001100668853896778],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001100433579003676],
[276.800450839193, 611.5966082295727, 0, 1, 0.3115729031446147, 0, 0.001635064659522497, 0.01134213760366905, 0.6884270968553854, 1, 0.00109955719084106],
[276.4277388704437, 612.0361743655805, 1, 0, 0.3111299567177913, 0.003617581955003005, 0, -0.02509448913058697, 1, 0.3111299567177913, 0.00110011953098946],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001100433579018043],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001100433579003676],
[276.3688623632094, 612.0281967055564, 1, 0, 0.3110870973086114, 0.003618352630065034, 0, -0.02509983515929008, 1, 0.3110870973086115, 0.001100429383770201],
[276.3688623632094, 612.0886305695486, 1, 0, 0.3110659368192487, 0.003618352630065034, 0, -0.02509983515929008, 1, 0.3110659368192487, 0.001100429385043028],
[276.3608847031853, 612.0745986961509, 0, 1, 0.3110646635203852, 0, 0.001633787780329739, 0.0113332801316277, 0.6889353364796148, 1, 0.001101966968408217],
[276.2620265086225, 612.1350325601433, 0, 1, 0.3109668404330441, 0, 0.001633626482408109, 0.01133216123812605, 0.6890331595669559, 1, 0.001100679327699089],
[277.3288806758809, 611.0681783928848, 0, 1, 0.3121677158258293, 0, 0.001636478604776982, 0.01135194587733396, 0.6878322841741707, 1, 0.00110066897402743],
[276.3608847031853, 612.0041703382761, 0, 1, 0.3110893242984294, 0, 0.001633975793738897, 0.01133458434546755, 0.6889106757015706, 1, 0.00110043357985114],
[276.4277388704437, 612.0361743655805, 1, 0, 0.3111299567177913, 0.003617581955003005, 0, -0.02509448913058697, 1, 0.3111299567177913, 0.001100114724123767],
[276.3608847031853, 612.0681783928848, 0, 1, 0.3110669114539098, 0, 0.001633804917984321, 0.01133339901233088, 0.6889330885460903, 1, 0.001100114724123767],
[275.9271414959533, 612.4699175728125, 0, 1, 0.310589886221804, 0, 0.001632733251557807, 0.01132596506285129, 0.6894101137781961, 1, 0.00109955744313813],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.0010992285608802],
[276.3288806758809, 612.0681783928848, 0, 1, 0.3110420930091033, 0, 0.001633804917984321, 0.01133339901233088, 0.6889579069908967, 1, 0.0011016605864445],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001100610519385864],
[276.3288806758809, 612.0681783928848, 0, 1, 0.3110420930091033, 0, 0.001633804917984321, 0.01133339901233088, 0.6889579069908967, 1, 0.001101288427017312],
[276.300450839193, 612.0966082295727, 0, 1, 0.3110100917362517, 0, 0.00163372903321977, 0.0113328726139181, 0.6889899082637483, 1, 0.001100668853896778],
[276.4213185671775, 611.9757405015882, 0, 1, 0.3111461432086768, 0, 0.001634051701429176, 0.01133511090291181, 0.6888538567913232, 1, 0.001100429385056491],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 1, 0, 0.3110781174724643, 0.003618457080400547, 0, -0.02510055971172367, 1, 0.3110781174724643, 0.001100114722428124],
[276.3608847031853, 612.0681783928848, 0, 1, 0.3110669114539098, 0, 0.001633804917984321, 0.01133339901233088, 0.6889330885460903, 1, 0.001101727762178896],
[276.8608847031853, 611.5361743655805, 0, 1, 0.3116409288808272, 0, 0.001635226241583206, 0.01134325846819032, 0.6883590711191727, 1, 0.0010992285608802],
[276.3608847031853, 612.0041703382761, 0, 1, 0.3110893242984294, 0, 0.001633975793738897, 0.01133458434546755, 0.6889106757015706, 1, 0.00110043357985114],
[276.2620265086225, 612.1350325601433, 0, 1, 0.3109668404330441, 0, 0.001633626482408109, 0.01133216123812605, 0.6890331595669559, 1, 0.001100433579003676],
[276.2940305359269, 612.0966082295727, 1, 0, 0.3110051124805444, 0.003619332629301843, 0, -0.02510663323062667, 1, 0.3110051124805444, 0.001100433579018043],
[276.4277388704436, 611.9693201983221, 1, 0, 0.3111533700485235, 0.003617581955003006, 0, -0.02509448913058698, 1, 0.3111533700485235, 0.00110011953097757],
[276.9561131484481, 611.9089418930132, 0, 1, 0.3115839818177231, 0, 0.001634230081532035, 0.01133634829230837, 0.6884160181822769, 1, 0.001101251445965167],
[276.2620265086225, 612.1350325601433, 0, 1, 0.3109668404330441, 0, 0.001633626482408109, 0.01133216123812605, 0.6890331595669559, 1, 0.00110066885290844],
[276.4213185671775, 611.9757405015882, 1, 0, 0.3111461432086768, 0.003617665978816225, 0, -0.02509507198805745, 1, 0.3111461432086768, 0.001100114724123767],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001100501888675506],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.00110070507164966],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 1, 0, 0.3110781174724643, 0.003618457080400547, 0, -0.02510055971172367, 1, 0.3110781174724643, 0.001100114722428124],
[276.3529070431612, 612.0441520256045, 1, 0, 0.3110691376363171, 0.003618561536766532, 0, -0.02510128430598952, 1, 0.3110691376363171, 0.001100668852907459],
[275.9881171757525, 612.4089418930132, 0, 1, 0.3106585218382514, 0, 0.001632895817799307, 0.01132709275445056, 0.6893414781617486, 1, 0.001100433579018043],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001100433579018817],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.00109955714844001],
[276.4213185671775, 611.9757405015882, 0, 1, 0.3111461432086768, 0, 0.001634051701429176, 0.01133511090291181, 0.6888538567913232, 1, 0.00110011953098946],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 1, 0, 0.3110781174724643, 0.003618457080400547, 0, -0.02510055971172367, 1, 0.3110781174724643, 0.001100429385043028],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.00110043357985114],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.00110042938376882],
[276.800450839193, 611.5966082295727, 0, 1, 0.3115729031446147, 0, 0.001635064659522497, 0.01134213760366905, 0.6884270968553854, 1, 0.001100265536322494],
[276.3331724082188, 612.2123555661309, 0, 1, 0.3109949504086593, 0, 0.001633420153821088, 0.01133072997532434, 0.6890050495913407, 1, 0.001100583125527526],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[276.2801743884436, 612.1911191331141, 0, 1, 0.3109612841776525, 0, 0.001633476815893766, 0.01133112302952038, 0.6890387158223474, 1, 0.001100045710974729],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[276.2940305359269, 612.1030285328389, 1, 0, 0.3110028648964049, 0.003619332629301843, 0, -0.02510663323062667, 1, 0.3110028648964049, 0.001099639188186163],
[276.4138827229605, 612.0574107985973, 0, 1, 0.3111117767546123, 0, 0.001633833660628706, 0.0113335983946769, 0.6888882232453877, 1, 0.001100603069486589],
[276.2940305359269, 612.1030285328389, 1, 0, 0.3110028648964049, 0.003619332629301843, 0, -0.02510663323062667, 1, 0.3110028648964049, 0.001100433579003676],
[276.3288806758809, 612.0681783928848, 0, 1, 0.3110420930091033, 0, 0.001633804917984321, 0.01133339901233088, 0.6889579069908967, 1, 0.001100433579003676],
[276.4277388704436, 611.9693201983221, 1, 0, 0.3111533700485235, 0.003617581955003006, 0, -0.02509448913058698, 1, 0.3111533700485235, 0.001100114722430069],
[276.300450839193, 612.0966082295727, 0, 1, 0.3110100917362517, 0, 0.00163372903321977, 0.0113328726139181, 0.6889899082637483, 1, 0.0011006793276998],
[276.3812813211657, 612.4837737202956, 0, 1, 0.3109372786719282, 0, 0.00163269631442787, 0.01132570883689228, 0.6890627213280718, 1, 0.001099557485046338],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001100433579018043],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 1, 0, 0.3110781174724643, 0.003618457080400547, 0, -0.02510055971172367, 1, 0.3110781174724643, 0.001100433579003676],
[276.8608847031853, 611.5361743655805, 0, 1, 0.3116409288808272, 0, 0.001635226241583206, 0.01134325846819032, 0.6883590711191727, 1, 0.001100429383756738],
[276.2940305359269, 612.1030285328389, 1, 0, 0.3110028648964049, 0.003619332629301843, 0, -0.02510663323062667, 1, 0.3110028648964049, 0.001100892535498448],
[276.2656562579224, 612.0121479983002, 0, 1, 0.3110126752398666, 0, 0.001633954494646367, 0.01133443659764797, 0.6889873247601334, 1, 0.001101690804675641],
[276.2866502503932, 612.1554291781237, 0, 1, 0.3109787983343972, 0, 0.001633572051043628, 0.01133178365793538, 0.6890212016656028, 1, 0.001100668853896778],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001100429383770201],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.00110043357985114],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 1, 0, 0.3110781174724643, 0.003618457080400547, 0, -0.02510055971172367, 1, 0.3110781174724643, 0.001101966968360149],
[275.8608847031853, 612.5361743655805, 0, 1, 0.3105153060641013, 0, 0.001632556642121138, 0.01132473995623478, 0.6894846939358987, 1, 0.0011006793276998],
[276.459742897748, 611.9373161710176, 0, 1, 0.3111893945118844, 0, 0.001634154305635662, 0.01133582264909378, 0.6888106054881156, 1, 0.001100114722428124],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 1, 0, 0.3110781174724643, 0.003618457080400547, 0, -0.02510055971172367, 1, 0.3110781174724643, 0.001100433579835997],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.00110043357985114],
[276.800450839193, 611.5966082295727, 0, 1, 0.3115729031446147, 0, 0.001635064659522497, 0.01134213760366905, 0.6884270968553854, 1, 0.001099388944532437],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001099228562047962],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001100114724123767],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001100433579003676],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001100433579018043],
[276.2620265086225, 612.0966082295727, 0, 1, 0.3109802907358903, 0, 0.00163372903321977, 0.0113328726139181, 0.6890197092641097, 1, 0.001099557148941099],
[276.2940305359269, 612.1030285328388, 1, 0, 0.3110028648964051, 0.003619332629301843, 0, -0.02510663323062667, 1, 0.3110028648964051, 0.001100679326894895],
[276.2940305359269, 612.1030285328388, 1, 0, 0.3110028648964051, 0.003619332629301843, 0, -0.02510663323062667, 1, 0.3110028648964051, 0.001100433579003676],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.00110043357985114],
[276.1631683140598, 612.1570420935649, 0, 1, 0.3108824555363165, 0, 0.001633567746897136, 0.01133175380087652, 0.6891175444636835, 1, 0.00110127408291041],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[276.2620265086225, 612.0966082295727, 0, 1, 0.3109802907358903, 0, 0.00163372903321977, 0.0113328726139181, 0.6890197092641097, 1, 0.00110086569360587],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[276.2940305359269, 612.1030285328388, 1, 0, 0.3110028648964051, 0.003619332629301843, 0, -0.02510663323062667, 1, 0.3110028648964051, 0.001100909459601714],
[275.3260345632312, 613.0710245055345, 0, 1, 0.30991326654304, 0, 0.001631132381124257, 0.01131486012419506, 0.69008673345696, 1, 0.001099398615877959],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.8928887304896, 612.504170338276, 1, 0, 0.3105513305274623, 0.003624595054267114, 0, -0.02514313768795041, 1, 0.3105513305274623, 0.001099325022582891],
[276.0679398687969, 612.2098643874257, 0, 1, 0.31079009128226, 0, 0.001633426800465875, 0.01133077608185557, 0.68920990871774, 1, 0.001102134123818939],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[276.2620265086225, 612.1350325601433, 0, 1, 0.3109668404330441, 0, 0.001633626482408109, 0.01133216123812605, 0.6890331595669559, 1, 0.001100284720104089],
[276.2620265086225, 612.1350325601433, 0, 1, 0.3109668404330441, 0, 0.001633626482408109, 0.01133216123812605, 0.6890331595669559, 1, 0.00110135652689343],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 1, 0, 0.3110781174724643, 0.003618457080400547, 0, -0.02510055971172367, 1, 0.3110781174724643, 0.001099660483203457]
],
"NAMES": [
["epi_isl_427274_Minnesota_20200320_null_2"],
["epi_isl_427482_New_York_20200401_null_2"],
["epi_isl_427632_New_York_20200406_null_2"],
["epi_isl_427779_New_South_Wales_20200324_null_3"],
["epi_isl_427799_New_South_Wales_20200317_null_8"],
["epi_isl_428299_Wisconsin_20200325_null_1"],
["epi_isl_428335_Wisconsin_20200327_null_11"],
["epi_isl_428354_Ile_De_France_20200325_null_17"],
["epi_isl_428360_Hauts_De_France_20200325_null_21"],
["epi_isl_428362_Ile_De_France_20200325_null_1"],
["epi_isl_426964_Victoria_20200327_null_1"],
["epi_isl_421692_Minnesota_20200317_null_1"],
["epi_isl_422800_Netherlands_20200314_null_3"],
["epi_isl_425777_Scotland_20200313_null_8"],
["epi_isl_427184_Washington_20200325_null_1"],
["epi_isl_426534_Arizona_20200327_null_1"],
["epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_2"],
["epi_isl_424003_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_425498_England_20200319_null_2"],
["epi_isl_429781_Luxembourg_20200323_null_1"],
["epi_isl_427025_Victoria_20200331_null_3"],
["epi_isl_421670_India_20200312_null_1"],
["epi_isl_423509_England_20200331_null_5"],
["epi_isl_425564_England_20200325_null_3"],
["epi_isl_429699_Minas_gerais_20200320_null_1"],
["epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_6"],
["epi_isl_425132_Duesseldorf_20200323_null_1"],
["epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1"],
["epi_isl_425319_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_429791_Luxembourg_20200328_null_2"],
["epi_isl_427020_Victoria_20200329_null_2"],
["epi_isl_421513_Ile_de_France_20200323_null_1"],
["epi_isl_421763_Luxembourg_20200317_null_1"],
["epi_isl_425342_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_427149_Victoria_20200408_null_15"],
["epi_isl_427212_Washington_20200327_null_3"],
["epi_isl_421515_Comunitat_Valenciana_20200307_null_1"],
["epi_isl_418844_British_Columbia_20200312_null_1"],
["epi_isl_429585_Unknown_20200326_null_7"],
["epi_isl_425191_Comunitat_Valenciana_20200316_null_3"],
["epi_isl_427096_Victoria_20200403_null_2"],
["epi_isl_428777_New_York_20200406_null_2"],
["epi_isl_425196_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1"],
["epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_2"],
["epi_isl_429026_California_20200331_null_2"],
["epi_isl_423084_England_20200324_null_2"],
["epi_isl_427051_Victoria_20200330_null_3"],
["epi_isl_428852_Moscow_20200402_null_2"],
["epi_isl_420422_Tielt_Winge_20200325_null_1"],
["epi_isl_423288_England_20200326_null_5"],
["epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1"],
["epi_isl_422914_Zuid_Holland_20200319_null_1"],
["epi_isl_424275_Washington_20200322_null_4"],
["epi_isl_428864_Moscow_20200311_null_2"],
["epi_isl_418366_Ontario_20200305_null_1"],
["epi_isl_421918_England_20200327_null_2"],
["epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1"],
["epi_isl_421506_Ile_de_France_20200321_null_1"],
["epi_isl_428333_Wisconsin_20200327_null_2"],
["epi_isl_428787_New_York_20200406_null_7"],
["epi_isl_429815_NL_20200315_null_20"],
["epi_isl_416720_Washington_20200313_null_1"],
["epi_isl_423428_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_424129_England_20200320_null_2"],
["epi_isl_426475_Virginia_20200404_null_2"],
["epi_isl_428258_Wisconsin_20200329_null_2"],
["Node24"],
["epi_isl_426465_Virginia_20200331_null_6"],
["epi_isl_429663_Istria_20200301_null_1"],
["epi_isl_420195_South_Yorkshire_20200328_null_2"],
["epi_isl_423089_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1"],
["epi_isl_424297_Washington_20200323_null_1"],
["epi_isl_428789_New_York_20200406_null_1"],
["epi_isl_421984_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_422661_Netherlands_20200310_null_1"],
["epi_isl_425878_Scotland_20200321_null_5"],
["epi_isl_428387_Connecticut_20200331_null_1"],
["epi_isl_429484_Unknown_20200324_null_13"],
["epi_isl_422504_New_York_20200319_null_1"],
["epi_isl_421871_England_20200327_null_2"],
["epi_isl_426028_New_York_20200304_null_2"],
["Node35"],
["epi_isl_422923_Zuid_Holland_20200323_null_10"],
["epi_isl_429309_Unknown_20200318_null_3"],
["epi_isl_414624_Normandie_20200226_null_1"],
["epi_isl_420241_South_Yorkshire_20200326_null_2"],
["epi_isl_417778_Reykjavik_20200310_null_1"],
["epi_isl_422919_Zuid_Holland_20200319_null_1"],
["epi_isl_429638_Washington_20200407_null_4"],
["epi_isl_428762_New_York_20200403_null_57"],
["epi_isl_420610_ARA_20200323_null_2"],
["epi_isl_425839_Scotland_20200313_null_1"],
["epi_isl_420520_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_423505_England_20200330_null_2"],
["Node59"],
["epi_isl_427453_Wisconsin_20200406_null_20"],
["Node58"],
["epi_isl_428779_New_York_20200406_null_116"],
["epi_isl_429868_Eskisehir_20200317_null_2"],
["epi_isl_421432_New_York_20200317_null_1"],
["epi_isl_423766_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_425655_Scotland_20200310_null_1"],
["epi_isl_426621_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_428902_Orenburg_Region_20200323_null_3"],
["epi_isl_415454_Switzerland_20200228_null_1"],
["epi_isl_423704_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_423958_England_20200319_null_1"],
["epi_isl_425982_Scotland_20200329_null_3"],
["epi_isl_428732_Wisconsin_20200406_null_1"],
["epi_isl_420510_England_20200323_null_2"],
["epi_isl_422860_Noord_Brabant_20200320_null_1"],
["epi_isl_418021_Portugal_20200316_null_1"],
["epi_isl_424470_Reykjavik_20200320_null_2"],
["epi_isl_429159_Ostergotland_20200310_null_1"],
["epi_isl_424552_Reykjavik_20200328_null_15"],
["epi_isl_421316_Wisconsin_20200323_null_2"],
["epi_isl_423772_England_20200322_null_2"],
["epi_isl_427164_Connecticut_20200331_null_1"],
["epi_isl_427132_Victoria_20200405_null_1"],
["epi_isl_418082_Washington_20200315_null_1"],
["epi_isl_419756_Victoria_20200311_null_1"],
["epi_isl_424164_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_427259_Washington_20200331_null_1"],
["epi_isl_429705_Istria_20200301_null_4"],
["epi_isl_429007_California_20200318_null_4"],
["epi_isl_426989_Victoria_20200328_null_3"],
["epi_isl_428365_Ile_De_France_20200326_null_2"],
["Node93"],
["epi_isl_416681_Washington_20200311_null_10783"],
["epi_isl_423389_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_425904_Scotland_20200322_null_1"],
["epi_isl_429518_Unknown_20200311_null_12"],
["Node106"],
["epi_isl_425242_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_429273_Unknown_20200310_null_125"],
["Node100"],
["epi_isl_422266_Wales_20200325_null_1"],
["epi_isl_429315_Unknown_20200318_null_4"],
["Node103"]
],
"RESOLVED": [
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001100433579003676],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001100433579003676],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001100433579003676],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001100433579018043],
[276.2940305359269, 612.1030285328388, 1, 0, 0.3110028648964051, 0.003619332629301843, 0, -0.02510663323062667, 1, 0.3110028648964051, 0.001100433579003676],
[276.2940305359269, 612.1030285328389, 1, 0, 0.3110028648964049, 0.003619332629301843, 0, -0.02510663323062667, 1, 0.3110028648964049, 0.001100433579003676],
[276.2620265086225, 612.1350325601433, 0, 1, 0.3109668404330441, 0, 0.001633626482408109, 0.01133216123812605, 0.6890331595669559, 1, 0.00110043357985114],
[276.3688623632094, 612.1024311583484, 1, 0, 0.311061105044587, 0.003618352630065034, 0, -0.02509983515929008, 1, 0.3110611050445871, 0.001100429385043028],
[276.2940305359269, 612.1030285328389, 1, 0, 0.3110028648964049, 0.003619332629301843, 0, -0.02510663323062667, 1, 0.3110028648964049, 0.001100433579018817],
[276.2336522306181, 612.1634068381476, 0, 1, 0.3109349016983142, 0, 0.001633550762475409, 0.01133163598312098, 0.6890650983016858, 1, 0.00110042938376882],
[276.4277388704437, 612.0361743655805, 1, 0, 0.3111299567177913, 0.003617581955003005, 0, -0.02509448913058697, 1, 0.3111299567177913, 0.001100114722442164],
[276.3529070431612, 612.0441520256045, 1, 0, 0.3110691376363171, 0.003618561536766532, 0, -0.02510128430598952, 1, 0.3110691376363171, 0.001100668853896778],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 1, 0, 0.3110781174724643, 0.003618457080400547, 0, -0.02510055971172367, 1, 0.3110781174724643, 0.001100433579003676],
[276.2940305359269, 612.1030285328389, 1, 0, 0.3110028648964049, 0.003619332629301843, 0, -0.02510663323062667, 1, 0.3110028648964049, 0.0011006793276998],
[276.800450839193, 611.5966082295727, 0, 1, 0.3115729031446147, 0, 0.001635064659522497, 0.01134213760366905, 0.6884270968553854, 1, 0.001099388944543565],
[276.2940305359268, 612.0966082295727, 1, 0, 0.3110051124805444, 0.003619332629301844, 0, -0.02510663323062668, 1, 0.3110051124805444, 0.001100433579003676],
[275.9881171757525, 612.4089418930132, 0, 1, 0.3106585218382514, 0, 0.001632895817799307, 0.01132709275445056, 0.6893414781617486, 1, 0.001100433579003676],
[276.2866502503932, 612.1554291781237, 0, 1, 0.3109787983343972, 0, 0.001633572051043628, 0.01133178365793538, 0.6890212016656028, 1, 0.001100668853911073],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001100119530991111],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 1, 0, 0.3110781174724643, 0.003618457080400547, 0, -0.02510055971172367, 1, 0.3110781174724643, 0.001101727781672833],
[276.6347940360553, 611.695410865452, 0, 1, 0.3114098704622195, 0, 0.001634800559620283, 0.01134030559206353, 0.6885901295377805, 1, 0.00110043357985114],
[276.5549713430109, 611.9409459203176, 1, 0, 0.3112619495144475, 0.003615917642499006, 0, -0.02508294410615877, 1, 0.3112619495144475, 0.001100114724123767],
[276.2620265086225, 612.0966082295727, 0, 1, 0.3109802907358903, 0, 0.00163372903321977, 0.0113328726139181, 0.6890197092641097, 1, 0.001100433579003676],
[276.2940305359269, 612.1030285328388, 1, 0, 0.3110028648964051, 0.003619332629301843, 0, -0.02510663323062667, 1, 0.3110028648964051, 0.0011006793276998],
[276.3325104251808, 611.9452938310418, 0, 1, 0.3110879379188822, 0, 0.001634133001889055, 0.01133567486898974, 0.6889120620811178, 1, 0.001101967277403315],
[276.4138827229605, 612.0574107985973, 0, 1, 0.3111117767546123, 0, 0.001633833660628706, 0.0113335983946769, 0.6888882232453877, 1, 0.001100429385056491],
[276.3608847031853, 612.0966082295727, 0, 1, 0.3110569575939199, 0, 0.00163372903321977, 0.0113328726139181, 0.6889430424060801, 1, 0.00110042938376882],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001100429385056491],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001100679326910874],
[276.6732183666259, 611.7238407021399, 1, 0, 0.3114296873704646, 0.003614372239942927, 0, -0.02507222393778988, 1, 0.3114296873704645, 0.001101727676963357],
[276.2940305359268, 612.1030285328389, 1, 0, 0.3110028648964049, 0.003619332629301844, 0, -0.02510663323062668, 1, 0.3110028648964049, 0.001100433579018043],
[276.4277388704436, 611.969320198322, 1, 0, 0.3111533700485235, 0.003617581955003006, 0, -0.02509448913058698, 1, 0.3111533700485235, 0.001100114722428124],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001100668852907459],
[276.6347940360553, 611.6634068381476, 0, 1, 0.3114210900841745, 0, 0.001634886097190722, 0.0113408989501846, 0.6885789099158255, 1, 0.001099557779273553],
[276.2940305359269, 612.1030285328389, 1, 0, 0.3110028648964049, 0.003619332629301843, 0, -0.02510663323062667, 1, 0.3110028648964049, 0.001100679327699089],
[276.4138827229605, 612.0574107985973, 0, 1, 0.3111117767546123, 0, 0.001633833660628706, 0.0113335983946769, 0.6888882232453877, 1, 0.001100429383770201],
[275.9881171757525, 612.4089418930133, 0, 1, 0.3106585218382514, 0, 0.001632895817799307, 0.01132709275445056, 0.6893414781617486, 1, 0.001100433579003676],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 1, 0, 0.3110781174724643, 0.003618457080400547, 0, -0.02510055971172367, 1, 0.3110781174724643, 0.001100433579018817],
[276.2940305359269, 612.1030285328389, 1, 0, 0.3110028648964049, 0.003619332629301843, 0, -0.02510663323062667, 1, 0.3110028648964049, 0.001100433579003676],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 1, 0, 0.3110781174724643, 0.003618457080400547, 0, -0.02510055971172367, 1, 0.3110781174724643, 0.001099557174235612],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001100679326910874],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001100668852907459],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 1, 0, 0.3110781174724643, 0.003618457080400547, 0, -0.02510055971172367, 1, 0.3110781174724643, 0.00110066885391009],
[276.3288806758809, 612.0681783928848, 0, 1, 0.3110420930091033, 0, 0.001633804917984321, 0.01133339901233088, 0.6889579069908967, 1, 0.001100668853911073],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 1, 0, 0.3110781174724643, 0.003618457080400547, 0, -0.02510055971172367, 1, 0.3110781174724643, 0.001100114722428124],
[276.3608847031853, 612.1554291781237, 1, 0, 0.3110363652142267, 0.003618457080400547, 0, -0.02510055971172367, 1, 0.3110363652142267, 0.001099512289288228],
[275.9881171757525, 612.4089418930132, 0, 1, 0.3106585218382514, 0, 0.001632895817799307, 0.01132709275445056, 0.6893414781617486, 1, 0.001101027038125074],
[276.2940305359268, 612.1030285328388, 1, 0, 0.3110028648964049, 0.003619332629301844, 0, -0.02510663323062668, 1, 0.3110028648964049, 0.00110043357985114],
[276.2620265086225, 612.1350325601433, 0, 1, 0.3109668404330441, 0, 0.001633626482408109, 0.01133216123812605, 0.6890331595669559, 1, 0.001100668853896778],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001100433579003676],
[276.800450839193, 611.5966082295727, 0, 1, 0.3115729031446147, 0, 0.001635064659522497, 0.01134213760366905, 0.6884270968553854, 1, 0.00109955719084106],
[276.4277388704437, 612.0361743655805, 1, 0, 0.3111299567177913, 0.003617581955003005, 0, -0.02509448913058697, 1, 0.3111299567177913, 0.00110011953098946],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001100433579018043],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001100433579003676],
[276.3688623632094, 612.0281967055564, 1, 0, 0.3110870973086114, 0.003618352630065034, 0, -0.02509983515929008, 1, 0.3110870973086115, 0.001100429383770201],
[276.3688623632094, 612.0886305695486, 1, 0, 0.3110659368192487, 0.003618352630065034, 0, -0.02509983515929008, 1, 0.3110659368192487, 0.001100429385043028],
[276.3608847031853, 612.0745986961509, 0, 1, 0.3110646635203852, 0, 0.001633787780329739, 0.0113332801316277, 0.6889353364796148, 1, 0.001101966968408217],
[276.2620265086225, 612.1350325601433, 0, 1, 0.3109668404330441, 0, 0.001633626482408109, 0.01133216123812605, 0.6890331595669559, 1, 0.001100679327699089],
[277.3288806758809, 611.0681783928848, 0, 1, 0.3121677158258293, 0, 0.001636478604776982, 0.01135194587733396, 0.6878322841741707, 1, 0.00110066897402743],
[276.3608847031853, 612.0041703382761, 0, 1, 0.3110893242984294, 0, 0.001633975793738897, 0.01133458434546755, 0.6889106757015706, 1, 0.00110043357985114],
[276.4277388704437, 612.0361743655805, 1, 0, 0.3111299567177913, 0.003617581955003005, 0, -0.02509448913058697, 1, 0.3111299567177913, 0.001100114724123767],
[276.3608847031853, 612.0681783928848, 0, 1, 0.3110669114539098, 0, 0.001633804917984321, 0.01133339901233088, 0.6889330885460903, 1, 0.001100114724123767],
[275.9271414959533, 612.4699175728125, 0, 1, 0.310589886221804, 0, 0.001632733251557807, 0.01132596506285129, 0.6894101137781961, 1, 0.00109955744313813],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.0010992285608802],
[276.3288806758809, 612.0681783928848, 0, 1, 0.3110420930091033, 0, 0.001633804917984321, 0.01133339901233088, 0.6889579069908967, 1, 0.0011016605864445],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001100610519385864],
[276.3288806758809, 612.0681783928848, 0, 1, 0.3110420930091033, 0, 0.001633804917984321, 0.01133339901233088, 0.6889579069908967, 1, 0.001101288427017312],
[276.300450839193, 612.0966082295727, 0, 1, 0.3110100917362517, 0, 0.00163372903321977, 0.0113328726139181, 0.6889899082637483, 1, 0.001100668853896778],
[276.4213185671775, 611.9757405015882, 0, 1, 0.3111461432086768, 0, 0.001634051701429176, 0.01133511090291181, 0.6888538567913232, 1, 0.001100429385056491],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 1, 0, 0.3110781174724643, 0.003618457080400547, 0, -0.02510055971172367, 1, 0.3110781174724643, 0.001100114722428124],
[276.3608847031853, 612.0681783928848, 0, 1, 0.3110669114539098, 0, 0.001633804917984321, 0.01133339901233088, 0.6889330885460903, 1, 0.001101727762178896],
[276.8608847031853, 611.5361743655805, 0, 1, 0.3116409288808272, 0, 0.001635226241583206, 0.01134325846819032, 0.6883590711191727, 1, 0.0010992285608802],
[276.3608847031853, 612.0041703382761, 0, 1, 0.3110893242984294, 0, 0.001633975793738897, 0.01133458434546755, 0.6889106757015706, 1, 0.00110043357985114],
[276.2620265086225, 612.1350325601433, 0, 1, 0.3109668404330441, 0, 0.001633626482408109, 0.01133216123812605, 0.6890331595669559, 1, 0.001100433579003676],
[276.2940305359269, 612.0966082295727, 1, 0, 0.3110051124805444, 0.003619332629301843, 0, -0.02510663323062667, 1, 0.3110051124805444, 0.001100433579018043],
[276.4277388704436, 611.9693201983221, 1, 0, 0.3111533700485235, 0.003617581955003006, 0, -0.02509448913058698, 1, 0.3111533700485235, 0.00110011953097757],
[276.9561131484481, 611.9089418930132, 0, 1, 0.3115839818177231, 0, 0.001634230081532035, 0.01133634829230837, 0.6884160181822769, 1, 0.001101251445965167],
[276.2620265086225, 612.1350325601433, 0, 1, 0.3109668404330441, 0, 0.001633626482408109, 0.01133216123812605, 0.6890331595669559, 1, 0.00110066885290844],
[276.4213185671775, 611.9757405015882, 1, 0, 0.3111461432086768, 0.003617665978816225, 0, -0.02509507198805745, 1, 0.3111461432086768, 0.001100114724123767],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001100501888675506],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.00110070507164966],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 1, 0, 0.3110781174724643, 0.003618457080400547, 0, -0.02510055971172367, 1, 0.3110781174724643, 0.001100114722428124],
[276.3529070431612, 612.0441520256045, 1, 0, 0.3110691376363171, 0.003618561536766532, 0, -0.02510128430598952, 1, 0.3110691376363171, 0.001100668852907459],
[275.9881171757525, 612.4089418930132, 0, 1, 0.3106585218382514, 0, 0.001632895817799307, 0.01132709275445056, 0.6893414781617486, 1, 0.001100433579018043],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001100433579018817],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.00109955714844001],
[276.4213185671775, 611.9757405015882, 0, 1, 0.3111461432086768, 0, 0.001634051701429176, 0.01133511090291181, 0.6888538567913232, 1, 0.00110011953098946],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 1, 0, 0.3110781174724643, 0.003618457080400547, 0, -0.02510055971172367, 1, 0.3110781174724643, 0.001100429385043028],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.00110043357985114],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.00110042938376882],
[276.800450839193, 611.5966082295727, 0, 1, 0.3115729031446147, 0, 0.001635064659522497, 0.01134213760366905, 0.6884270968553854, 1, 0.001100265536322494],
[276.3331724082188, 612.2123555661309, 0, 1, 0.3109949504086593, 0, 0.001633420153821088, 0.01133072997532434, 0.6890050495913407, 1, 0.001100583125527526],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[276.2801743884436, 612.1911191331141, 0, 1, 0.3109612841776525, 0, 0.001633476815893766, 0.01133112302952038, 0.6890387158223474, 1, 0.001100045710974729],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[276.2940305359269, 612.1030285328389, 1, 0, 0.3110028648964049, 0.003619332629301843, 0, -0.02510663323062667, 1, 0.3110028648964049, 0.001099639188186163],
[276.4138827229605, 612.0574107985973, 0, 1, 0.3111117767546123, 0, 0.001633833660628706, 0.0113335983946769, 0.6888882232453877, 1, 0.001100603069486589],
[276.2940305359269, 612.1030285328389, 1, 0, 0.3110028648964049, 0.003619332629301843, 0, -0.02510663323062667, 1, 0.3110028648964049, 0.001100433579003676],
[276.3288806758809, 612.0681783928848, 0, 1, 0.3110420930091033, 0, 0.001633804917984321, 0.01133339901233088, 0.6889579069908967, 1, 0.001100433579003676],
[276.4277388704436, 611.9693201983221, 1, 0, 0.3111533700485235, 0.003617581955003006, 0, -0.02509448913058698, 1, 0.3111533700485235, 0.001100114722430069],
[276.300450839193, 612.0966082295727, 0, 1, 0.3110100917362517, 0, 0.00163372903321977, 0.0113328726139181, 0.6889899082637483, 1, 0.0011006793276998],
[276.3812813211657, 612.4837737202956, 0, 1, 0.3109372786719282, 0, 0.00163269631442787, 0.01132570883689228, 0.6890627213280718, 1, 0.001099557485046338],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001100433579018043],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 1, 0, 0.3110781174724643, 0.003618457080400547, 0, -0.02510055971172367, 1, 0.3110781174724643, 0.001100433579003676],
[276.8608847031853, 611.5361743655805, 0, 1, 0.3116409288808272, 0, 0.001635226241583206, 0.01134325846819032, 0.6883590711191727, 1, 0.001100429383756738],
[276.2940305359269, 612.1030285328389, 1, 0, 0.3110028648964049, 0.003619332629301843, 0, -0.02510663323062667, 1, 0.3110028648964049, 0.001100892535498448],
[276.2656562579224, 612.0121479983002, 0, 1, 0.3110126752398666, 0, 0.001633954494646367, 0.01133443659764797, 0.6889873247601334, 1, 0.001101690804675641],
[276.2866502503932, 612.1554291781237, 0, 1, 0.3109787983343972, 0, 0.001633572051043628, 0.01133178365793538, 0.6890212016656028, 1, 0.001100668853896778],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001100429383770201],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.00110043357985114],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 1, 0, 0.3110781174724643, 0.003618457080400547, 0, -0.02510055971172367, 1, 0.3110781174724643, 0.001101966968360149],
[275.8608847031853, 612.5361743655805, 0, 1, 0.3105153060641013, 0, 0.001632556642121138, 0.01132473995623478, 0.6894846939358987, 1, 0.0011006793276998],
[276.459742897748, 611.9373161710176, 0, 1, 0.3111893945118844, 0, 0.001634154305635662, 0.01133582264909378, 0.6888106054881156, 1, 0.001100114722428124],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 1, 0, 0.3110781174724643, 0.003618457080400547, 0, -0.02510055971172367, 1, 0.3110781174724643, 0.001100433579835997],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.00110043357985114],
[276.800450839193, 611.5966082295727, 0, 1, 0.3115729031446147, 0, 0.001635064659522497, 0.01134213760366905, 0.6884270968553854, 1, 0.001099388944532437],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001099228562047962],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001100114724123767],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001100433579003676],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.001100433579018043],
[276.2620265086225, 612.0966082295727, 0, 1, 0.3109802907358903, 0, 0.00163372903321977, 0.0113328726139181, 0.6890197092641097, 1, 0.001099557148941099],
[276.2940305359269, 612.1030285328388, 1, 0, 0.3110028648964051, 0.003619332629301843, 0, -0.02510663323062667, 1, 0.3110028648964051, 0.001100679326894895],
[276.2940305359269, 612.1030285328388, 1, 0, 0.3110028648964051, 0.003619332629301843, 0, -0.02510663323062667, 1, 0.3110028648964051, 0.001100433579003676],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 0, 1, 0.3110781174724643, 0, 0.001633890351393971, 0.01133399164790805, 0.6889218825275357, 1, 0.00110043357985114],
[276.1631683140598, 612.1570420935649, 0, 1, 0.3108824555363165, 0, 0.001633567746897136, 0.01133175380087652, 0.6891175444636835, 1, 0.00110127408291041],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[276.2620265086225, 612.0966082295727, 0, 1, 0.3109802907358903, 0, 0.00163372903321977, 0.0113328726139181, 0.6890197092641097, 1, 0.00110086569360587],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[276.2940305359269, 612.1030285328388, 1, 0, 0.3110028648964051, 0.003619332629301843, 0, -0.02510663323062667, 1, 0.3110028648964051, 0.001100909459601714],
[275.3260345632312, 613.0710245055345, 0, 1, 0.30991326654304, 0, 0.001631132381124257, 0.01131486012419506, 0.69008673345696, 1, 0.001099398615877959],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.8928887304896, 612.504170338276, 1, 0, 0.3105513305274623, 0.003624595054267114, 0, -0.02514313768795041, 1, 0.3105513305274623, 0.001099325022582891],
[276.0679398687969, 612.2098643874257, 0, 1, 0.31079009128226, 0, 0.001633426800465875, 0.01133077608185557, 0.68920990871774, 1, 0.001102134123818939],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[276.2620265086225, 612.1350325601433, 0, 1, 0.3109668404330441, 0, 0.001633626482408109, 0.01133216123812605, 0.6890331595669559, 1, 0.001100284720104089],
[276.2620265086225, 612.1350325601433, 0, 1, 0.3109668404330441, 0, 0.001633626482408109, 0.01133216123812605, 0.6890331595669559, 1, 0.00110135652689343],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[276.3608847031853, 612.0361743655805, 1, 0, 0.3110781174724643, 0.003618457080400547, 0, -0.02510055971172367, 1, 0.3110781174724643, 0.001099660483203457]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8515310944159269, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2986224123887183, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.7455350548655711, 2.105996039550357, 0, 0, 0.2614507891306292, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.007390779664769667, 2.992609220335232, 0, 1, 0.002463593221589888, 0, 0.3341565591674479, 2.317981526401907, 0.9975364067784102, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.468406444238537, 0.6666666666666667, 1, 0.1441584220415006],
[0.9354816139829409, 2.064518386017062, 1, 0, 0.31182720466098, 1.068968096275418, 0, -7.415231667614131, 1, 0.31182720466098, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.7455350548655711, 2.105996039550357, 0, 0, 0.2614507891306292, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9995385793568302, 2.000461420643173, 0, 1, 0.3331795264522763, 0, 0.4998846714466943, 3.467606431643561, 0.6668204735477237, 1, 0.1441584220415006],
[0.7614903749137285, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2757534054188103, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.995469879964165, 2.004530120035838, 0, 4, 0.331823293321388, 0, 1.99548011776869, 13.84227219963762, 0.1993266310247577, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.120867727984453, 0, 0, 0.2744584586536227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.003352243618334476, 2.996647756381667, 0, 1, 0.001117414539444825, 0, 0.3337062215171596, 2.314857618385221, 0.9988825854605552, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.7455350548655711, 1.31847299974313, 0, 0, 0.3612074348260774, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.002089223324645, 1.997156743055005, 0, 1, 0.3341137187672051, 0, 0.5007118261886259, 3.473344249318157, 0.6658862812327949, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.120867727984453, 0, 0, 0.2744584586536227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9354816139829409, 2.064518386017062, 1, 0, 0.31182720466098, 1.068968096275418, 0, -7.415231667614131, 1, 0.31182720466098, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0, 1.477019250172547, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9354815000157914, 2.064518499984211, 1, 0, 0.3118271666719302, 1.068968226504874, 0, -7.4152325709915, 1, 0.3118271666719302, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9359919453913015, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3187992211152181, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.120867727984453, 0, 0, 0.2744584586536227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8515310944159269, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2986224123887183, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9354816139829343, 2.000461322011613, 1, 0, 0.3186307208202059, 1.068968096275426, 0, -7.415231667614184, 1, 0.3186307208202059, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.468406444238537, 0.6666666666666667, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.7455350548655711, 2.015955320048159, 0, 0, 0.2699756123136449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9347533434303312, 2.064334917966598, 1, 1, 0.311679171120805, 1.069800934148284, 0.4844175193165921, -4.060695216705207, 0.902856094289448, 0.5262144365310579, 0.1441584220415006],
[0.003354916511534576, 2.996645083488467, 0, 1, 0.001118305503844858, 0, 0.3337065191703903, 2.314859683149988, 0.9988816944961552, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9354815000161648, 2.064518499983838, 1, 0, 0.3118271666720547, 1.068968226504448, 0, -7.41523257098854, 1, 0.3118271666720547, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.468406444238537, 0.6666666666666667, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.000000000000002, 0, 0, 0.286296364779486, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.7455350548655711, 2.015955320048159, 0, 0, 0.2699756123136449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.547818665740074, 1.25446494513443, 0, 0, 0.5523419042004277, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -6.936812888477075, 1, 0.3333333333333333, 0.1441584220415006],
[0.8791322720155496, 2.120867727984453, 0, 0, 0.2930440906718496, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9992453657905255, 2.000461322011607, 0, 1, 0.3331143574316149, 0, 0.4998846960932133, 3.467606602611851, 0.6668856425683851, 1, 0.1441584220415006],
[0.7618949338530157, 2.090202827234753, 0, 1, 0.2671349293309058, 0, 0.4784224702838797, 3.318727158002261, 0.7328650706690942, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9359919453913015, 2.064008054608701, 0, 0, 0.3119973151304336, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.563773985788232, 1.359377353070725, 0, 0, 0.5349616918563805, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -6.936812888477075, 1, 0.3333333333333333, 0.1441584220415006],
[0.7616459485781205, 1.305931709994483, 0, 1, 0.3683759811488479, 0, 0.7657368240213912, 5.311773070053094, 0.6316240188511522, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.468406444238537, 0.6666666666666667, 1, 0.1441584220415006],
[0.9992452044489047, 2.000754795551098, 0, 1, 0.3330817348163012, 0, 0.4998113722998998, 3.467097969177362, 0.6669182651836988, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.7455350548655711, 1.31847299974313, 0, 0, 0.3612074348260774, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.999755697198886, 2.000244302801117, 1, 1, 0.3332518990662949, 1.000244362499557, 0.4999389317592918, -3.470525160134152, 0.888943171768708, 0.5554469699012978, 0.1441584220415006],
[0.8674864144640841, 2.132513585535918, 0, 0, 0.2891621381546944, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.468406444238537, 0.6666666666666667, 1, 0.1441584220415006],
[0.8791322720155496, 2.120867727984453, 0, 0, 0.2930440906718496, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 1.761490374913729, 0, 0, 0.362123297290595, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.7500821092571391, 1.317501048591028, 0, 1, 0.3627820754923277, 0, 0.7590126786384173, 5.265128931696487, 0.6372179245076723, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.120867727984453, 0, 0, 0.2744584586536227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9971529438181542, 2.002847056181849, 0, 1, 0.3323843146060511, 0, 0.4992892477303593, 3.463476088733983, 0.667615685393949, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.7614903749137285, 2.0900407195022, 0, 0, 0.2670461410731005, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9992453657899444, 2.000754634210059, 0, 1, 0.3330817885966477, 0, 0.4998114126047352, 3.467098248764464, 0.6669182114033523, 1, 0.1441584220415006],
[0.7631086465123161, 2.090689164794161, 0, 2, 0.2674010903957358, 0, 0.9566223586359431, 6.635910306791156, 0.536701162353357, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8020667138979812, 2.197021685522365, 0, 1, 0.2674368364910491, 0, 0.4551616429594956, 3.157371151221833, 0.7325631635089509, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.468406444238537, 0.6666666666666667, 1, 0.1441584220415006],
[0.8027937944115799, 2.197206205588423, 1, 0, 0.2675979314705264, 1.245649887880568, 0, -8.640840196779953, 1, 0.2675979314705264, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.468406444238537, 0.6666666666666667, 1, 0.1441584220415006],
[0.7614903749137285, 2.0900407195022, 0, 0, 0.2670461410731005, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.468406444238537, 0.6666666666666667, 1, 0.1441584220415006],
[0.7614903749137285, 2.0900407195022, 0, 0, 0.2670461410731005, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745025, 2.000461320252888, 0, 1, 0.2862492415789645, 0, 0.4998846965326904, 3.467606605660422, 0.7137507584210355, 1, 0.1441584220415006],
[0.7614294644113025, 2.090101630004626, 1, 0, 0.2670247804424746, 1.313319285290789, 0, -9.110250144890655, 1, 0.2670247804424746, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.999755644966457, 2.000244355033546, 1, 1, 0.3332518816554852, 1.000244414757519, 0.4999389187043744, -3.470525613197376, 0.8889431833730784, 0.555446946684049, 0.1441584220415006],
[0.8791322720155496, 2.120867727984453, 0, 0, 0.2930440906718496, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.7455350548655711, 1.31847299974313, 0, 0, 0.3612074348260774, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 1.999755697198699, 0, 1, 0.333360480299727, 0, 0.500061083161719, 3.468830166702023, 0.666639519700273, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 1.761490374913729, 0, 0, 0.362123297290595, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.7614903749137285, 1.302517679694974, 0, 0, 0.3689376953803084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 1.935991945391302, 0, 0, 0.3406003894423911, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -6.936812888477075, 1, 0.3333333333333333, 0.1441584220415006],
[1.547818665740074, 1.25446494513443, 0, 0, 0.5523419042004277, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.468406444238537, 0.6666666666666667, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.120867727984453, 0, 0, 0.2744584586536227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9359919453913015, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3187992211152181, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 1.935991945391302, 0, 0, 0.3406003894423911, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9359919453913015, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3187992211152181, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.7455350548655711, 1.31847299974313, 0, 0, 0.3612074348260774, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.120867727984453, 0, 0, 0.2744584586536227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.468406444238537, 0.6666666666666667, 1, 0.1441584220415006],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8674864144640841, 2.132513585535918, 0, 0, 0.2891621381546944, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0.4999999999999994, -3.468406444238537, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9354816139829343, 2.064518386017068, 1, 0, 0.3118272046609778, 1.068968096275426, 0, -7.415231667614184, 1, 0.3118272046609778, 0.1441584220415006],
[0.9995385749660194, 2.000461425033984, 0, 1, 0.3331795249886728, 0, 0.499884670349498, 3.467606424032515, 0.6668204750113272, 1, 0.1441584220415006],
[0.8795935922689747, 2.120406407731028, 0, 1, 0.293197864089658, 0, 0.4716077051804728, 3.271454407601004, 0.706802135910342, 1, 0.1441584220415006],
[0.7614294644113574, 2.090101630004571, 1, 0, 0.2670247804424938, 1.313319285290694, 0, -9.110250144889999, 1, 0.2670247804424939, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 1.935991945391302, 0, 0, 0.3406003894423911, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9359919453913015, 2.064008054608701, 0, 0, 0.3119973151304336, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.802793796641568, 2.197206203358435, 1, 1, 0.2675979322138557, 1.245649884420421, 0.4551234192182316, -5.483734172496775, 0.9283913466748687, 0.4635872111025802, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 1.935991945391302, 0, 0, 0.3406003894423911, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.120867727984453, 0, 0, 0.2744584586536227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.468406444238537, 0.6666666666666667, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9334408777975999, 2.066559122202403, 1, 1, 0.3111469592658663, 1.071305128996967, 0.4838961485574464, -4.074746186320049, 0.9031875697396053, 0.5254814882713379, 0.1441584220415006],
[0.2544649451344296, 2.745535054865573, 0, 0, 0.08482164837814314, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8027937966415735, 2.000000000000002, 1, 0, 0.2864262785237767, 1.245649884420412, 0, -8.640840172777503, 1, 0.2864262785237767, 0.1441584220415006],
[0.9354816139829409, 2.064518386017062, 1, 0, 0.31182720466098, 1.068968096275418, 0, -7.415231667614131, 1, 0.31182720466098, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.120867727984453, 0, 0, 0.2744584586536227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999989, 6.936812888477075, 0.4444444444444445, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.121161448895602, 0, 1, 0.2744308835882802, 0, 0.4714398333614148, 3.270289912202951, 0.7255691164117197, 1, 0.1441584220415006],
[0.9359919453913015, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3187992211152181, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9359919453913015, 2.064008054608701, 0, 0, 0.3119973151304336, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.003352756632966099, 2.996647243367036, 0, 1, 0.001117585544322032, 0, 0.3337062786463978, 2.314858014680057, 0.9988824144556779, 1, 0.1441584220415006],
[0.7455350548655711, 2.015955320048159, 0, 0, 0.2699756123136449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.547818665740074, 1.25446494513443, 0, 0, 0.5523419042004277, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 1.999755697198699, 0, 1, 0.333360480299727, 0, 0.500061083161719, 3.468830166702023, 0.666639519700273, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -6.936812888477075, 1, 0.3333333333333333, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 1.761490374913729, 0, 0, 0.362123297290595, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.468406444238537, 0.6666666666666667, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -6.936812888477075, 1, 0.3333333333333333, 0.1441584220415006],
[0.9354816139829339, 2.064518386017068, 1, 0, 0.3118272046609777, 1.068968096275426, 0, -7.415231667614187, 1, 0.3118272046609778, 0.1441584220415006],
[1.547818665740074, 1.25446494513443, 0, 0, 0.5523419042004277, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.7455350548655711, 2.015955320048159, 0, 0, 0.2699756123136449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9359919453913015, 2.064008054608701, 0, 1, 0.3119973151304336, 0, 0.4844942333277775, 3.36084584214095, 0.6880026848695664, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8027937944115864, 2.000000000000002, 1, 0, 0.286426277956036, 1.245649887880558, 0, -8.640840196779884, 1, 0.286426277956036, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 1.761490374913729, 0, 0, 0.362123297290595, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999989, 6.936812888477075, 0.4444444444444445, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9354816139829409, 2.064518386017062, 1, 0, 0.31182720466098, 1.068968096275418, 0, -7.415231667614131, 1, 0.31182720466098, 0.1441584220415006],
[0.8674864144640841, 2.132513585535918, 0, 0, 0.2891621381546944, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.7455350548655711, 1.31847299974313, 0, 0, 0.3612074348260774, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9971544783957821, 2.002845521604221, 0, 1, 0.332384826131927, 0, 0.49928963028513, 3.463478742444847, 0.667615173868073, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.468406444238537, 0.6666666666666667, 1, 0.1441584220415006],
[0.7455959521158316, 1.318412102492869, 1, 0, 0.3612369391926541, 1.341208998201006, 0, -9.303715864862177, 1, 0.3612369391926541, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999989, 6.936812888477075, 0.4444444444444445, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.996182396726767, 2.003817603273236, 1, 1, 0.3320607989089219, 1.003832233219315, 0.4990474174727779, -3.501597815778106, 0.8897356258279685, 0.5538572236458124, 0.1441584220415006],
[0.9359919453913015, 2.064008054608701, 0, 0, 0.3119973151304336, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9971544783957821, 2.002845521604221, 0, 1, 0.332384826131927, 0, 0.49928963028513, 3.463478742444847, 0.667615173868073, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8791322720155496, 2.120867727984453, 0, 0, 0.2930440906718496, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.468406444238537, 0.6666666666666667, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.468406444238537, 0.6666666666666667, 1, 0.1441584220415006],
[1.549299797173147, 1.253738229252656, 1, 0, 0.552721647928795, 0.6454528696283318, 0, -4.47738578494233, 1, 0.552721647928795, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0, 1.477019250172547, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.563773985788232, 1.359377353070725, 0, 0, 0.5349616918563805, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9359919453913015, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3187992211152181, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -6.936812888477075, 1, 0.3333333333333333, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.2544649451344296, 2.745535054865573, 0, 0, 0.08482164837814314, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 1.761490374913729, 0, 0, 0.362123297290595, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9354816139829409, 2.064518386017062, 1, 0, 0.31182720466098, 1.068968096275418, 0, -7.415231667614131, 1, 0.31182720466098, 0.1441584220415006],
[0.8641780710099273, 2.135821928990076, 0, 1, 0.2880593570033088, 0, 0.4682038265581675, 3.247842338502985, 0.7119406429966912, 1, 0.1441584220415006],
[0, 1.477019250172547, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9995109322134751, 2.000489067786528, 0, 2, 0.3331703107378247, 0, 0.999755525888942, 6.935117017312597, 0.4446618344814893, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.0640080546087, 1.000000000000001, 0, 0, 0.5155057666722221, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8030380264246382, 2.196961973575365, 0, 1, 0.2676793421415458, 0, 0.4551740139464439, 3.157456966443539, 0.7323206578584542, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9971544783957448, 2.002845521604258, 0, 1, 0.3323848261319146, 0, 0.4992896302851208, 3.463478742444783, 0.6676151738680854, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9354815000157914, 2.064518499984211, 1, 0, 0.3118271666719302, 1.068968226504874, 0, -7.4152325709915, 1, 0.3118271666719302, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9359919453913015, 2.064008054608701, 0, 0, 0.3119973151304336, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.999245197265704, 2.0007548027343, 0, 1, 0.333081732421901, 0, 0.4998113705054542, 3.467097956729629, 0.666918267578099, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999989, 6.936812888477075, 0.4444444444444445, 1, 0.1441584220415006],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.7618949338525427, 2.090202827234563, 0, 1, 0.267134929330802, 0, 0.4784224702839232, 3.318727158002562, 0.7328650706691979, 1, 0.1441584220415006],
[0.9359919453913015, 2.000488822130916, 0, 2, 0.3187461521095148, 0, 0.9997556486567142, 6.935117868929661, 0.4641068052655924, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8027937944123663, 2.000000000000002, 1, 0, 0.2864262779562345, 1.245649887879347, 0, -8.640840196771489, 1, 0.2864262779562345, 0.1441584220415006],
[0.7455350548655711, 2.015955320048159, 0, 0, 0.2699756123136449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.935991945391302, 1.0640080546087, 0, 0, 0.6453306484637669, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.7455350548655711, 1.31847299974313, 0, 0, 0.3612074348260774, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9354815000157918, 2.064518499984211, 1, 0, 0.3118271666719304, 1.068968226504874, 0, -7.415232570991498, 1, 0.3118271666719303, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9347536441275709, 2.064334984004375, 1, 1, 0.3116792332708769, 1.06980059000821, 0.4844175038201459, -4.060692936965856, 0.9028560555476783, 0.5262145220894321, 0.1441584220415006],
[0.2568519485199187, 2.743148051480084, 1, 0, 0.08561731617330613, 3.893293415768854, 0, -27.00704794512835, 1, 0.08561731617330615, 0.1441584220415006],
[1.935991945391302, 1.0640080546087, 0, 0, 0.6453306484637669, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.99943321001356, 1.76240090137472, 0, 1, 0.3618730052947239, 0, 0.5674077896918761, 3.9360016685569, 0.6381269947052761, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9992453657905255, 2.000754634209478, 0, 1, 0.3330817885968415, 0, 0.4998114126048805, 3.467098248765472, 0.6669182114031585, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.468406444238537, 0.6666666666666667, 1, 0.1441584220415006],
[0.7455350548655711, 1.31847299974313, 0, 0, 0.3612074348260774, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -6.936812888477075, 1, 0.3333333333333333, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 1.76239994460859, 1, 0, 0.3620040617042848, 0.9999999999999989, 0, -6.936812888477075, 1, 0.3620040617042848, 0.1441584220415006],
[0.8800546507142166, 2.119945349285786, 1, 1, 0.293351550238072, 1.136293069059337, 0.4717102732562904, -4.610086503386706, 0.9139448679729201, 0.5006479684490638, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0.4999999999999994, -3.468406444238537, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.468406444238537, 0.6666666666666667, 1, 0.1441584220415006],
[1.547818665740074, 1.25446494513443, 0, 0, 0.5523419042004277, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.007164815042616352, 2.992835184957385, 0, 2, 0.002388271680872116, 0, 0.6682626594516189, 4.635613028971961, 0.9952291604798775, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.120867727984453, 0, 0, 0.2744584586536227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.468406444238537, 0.6666666666666667, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 1.935991945391302, 0, 0, 0.3406003894423911, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.547818665740074, 1.25446494513443, 0, 0, 0.5523419042004277, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.7455350548655711, 2.105996039550357, 0, 0, 0.2614507891306292, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.7455350548655711, 2.015955320048159, 0, 0, 0.2699756123136449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.547818665740074, 1.25446494513443, 0, 0, 0.5523419042004277, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.925284919671749, 1.074715080328253, 1, 0, 0.6417616398905827, 0.5194036424336065, 0, -3.603005881155383, 1, 0.6417616398905827, 0.1441584220415006],
[0.7455350548655711, 1.31847299974313, 0, 0, 0.3612074348260774, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 1, 0.2674278702915006, 0, 0.4550177652349004, 3.156373098367496, 0.7325721297084995, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.003816736366051317, 2.99618326363395, 0, 1, 0.001272245455350438, 0, 0.3337579553752463, 2.315216486478767, 0.9987277545446496, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9994332100135527, 1.762400901374732, 0, 1, 0.3618730052947206, 0, 0.5674077896918722, 3.936001668556873, 0.6381269947052794, 1, 0.1441584220415006],
[0.99773464827506, 2.001384851894629, 0, 1, 0.3326758564367337, 0, 0.4996540265873107, 3.466006491410328, 0.6673241435632663, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.2534937195244391, 2.746506280475564, 0, 1, 0.0844979065081463, 0, 0.3640989307429684, 2.525686155458548, 0.9155020934918537, 1, 0.1441584220415006],
[1.563773985788232, 1.359377353070725, 0, 0, 0.5349616918563805, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.547879562990405, 1.254865368137519, 1, 0, 0.5522727187191748, 0.646045095438862, 0, -4.481493944577704, 1, 0.5522727187191748, 0.1441584220415006],
[1.547818665740074, 1.25446494513443, 0, 0, 0.5523419042004277, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.7455350548655711, 2.015955320048159, 0, 0, 0.2699756123136449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8027937944115807, 2.197206205588422, 1, 0, 0.2675979314705266, 1.245649887880566, 0, -8.640840196779946, 1, 0.2675979314705266, 0.1441584220415006],
[0.7455350548655711, 2.015955320048159, 0, 0, 0.2699756123136449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8515919916662579, 2.000505769421504, 1, 0, 0.2985844325832187, 1.174271258755453, 0, -8.145700002303034, 1, 0.2985844325832187, 0.1441584220415006],
[0.7455350548655711, 1.31847299974313, 0, 0, 0.3612074348260774, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9354816139829409, 2.000461322011607, 1, 0, 0.318630720820208, 1.068968096275418, 0, -7.415231667614131, 1, 0.318630720820208, 0.1441584220415006],
[1.002090887396355, 1.933390726586194, 0, 1, 0.3413718834494162, 0, 0.5172260248530876, 3.587900155456666, 0.6586281165505838, 1, 0.1441584220415006],
[0.9992459668119048, 2.000460954595993, 1, 1, 0.3331145318499694, 1.000754602183185, 0.4998847879047742, -3.474440183135603, 0.8890347086703757, 0.5552637723703145, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9354816139825479, 2.064518386017455, 1, 0, 0.311827204660849, 1.068968096275867, 0, -7.415231667617246, 1, 0.311827204660849, 0.1441584220415006],
[0.7455350548655711, 1.31847299974313, 0, 0, 0.3612074348260774, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006]
],
"RESOLVED": [
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8515310944159269, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2986224123887183, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.7455350548655711, 2.105996039550357, 0, 0, 0.2614507891306292, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.007390779664769667, 2.992609220335232, 0, 1, 0.002463593221589888, 0, 0.3341565591674479, 2.317981526401907, 0.9975364067784102, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.468406444238537, 0.6666666666666667, 1, 0.1441584220415006],
[0.9354816139829409, 2.064518386017062, 1, 0, 0.31182720466098, 1.068968096275418, 0, -7.415231667614131, 1, 0.31182720466098, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.7455350548655711, 2.105996039550357, 0, 0, 0.2614507891306292, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9995385793568302, 2.000461420643173, 0, 1, 0.3331795264522763, 0, 0.4998846714466943, 3.467606431643561, 0.6668204735477237, 1, 0.1441584220415006],
[0.7614903749137285, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2757534054188103, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.995469879964165, 2.004530120035838, 0, 4, 0.331823293321388, 0, 1.99548011776869, 13.84227219963762, 0.1993266310247577, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.120867727984453, 0, 0, 0.2744584586536227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.003352243618334476, 2.996647756381667, 0, 1, 0.001117414539444825, 0, 0.3337062215171596, 2.314857618385221, 0.9988825854605552, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.7455350548655711, 1.31847299974313, 0, 0, 0.3612074348260774, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.002089223324645, 1.997156743055005, 0, 1, 0.3341137187672051, 0, 0.5007118261886259, 3.473344249318157, 0.6658862812327949, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.120867727984453, 0, 0, 0.2744584586536227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9354816139829409, 2.064518386017062, 1, 0, 0.31182720466098, 1.068968096275418, 0, -7.415231667614131, 1, 0.31182720466098, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0, 1.477019250172547, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9354815000157914, 2.064518499984211, 1, 0, 0.3118271666719302, 1.068968226504874, 0, -7.4152325709915, 1, 0.3118271666719302, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9359919453913015, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3187992211152181, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.120867727984453, 0, 0, 0.2744584586536227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8515310944159269, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2986224123887183, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9354816139829343, 2.000461322011613, 1, 0, 0.3186307208202059, 1.068968096275426, 0, -7.415231667614184, 1, 0.3186307208202059, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.468406444238537, 0.6666666666666667, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.7455350548655711, 2.015955320048159, 0, 0, 0.2699756123136449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9347533434303312, 2.064334917966598, 1, 1, 0.311679171120805, 1.069800934148284, 0.4844175193165921, -4.060695216705207, 0.902856094289448, 0.5262144365310579, 0.1441584220415006],
[0.003354916511534576, 2.996645083488467, 0, 1, 0.001118305503844858, 0, 0.3337065191703903, 2.314859683149988, 0.9988816944961552, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9354815000161648, 2.064518499983838, 1, 0, 0.3118271666720547, 1.068968226504448, 0, -7.41523257098854, 1, 0.3118271666720547, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.468406444238537, 0.6666666666666667, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.000000000000002, 0, 0, 0.286296364779486, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.7455350548655711, 2.015955320048159, 0, 0, 0.2699756123136449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.547818665740074, 1.25446494513443, 0, 0, 0.5523419042004277, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -6.936812888477075, 1, 0.3333333333333333, 0.1441584220415006],
[0.8791322720155496, 2.120867727984453, 0, 0, 0.2930440906718496, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9992453657905255, 2.000461322011607, 0, 1, 0.3331143574316149, 0, 0.4998846960932133, 3.467606602611851, 0.6668856425683851, 1, 0.1441584220415006],
[0.7618949338530157, 2.090202827234753, 0, 1, 0.2671349293309058, 0, 0.4784224702838797, 3.318727158002261, 0.7328650706690942, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9359919453913015, 2.064008054608701, 0, 0, 0.3119973151304336, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.563773985788232, 1.359377353070725, 0, 0, 0.5349616918563805, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -6.936812888477075, 1, 0.3333333333333333, 0.1441584220415006],
[0.7616459485781205, 1.305931709994483, 0, 1, 0.3683759811488479, 0, 0.7657368240213912, 5.311773070053094, 0.6316240188511522, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.468406444238537, 0.6666666666666667, 1, 0.1441584220415006],
[0.9992452044489047, 2.000754795551098, 0, 1, 0.3330817348163012, 0, 0.4998113722998998, 3.467097969177362, 0.6669182651836988, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.7455350548655711, 1.31847299974313, 0, 0, 0.3612074348260774, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.999755697198886, 2.000244302801117, 1, 1, 0.3332518990662949, 1.000244362499557, 0.4999389317592918, -3.470525160134152, 0.888943171768708, 0.5554469699012978, 0.1441584220415006],
[0.8674864144640841, 2.132513585535918, 0, 0, 0.2891621381546944, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.468406444238537, 0.6666666666666667, 1, 0.1441584220415006],
[0.8791322720155496, 2.120867727984453, 0, 0, 0.2930440906718496, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 1.761490374913729, 0, 0, 0.362123297290595, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.7500821092571391, 1.317501048591028, 0, 1, 0.3627820754923277, 0, 0.7590126786384173, 5.265128931696487, 0.6372179245076723, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.120867727984453, 0, 0, 0.2744584586536227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9971529438181542, 2.002847056181849, 0, 1, 0.3323843146060511, 0, 0.4992892477303593, 3.463476088733983, 0.667615685393949, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.7614903749137285, 2.0900407195022, 0, 0, 0.2670461410731005, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9992453657899444, 2.000754634210059, 0, 1, 0.3330817885966477, 0, 0.4998114126047352, 3.467098248764464, 0.6669182114033523, 1, 0.1441584220415006],
[0.7631086465123161, 2.090689164794161, 0, 2, 0.2674010903957358, 0, 0.9566223586359431, 6.635910306791156, 0.536701162353357, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8020667138979812, 2.197021685522365, 0, 1, 0.2674368364910491, 0, 0.4551616429594956, 3.157371151221833, 0.7325631635089509, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.468406444238537, 0.6666666666666667, 1, 0.1441584220415006],
[0.8027937944115799, 2.197206205588423, 1, 0, 0.2675979314705264, 1.245649887880568, 0, -8.640840196779953, 1, 0.2675979314705264, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.468406444238537, 0.6666666666666667, 1, 0.1441584220415006],
[0.7614903749137285, 2.0900407195022, 0, 0, 0.2670461410731005, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.468406444238537, 0.6666666666666667, 1, 0.1441584220415006],
[0.7614903749137285, 2.0900407195022, 0, 0, 0.2670461410731005, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745025, 2.000461320252888, 0, 1, 0.2862492415789645, 0, 0.4998846965326904, 3.467606605660422, 0.7137507584210355, 1, 0.1441584220415006],
[0.7614294644113025, 2.090101630004626, 1, 0, 0.2670247804424746, 1.313319285290789, 0, -9.110250144890655, 1, 0.2670247804424746, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.999755644966457, 2.000244355033546, 1, 1, 0.3332518816554852, 1.000244414757519, 0.4999389187043744, -3.470525613197376, 0.8889431833730784, 0.555446946684049, 0.1441584220415006],
[0.8791322720155496, 2.120867727984453, 0, 0, 0.2930440906718496, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.7455350548655711, 1.31847299974313, 0, 0, 0.3612074348260774, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 1.999755697198699, 0, 1, 0.333360480299727, 0, 0.500061083161719, 3.468830166702023, 0.666639519700273, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 1.761490374913729, 0, 0, 0.362123297290595, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.7614903749137285, 1.302517679694974, 0, 0, 0.3689376953803084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 1.935991945391302, 0, 0, 0.3406003894423911, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -6.936812888477075, 1, 0.3333333333333333, 0.1441584220415006],
[1.547818665740074, 1.25446494513443, 0, 0, 0.5523419042004277, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.468406444238537, 0.6666666666666667, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.120867727984453, 0, 0, 0.2744584586536227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9359919453913015, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3187992211152181, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 1.935991945391302, 0, 0, 0.3406003894423911, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9359919453913015, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3187992211152181, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.7455350548655711, 1.31847299974313, 0, 0, 0.3612074348260774, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.120867727984453, 0, 0, 0.2744584586536227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.468406444238537, 0.6666666666666667, 1, 0.1441584220415006],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8674864144640841, 2.132513585535918, 0, 0, 0.2891621381546944, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0.4999999999999994, -3.468406444238537, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9354816139829343, 2.064518386017068, 1, 0, 0.3118272046609778, 1.068968096275426, 0, -7.415231667614184, 1, 0.3118272046609778, 0.1441584220415006],
[0.9995385749660194, 2.000461425033984, 0, 1, 0.3331795249886728, 0, 0.499884670349498, 3.467606424032515, 0.6668204750113272, 1, 0.1441584220415006],
[0.8795935922689747, 2.120406407731028, 0, 1, 0.293197864089658, 0, 0.4716077051804728, 3.271454407601004, 0.706802135910342, 1, 0.1441584220415006],
[0.7614294644113574, 2.090101630004571, 1, 0, 0.2670247804424938, 1.313319285290694, 0, -9.110250144889999, 1, 0.2670247804424939, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 1.935991945391302, 0, 0, 0.3406003894423911, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9359919453913015, 2.064008054608701, 0, 0, 0.3119973151304336, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.802793796641568, 2.197206203358435, 1, 1, 0.2675979322138557, 1.245649884420421, 0.4551234192182316, -5.483734172496775, 0.9283913466748687, 0.4635872111025802, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 1.935991945391302, 0, 0, 0.3406003894423911, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.120867727984453, 0, 0, 0.2744584586536227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.468406444238537, 0.6666666666666667, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9334408777975999, 2.066559122202403, 1, 1, 0.3111469592658663, 1.071305128996967, 0.4838961485574464, -4.074746186320049, 0.9031875697396053, 0.5254814882713379, 0.1441584220415006],
[0.2544649451344296, 2.745535054865573, 0, 0, 0.08482164837814314, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8027937966415735, 2.000000000000002, 1, 0, 0.2864262785237767, 1.245649884420412, 0, -8.640840172777503, 1, 0.2864262785237767, 0.1441584220415006],
[0.9354816139829409, 2.064518386017062, 1, 0, 0.31182720466098, 1.068968096275418, 0, -7.415231667614131, 1, 0.31182720466098, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.120867727984453, 0, 0, 0.2744584586536227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999989, 6.936812888477075, 0.4444444444444445, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.121161448895602, 0, 1, 0.2744308835882802, 0, 0.4714398333614148, 3.270289912202951, 0.7255691164117197, 1, 0.1441584220415006],
[0.9359919453913015, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3187992211152181, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9359919453913015, 2.064008054608701, 0, 0, 0.3119973151304336, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.003352756632966099, 2.996647243367036, 0, 1, 0.001117585544322032, 0, 0.3337062786463978, 2.314858014680057, 0.9988824144556779, 1, 0.1441584220415006],
[0.7455350548655711, 2.015955320048159, 0, 0, 0.2699756123136449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.547818665740074, 1.25446494513443, 0, 0, 0.5523419042004277, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 1.999755697198699, 0, 1, 0.333360480299727, 0, 0.500061083161719, 3.468830166702023, 0.666639519700273, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -6.936812888477075, 1, 0.3333333333333333, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 1.761490374913729, 0, 0, 0.362123297290595, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.468406444238537, 0.6666666666666667, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -6.936812888477075, 1, 0.3333333333333333, 0.1441584220415006],
[0.9354816139829339, 2.064518386017068, 1, 0, 0.3118272046609777, 1.068968096275426, 0, -7.415231667614187, 1, 0.3118272046609778, 0.1441584220415006],
[1.547818665740074, 1.25446494513443, 0, 0, 0.5523419042004277, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.7455350548655711, 2.015955320048159, 0, 0, 0.2699756123136449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9359919453913015, 2.064008054608701, 0, 1, 0.3119973151304336, 0, 0.4844942333277775, 3.36084584214095, 0.6880026848695664, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8027937944115864, 2.000000000000002, 1, 0, 0.286426277956036, 1.245649887880558, 0, -8.640840196779884, 1, 0.286426277956036, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 1.761490374913729, 0, 0, 0.362123297290595, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999989, 6.936812888477075, 0.4444444444444445, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9354816139829409, 2.064518386017062, 1, 0, 0.31182720466098, 1.068968096275418, 0, -7.415231667614131, 1, 0.31182720466098, 0.1441584220415006],
[0.8674864144640841, 2.132513585535918, 0, 0, 0.2891621381546944, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.7455350548655711, 1.31847299974313, 0, 0, 0.3612074348260774, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9971544783957821, 2.002845521604221, 0, 1, 0.332384826131927, 0, 0.49928963028513, 3.463478742444847, 0.667615173868073, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.468406444238537, 0.6666666666666667, 1, 0.1441584220415006],
[0.7455959521158316, 1.318412102492869, 1, 0, 0.3612369391926541, 1.341208998201006, 0, -9.303715864862177, 1, 0.3612369391926541, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999989, 6.936812888477075, 0.4444444444444445, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.996182396726767, 2.003817603273236, 1, 1, 0.3320607989089219, 1.003832233219315, 0.4990474174727779, -3.501597815778106, 0.8897356258279685, 0.5538572236458124, 0.1441584220415006],
[0.9359919453913015, 2.064008054608701, 0, 0, 0.3119973151304336, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9971544783957821, 2.002845521604221, 0, 1, 0.332384826131927, 0, 0.49928963028513, 3.463478742444847, 0.667615173868073, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8791322720155496, 2.120867727984453, 0, 0, 0.2930440906718496, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.468406444238537, 0.6666666666666667, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.468406444238537, 0.6666666666666667, 1, 0.1441584220415006],
[1.549299797173147, 1.253738229252656, 1, 0, 0.552721647928795, 0.6454528696283318, 0, -4.47738578494233, 1, 0.552721647928795, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0, 1.477019250172547, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.563773985788232, 1.359377353070725, 0, 0, 0.5349616918563805, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9359919453913015, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3187992211152181, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -6.936812888477075, 1, 0.3333333333333333, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.2544649451344296, 2.745535054865573, 0, 0, 0.08482164837814314, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 1.761490374913729, 0, 0, 0.362123297290595, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9354816139829409, 2.064518386017062, 1, 0, 0.31182720466098, 1.068968096275418, 0, -7.415231667614131, 1, 0.31182720466098, 0.1441584220415006],
[0.8641780710099273, 2.135821928990076, 0, 1, 0.2880593570033088, 0, 0.4682038265581675, 3.247842338502985, 0.7119406429966912, 1, 0.1441584220415006],
[0, 1.477019250172547, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9995109322134751, 2.000489067786528, 0, 2, 0.3331703107378247, 0, 0.999755525888942, 6.935117017312597, 0.4446618344814893, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.0640080546087, 1.000000000000001, 0, 0, 0.5155057666722221, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8030380264246382, 2.196961973575365, 0, 1, 0.2676793421415458, 0, 0.4551740139464439, 3.157456966443539, 0.7323206578584542, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9971544783957448, 2.002845521604258, 0, 1, 0.3323848261319146, 0, 0.4992896302851208, 3.463478742444783, 0.6676151738680854, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9354815000157914, 2.064518499984211, 1, 0, 0.3118271666719302, 1.068968226504874, 0, -7.4152325709915, 1, 0.3118271666719302, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9359919453913015, 2.064008054608701, 0, 0, 0.3119973151304336, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.999245197265704, 2.0007548027343, 0, 1, 0.333081732421901, 0, 0.4998113705054542, 3.467097956729629, 0.666918267578099, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999989, 6.936812888477075, 0.4444444444444445, 1, 0.1441584220415006],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.7618949338525427, 2.090202827234563, 0, 1, 0.267134929330802, 0, 0.4784224702839232, 3.318727158002562, 0.7328650706691979, 1, 0.1441584220415006],
[0.9359919453913015, 2.000488822130916, 0, 2, 0.3187461521095148, 0, 0.9997556486567142, 6.935117868929661, 0.4641068052655924, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8027937944123663, 2.000000000000002, 1, 0, 0.2864262779562345, 1.245649887879347, 0, -8.640840196771489, 1, 0.2864262779562345, 0.1441584220415006],
[0.7455350548655711, 2.015955320048159, 0, 0, 0.2699756123136449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.935991945391302, 1.0640080546087, 0, 0, 0.6453306484637669, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.7455350548655711, 1.31847299974313, 0, 0, 0.3612074348260774, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9354815000157918, 2.064518499984211, 1, 0, 0.3118271666719304, 1.068968226504874, 0, -7.415232570991498, 1, 0.3118271666719303, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9347536441275709, 2.064334984004375, 1, 1, 0.3116792332708769, 1.06980059000821, 0.4844175038201459, -4.060692936965856, 0.9028560555476783, 0.5262145220894321, 0.1441584220415006],
[0.2568519485199187, 2.743148051480084, 1, 0, 0.08561731617330613, 3.893293415768854, 0, -27.00704794512835, 1, 0.08561731617330615, 0.1441584220415006],
[1.935991945391302, 1.0640080546087, 0, 0, 0.6453306484637669, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.99943321001356, 1.76240090137472, 0, 1, 0.3618730052947239, 0, 0.5674077896918761, 3.9360016685569, 0.6381269947052761, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9992453657905255, 2.000754634209478, 0, 1, 0.3330817885968415, 0, 0.4998114126048805, 3.467098248765472, 0.6669182114031585, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.468406444238537, 0.6666666666666667, 1, 0.1441584220415006],
[0.7455350548655711, 1.31847299974313, 0, 0, 0.3612074348260774, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -6.936812888477075, 1, 0.3333333333333333, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 1.76239994460859, 1, 0, 0.3620040617042848, 0.9999999999999989, 0, -6.936812888477075, 1, 0.3620040617042848, 0.1441584220415006],
[0.8800546507142166, 2.119945349285786, 1, 1, 0.293351550238072, 1.136293069059337, 0.4717102732562904, -4.610086503386706, 0.9139448679729201, 0.5006479684490638, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0.4999999999999994, -3.468406444238537, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.468406444238537, 0.6666666666666667, 1, 0.1441584220415006],
[1.547818665740074, 1.25446494513443, 0, 0, 0.5523419042004277, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.007164815042616352, 2.992835184957385, 0, 2, 0.002388271680872116, 0, 0.6682626594516189, 4.635613028971961, 0.9952291604798775, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.120867727984453, 0, 0, 0.2744584586536227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.468406444238537, 0.6666666666666667, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 1.935991945391302, 0, 0, 0.3406003894423911, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.547818665740074, 1.25446494513443, 0, 0, 0.5523419042004277, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.7455350548655711, 2.105996039550357, 0, 0, 0.2614507891306292, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.7455350548655711, 2.015955320048159, 0, 0, 0.2699756123136449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.547818665740074, 1.25446494513443, 0, 0, 0.5523419042004277, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.925284919671749, 1.074715080328253, 1, 0, 0.6417616398905827, 0.5194036424336065, 0, -3.603005881155383, 1, 0.6417616398905827, 0.1441584220415006],
[0.7455350548655711, 1.31847299974313, 0, 0, 0.3612074348260774, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 1, 0.2674278702915006, 0, 0.4550177652349004, 3.156373098367496, 0.7325721297084995, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.003816736366051317, 2.99618326363395, 0, 1, 0.001272245455350438, 0, 0.3337579553752463, 2.315216486478767, 0.9987277545446496, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9994332100135527, 1.762400901374732, 0, 1, 0.3618730052947206, 0, 0.5674077896918722, 3.936001668556873, 0.6381269947052794, 1, 0.1441584220415006],
[0.99773464827506, 2.001384851894629, 0, 1, 0.3326758564367337, 0, 0.4996540265873107, 3.466006491410328, 0.6673241435632663, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.2534937195244391, 2.746506280475564, 0, 1, 0.0844979065081463, 0, 0.3640989307429684, 2.525686155458548, 0.9155020934918537, 1, 0.1441584220415006],
[1.563773985788232, 1.359377353070725, 0, 0, 0.5349616918563805, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.547879562990405, 1.254865368137519, 1, 0, 0.5522727187191748, 0.646045095438862, 0, -4.481493944577704, 1, 0.5522727187191748, 0.1441584220415006],
[1.547818665740074, 1.25446494513443, 0, 0, 0.5523419042004277, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.7455350548655711, 2.015955320048159, 0, 0, 0.2699756123136449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8027937944115807, 2.197206205588422, 1, 0, 0.2675979314705266, 1.245649887880566, 0, -8.640840196779946, 1, 0.2675979314705266, 0.1441584220415006],
[0.7455350548655711, 2.015955320048159, 0, 0, 0.2699756123136449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8022836108745024, 2.1977163891255, 0, 0, 0.2674278702915006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.8515919916662579, 2.000505769421504, 1, 0, 0.2985844325832187, 1.174271258755453, 0, -8.145700002303034, 1, 0.2985844325832187, 0.1441584220415006],
[0.7455350548655711, 1.31847299974313, 0, 0, 0.3612074348260774, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9354816139829409, 2.000461322011607, 1, 0, 0.318630720820208, 1.068968096275418, 0, -7.415231667614131, 1, 0.318630720820208, 0.1441584220415006],
[1.002090887396355, 1.933390726586194, 0, 1, 0.3413718834494162, 0, 0.5172260248530876, 3.587900155456666, 0.6586281165505838, 1, 0.1441584220415006],
[0.9992459668119048, 2.000460954595993, 1, 1, 0.3331145318499694, 1.000754602183185, 0.4998847879047742, -3.474440183135603, 0.8890347086703757, 0.5552637723703145, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006],
[0.9354816139825479, 2.064518386017455, 1, 0, 0.311827204660849, 1.068968096275867, 0, -7.415231667617246, 1, 0.311827204660849, 0.1441584220415006],
[0.7455350548655711, 1.31847299974313, 0, 0, 0.3612074348260774, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1441584220415006]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node100":{
"Global MG94xREV":0.001100284720104089,
"Nucleotide GTR":0.001090035212989633,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node103":{
"Global MG94xREV":0.001099660483203457,
"Nucleotide GTR":0.001089416791057107,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGT", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node106":{
"Global MG94xREV":0.001099325022582891,
"Nucleotide GTR":0.001089084455360438,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTT", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node138":{
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node24":{
"Global MG94xREV":0.001100610519385864,
"Nucleotide GTR":0.001090357977345997,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "V", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GTA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node35":{
"Global MG94xREV":0.00110070507164966,
"Nucleotide GTR":0.001090451648824956,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "I", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "ATC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node58":{
"Global MG94xREV":0.001099639188186163,
"Nucleotide GTR":0.001089395694409769,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node59":{
"Global MG94xREV":0.001100045710974729,
"Nucleotide GTR":0.001089798430307417,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "R", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AGG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node93":{
"Global MG94xREV":0.00110086569360587,
"Nucleotide GTR":0.001090610774535827,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "C", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "TGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414624_Normandie_20200226_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100433579018043,
"Nucleotide GTR":0.001090182685234782,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "I", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ATA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414624_Normandie_20200226_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415454_Switzerland_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100433579003676,
"Nucleotide GTR":0.001090182685220549,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCT", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415454_Switzerland_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00109955719084106,
"Nucleotide GTR":0.001089314460896386,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "I", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATT", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416681_Washington_20200311_null_10783":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416681_Washington_20200311_null_10783",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416720_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100114724123767,
"Nucleotide GTR":0.001089866800576708,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "H", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "CAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416720_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001101727762178896,
"Nucleotide GTR":0.001091464812661995,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "F", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TTC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001101966968408217,
"Nucleotide GTR":0.001091701790608123,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "S", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "AGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417778_Reykjavik_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00109955714844001,
"Nucleotide GTR":0.001089314418890315,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "V", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GTT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417778_Reykjavik_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418021_Portugal_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001101966968360149,
"Nucleotide GTR":0.001091701790560504,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACA", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418021_Portugal_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418082_Washington_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100433579003676,
"Nucleotide GTR":0.001090182685220549,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "V", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GTT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418082_Washington_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418366_Ontario_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100429383770201,
"Nucleotide GTR":0.001090178529067028,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAG", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418366_Ontario_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418844_British_Columbia_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100433579018817,
"Nucleotide GTR":0.00109018268523555,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418844_British_Columbia_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100429385056491,
"Nucleotide GTR":0.001090178530341336,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "D", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "GAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419756_Victoria_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100433579018043,
"Nucleotide GTR":0.001090182685234782,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "L", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CTT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419756_Victoria_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001100668853911073,
"Nucleotide GTR":0.001090415768466286,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "H", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CAC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420195_South_Yorkshire_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001100429385056491,
"Nucleotide GTR":0.001090178530341336,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "V", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "GTT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420195_South_Yorkshire_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420241_South_Yorkshire_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001100433579018817,
"Nucleotide GTR":0.00109018268523555,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "L", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CTT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420241_South_Yorkshire_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420422_Tielt_Winge_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100668853896778,
"Nucleotide GTR":0.001090415768452124,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "D", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GAT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420422_Tielt_Winge_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420510_England_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001100429383770201,
"Nucleotide GTR":0.001090178529067028,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "D", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "GAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420510_England_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420520_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100583125527526,
"Nucleotide GTR":0.001090330838670287,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "A", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "R", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GCT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AGG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420520_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420610_ARA_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00110042938376882,
"Nucleotide GTR":0.001090178529065661,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "D", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "GAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420610_ARA_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421316_Wisconsin_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00110043357985114,
"Nucleotide GTR":0.001090182686060119,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "I", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ATC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421316_Wisconsin_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421432_New_York_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100433579003676,
"Nucleotide GTR":0.001090182685220549,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "F", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "TTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421432_New_York_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421506_Ile_de_France_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100679327699089,
"Nucleotide GTR":0.001090426144687588,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "F", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "TTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421506_Ile_de_France_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421513_Ile_de_France_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100114722428124,
"Nucleotide GTR":0.001089866798896862,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAC", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421513_Ile_de_France_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421515_Comunitat_Valenciana_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100433579003676,
"Nucleotide GTR":0.001090182685220549,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "I", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ATA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421515_Comunitat_Valenciana_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421670_India_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100114724123767,
"Nucleotide GTR":0.001089866800576708,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "CTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421670_India_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421692_Minnesota_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100668853896778,
"Nucleotide GTR":0.001090415768452124,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAA", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421692_Minnesota_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421763_Luxembourg_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100668852907459,
"Nucleotide GTR":0.00109041576747202,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "T", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "ACT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421763_Luxembourg_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421871_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "I", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "ATC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421871_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421918_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001100429385043028,
"Nucleotide GTR":0.001090178530327999,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTG", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421918_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421984_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100433579003676,
"Nucleotide GTR":0.001090182685220549,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "F", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TTT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421984_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422266_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110135652689343,
"Nucleotide GTR":0.001091097035552974,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGT", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422266_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422504_New_York_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100114724123767,
"Nucleotide GTR":0.001089866800576708,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATC", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422504_New_York_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422661_Netherlands_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100433579018043,
"Nucleotide GTR":0.001090182685234782,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGT", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422661_Netherlands_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422800_Netherlands_20200314_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001100433579003676,
"Nucleotide GTR":0.001090182685220549,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTT", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422800_Netherlands_20200314_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422860_Noord_Brabant_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110043357985114,
"Nucleotide GTR":0.001090182686060119,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "V", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GTT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422860_Noord_Brabant_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422914_Zuid_Holland_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110011953098946,
"Nucleotide GTR":0.001089871562664896,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAC", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422914_Zuid_Holland_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422919_Zuid_Holland_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110011953098946,
"Nucleotide GTR":0.001089871562664896,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "T", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ACT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422919_Zuid_Holland_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422923_Zuid_Holland_20200323_null_10":{
"Global MG94xREV":0.001100114722428124,
"Nucleotide GTR":0.001089866798896862,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACC", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422923_Zuid_Holland_20200323_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423084_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001099512289288228,
"Nucleotide GTR":0.001089269977616005,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGC", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423084_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423089_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100114722428124,
"Nucleotide GTR":0.001089866798896862,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCC", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423089_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423288_England_20200326_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001100433579003676,
"Nucleotide GTR":0.001090182685220549,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "S", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "TCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423288_England_20200326_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423389_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100909459601714,
"Nucleotide GTR":0.0010906541328373,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAT", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423389_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423428_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00109955744313813,
"Nucleotide GTR":0.001089314710843229,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "M", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "ATG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423428_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423505_England_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "R", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AGG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423505_England_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423509_England_20200331_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001100433579003676,
"Nucleotide GTR":0.001090182685220549,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "C", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "TGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423509_England_20200331_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423704_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100429383756738,
"Nucleotide GTR":0.001090178529053691,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "V", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "GTG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423704_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423766_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100114722430069,
"Nucleotide GTR":0.001089866798898789,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAC", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423766_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423772_England_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001099388944532437,
"Nucleotide GTR":0.001089147781856405,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "I", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATT", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423772_England_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423958_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100892535498448,
"Nucleotide GTR":0.001090637366387516,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAT", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423958_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424003_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100668853911073,
"Nucleotide GTR":0.001090415768466286,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "R", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "AGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424003_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424129_England_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0010992285608802,
"Nucleotide GTR":0.001088988892229628,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "A", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "GCA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424129_England_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424164_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001099557148941099,
"Nucleotide GTR":0.001089314419386738,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "C", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "TGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424164_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424275_Washington_20200322_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001100433579018043,
"Nucleotide GTR":0.001090182685234782,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "V", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GTT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424275_Washington_20200322_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424297_Washington_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0010992285608802,
"Nucleotide GTR":0.001088988892229628,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "V", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "GTG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424297_Washington_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424470_Reykjavik_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0011006793276998,
"Nucleotide GTR":0.001090426144688292,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "M", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ATG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424470_Reykjavik_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424552_Reykjavik_20200328_null_15":{
"Global MG94xREV":0.001100433579835997,
"Nucleotide GTR":0.001090182686045117,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCT", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424552_Reykjavik_20200328_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001100433579003676,
"Nucleotide GTR":0.001090182685220549,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "I", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ATA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425132_Duesseldorf_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110042938376882,
"Nucleotide GTR":0.001090178529065661,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "C", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TGT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425132_Duesseldorf_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425191_Comunitat_Valenciana_20200316_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001099557174235612,
"Nucleotide GTR":0.001089314444445623,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTT", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425191_Comunitat_Valenciana_20200316_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425196_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110066885391009,
"Nucleotide GTR":0.001090415768465312,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACA", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425196_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425242_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001102134123818939,
"Nucleotide GTR":0.001091867388912271,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "E", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425242_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425319_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100679326910874,
"Nucleotide GTR":0.001090426143906716,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "V", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GTA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425319_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425342_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001099557779273553,
"Nucleotide GTR":0.001089315043847444,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "L", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "TTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425342_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425498_England_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001100119530991111,
"Nucleotide GTR":0.001089871562666531,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "A", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GCT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425498_England_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425564_England_20200325_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0011006793276998,
"Nucleotide GTR":0.001090426144688292,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAT", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425564_England_20200325_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425655_Scotland_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0011006793276998,
"Nucleotide GTR":0.001090426144688292,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "I", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ATT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425655_Scotland_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425777_Scotland_20200313_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0011006793276998,
"Nucleotide GTR":0.001090426144688292,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAT", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425777_Scotland_20200313_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425839_Scotland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100265536322494,
"Nucleotide GTR":0.001090016207911153,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "I", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATT", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425839_Scotland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425878_Scotland_20200321_null_5":{
"Global MG94xREV":0.00110011953097757,
"Nucleotide GTR":0.001089871562653118,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAC", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425878_Scotland_20200321_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425904_Scotland_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001099398615877959,
"Nucleotide GTR":0.001089157363110223,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTT", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425904_Scotland_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425982_Scotland_20200329_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001101690804675641,
"Nucleotide GTR":0.001091428199429805,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "E", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAA", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425982_Scotland_20200329_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426028_New_York_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001100501888675506,
"Nucleotide GTR":0.00109025035856575,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "L", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "CTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426028_New_York_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426465_Virginia_20200331_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001101288427017312,
"Nucleotide GTR":0.001091029570049169,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "F", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "TTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426465_Virginia_20200331_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426475_Virginia_20200404_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0011016605864445,
"Nucleotide GTR":0.001091398262691237,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "V", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "F", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GTA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "TTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426475_Virginia_20200404_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001100429385056491,
"Nucleotide GTR":0.001090178530341336,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "R", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AGG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426534_Arizona_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100433579003676,
"Nucleotide GTR":0.001090182685220549,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGT", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426534_Arizona_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426621_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001099557485046338,
"Nucleotide GTR":0.001089314752361049,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "H", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAT", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426621_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426964_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100114722442164,
"Nucleotide GTR":0.001089866798910771,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAC", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426964_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426989_Victoria_20200328_null_3":{
"Global MG94xREV":0.00110127408291041,
"Nucleotide GTR":0.00109101535956225,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "T", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "C", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "ACA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "TGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426989_Victoria_20200328_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427020_Victoria_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001100433579018043,
"Nucleotide GTR":0.001090182685234782,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTT", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427020_Victoria_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427025_Victoria_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":0.00110043357985114,
"Nucleotide GTR":0.001090182686060119,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "L", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TTA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427025_Victoria_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427051_Victoria_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001101027038125074,
"Nucleotide GTR":0.001090770616078785,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "I", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "ATA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427051_Victoria_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427096_Victoria_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001100679326910874,
"Nucleotide GTR":0.001090426143906716,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "V", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GTT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427096_Victoria_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427132_Victoria_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100114724123767,
"Nucleotide GTR":0.001089866800576708,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "A", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GCT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427132_Victoria_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427149_Victoria_20200408_null_15":{
"Global MG94xREV":0.001100679327699089,
"Nucleotide GTR":0.001090426144687588,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAT", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427149_Victoria_20200408_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427164_Connecticut_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001099228562047962,
"Nucleotide GTR":0.001088988893386511,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "S", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AGT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427164_Connecticut_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427184_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001099388944543565,
"Nucleotide GTR":0.001089147781867429,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "I", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATT", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427184_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427212_Washington_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001100429383770201,
"Nucleotide GTR":0.001090178529067028,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "R", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AGG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427212_Washington_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427259_Washington_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100679326894895,
"Nucleotide GTR":0.001090426143890884,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAT", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427259_Washington_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427274_Minnesota_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001100433579003676,
"Nucleotide GTR":0.001090182685220549,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "V", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GTT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427274_Minnesota_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427453_Wisconsin_20200406_null_20":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427453_Wisconsin_20200406_null_20",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427482_New_York_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001100433579003676,
"Nucleotide GTR":0.001090182685220549,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "L", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CTT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427482_New_York_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427632_New_York_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001100433579003676,
"Nucleotide GTR":0.001090182685220549,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "V", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GTC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427632_New_York_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427779_New_South_Wales_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001100433579018043,
"Nucleotide GTR":0.001090182685234782,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "V", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GTC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427779_New_South_Wales_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427799_New_South_Wales_20200317_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001100433579003676,
"Nucleotide GTR":0.001090182685220549,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAT", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427799_New_South_Wales_20200317_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428258_Wisconsin_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "V", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GTA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428258_Wisconsin_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428299_Wisconsin_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100433579003676,
"Nucleotide GTR":0.001090182685220549,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAT", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428299_Wisconsin_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428333_Wisconsin_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00110066897402743,
"Nucleotide GTR":0.001090415887463722,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "L", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "CTG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428333_Wisconsin_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428335_Wisconsin_20200327_null_11":{
"Global MG94xREV":0.00110043357985114,
"Nucleotide GTR":0.001090182686060119,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "F", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "TTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428335_Wisconsin_20200327_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428354_Ile_De_France_20200325_null_17":{
"Global MG94xREV":0.001100429385043028,
"Nucleotide GTR":0.001090178530327999,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGG", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428354_Ile_De_France_20200325_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428360_Hauts_De_France_20200325_null_21":{
"Global MG94xREV":0.001100433579018817,
"Nucleotide GTR":0.00109018268523555,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAT", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428360_Hauts_De_France_20200325_null_21",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428362_Ile_De_France_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110042938376882,
"Nucleotide GTR":0.001090178529065661,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "M", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATG", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428362_Ile_De_France_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428365_Ile_De_France_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "C", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "TGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428365_Ile_De_France_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428387_Connecticut_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001101251445965167,
"Nucleotide GTR":0.001090992933487455,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "L", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CTA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428387_Connecticut_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428732_Wisconsin_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100668853896778,
"Nucleotide GTR":0.001090415768452124,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "R", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "AGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428732_Wisconsin_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428762_New_York_20200403_null_57":{
"Global MG94xREV":0.00110043357985114,
"Nucleotide GTR":0.001090182686060119,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "V", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GTT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428762_New_York_20200403_null_57",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428777_New_York_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001100668852907459,
"Nucleotide GTR":0.00109041576747202,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "T", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "ACT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428777_New_York_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428779_New_York_20200406_null_116":{
"Global MG94xREV":0.001100603069486589,
"Nucleotide GTR":0.001090350596844938,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "R", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AGG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428779_New_York_20200406_null_116",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428787_New_York_20200406_null_7":{
"Global MG94xREV":0.00110043357985114,
"Nucleotide GTR":0.001090182686060119,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "S", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "TCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428787_New_York_20200406_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428789_New_York_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00110043357985114,
"Nucleotide GTR":0.001090182686060119,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "S", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "TCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428789_New_York_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428852_Moscow_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00110043357985114,
"Nucleotide GTR":0.001090182686060119,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTT", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428852_Moscow_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
]
},
"epi_isl_428864_Moscow_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001100433579003676,
"Nucleotide GTR":0.001090182685220549,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "S", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "TCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428864_Moscow_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428902_Orenburg_Region_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001100433579018043,
"Nucleotide GTR":0.001090182685234782,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "L", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CTC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428902_Orenburg_Region_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429007_California_20200318_null_4":{
"Global MG94xREV":0.00110043357985114,
"Nucleotide GTR":0.001090182686060119,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "V", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GTA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429007_California_20200318_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429026_California_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001100114722428124,
"Nucleotide GTR":0.001089866798896862,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGC", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429026_California_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429159_Ostergotland_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100114722428124,
"Nucleotide GTR":0.001089866798896862,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "S", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TCT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429159_Ostergotland_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429273_Unknown_20200310_null_125":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "S", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "AGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429273_Unknown_20200310_null_125",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429309_Unknown_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001100668852907459,
"Nucleotide GTR":0.00109041576747202,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAA", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429309_Unknown_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429315_Unknown_20200318_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGT", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429315_Unknown_20200318_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429484_Unknown_20200324_null_13":{
"Global MG94xREV":0.00110066885290844,
"Nucleotide GTR":0.001090415767472994,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "S", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "AGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429484_Unknown_20200324_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429518_Unknown_20200311_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTT", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429518_Unknown_20200311_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429585_Unknown_20200326_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001100433579003676,
"Nucleotide GTR":0.001090182685220549,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAT", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429585_Unknown_20200326_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429638_Washington_20200407_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001100429385043028,
"Nucleotide GTR":0.001090178530327999,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACG", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429638_Washington_20200407_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429663_Istria_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001100668853896778,
"Nucleotide GTR":0.001090415768452124,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "I", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "ATT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429663_Istria_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429699_Minas_gerais_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001101967277403315,
"Nucleotide GTR":0.001091702096724833,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "E", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAA", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429699_Minas_gerais_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429705_Istria_20200301_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001100433579003676,
"Nucleotide GTR":0.001090182685220549,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTT", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429705_Istria_20200301_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429781_Luxembourg_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001101727781672833,
"Nucleotide GTR":0.001091464831974341,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTT", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429781_Luxembourg_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429791_Luxembourg_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001101727676963357,
"Nucleotide GTR":0.001091464728240267,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATT", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429791_Luxembourg_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429815_NL_20200315_null_20":{
"Global MG94xREV":0.001100114724123767,
"Nucleotide GTR":0.001089866800576708,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAC", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAC", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429815_NL_20200315_null_20",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429868_Eskisehir_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001100433579003676,
"Nucleotide GTR":0.001090182685220549,
"amino-acid": [
["S", "G", "F", "R", "K", "M", "A", "F", "P", "S", "G", "K", "V", "E", "G", "C", "M", "V", "Q", "V", "T", "C", "G", "T", "T", "T", "L", "N", "G", "L", "W", "L", "D", "D", "V", "V", "Y", "C", "P", "R", "H", "V", "I", "C", "T", "S", "E", "D", "M", "L", "N", "P", "N", "Y", "E", "D", "L", "L", "I", "R", "K", "S", "N", "H", "N", "F", "L", "V", "Q", "A", "G", "N", "V", "Q", "L", "R", "V", "I", "G", "H", "S", "M", "Q", "N", "C", "V", "L", "K", "L", "K", "V", "D", "T", "A", "N", "P", "K", "T", "P", "K", "Y", "K", "F", "V", "R", "I", "Q", "P", "G", "Q", "T", "F", "S", "V", "L", "A", "C", "Y", "N", "G", "S", "P", "S", "G", "V", "Y", "Q", "C", "A", "M", "R", "P", "N", "F", "T", "I", "K", "G", "S", "F", "L", "N", "G", "S", "C", "G", "S", "V", "G", "F", "N", "I", "D", "Y", "D", "C", "V", "S", "F", "C", "Y", "M", "H", "H", "M", "E", "L", "P", "T", "G", "V", "H", "A", "G", "T", "D", "L", "E", "G", "N", "F", "Y", "G", "P", "F", "V", "D", "R", "Q", "T", "A", "Q", "A", "A", "G", "T", "D", "T", "T", "I", "T", "V", "N", "V", "L", "A", "W", "L", "Y", "A", "A", "V", "I", "N", "G", "D", "R", "W", "F", "L", "N", "R", "F", "T", "T", "T", "L", "N", "D", "F", "N", "L", "V", "A", "M", "K", "Y", "N", "Y", "E", "P", "L", "T", "Q", "D", "H", "V", "D", "I", "L", "G", "P", "L", "S", "A", "Q", "T", "G", "I", "A", "V", "L", "D", "M", "C", "A", "S", "L", "K", "E", "L", "L", "Q", "N", "G", "M", "N", "G", "R", "T", "I", "L", "G", "S", "A", "L", "L", "E", "D", "E", "F", "T", "P", "F", "D", "V", "V", "R", "Q", "C", "S", "G", "V", "T", "F", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GGT", "TTT", "AGA", "AAA", "ATG", "GCA", "TTC", "CCA", "TCT", "GGT", "AAA", "GTT", "GAG", "GGT", "TGT", "ATG", "GTA", "CAA", "GTA", "ACT", "TGT", "GGT", "ACA", "ACT", "ACA", "CTT", "AAC", "GGT", "CTT", "TGG", "CTT", "GAT", "GAC", "GTA", "GTT", "TAC", "TGT", "CCA", "AGA", "CAT", "GTG", "ATC", "TGC", "ACC", "TCT", "GAA", "GAC", "ATG", "CTT", "AAC", "CCT", "AAT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTA", "CTC", "ATT", "CGT", "AAG", "TCT", "AAT", "CAT", "AAT", "TTC", "TTG", "GTA", "CAG", "GCT", "GGT", "AAT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGG", "GTT", "ATT", "GGA", "CAT", "TCT", "ATG", "CAA", "AAT", "TGT", "GTA", "CTT", "AAG", "CTT", "AAG", "GTT", "GAT", "ACA", "GCC", "AAT", "CCT", "AAG", "ACA", "CCT", "AAG", "TAT", "AAG", "TTT", "GTT", "CGC", "ATT", "CAA", "CCA", "GGA", "CAG", "ACT", "TTT", "TCA", "GTG", "TTA", "GCT", "TGT", "TAC", "AAT", "GGT", "TCA", "CCA", "TCT", "GGT", "GTT", "TAC", "CAA", "TGT", "GCT", "ATG", "AGG", "CCC", "AAT", "TTC", "ACT", "ATT", "AAG", "GGT", "TCA", "TTC", "CTT", "AAT", "GGT", "TCA", "TGT", "GGT", "AGT", "GTT", "GGT", "TTT", "AAC", "ATA", "GAT", "TAT", "GAC", "TGT", "GTC", "TCT", "TTT", "TGT", "TAC", "ATG", "CAC", "CAT", "ATG", "GAA", "TTA", "CCA", "ACT", "GGA", "GTT", "CAT", "GCT", "GGC", "ACA", "GAC", "TTA", "GAA", "GGT", "AAC", "TTT", "TAT", "GGA", "CCT", "TTT", "GTT", "GAC", "AGG", "CAA", "ACA", "GCA", "CAA", "GCA", "GCT", "GGT", "ACG", "GAC", "ACA", "ACT", "ATT", "ACA", "GTT", "AAT", "GTT", "TTA", "GCT", "TGG", "TTG", "TAC", "GCT", "GCT", "GTT", "ATA", "AAT", "GGA", "GAT", "AGG", "TGG", "TTT", "CTC", "AAT", "CGA", "TTT", "ACC", "ACA", "ACT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "AAC", "CTT", "GTG", "GCT", "ATG", "AAG", "TAC", "AAT", "TAT", "GAA", "CCT", "CTA", "ACA", "CAA", "GAC", "CAT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTA", "GGA", "CCT", "CTT", "TCT", "GCT", "CAA", "ACT", "GGA", "ATT", "GCC", "GTT", "TTA", "GAT", "ATG", "TGT", "GCT", "TCA", "TTA", "AAA", "GAA", "TTA", "CTG", "CAA", "AAT", "GGT", "ATG", "AAT", "GGA", "CGT", "ACC", "ATA", "TTG", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "TTA", "GAA", "GAT", "GAA", "TTT", "ACA", "CCT", "TTT", "GAT", "GTT", "GTT", "AGA", "CAA", "TGC", "TCA", "GGT", "GTT", "ACT", "TTC", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429868_Eskisehir_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":4826.49510543681,
"Equilibrium frequencies": [
[0.02588636985236994],
[0.01162930531271862],
[0.01087311041913272],
[0.04086479712383448],
[0.01716188938077614],
[0.007709881782975341],
[0.007208547173756631],
[0.02709213890579173],
[0.01528897627336906],
[0.00686848615761556],
[0.00642186324942053],
[0.02413551676830213],
[0.02418363961559241],
[0.01086436337989404],
[0.01015790879047396],
[0.03817682943738954],
[0.01603832847273854],
[0.007205128396868236],
[0.006736615346876879],
[0.02531846075682469],
[0.01063293233742048],
[0.004776784741411738],
[0.004466174594710709],
[0.01678538262715761],
[0.009472538053138786],
[0.004255484169257162],
[0.003978771561582438],
[0.01495355849417717],
[0.01498337379992636],
[0.006731195974084407],
[0.006293500351994093],
[0.02365308593118595],
[0.02852129274417493],
[0.01281302952584795],
[0.01197986303496437],
[0.04502434479408071],
[0.01890876449126568],
[0.008494655550750742],
[0.007942291073465632],
[0.02984979466818499],
[0.0168452112265398],
[0.007567615912461815],
[0.007075532133101033],
[0.02659222375352355],
[0.02664524493119646],
[0.01197022565173166],
[0.01119186243316428],
[0.04206277414090705],
[0.01129090228203672],
[0.03967566580231158],
[0.01666249279409177],
[0.007485530689646961],
[0.006998784497069078],
[0.02630378038678821],
[0.006668618971276261],
[0.006234992415110951],
[0.02343319347367382],
[0.02347991598647032],
[0.01054821951787293],
[0.009862322164476],
[0.03706591572104666]
],
"Log Likelihood":-2257.646598349183,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.78975137772973, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":155
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":5165.889531639324,
"Equilibrium frequencies": [
[0.2810292467155212],
[0.1772050571070179],
[0.2036046741929095],
[0.3381610219845514]
],
"Log Likelihood":-2313.344051214928,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.1633552896789378,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.1199034378101325,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":1.985174361291286,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.2602971801714093
},
"display order":0,
"estimated parameters":269
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-04-24/sequences.3C.compressed.fas",
"number of sequences":132,
"number of sites":306,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_427274_Minnesota_20200320_null_2,epi_isl_427482_New_York_20200401_null_2,epi_isl_427632_New_York_20200406_null_2,epi_isl_427779_New_South_Wales_20200324_null_3,epi_isl_427799_New_South_Wales_20200317_null_8,epi_isl_428299_Wisconsin_20200325_null_1,epi_isl_428335_Wisconsin_20200327_null_11,epi_isl_428354_Ile_De_France_20200325_null_17,epi_isl_428360_Hauts_De_France_20200325_null_21,epi_isl_428362_Ile_De_France_20200325_null_1,epi_isl_426964_Victoria_20200327_null_1,epi_isl_421692_Minnesota_20200317_null_1,epi_isl_422800_Netherlands_20200314_null_3,epi_isl_425777_Scotland_20200313_null_8,epi_isl_427184_Washington_20200325_null_1,epi_isl_426534_Arizona_20200327_null_1,epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_2,epi_isl_424003_England_20200320_null_1,epi_isl_425498_England_20200319_null_2,epi_isl_429781_Luxembourg_20200323_null_1,epi_isl_427025_Victoria_20200331_null_3,epi_isl_421670_India_20200312_null_1,epi_isl_423509_England_20200331_null_5,epi_isl_425564_England_20200325_null_3,epi_isl_429699_Minas_gerais_20200320_null_1,epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_6,epi_isl_425132_Duesseldorf_20200323_null_1,epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1,epi_isl_425319_England_20200328_null_1,epi_isl_429791_Luxembourg_20200328_null_2,epi_isl_427020_Victoria_20200329_null_2,epi_isl_421513_Ile_de_France_20200323_null_1,epi_isl_421763_Luxembourg_20200317_null_1,epi_isl_425342_England_20200318_null_1,epi_isl_427149_Victoria_20200408_null_15,epi_isl_427212_Washington_20200327_null_3,epi_isl_421515_Comunitat_Valenciana_20200307_null_1,epi_isl_418844_British_Columbia_20200312_null_1,epi_isl_429585_Unknown_20200326_null_7,epi_isl_425191_Comunitat_Valenciana_20200316_null_3,epi_isl_427096_Victoria_20200403_null_2,epi_isl_428777_New_York_20200406_null_2,epi_isl_425196_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1,epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_2,epi_isl_429026_California_20200331_null_2,epi_isl_423084_England_20200324_null_2,epi_isl_427051_Victoria_20200330_null_3,epi_isl_428852_Moscow_20200402_null_2,epi_isl_420422_Tielt_Winge_20200325_null_1,epi_isl_423288_England_20200326_null_5,epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1,epi_isl_422914_Zuid_Holland_20200319_null_1,epi_isl_424275_Washington_20200322_null_4,epi_isl_428864_Moscow_20200311_null_2,epi_isl_418366_Ontario_20200305_null_1,epi_isl_421918_England_20200327_null_2,epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1,epi_isl_421506_Ile_de_France_20200321_null_1,epi_isl_428333_Wisconsin_20200327_null_2,epi_isl_428787_New_York_20200406_null_7,epi_isl_429815_NL_20200315_null_20,epi_isl_416720_Washington_20200313_null_1,epi_isl_423428_England_20200330_null_1,epi_isl_424129_England_20200320_null_2,(epi_isl_426475_Virginia_20200404_null_2,epi_isl_428258_Wisconsin_20200329_null_2)Node24,epi_isl_426465_Virginia_20200331_null_6,epi_isl_429663_Istria_20200301_null_1,epi_isl_420195_South_Yorkshire_20200328_null_2,epi_isl_423089_England_20200323_null_1,epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1,epi_isl_424297_Washington_20200323_null_1,epi_isl_428789_New_York_20200406_null_1,epi_isl_421984_England_20200401_null_1,epi_isl_422661_Netherlands_20200310_null_1,epi_isl_425878_Scotland_20200321_null_5,epi_isl_428387_Connecticut_20200331_null_1,epi_isl_429484_Unknown_20200324_null_13,epi_isl_422504_New_York_20200319_null_1,(epi_isl_421871_England_20200327_null_2,epi_isl_426028_New_York_20200304_null_2)Node35,epi_isl_422923_Zuid_Holland_20200323_null_10,epi_isl_429309_Unknown_20200318_null_3,epi_isl_414624_Normandie_20200226_null_1,epi_isl_420241_South_Yorkshire_20200326_null_2,epi_isl_417778_Reykjavik_20200310_null_1,epi_isl_422919_Zuid_Holland_20200319_null_1,epi_isl_429638_Washington_20200407_null_4,epi_isl_428762_New_York_20200403_null_57,epi_isl_420610_ARA_20200323_null_2,epi_isl_425839_Scotland_20200313_null_1,((epi_isl_420520_England_20200324_null_1,epi_isl_423505_England_20200330_null_2)Node59,epi_isl_427453_Wisconsin_20200406_null_20)Node58,epi_isl_428779_New_York_20200406_null_116,epi_isl_429868_Eskisehir_20200317_null_2,epi_isl_421432_New_York_20200317_null_1,epi_isl_423766_England_20200323_null_1,epi_isl_425655_Scotland_20200310_null_1,epi_isl_426621_New_York_20200401_null_1,epi_isl_428902_Orenburg_Region_20200323_null_3,epi_isl_415454_Switzerland_20200228_null_1,epi_isl_423704_England_20200323_null_1,epi_isl_423958_England_20200319_null_1,epi_isl_425982_Scotland_20200329_null_3,epi_isl_428732_Wisconsin_20200406_null_1,epi_isl_420510_England_20200323_null_2,epi_isl_422860_Noord_Brabant_20200320_null_1,epi_isl_418021_Portugal_20200316_null_1,epi_isl_424470_Reykjavik_20200320_null_2,epi_isl_429159_Ostergotland_20200310_null_1,epi_isl_424552_Reykjavik_20200328_null_15,epi_isl_421316_Wisconsin_20200323_null_2,epi_isl_423772_England_20200322_null_2,epi_isl_427164_Connecticut_20200331_null_1,epi_isl_427132_Victoria_20200405_null_1,epi_isl_418082_Washington_20200315_null_1,epi_isl_419756_Victoria_20200311_null_1,epi_isl_424164_England_20200322_null_1,epi_isl_427259_Washington_20200331_null_1,epi_isl_429705_Istria_20200301_null_4,epi_isl_429007_California_20200318_null_4,(epi_isl_426989_Victoria_20200328_null_3,epi_isl_428365_Ile_De_France_20200326_null_2)Node93,epi_isl_416681_Washington_20200311_null_10783,epi_isl_423389_England_20200330_null_1,(epi_isl_425904_Scotland_20200322_null_1,epi_isl_429518_Unknown_20200311_null_12)Node106,(epi_isl_425242_England_20200331_null_1,epi_isl_429273_Unknown_20200310_null_125)Node100,(epi_isl_422266_Wales_20200325_null_1,epi_isl_429315_Unknown_20200318_null_4)Node103)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node100":"test",
"Node103":"test",
"Node106":"test",
"Node24":"test",
"Node35":"test",
"Node58":"test",
"Node59":"test",
"Node93":"test",
"epi_isl_414624_Normandie_20200226_null_1":"test",
"epi_isl_415454_Switzerland_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1":"test",
"epi_isl_416681_Washington_20200311_null_10783":"test",
"epi_isl_416720_Washington_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1":"test",
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417778_Reykjavik_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_418021_Portugal_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418082_Washington_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418366_Ontario_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_418844_British_Columbia_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419756_Victoria_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_420195_South_Yorkshire_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_420241_South_Yorkshire_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_420422_Tielt_Winge_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_420510_England_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_420520_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420610_ARA_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_421316_Wisconsin_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_421432_New_York_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_421506_Ile_de_France_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_421513_Ile_de_France_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_421515_Comunitat_Valenciana_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_421670_India_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_421692_Minnesota_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_421763_Luxembourg_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_421871_England_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_421918_England_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_421984_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_422266_Wales_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422504_New_York_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_422661_Netherlands_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_422800_Netherlands_20200314_null_3":"test",
"epi_isl_422860_Noord_Brabant_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_422914_Zuid_Holland_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_422919_Zuid_Holland_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_422923_Zuid_Holland_20200323_null_10":"test",
"epi_isl_423084_England_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_423089_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423288_England_20200326_null_5":"test",
"epi_isl_423389_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423428_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423505_England_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_423509_England_20200331_null_5":"test",
"epi_isl_423704_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423766_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423772_England_20200322_null_2":"test",
"epi_isl_423958_England_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_424003_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424129_England_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_424164_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_424275_Washington_20200322_null_4":"test",
"epi_isl_424297_Washington_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_424470_Reykjavik_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_424552_Reykjavik_20200328_null_15":"test",
"epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_425132_Duesseldorf_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_425191_Comunitat_Valenciana_20200316_null_3":"test",
"epi_isl_425196_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_425242_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_425319_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_425342_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_425498_England_20200319_null_2":"test",
"epi_isl_425564_England_20200325_null_3":"test",
"epi_isl_425655_Scotland_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_425777_Scotland_20200313_null_8":"test",
"epi_isl_425839_Scotland_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_425878_Scotland_20200321_null_5":"test",
"epi_isl_425904_Scotland_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_425982_Scotland_20200329_null_3":"test",
"epi_isl_426028_New_York_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_426465_Virginia_20200331_null_6":"test",
"epi_isl_426475_Virginia_20200404_null_2":"test",
"epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_6":"test",
"epi_isl_426534_Arizona_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_426621_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_426964_Victoria_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_426989_Victoria_20200328_null_3":"test",
"epi_isl_427020_Victoria_20200329_null_2":"test",
"epi_isl_427025_Victoria_20200331_null_3":"test",
"epi_isl_427051_Victoria_20200330_null_3":"test",
"epi_isl_427096_Victoria_20200403_null_2":"test",
"epi_isl_427132_Victoria_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_427149_Victoria_20200408_null_15":"test",
"epi_isl_427164_Connecticut_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_427184_Washington_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_427212_Washington_20200327_null_3":"test",
"epi_isl_427259_Washington_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_427274_Minnesota_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_427453_Wisconsin_20200406_null_20":"test",
"epi_isl_427482_New_York_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_427632_New_York_20200406_null_2":"test",
"epi_isl_427779_New_South_Wales_20200324_null_3":"test",
"epi_isl_427799_New_South_Wales_20200317_null_8":"test",
"epi_isl_428258_Wisconsin_20200329_null_2":"test",
"epi_isl_428299_Wisconsin_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_428333_Wisconsin_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_428335_Wisconsin_20200327_null_11":"test",
"epi_isl_428354_Ile_De_France_20200325_null_17":"test",
"epi_isl_428360_Hauts_De_France_20200325_null_21":"test",
"epi_isl_428362_Ile_De_France_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_428365_Ile_De_France_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_428387_Connecticut_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_428732_Wisconsin_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_428762_New_York_20200403_null_57":"test",
"epi_isl_428777_New_York_20200406_null_2":"test",
"epi_isl_428779_New_York_20200406_null_116":"test",
"epi_isl_428787_New_York_20200406_null_7":"test",
"epi_isl_428789_New_York_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_428852_Moscow_20200402_null_2":"test",
"epi_isl_428864_Moscow_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_428902_Orenburg_Region_20200323_null_3":"test",
"epi_isl_429007_California_20200318_null_4":"test",
"epi_isl_429026_California_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_429159_Ostergotland_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_429273_Unknown_20200310_null_125":"test",
"epi_isl_429309_Unknown_20200318_null_3":"test",
"epi_isl_429315_Unknown_20200318_null_4":"test",
"epi_isl_429484_Unknown_20200324_null_13":"test",
"epi_isl_429518_Unknown_20200311_null_12":"test",
"epi_isl_429585_Unknown_20200326_null_7":"test",
"epi_isl_429638_Washington_20200407_null_4":"test",
"epi_isl_429663_Istria_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_429699_Minas_gerais_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_429705_Istria_20200301_null_4":"test",
"epi_isl_429781_Luxembourg_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_429791_Luxembourg_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_429815_NL_20200315_null_20":"test",
"epi_isl_429868_Eskisehir_20200317_null_2":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":2
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":3
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":6
}
}
}